MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pantoea vagans C9-1 chromosome

Total Repeats: 77202

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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75002	NC_014562	ACA	2	6	3909961	3909966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308189112
75003	NC_014562	GCA	2	6	3909982	3909987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189112
75004	NC_014562	TGC	2	6	3910018	3910023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189112
75005	NC_014562	TACTC	2	10	3910063	3910072	20 %	40 %	0 %	40 %	308189112
75006	NC_014562	GC	3	6	3910093	3910098	0 %	0 %	50 %	50 %	308189112
75007	NC_014562	GAA	2	6	3910170	3910175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308189112
75008	NC_014562	GCT	2	6	3910191	3910196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189112
75009	NC_014562	CG	3	6	3910213	3910218	0 %	0 %	50 %	50 %	308189112
75010	NC_014562	GGTG	2	8	3910259	3910266	0 %	25 %	75 %	0 %	308189112
75011	NC_014562	TG	3	6	3910269	3910274	0 %	50 %	50 %	0 %	308189112
75012	NC_014562	GCGCG	2	10	3910280	3910289	0 %	0 %	60 %	40 %	308189112
75013	NC_014562	CG	4	8	3910286	3910293	0 %	0 %	50 %	50 %	308189112
75014	NC_014562	GCG	2	6	3910318	3910323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189112
75015	NC_014562	TTA	2	6	3910369	3910374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308189112
75016	NC_014562	TGA	2	6	3910412	3910417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189112
75017	NC_014562	TGA	2	6	3910531	3910536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189112
75018	NC_014562	GAT	2	6	3910542	3910547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189112
75019	NC_014562	CGAT	2	8	3910582	3910589	25 %	25 %	25 %	25 %	308189112
75020	NC_014562	CGA	2	6	3910613	3910618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189112
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75022	NC_014562	GCT	2	6	3910691	3910696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189112
75023	NC_014562	A	6	6	3910748	3910753	100 %	0 %	0 %	0 %	308189112
75024	NC_014562	ACC	2	6	3910761	3910766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308189112
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75026	NC_014562	TGA	2	6	3910940	3910945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189112
75027	NC_014562	GC	3	6	3910954	3910959	0 %	0 %	50 %	50 %	308189112
75028	NC_014562	CTG	2	6	3910982	3910987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189112
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75032	NC_014562	AAGT	2	8	3911260	3911267	50 %	25 %	25 %	0 %	308189113
75033	NC_014562	GAA	2	6	3911393	3911398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308189113
75034	NC_014562	GCA	2	6	3911483	3911488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189113
75035	NC_014562	CGA	2	6	3911521	3911526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189113
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75054	NC_014562	CGT	2	6	3912146	3912151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189113
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75056	NC_014562	CAT	2	6	3912229	3912234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189113
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75058	NC_014562	GCGG	2	8	3912305	3912312	0 %	0 %	75 %	25 %	308189113
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75089	NC_014562	AAGATG	2	12	3913961	3913972	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	308189114
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75100	NC_014562	GC	3	6	3914323	3914328	0 %	0 %	50 %	50 %	308189115
75101	NC_014562	TCAG	2	8	3914497	3914504	25 %	25 %	25 %	25 %	308189115
75102	NC_014562	GTC	2	6	3914587	3914592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189115
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75104	NC_014562	CAT	2	6	3914735	3914740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189115
75105	NC_014562	GAT	2	6	3914742	3914747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189115
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75230	NC_014562	TCC	2	6	3921237	3921242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308189120
75231	NC_014562	GCC	2	6	3921270	3921275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308189120
75232	NC_014562	AGC	2	6	3921276	3921281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189120
75233	NC_014562	T	6	6	3921369	3921374	0 %	100 %	0 %	0 %	308189120
75234	NC_014562	CG	3	6	3921385	3921390	0 %	0 %	50 %	50 %	308189120
75235	NC_014562	TGG	2	6	3921424	3921429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308189120
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75237	NC_014562	TGC	2	6	3921490	3921495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189120
75238	NC_014562	CTG	2	6	3921524	3921529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189120
75239	NC_014562	CTG	3	9	3921566	3921574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189120
75240	NC_014562	ATG	2	6	3921608	3921613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189120
75241	NC_014562	ATT	2	6	3921626	3921631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308189120
75242	NC_014562	CAC	2	6	3921632	3921637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308189120
75243	NC_014562	GGT	2	6	3921665	3921670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308189120
75244	NC_014562	CAC	2	6	3921755	3921760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308189120
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75247	NC_014562	GGA	2	6	3922129	3922134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308189121
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75249	NC_014562	TGG	2	6	3922230	3922235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308189121
75250	NC_014562	GCA	2	6	3922242	3922247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189121
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75252	NC_014562	TGC	2	6	3922272	3922277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189121
75253	NC_014562	GC	3	6	3922324	3922329	0 %	0 %	50 %	50 %	308189121
75254	NC_014562	GTG	2	6	3922458	3922463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308189121
75255	NC_014562	TGG	2	6	3922491	3922496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308189121
75256	NC_014562	GCT	2	6	3922585	3922590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189121
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75259	NC_014562	GCTG	2	8	3922668	3922675	0 %	25 %	50 %	25 %	308189121
75260	NC_014562	TCA	2	6	3922687	3922692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189121
