MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pantoea vagans C9-1 chromosome

Total Repeats: 77202

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_014562	GAG	2	6	314446	314451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308185819
6002	NC_014562	TGA	2	6	314484	314489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185819
6003	NC_014562	GCT	3	9	314491	314499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185819
6004	NC_014562	GCA	2	6	314511	314516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185819
6005	NC_014562	CAC	2	6	314775	314780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308185820
6006	NC_014562	CCA	2	6	314785	314790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308185820
6007	NC_014562	GGC	2	6	314848	314853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185820
6008	NC_014562	CAC	3	9	314874	314882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308185820
6009	NC_014562	GAT	2	6	314893	314898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185820
6010	NC_014562	CCG	2	6	314954	314959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185820
6011	NC_014562	ACA	2	6	315050	315055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308185820
6012	NC_014562	GGT	2	6	315088	315093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185820
6013	NC_014562	CAC	2	6	315186	315191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308185820
6014	NC_014562	TAT	2	6	315192	315197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308185820
6015	NC_014562	CTG	2	6	315261	315266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185820
6016	NC_014562	GCA	2	6	315332	315337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185820
6017	NC_014562	TTC	2	6	315349	315354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308185820
6018	NC_014562	CGG	2	6	315369	315374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185820
6019	NC_014562	TCT	2	6	315389	315394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308185820
6020	NC_014562	AC	3	6	315515	315520	50 %	0 %	0 %	50 %	308185820
6021	NC_014562	CG	3	6	315608	315613	0 %	0 %	50 %	50 %	308185820
6022	NC_014562	CGG	2	6	315678	315683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185820
6023	NC_014562	CGC	2	6	315722	315727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185820
6024	NC_014562	AAT	2	6	315736	315741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308185820
6025	NC_014562	TCG	2	6	315840	315845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185820
6026	NC_014562	GTG	2	6	315910	315915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185820
6027	NC_014562	CGAC	2	8	315926	315933	25 %	0 %	25 %	50 %	308185820
6028	NC_014562	CCA	2	6	316013	316018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308185820
6029	NC_014562	CCG	2	6	316031	316036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185820
6030	NC_014562	TGCC	2	8	316052	316059	0 %	25 %	25 %	50 %	308185820
6031	NC_014562	ACC	2	6	316165	316170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308185820
6032	NC_014562	GCG	2	6	316205	316210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185820
6033	NC_014562	ACC	2	6	316231	316236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308185820
6034	NC_014562	GGT	2	6	316290	316295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185820
6035	NC_014562	GTG	2	6	316387	316392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185820
6036	NC_014562	TAC	2	6	316486	316491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185820
6037	NC_014562	TGA	2	6	316495	316500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185820
6038	NC_014562	TC	3	6	317240	317245	0 %	50 %	0 %	50 %	308185821
6039	NC_014562	GCA	2	6	317255	317260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185821
6040	NC_014562	GCT	2	6	317365	317370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185821
6041	NC_014562	GTT	2	6	317377	317382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308185821
6042	NC_014562	AGC	2	6	317889	317894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185822
6043	NC_014562	GCG	2	6	317914	317919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185822
6044	NC_014562	CTG	2	6	317922	317927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185822
6045	NC_014562	TGAT	2	8	317956	317963	25 %	50 %	25 %	0 %	308185822
6046	NC_014562	GCT	2	6	317976	317981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185822
6047	NC_014562	GCT	2	6	317988	317993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185822
6048	NC_014562	ATG	2	6	318013	318018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185822
6049	NC_014562	ACC	2	6	318043	318048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308185822
6050	NC_014562	TGC	2	6	318083	318088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185822
6051	NC_014562	CACTT	2	10	318171	318180	20 %	40 %	0 %	40 %	308185822
6052	NC_014562	ACC	2	6	318184	318189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308185822
6053	NC_014562	CCCG	2	8	318211	318218	0 %	0 %	25 %	75 %	308185822
6054	NC_014562	CGC	2	6	318219	318224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185822
6055	NC_014562	CGG	2	6	318230	318235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185822
6056	NC_014562	TGA	2	6	318284	318289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185822
6057	NC_014562	GAG	2	6	318307	318312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308185822
6058	NC_014562	TCT	2	6	318329	318334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308185822
