MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pantoea vagans C9-1 chromosome

Total Repeats: 77202

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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63002	NC_014562	CTT	2	6	3278599	3278604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308188574
63003	NC_014562	CGCCAG	2	12	3278611	3278622	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	308188574
63004	NC_014562	TGA	2	6	3278703	3278708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308188574
63005	NC_014562	CAGG	2	8	3278833	3278840	25 %	0 %	50 %	25 %	308188574
63006	NC_014562	TCT	2	6	3278846	3278851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308188574
63007	NC_014562	GCT	2	6	3278886	3278891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188574
63008	NC_014562	CCG	2	6	3278921	3278926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308188574
63009	NC_014562	CTG	2	6	3278965	3278970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188574
63010	NC_014562	CGG	2	6	3279025	3279030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308188574
63011	NC_014562	GC	3	6	3279125	3279130	0 %	0 %	50 %	50 %	308188574
63012	NC_014562	TCG	2	6	3279195	3279200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188574
63013	NC_014562	CAC	2	6	3279244	3279249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308188574
63014	NC_014562	CG	3	6	3279252	3279257	0 %	0 %	50 %	50 %	308188574
63015	NC_014562	ATC	2	6	3279284	3279289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308188574
63016	NC_014562	TCC	2	6	3279332	3279337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308188574
63017	NC_014562	T	6	6	3279375	3279380	0 %	100 %	0 %	0 %	308188574
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63019	NC_014562	GCA	2	6	3279429	3279434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188574
63020	NC_014562	GC	3	6	3279437	3279442	0 %	0 %	50 %	50 %	308188574
63021	NC_014562	CGC	2	6	3279453	3279458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308188574
63022	NC_014562	CGC	2	6	3279609	3279614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308188575
63023	NC_014562	CTG	2	6	3279627	3279632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188575
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63025	NC_014562	GCC	2	6	3279738	3279743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308188575
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63028	NC_014562	GC	3	6	3279818	3279823	0 %	0 %	50 %	50 %	308188575
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63033	NC_014562	CGCC	2	8	3280025	3280032	0 %	0 %	25 %	75 %	308188575
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63052	NC_014562	GCC	2	6	3280908	3280913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308188575
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63054	NC_014562	CCGC	2	8	3281140	3281147	0 %	0 %	25 %	75 %	308188575
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63062	NC_014562	AG	3	6	3281596	3281601	50 %	0 %	50 %	0 %	308188576
63063	NC_014562	TGA	2	6	3281656	3281661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308188576
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63116	NC_014562	CAT	2	6	3283996	3284001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308188578
63117	NC_014562	GCC	2	6	3284096	3284101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308188578
63118	NC_014562	GAC	2	6	3284121	3284126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188578
63119	NC_014562	CGC	2	6	3284142	3284147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308188578
63120	NC_014562	CAT	2	6	3284148	3284153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308188578
63121	NC_014562	CGT	2	6	3284160	3284165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188578
63122	NC_014562	ATG	2	6	3284174	3284179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308188578
63123	NC_014562	GCC	2	6	3284182	3284187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308188578
63124	NC_014562	GC	3	6	3284217	3284222	0 %	0 %	50 %	50 %	308188578
63125	NC_014562	GCA	2	6	3284862	3284867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188579
63126	NC_014562	GCCT	3	12	3284917	3284928	0 %	25 %	25 %	50 %	308188579
63127	NC_014562	TGG	2	6	3284935	3284940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308188579
63128	NC_014562	AAG	2	6	3284962	3284967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308188579
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63131	NC_014562	GAC	2	6	3285232	3285237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188579
63132	NC_014562	TC	3	6	3285245	3285250	0 %	50 %	0 %	50 %	308188579
63133	NC_014562	ATC	2	6	3285290	3285295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308188579
63134	NC_014562	CTG	2	6	3285391	3285396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188579
63135	NC_014562	ATT	2	6	3285411	3285416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308188579
63136	NC_014562	CGG	2	6	3285451	3285456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308188579
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63139	NC_014562	TC	3	6	3285657	3285662	0 %	50 %	0 %	50 %	308188579
63140	NC_014562	TGG	3	9	3285674	3285682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308188579
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63146	NC_014562	TGG	2	6	3286004	3286009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308188579
63147	NC_014562	GGT	2	6	3286064	3286069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308188579
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63152	NC_014562	CCG	2	6	3286433	3286438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308188580
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63154	NC_014562	CACG	2	8	3286518	3286525	25 %	0 %	25 %	50 %	308188580
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63157	NC_014562	CTT	2	6	3286629	3286634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308188580
63158	NC_014562	TGTT	2	8	3286676	3286683	0 %	75 %	25 %	0 %	308188580
63159	NC_014562	TGC	2	6	3286902	3286907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188581
