MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pantoea vagans C9-1 chromosome

Total Repeats: 77202

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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64002	NC_014562	T	6	6	3337682	3337687	0 %	100 %	0 %	0 %	308188620
64003	NC_014562	CTC	2	6	3337723	3337728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308188620
64004	NC_014562	AGC	2	6	3337748	3337753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188620
64005	NC_014562	CTG	2	6	3337876	3337881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188620
64006	NC_014562	GCG	2	6	3337962	3337967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308188620
64007	NC_014562	GA	3	6	3338009	3338014	50 %	0 %	50 %	0 %	308188620
64008	NC_014562	TGCG	2	8	3338033	3338040	0 %	25 %	50 %	25 %	308188620
64009	NC_014562	GTTC	2	8	3338114	3338121	0 %	50 %	25 %	25 %	308188620
64010	NC_014562	CAG	2	6	3338206	3338211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188620
64011	NC_014562	GCT	2	6	3338293	3338298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188620
64012	NC_014562	TGA	2	6	3338303	3338308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308188620
64013	NC_014562	GGCA	2	8	3338309	3338316	25 %	0 %	50 %	25 %	308188620
64014	NC_014562	GCG	2	6	3338369	3338374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308188620
64015	NC_014562	CAGC	2	8	3338391	3338398	25 %	0 %	25 %	50 %	308188620
64016	NC_014562	CAG	2	6	3338401	3338406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188620
64017	NC_014562	ACG	2	6	3338428	3338433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188620
64018	NC_014562	AAC	2	6	3338446	3338451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308188620
64019	NC_014562	GCC	2	6	3338633	3338638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308188621
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64022	NC_014562	TCA	2	6	3338817	3338822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308188621
64023	NC_014562	CCA	2	6	3338848	3338853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308188621
64024	NC_014562	ACC	2	6	3338862	3338867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308188621
64025	NC_014562	CGGT	2	8	3338872	3338879	0 %	25 %	50 %	25 %	308188621
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64027	NC_014562	GCC	2	6	3339120	3339125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308188621
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64031	NC_014562	GCC	2	6	3339407	3339412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308188621
64032	NC_014562	TGT	2	6	3339475	3339480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308188621
64033	NC_014562	T	6	6	3339749	3339754	0 %	100 %	0 %	0 %	308188622
64034	NC_014562	CCAG	2	8	3339763	3339770	25 %	0 %	25 %	50 %	308188622
64035	NC_014562	CGA	2	6	3339808	3339813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188622
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64041	NC_014562	CGC	3	9	3340157	3340165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308188622
64042	NC_014562	CAC	2	6	3340177	3340182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308188622
64043	NC_014562	CAA	2	6	3340201	3340206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308188622
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64050	NC_014562	T	7	7	3340690	3340696	0 %	100 %	0 %	0 %	308188622
64051	NC_014562	TCT	2	6	3340926	3340931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308188623
64052	NC_014562	CT	3	6	3340930	3340935	0 %	50 %	0 %	50 %	308188623
64053	NC_014562	TTCCAG	2	12	3341057	3341068	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	308188623
64054	NC_014562	CTG	2	6	3341162	3341167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188623
64055	NC_014562	CTC	2	6	3341171	3341176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308188623
64056	NC_014562	GC	3	6	3341185	3341190	0 %	0 %	50 %	50 %	308188623
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64062	NC_014562	CAC	2	6	3341453	3341458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308188623
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64100	NC_014562	TGG	2	6	3343637	3343642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308188627
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64114	NC_014562	AGCTG	2	10	3344174	3344183	20 %	20 %	40 %	20 %	308188628
64115	NC_014562	TGG	2	6	3344211	3344216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308188628
64116	NC_014562	CGT	2	6	3344217	3344222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188628
64117	NC_014562	CCG	2	6	3344250	3344255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308188628
64118	NC_014562	GCT	2	6	3344264	3344269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188628
64119	NC_014562	GC	3	6	3344299	3344304	0 %	0 %	50 %	50 %	308188628
64120	NC_014562	ATC	2	6	3344359	3344364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308188628
64121	NC_014562	AGA	3	9	3344368	3344376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308188628
64122	NC_014562	CTG	2	6	3344487	3344492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188628
64123	NC_014562	CCGT	2	8	3344498	3344505	0 %	25 %	25 %	50 %	308188628
64124	NC_014562	CTG	2	6	3344508	3344513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188628
64125	NC_014562	TCA	2	6	3344530	3344535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308188628
64126	NC_014562	GCT	3	9	3344543	3344551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188628
64127	NC_014562	GCC	2	6	3344598	3344603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308188628
64128	NC_014562	GGC	2	6	3344669	3344674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308188628
64129	NC_014562	GAT	2	6	3344714	3344719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308188628
64130	NC_014562	GCT	2	6	3344798	3344803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188628
64131	NC_014562	AGCGA	2	10	3344925	3344934	40 %	0 %	40 %	20 %	308188628
64132	NC_014562	AAG	2	6	3345000	3345005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308188628
64133	NC_014562	TGCGC	2	10	3345092	3345101	0 %	20 %	40 %	40 %	308188628
64134	NC_014562	CA	3	6	3345106	3345111	50 %	0 %	0 %	50 %	308188628