75261	NC_014562	CAG	2	6	3922717	3922722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189121
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75264	NC_014562	TGA	2	6	3922827	3922832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189121
75265	NC_014562	TGG	2	6	3922833	3922838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308189121
75266	NC_014562	CGC	2	6	3922910	3922915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308189121
75267	NC_014562	GTC	2	6	3922944	3922949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189121
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75299	NC_014562	CAG	2	6	3924618	3924623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189123
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75301	NC_014562	GCG	2	6	3924870	3924875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189123
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75303	NC_014562	ACT	2	6	3924915	3924920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189123
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75322	NC_014562	GC	3	6	3925542	3925547	0 %	0 %	50 %	50 %	308189124
75323	NC_014562	GTT	2	6	3925550	3925555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308189124
75324	NC_014562	TGA	2	6	3925561	3925566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189124
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75327	NC_014562	GAT	2	6	3925613	3925618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189124
75328	NC_014562	AG	3	6	3925659	3925664	50 %	0 %	50 %	0 %	308189124
75329	NC_014562	GCC	2	6	3925750	3925755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308189124
75330	NC_014562	TGA	2	6	3925837	3925842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189124
75331	NC_014562	GC	3	6	3925848	3925853	0 %	0 %	50 %	50 %	308189124
75332	NC_014562	CAGC	2	8	3925859	3925866	25 %	0 %	25 %	50 %	308189124
75333	NC_014562	TG	3	6	3926232	3926237	0 %	50 %	50 %	0 %	308189125
75334	NC_014562	TGC	3	9	3926299	3926307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189125
75335	NC_014562	AAC	2	6	3926308	3926313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308189125
75336	NC_014562	CTG	2	6	3926376	3926381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189125
75337	NC_014562	TGG	2	6	3926503	3926508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308189125
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75339	NC_014562	GGC	2	6	3926660	3926665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189125
75340	NC_014562	CG	3	6	3926712	3926717	0 %	0 %	50 %	50 %	308189125
75341	NC_014562	GCT	2	6	3926784	3926789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189126
75342	NC_014562	CCG	2	6	3926799	3926804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308189126
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75344	NC_014562	GAT	2	6	3926867	3926872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189126
75345	NC_014562	CGA	2	6	3926923	3926928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189126
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75460	NC_014562	CGGCAG	2	12	3932475	3932486	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	308189135
75461	NC_014562	GGCCAG	3	18	3932493	3932510	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	308189135
75462	NC_014562	CTG	2	6	3932520	3932525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189135
75463	NC_014562	CAT	2	6	3932591	3932596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189135
75464	NC_014562	GC	3	6	3932657	3932662	0 %	0 %	50 %	50 %	308189135
75465	NC_014562	CCG	2	6	3932663	3932668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308189135
75466	NC_014562	CGG	2	6	3932693	3932698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189135
75467	NC_014562	CAG	2	6	3932718	3932723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189135
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75469	NC_014562	GTA	2	6	3932817	3932822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189135
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75472	NC_014562	TCG	2	6	3932935	3932940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189135
75473	NC_014562	CAG	2	6	3932982	3932987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189135
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75476	NC_014562	A	6	6	3933192	3933197	100 %	0 %	0 %	0 %	308189135
75477	NC_014562	TGC	2	6	3933244	3933249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189135
75478	NC_014562	GC	3	6	3933254	3933259	0 %	0 %	50 %	50 %	308189135
75479	NC_014562	GCT	2	6	3933287	3933292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189135
75480	NC_014562	ATT	2	6	3933342	3933347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308189135
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75482	NC_014562	CCG	2	6	3933648	3933653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308189136
75483	NC_014562	GCCGAT	2	12	3933695	3933706	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	308189136
75484	NC_014562	GAT	2	6	3933715	3933720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189136
75485	NC_014562	AGA	2	6	3933801	3933806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308189136
75486	NC_014562	TGG	2	6	3933870	3933875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308189136
75487	NC_014562	CGC	2	6	3933887	3933892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308189136
75488	NC_014562	GGC	3	9	3934004	3934012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189136
75489	NC_014562	CAG	2	6	3934019	3934024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189136
75490	NC_014562	GCG	2	6	3934043	3934048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189136
75491	NC_014562	TTC	2	6	3934052	3934057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308189136
75492	NC_014562	GGT	2	6	3934117	3934122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308189136
75493	NC_014562	GCA	2	6	3934198	3934203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189136
75494	NC_014562	GGC	2	6	3934231	3934236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189136
75495	NC_014562	TCA	2	6	3934251	3934256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189136
75496	NC_014562	GCGCG	2	10	3934369	3934378	0 %	0 %	60 %	40 %	308189136
75497	NC_014562	GCCA	2	8	3934397	3934404	25 %	0 %	25 %	50 %	308189136
75498	NC_014562	GC	3	6	3934426	3934431	0 %	0 %	50 %	50 %	308189136
75499	NC_014562	CTG	2	6	3934436	3934441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189136
75500	NC_014562	CCG	2	6	3934467	3934472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308189136

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