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63176	NC_014562	CAG	2	6	3287617	3287622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188581
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63179	NC_014562	AATC	2	8	3293850	3293857	50 %	25 %	0 %	25 %	308188582
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63181	NC_014562	GAC	2	6	3293926	3293931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188582
63182	NC_014562	GCTTC	2	10	3294012	3294021	0 %	40 %	20 %	40 %	308188582
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63186	NC_014562	CAC	2	6	3294184	3294189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308188582
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63189	NC_014562	GA	3	6	3294272	3294277	50 %	0 %	50 %	0 %	308188582
63190	NC_014562	ACC	2	6	3294311	3294316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308188582
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63194	NC_014562	TGC	2	6	3294787	3294792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188583
63195	NC_014562	CGG	2	6	3294853	3294858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308188583
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63200	NC_014562	GCT	2	6	3295255	3295260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188583
63201	NC_014562	GTC	2	6	3295296	3295301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188583
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63214	NC_014562	ATCA	2	8	3296039	3296046	50 %	25 %	0 %	25 %	308188583
63215	NC_014562	CTG	2	6	3296093	3296098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188583
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63218	NC_014562	GAC	2	6	3296195	3296200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188583
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63220	NC_014562	ATC	2	6	3296264	3296269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308188583
63221	NC_014562	T	7	7	3296341	3296347	0 %	100 %	0 %	0 %	308188583
63222	NC_014562	AGTC	2	8	3296770	3296777	25 %	25 %	25 %	25 %	308188584
63223	NC_014562	GAT	2	6	3296788	3296793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308188584
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63225	NC_014562	GC	3	6	3296854	3296859	0 %	0 %	50 %	50 %	308188584
63226	NC_014562	ACG	2	6	3296877	3296882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188584
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63228	NC_014562	CAT	2	6	3296899	3296904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308188584
63229	NC_014562	CAG	2	6	3296912	3296917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188584
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63231	NC_014562	CCAG	2	8	3296955	3296962	25 %	0 %	25 %	50 %	308188584
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63347	NC_014562	TCA	3	9	3304106	3304114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308188591
63348	NC_014562	TCT	2	6	3304181	3304186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308188591
63349	NC_014562	GAG	2	6	3304198	3304203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308188591
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63353	NC_014562	CGAT	2	8	3304405	3304412	25 %	25 %	25 %	25 %	308188591
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63461	NC_014562	GCT	2	6	3309991	3309996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188596
63462	NC_014562	GAG	2	6	3310022	3310027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308188596
63463	NC_014562	GCG	2	6	3310107	3310112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308188596
63464	NC_014562	CTG	2	6	3310133	3310138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188596
63465	NC_014562	AGC	2	6	3310161	3310166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188596
63466	NC_014562	GGC	2	6	3310195	3310200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308188596
63467	NC_014562	GTCGCT	2	12	3310207	3310218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188596
63468	NC_014562	CCGA	2	8	3310241	3310248	25 %	0 %	25 %	50 %	308188596
63469	NC_014562	CGT	2	6	3310256	3310261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188596
63470	NC_014562	TGG	2	6	3310368	3310373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308188596
63471	NC_014562	CGA	2	6	3310423	3310428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188596
63472	NC_014562	GTTCA	2	10	3310553	3310562	20 %	40 %	20 %	20 %	308188596
63473	NC_014562	ATGG	2	8	3310567	3310574	25 %	25 %	50 %	0 %	308188596
63474	NC_014562	GCG	2	6	3310734	3310739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308188596
63475	NC_014562	CGC	2	6	3310820	3310825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308188596
63476	NC_014562	ATT	2	6	3310934	3310939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308188596
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63479	NC_014562	CGC	2	6	3311233	3311238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308188596
63480	NC_014562	CTG	3	9	3311288	3311296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188596
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63483	NC_014562	ACG	2	6	3311370	3311375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188596
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63485	NC_014562	TGA	2	6	3311436	3311441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308188596
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63488	NC_014562	GGC	2	6	3311588	3311593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308188596
63489	NC_014562	GC	3	6	3311592	3311597	0 %	0 %	50 %	50 %	308188596
63490	NC_014562	GCG	2	6	3311640	3311645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308188596
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63494	NC_014562	CT	3	6	3311804	3311809	0 %	50 %	0 %	50 %	308188596
63495	NC_014562	TGCG	2	8	3311961	3311968	0 %	25 %	50 %	25 %	308188596
63496	NC_014562	TGC	2	6	3312006	3312011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188596
63497	NC_014562	CTGG	2	8	3312016	3312023	0 %	25 %	50 %	25 %	308188596
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63500	NC_014562	GGC	2	6	3312052	3312057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308188596

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