64135	NC_014562	TGA	3	9	3345164	3345172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308188628
64136	NC_014562	TGA	2	6	3345230	3345235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308188628
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64138	NC_014562	GCA	3	9	3345296	3345304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188628
64139	NC_014562	GGC	2	6	3345339	3345344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308188628
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64145	NC_014562	CA	3	6	3345681	3345686	50 %	0 %	0 %	50 %	308188629
64146	NC_014562	GGCG	2	8	3345703	3345710	0 %	0 %	75 %	25 %	308188629
64147	NC_014562	CTG	2	6	3345716	3345721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188629
64148	NC_014562	GGC	2	6	3345760	3345765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308188629
64149	NC_014562	GCA	2	6	3345775	3345780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188629
64150	NC_014562	GCA	2	6	3345813	3345818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188629
64151	NC_014562	GGT	3	9	3345841	3345849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308188629
64152	NC_014562	ATCCAT	2	12	3345949	3345960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308188630
64153	NC_014562	CGA	2	6	3345987	3345992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188630
64154	NC_014562	CG	3	6	3345995	3346000	0 %	0 %	50 %	50 %	308188630
64155	NC_014562	CTG	2	6	3346008	3346013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188630
64156	NC_014562	TGG	2	6	3346024	3346029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308188630
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64162	NC_014562	GC	3	6	3346338	3346343	0 %	0 %	50 %	50 %	308188630
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64176	NC_014562	TC	3	6	3346842	3346847	0 %	50 %	0 %	50 %	308188631
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64183	NC_014562	T	6	6	3347220	3347225	0 %	100 %	0 %	0 %	308188631
64184	NC_014562	CGC	2	6	3347230	3347235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308188631
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64195	NC_014562	CTG	2	6	3347845	3347850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188632
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64200	NC_014562	GCC	2	6	3348372	3348377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308188633
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64211	NC_014562	TCG	2	6	3348827	3348832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188634
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64215	NC_014562	TTGC	2	8	3348989	3348996	0 %	50 %	25 %	25 %	308188634
64216	NC_014562	A	7	7	3349136	3349142	100 %	0 %	0 %	0 %	308188635
64217	NC_014562	GCA	2	6	3349225	3349230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188635
64218	NC_014562	GCG	2	6	3349238	3349243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308188635
64219	NC_014562	AAT	2	6	3349255	3349260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308188635
64220	NC_014562	AAC	2	6	3349281	3349286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308188635
64221	NC_014562	CA	3	6	3349294	3349299	50 %	0 %	0 %	50 %	308188635
64222	NC_014562	GTT	2	6	3349329	3349334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308188635
64223	NC_014562	CA	3	6	3349335	3349340	50 %	0 %	0 %	50 %	308188635
64224	NC_014562	TGT	2	6	3349382	3349387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308188635
64225	NC_014562	TGCC	2	8	3349388	3349395	0 %	25 %	25 %	50 %	308188635
64226	NC_014562	GTT	2	6	3349396	3349401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308188635
64227	NC_014562	AGA	2	6	3349410	3349415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308188635
64228	NC_014562	TGC	2	6	3349452	3349457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188635
64229	NC_014562	GCAGC	2	10	3349488	3349497	20 %	0 %	40 %	40 %	308188635
64230	NC_014562	CTG	2	6	3349501	3349506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188635
64231	NC_014562	GTC	2	6	3349547	3349552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188635
64232	NC_014562	ATG	2	6	3349589	3349594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308188635
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64235	NC_014562	AG	3	6	3349731	3349736	50 %	0 %	50 %	0 %	308188635
64236	NC_014562	AGC	4	12	3349859	3349870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188635
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64239	NC_014562	GCA	3	9	3349899	3349907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188635
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64241	NC_014562	CG	3	6	3349929	3349934	0 %	0 %	50 %	50 %	308188635
64242	NC_014562	GC	3	6	3349961	3349966	0 %	0 %	50 %	50 %	308188635
64243	NC_014562	GC	3	6	3350050	3350055	0 %	0 %	50 %	50 %	308188635
64244	NC_014562	GC	3	6	3350058	3350063	0 %	0 %	50 %	50 %	308188635
64245	NC_014562	GCGTCA	2	12	3350094	3350105	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	308188635
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64250	NC_014562	GTG	2	6	3350486	3350491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308188635
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64252	NC_014562	TGC	2	6	3350628	3350633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188636
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64257	NC_014562	GCA	2	6	3350945	3350950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188636
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64267	NC_014562	A	6	6	3351597	3351602	100 %	0 %	0 %	0 %	308188637
64268	NC_014562	CTG	3	9	3351605	3351613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188637
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64338	NC_014562	CAGA	2	8	3355487	3355494	50 %	0 %	25 %	25 %	308188640
64339	NC_014562	ATT	2	6	3355514	3355519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308188640
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64342	NC_014562	GCT	2	6	3355708	3355713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188640
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64344	NC_014562	CGC	2	6	3355787	3355792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308188640
