MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pantoea vagans C9-1 chromosome

Total Repeats: 77202

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
74001	NC_014562	CGT	2	6	3859442	3859447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189063
74002	NC_014562	TCT	2	6	3859448	3859453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308189063
74003	NC_014562	GGC	2	6	3859495	3859500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189063
74004	NC_014562	CAT	2	6	3859530	3859535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189063
74005	NC_014562	CGG	2	6	3859544	3859549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189063
74006	NC_014562	ATC	2	6	3859563	3859568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189063
74007	NC_014562	GCCAGT	2	12	3859651	3859662	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	308189063
74008	NC_014562	TGG	2	6	3859760	3859765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308189063
74009	NC_014562	TGA	2	6	3859798	3859803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189063
74010	NC_014562	CGA	2	6	3859878	3859883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189063
74011	NC_014562	CAG	2	6	3859944	3859949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189063
74012	NC_014562	GTT	2	6	3859964	3859969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308189063
74013	NC_014562	GCT	2	6	3860061	3860066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189063
74014	NC_014562	CG	3	6	3860145	3860150	0 %	0 %	50 %	50 %	308189063
74015	NC_014562	GCA	2	6	3860155	3860160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189063
74016	NC_014562	AAG	2	6	3860173	3860178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308189063
74017	NC_014562	GAA	2	6	3860229	3860234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308189063
74018	NC_014562	CCG	2	6	3860293	3860298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308189063
74019	NC_014562	CTGC	2	8	3860398	3860405	0 %	25 %	25 %	50 %	308189063
74020	NC_014562	T	6	6	3860436	3860441	0 %	100 %	0 %	0 %	308189063
74021	NC_014562	TAC	2	6	3861368	3861373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189064
74022	NC_014562	GCT	3	9	3861412	3861420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189064
74023	NC_014562	TGG	2	6	3861432	3861437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308189064
74024	NC_014562	GAT	2	6	3861445	3861450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189064
74025	NC_014562	GTG	2	6	3861503	3861508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308189064
74026	NC_014562	GCT	2	6	3861526	3861531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189064
74027	NC_014562	GGT	3	9	3861562	3861570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308189064
74028	NC_014562	GGA	2	6	3861580	3861585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308189064
74029	NC_014562	TGG	2	6	3861609	3861614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308189064
74030	NC_014562	CAG	2	6	3861656	3861661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189064
74031	NC_014562	AGC	2	6	3861792	3861797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189064
74032	NC_014562	TCC	2	6	3861800	3861805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308189064
74033	NC_014562	CTG	2	6	3861896	3861901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189064
74034	NC_014562	ATG	3	9	3861951	3861959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189064
74035	NC_014562	TTA	2	6	3862084	3862089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308189064
74036	NC_014562	ACC	2	6	3862190	3862195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308189064
74037	NC_014562	CGC	2	6	3862227	3862232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308189064
74038	NC_014562	CTG	2	6	3862262	3862267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189064
74039	NC_014562	ATG	2	6	3862347	3862352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189064
74040	NC_014562	CTG	2	6	3862451	3862456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189064
74041	NC_014562	CTGCCG	2	12	3862496	3862507	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	308189064
74042	NC_014562	GACG	2	8	3862519	3862526	25 %	0 %	50 %	25 %	308189064
74043	NC_014562	CAG	2	6	3862583	3862588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189064
74044	NC_014562	GTG	2	6	3862598	3862603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308189064
74045	NC_014562	AGG	2	6	3862671	3862676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308189064
74046	NC_014562	CGT	2	6	3862769	3862774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189064
74047	NC_014562	GGA	2	6	3862876	3862881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308189064
74048	NC_014562	GAC	2	6	3862892	3862897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189064
74049	NC_014562	CTGC	2	8	3862907	3862914	0 %	25 %	25 %	50 %	308189064
74050	NC_014562	CTG	2	6	3862925	3862930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189064
74051	NC_014562	GC	3	6	3862961	3862966	0 %	0 %	50 %	50 %	308189064
74052	NC_014562	GCGCTG	2	12	3863021	3863032	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	308189064
74053	NC_014562	TGC	2	6	3863058	3863063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189064
74054	NC_014562	CAG	2	6	3863117	3863122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189064
74055	NC_014562	TGG	2	6	3863148	3863153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308189064
74056	NC_014562	A	6	6	3863180	3863185	100 %	0 %	0 %	0 %	308189064
74057	NC_014562	GAT	2	6	3863207	3863212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189064
74058	NC_014562	GAT	2	6	3863251	3863256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189064
74059	NC_014562	TGC	2	6	3863328	3863333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189064
74060	NC_014562	GAT	2	6	3863413	3863418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189064
74061	NC_014562	GAATC	2	10	3863441	3863450	40 %	20 %	20 %	20 %	308189064
74062	NC_014562	GC	3	6	3863456	3863461	0 %	0 %	50 %	50 %	308189064
74063	NC_014562	GGC	2	6	3863503	3863508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308189064
74064	NC_014562	TCGG	2	8	3863513	3863520	0 %	25 %	50 %	25 %	308189064
74065	NC_014562	GTG	2	6	3863575	3863580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308189064
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74068	NC_014562	A	7	7	3863683	3863689	100 %	0 %	0 %	0 %	308189064
74069	NC_014562	TAT	2	6	3864604	3864609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308189065
74070	NC_014562	TGGC	2	8	3864641	3864648	0 %	25 %	50 %	25 %	308189065
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74074	NC_014562	ACAG	2	8	3864916	3864923	50 %	0 %	25 %	25 %	308189065
74075	NC_014562	ACG	2	6	3865015	3865020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189065