6059	NC_014562	GTC	2	6	318382	318387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185822
6060	NC_014562	CTG	2	6	318486	318491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185822
6061	NC_014562	CAG	2	6	318588	318593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185822
6062	NC_014562	CG	3	6	318641	318646	0 %	0 %	50 %	50 %	308185822
6063	NC_014562	GCA	2	6	318706	318711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185822
6064	NC_014562	GTGATG	2	12	318793	318804	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	308185822
6065	NC_014562	GCTG	2	8	318933	318940	0 %	25 %	50 %	25 %	308185822
6066	NC_014562	CAG	2	6	319011	319016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185822
6067	NC_014562	TGCGT	2	10	319085	319094	0 %	40 %	40 %	20 %	308185822
6068	NC_014562	CATT	2	8	319124	319131	25 %	50 %	0 %	25 %	308185822
6069	NC_014562	TGATC	2	10	319172	319181	20 %	40 %	20 %	20 %	308185822
6070	NC_014562	CGAT	2	8	319238	319245	25 %	25 %	25 %	25 %	308185822
6071	NC_014562	AAT	2	6	319314	319319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308185822
6072	NC_014562	GCT	2	6	319327	319332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185822
6073	NC_014562	AG	3	6	320019	320024	50 %	0 %	50 %	0 %	308185823
6074	NC_014562	GAG	2	6	320026	320031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308185823
6075	NC_014562	GAC	2	6	320037	320042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185823
6076	NC_014562	CCAT	2	8	320095	320102	25 %	25 %	0 %	50 %	308185823
6077	NC_014562	TCA	2	6	320180	320185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185823
6078	NC_014562	T	6	6	320192	320197	0 %	100 %	0 %	0 %	308185823
6079	NC_014562	CAG	2	6	320262	320267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185823
6080	NC_014562	TCT	2	6	320287	320292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308185823
6081	NC_014562	CGC	2	6	320357	320362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185823
6082	NC_014562	ATG	2	6	320374	320379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185823
6083	NC_014562	CAGG	2	8	320442	320449	25 %	0 %	50 %	25 %	308185823
6084	NC_014562	GCC	2	6	320469	320474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185823
6085	NC_014562	CAG	3	9	320577	320585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185823
6086	NC_014562	CA	3	6	320604	320609	50 %	0 %	0 %	50 %	308185823
6087	NC_014562	GCAG	2	8	320620	320627	25 %	0 %	50 %	25 %	308185823
6088	NC_014562	CAG	2	6	320670	320675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185823
6089	NC_014562	CAG	3	9	320796	320804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185823
6090	NC_014562	TGAAA	2	10	321031	321040	60 %	20 %	20 %	0 %	308185824
6091	NC_014562	A	6	6	321038	321043	100 %	0 %	0 %	0 %	308185824
6092	NC_014562	CGT	2	6	321054	321059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185824
6093	NC_014562	TGA	3	9	321066	321074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185824
6094	NC_014562	CGC	4	12	321120	321131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185824
6095	NC_014562	AGA	2	6	321163	321168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308185824
6096	NC_014562	GAA	2	6	321244	321249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308185824
6097	NC_014562	ACA	2	6	321279	321284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308185824
6098	NC_014562	ATT	2	6	321299	321304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308185824
6099	NC_014562	GAA	2	6	321310	321315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308185824
6100	NC_014562	CAG	2	6	321473	321478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185825
6101	NC_014562	CCA	2	6	321672	321677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308185825
6102	NC_014562	TCA	2	6	321691	321696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185825
6103	NC_014562	GGC	2	6	321698	321703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185825
6104	NC_014562	CTG	2	6	321717	321722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185825
6105	NC_014562	CTG	2	6	321761	321766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185825
6106	NC_014562	ACC	2	6	321906	321911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308185825
6107	NC_014562	CG	4	8	321937	321944	0 %	0 %	50 %	50 %	308185825
6108	NC_014562	GCT	2	6	322015	322020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185825
6109	NC_014562	CG	3	6	322056	322061	0 %	0 %	50 %	50 %	308185825
6110	NC_014562	TGC	2	6	322067	322072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185825
6111	NC_014562	CAT	2	6	322078	322083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185825
6112	NC_014562	AGA	2	6	322105	322110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308185825
6113	NC_014562	CAG	2	6	322151	322156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185825
6114	NC_014562	TGGC	2	8	322173	322180	0 %	25 %	50 %	25 %	308185825
6115	NC_014562	CTG	2	6	322190	322195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185825
6116	NC_014562	AGC	2	6	322302	322307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185825
6117	NC_014562	GGCG	2	8	322319	322326	0 %	0 %	75 %	25 %	308185825
6118	NC_014562	ATCCG	2	10	322374	322383	20 %	20 %	20 %	40 %	308185825
6119	NC_014562	CA	3	6	322525	322530	50 %	0 %	0 %	50 %	308185825
6120	NC_014562	GCA	2	6	322573	322578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185825
6121	NC_014562	GC	4	8	322711	322718	0 %	0 %	50 %	50 %	308185825
6122	NC_014562	GCTG	2	8	322804	322811	0 %	25 %	50 %	25 %	308185825