64345	NC_014562	CTG	2	6	3355883	3355888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188640
64346	NC_014562	TGA	2	6	3355897	3355902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308188640
64347	NC_014562	TCCT	2	8	3355922	3355929	0 %	50 %	0 %	50 %	308188640
64348	NC_014562	CAT	2	6	3355936	3355941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308188640
64349	NC_014562	GTT	2	6	3355957	3355962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308188640
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64353	NC_014562	TGG	3	9	3356294	3356302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308188641
64354	NC_014562	TCG	2	6	3356351	3356356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188641
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64356	NC_014562	TGA	2	6	3356381	3356386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308188641
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64358	NC_014562	CTC	2	6	3356445	3356450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308188641
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64362	NC_014562	CTG	2	6	3356558	3356563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188641
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64365	NC_014562	CGTC	2	8	3356661	3356668	0 %	25 %	25 %	50 %	308188641
64366	NC_014562	TGC	2	6	3356672	3356677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188641
64367	NC_014562	CG	3	6	3356729	3356734	0 %	0 %	50 %	50 %	308188641
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64373	NC_014562	CGT	2	6	3357184	3357189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188642
64374	NC_014562	ATG	3	9	3357201	3357209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308188642
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64376	NC_014562	CCGT	2	8	3357284	3357291	0 %	25 %	25 %	50 %	308188642
64377	NC_014562	TGC	2	6	3357385	3357390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188642
64378	NC_014562	TGC	2	6	3357418	3357423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188642
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64380	NC_014562	CGC	2	6	3357471	3357476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308188642
64381	NC_014562	CTG	2	6	3357507	3357512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188642
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64383	NC_014562	CGG	2	6	3357598	3357603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308188642
64384	NC_014562	TGT	2	6	3357622	3357627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308188642
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64393	NC_014562	TGC	2	6	3357983	3357988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188642
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64400	NC_014562	CGATG	2	10	3358270	3358279	20 %	20 %	40 %	20 %	308188643
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64425	NC_014562	CTG	2	6	3359335	3359340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188644
64426	NC_014562	T	6	6	3359422	3359427	0 %	100 %	0 %	0 %	308188644
64427	NC_014562	TGA	2	6	3359453	3359458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308188644
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64430	NC_014562	GCC	2	6	3359720	3359725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308188644
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64432	NC_014562	GCA	2	6	3359816	3359821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188645
64433	NC_014562	GCTG	2	8	3359834	3359841	0 %	25 %	50 %	25 %	308188645
64434	NC_014562	AGC	2	6	3359881	3359886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188645
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64439	NC_014562	CGTT	2	8	3360142	3360149	0 %	50 %	25 %	25 %	308188645
64440	NC_014562	ATT	2	6	3360188	3360193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308188645
64441	NC_014562	TTA	2	6	3360232	3360237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308188645
64442	NC_014562	GCT	2	6	3360305	3360310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188646
64443	NC_014562	GAT	2	6	3360333	3360338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308188646
64444	NC_014562	CAT	3	9	3360414	3360422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308188646
64445	NC_014562	TGA	2	6	3360467	3360472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308188646
64446	NC_014562	CTG	2	6	3360562	3360567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188646
64447	NC_014562	ACT	2	6	3360676	3360681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308188646
64448	NC_014562	GGC	2	6	3360719	3360724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308188646
64449	NC_014562	AC	3	6	3360733	3360738	50 %	0 %	0 %	50 %	308188646
64450	NC_014562	CAT	2	6	3360780	3360785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308188646
64451	NC_014562	GC	3	6	3360849	3360854	0 %	0 %	50 %	50 %	308188646
64452	NC_014562	CAT	2	6	3360974	3360979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308188646
64453	NC_014562	TGA	2	6	3361024	3361029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308188646
64454	NC_014562	GGGC	2	8	3361066	3361073	0 %	0 %	75 %	25 %	308188646
64455	NC_014562	CTA	2	6	3361091	3361096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308188646
64456	NC_014562	GAT	2	6	3361220	3361225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308188646
64457	NC_014562	T	6	6	3361245	3361250	0 %	100 %	0 %	0 %	308188646
64458	NC_014562	TGA	2	6	3361596	3361601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308188647
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64460	NC_014562	TGA	2	6	3361657	3361662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308188647
64461	NC_014562	CTG	2	6	3361676	3361681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188647
64462	NC_014562	ATC	2	6	3361706	3361711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308188647
64463	NC_014562	CGA	2	6	3361717	3361722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188647
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64472	NC_014562	TCG	2	6	3362107	3362112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188647
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