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74077	NC_014562	AGCC	3	12	3865104	3865115	25 %	0 %	25 %	50 %	308189065
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74081	NC_014562	CAG	2	6	3865211	3865216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189065
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74083	NC_014562	TCA	2	6	3865293	3865298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189066
74084	NC_014562	TCC	2	6	3865344	3865349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308189066
74085	NC_014562	CAG	2	6	3865400	3865405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189066
74086	NC_014562	GCT	2	6	3865415	3865420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189066
74087	NC_014562	GGCTTC	2	12	3865421	3865432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189066
74088	NC_014562	GCA	2	6	3865450	3865455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189066
74089	NC_014562	AAC	2	6	3865488	3865493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308189066
74090	NC_014562	GCAT	2	8	3865509	3865516	25 %	25 %	25 %	25 %	308189066
74091	NC_014562	CG	3	6	3865605	3865610	0 %	0 %	50 %	50 %	308189067
74092	NC_014562	CCA	2	6	3865661	3865666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308189067
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74095	NC_014562	CAG	2	6	3865951	3865956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189067
74096	NC_014562	GCA	2	6	3865965	3865970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189067
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74098	NC_014562	CAG	2	6	3866041	3866046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189067
74099	NC_014562	CT	3	6	3866051	3866056	0 %	50 %	0 %	50 %	308189067
74100	NC_014562	CAG	2	6	3866161	3866166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189067
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74102	NC_014562	CCG	3	9	3866253	3866261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308189067
74103	NC_014562	GCA	3	9	3866298	3866306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189067
74104	NC_014562	ATC	2	6	3866396	3866401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189067
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74107	NC_014562	GCA	2	6	3866512	3866517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189068
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74109	NC_014562	GT	3	6	3866580	3866585	0 %	50 %	50 %	0 %	308189068
74110	NC_014562	GCT	2	6	3866663	3866668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189068
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74112	NC_014562	GCT	2	6	3866813	3866818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189068
74113	NC_014562	TGA	2	6	3866834	3866839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189068
74114	NC_014562	T	6	6	3866853	3866858	0 %	100 %	0 %	0 %	308189068
74115	NC_014562	CGC	2	6	3866873	3866878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308189068
74116	NC_014562	GTT	2	6	3866928	3866933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308189068
74117	NC_014562	T	6	6	3867093	3867098	0 %	100 %	0 %	0 %	308189069
74118	NC_014562	CATA	2	8	3867161	3867168	50 %	25 %	0 %	25 %	308189069
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74141	NC_014562	TCA	2	6	3868507	3868512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189070
74142	NC_014562	TCA	2	6	3868588	3868593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189070
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74145	NC_014562	CTG	2	6	3868767	3868772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189070
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74213	NC_014562	ATC	2	6	3872548	3872553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189076
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74217	NC_014562	CT	3	6	3872753	3872758	0 %	50 %	0 %	50 %	308189076
74218	NC_014562	GCT	2	6	3872778	3872783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189076
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74222	NC_014562	TCCA	2	8	3872878	3872885	25 %	25 %	0 %	50 %	308189076
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74225	NC_014562	CAG	2	6	3873241	3873246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189076
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74228	NC_014562	CGA	2	6	3873563	3873568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189077
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74346	NC_014562	TGA	2	6	3880236	3880241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189086
74347	NC_014562	GC	3	6	3880269	3880274	0 %	0 %	50 %	50 %	308189086
74348	NC_014562	GTT	2	6	3880307	3880312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308189086
74349	NC_014562	TCG	3	9	3880351	3880359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189086
74350	NC_014562	AAGC	2	8	3880373	3880380	50 %	0 %	25 %	25 %	308189086
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74352	NC_014562	CAT	2	6	3880552	3880557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308189087
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74354	NC_014562	TGA	2	6	3880960	3880965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189088
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74357	NC_014562	AT	3	6	3881029	3881034	50 %	50 %	0 %	0 %	308189088
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74368	NC_014562	ATCGAT	2	12	3881681	3881692	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	308189088
74369	NC_014562	TGA	2	6	3881698	3881703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308189088
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74372	NC_014562	GCTG	2	8	3881781	3881788	0 %	25 %	50 %	25 %	308189088
74373	NC_014562	CAA	2	6	3881794	3881799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308189088
74374	NC_014562	TGATC	2	10	3881803	3881812	20 %	40 %	20 %	20 %	308189088
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74377	NC_014562	CTG	2	6	3881920	3881925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189088
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74460	NC_014562	GCA	2	6	3886151	3886156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189093
74461	NC_014562	GTC	2	6	3886185	3886190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189093
74462	NC_014562	CAG	2	6	3886242	3886247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189093
74463	NC_014562	CAG	2	6	3886269	3886274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308189093
74464	NC_014562	CGTC	2	8	3886307	3886314	0 %	25 %	25 %	50 %	308189093
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74488	NC_014562	CG	3	6	3887758	3887763	0 %	0 %	50 %	50 %	308189094
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74490	NC_014562	CTG	2	6	3888014	3888019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308189094
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