6123	NC_014562	TAG	2	6	323304	323309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185826
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6126	NC_014562	GCT	2	6	323873	323878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185827
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6130	NC_014562	TGC	2	6	324039	324044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185827
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6134	NC_014562	CTG	2	6	324172	324177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185827
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6153	NC_014562	CGA	2	6	324939	324944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185827
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6204	NC_014562	GATT	2	8	326561	326568	25 %	50 %	25 %	0 %	308185829
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6225	NC_014562	GCA	2	6	327224	327229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185829
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6228	NC_014562	CTGCAT	2	12	327545	327556	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	308185830
6229	NC_014562	CAA	2	6	327601	327606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308185830
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6240	NC_014562	GCT	2	6	328020	328025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185830
6241	NC_014562	GGTCA	2	10	328129	328138	20 %	20 %	40 %	20 %	308185830
6242	NC_014562	GCT	2	6	328188	328193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185830
6243	NC_014562	ATGG	2	8	328228	328235	25 %	25 %	50 %	0 %	308185830
6244	NC_014562	GCG	2	6	328241	328246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185830
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6358	NC_014562	CAG	2	6	334125	334130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185836
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6360	NC_014562	ACG	2	6	334225	334230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185836
6361	NC_014562	GGC	2	6	334309	334314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185836
6362	NC_014562	TGC	2	6	334325	334330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185836
6363	NC_014562	CTG	4	12	334381	334392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185836
6364	NC_014562	ATC	3	9	334399	334407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185836
6365	NC_014562	CAT	2	6	334410	334415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185836
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6369	NC_014562	CCG	2	6	334464	334469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185836
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6373	NC_014562	CA	3	6	334629	334634	50 %	0 %	0 %	50 %	308185836
6374	NC_014562	CTGG	2	8	334635	334642	0 %	25 %	50 %	25 %	308185836
6375	NC_014562	ATC	2	6	334655	334660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185836
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6383	NC_014562	GCT	2	6	334926	334931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185836
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6385	NC_014562	CTCGAT	2	12	334993	335004	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	308185836
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6392	NC_014562	GCCA	2	8	335278	335285	25 %	0 %	25 %	50 %	308185836
6393	NC_014562	GCT	2	6	335295	335300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185836
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6395	NC_014562	GGCGC	2	10	335406	335415	0 %	0 %	60 %	40 %	308185836
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6400	NC_014562	GCTGG	2	10	335631	335640	0 %	20 %	60 %	20 %	308185836
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6477	NC_014562	GCT	2	6	340156	340161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185841
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6480	NC_014562	GCT	2	6	340271	340276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185841
6481	NC_014562	CTG	2	6	340325	340330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185841
6482	NC_014562	GC	3	6	340332	340337	0 %	0 %	50 %	50 %	308185841
6483	NC_014562	GCG	2	6	340360	340365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185841
6484	NC_014562	CCG	2	6	340431	340436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185841
6485	NC_014562	GCC	2	6	340505	340510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185841
6486	NC_014562	CA	3	6	340591	340596	50 %	0 %	0 %	50 %	308185841
6487	NC_014562	CCG	2	6	340657	340662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185841
6488	NC_014562	GAT	2	6	340703	340708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185841
6489	NC_014562	CGG	2	6	340717	340722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185841
6490	NC_014562	CCG	2	6	340731	340736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185841
6491	NC_014562	GCT	2	6	340766	340771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185841
6492	NC_014562	ATA	2	6	340836	340841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308185841
6493	NC_014562	TGC	2	6	340843	340848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185841
6494	NC_014562	TCG	2	6	340914	340919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185841
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6499	NC_014562	TCA	2	6	341062	341067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185841
6500	NC_014562	CCA	2	6	341098	341103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308185841

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