MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pantoea vagans C9-1 chromosome

Total Repeats: 77202

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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62002	NC_014562	TCG	2	6	3230770	3230775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188531
62003	NC_014562	CATCAC	2	12	3230814	3230825	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	308188531
62004	NC_014562	CAG	2	6	3230826	3230831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188531
62005	NC_014562	GCC	2	6	3230832	3230837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308188531
62006	NC_014562	CCA	2	6	3230852	3230857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308188531
62007	NC_014562	CAG	4	12	3230862	3230873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188531
62008	NC_014562	GCA	2	6	3230909	3230914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188531
62009	NC_014562	CGG	2	6	3231123	3231128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308188532
62010	NC_014562	GA	3	6	3231139	3231144	50 %	0 %	50 %	0 %	308188532
62011	NC_014562	GCCGC	2	10	3231151	3231160	0 %	0 %	40 %	60 %	308188532
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62014	NC_014562	GCA	2	6	3231352	3231357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188532
62015	NC_014562	GC	3	6	3231380	3231385	0 %	0 %	50 %	50 %	308188532
62016	NC_014562	CAG	2	6	3231438	3231443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188532
62017	NC_014562	TGC	2	6	3231521	3231526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188532
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62019	NC_014562	GCCA	2	8	3231556	3231563	25 %	0 %	25 %	50 %	308188532
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62051	NC_014562	CAG	2	6	3232665	3232670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188532
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62061	NC_014562	GTC	2	6	3233076	3233081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188532
62062	NC_014562	CG	3	6	3233166	3233171	0 %	0 %	50 %	50 %	308188532
62063	NC_014562	TCG	2	6	3233215	3233220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188532
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62105	NC_014562	TCGAG	2	10	3234751	3234760	20 %	20 %	40 %	20 %	308188534
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62115	NC_014562	GCC	2	6	3235127	3235132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308188534
62116	NC_014562	GAC	2	6	3235201	3235206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188534
62117	NC_014562	TGC	2	6	3235303	3235308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188534
62118	NC_014562	GCT	2	6	3235336	3235341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188534
62119	NC_014562	CAC	2	6	3235349	3235354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308188534
62120	NC_014562	TGC	2	6	3235357	3235362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188534
62121	NC_014562	TCA	2	6	3235377	3235382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308188534
62122	NC_014562	GCGAG	2	10	3235387	3235396	20 %	0 %	60 %	20 %	308188534
62123	NC_014562	GCG	2	6	3235401	3235406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308188534
62124	NC_014562	GCT	2	6	3235414	3235419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188534
62125	NC_014562	CACATC	2	12	3235502	3235513	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	308188534
62126	NC_014562	CGG	2	6	3235516	3235521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308188534
62127	NC_014562	CAG	2	6	3235598	3235603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188534
62128	NC_014562	GCC	2	6	3235604	3235609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308188534
62129	NC_014562	CAGA	2	8	3235625	3235632	50 %	0 %	25 %	25 %	308188534
62130	NC_014562	CAG	2	6	3235634	3235639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188534
62131	NC_014562	CCA	2	6	3235642	3235647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308188534
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62133	NC_014562	CAG	2	6	3235709	3235714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188534
62134	NC_014562	CAG	2	6	3235736	3235741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188534
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62138	NC_014562	CCAG	2	8	3235849	3235856	25 %	0 %	25 %	50 %	308188534
62139	NC_014562	AG	3	6	3235859	3235864	50 %	0 %	50 %	0 %	308188534
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62144	NC_014562	GCT	2	6	3236123	3236128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188534
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62215	NC_014562	CTC	2	6	3238854	3238859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308188537
62216	NC_014562	CAT	2	6	3238916	3238921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308188537
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62219	NC_014562	ATC	2	6	3238990	3238995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308188537
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62222	NC_014562	CAT	2	6	3239115	3239120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308188537
62223	NC_014562	CTG	2	6	3239187	3239192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188537
62224	NC_014562	A	6	6	3239223	3239228	100 %	0 %	0 %	0 %	308188537
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62230	NC_014562	CAC	2	6	3239734	3239739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308188538
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62232	NC_014562	CTG	2	6	3239842	3239847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188538
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62235	NC_014562	GCA	2	6	3239904	3239909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188538
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62304	NC_014562	GCA	2	6	3243256	3243261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188540
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62314	NC_014562	TGT	2	6	3243893	3243898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308188542
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62317	NC_014562	CACC	2	8	3243938	3243945	25 %	0 %	0 %	75 %	308188542
62318	NC_014562	C	6	6	3243952	3243957	0 %	0 %	0 %	100 %	308188542
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62323	NC_014562	CTG	2	6	3244141	3244146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188542
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62333	NC_014562	GGT	2	6	3244524	3244529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308188542
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62338	NC_014562	CG	3	6	3244632	3244637	0 %	0 %	50 %	50 %	308188542
62339	NC_014562	CTG	2	6	3244726	3244731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188542
62340	NC_014562	GGT	2	6	3244854	3244859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308188542
62341	NC_014562	AGC	2	6	3244949	3244954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188542
62342	NC_014562	CTG	3	9	3245110	3245118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188542
62343	NC_014562	CGA	2	6	3245154	3245159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188542
62344	NC_014562	CGT	2	6	3245172	3245177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188542
62345	NC_014562	GCT	2	6	3245229	3245234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188542
62346	NC_014562	CCGCGC	2	12	3245310	3245321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308188542
62347	NC_014562	GCT	2	6	3245337	3245342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188542
62348	NC_014562	GCG	2	6	3245390	3245395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308188542
62349	NC_014562	GTCAGC	2	12	3245411	3245422	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	308188542
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62353	NC_014562	GCT	2	6	3245652	3245657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188542
62354	NC_014562	GCA	2	6	3245688	3245693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188542
62355	NC_014562	CGG	2	6	3245700	3245705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308188542
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62358	NC_014562	GCA	2	6	3245831	3245836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188543
62359	NC_014562	ATCC	2	8	3245940	3245947	25 %	25 %	0 %	50 %	308188543
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62368	NC_014562	GC	3	6	3246431	3246436	0 %	0 %	50 %	50 %	308188543
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62446	NC_014562	TCGCCA	2	12	3249728	3249739	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	308188547
62447	NC_014562	CGG	2	6	3249767	3249772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308188547
62448	NC_014562	CA	3	6	3249779	3249784	50 %	0 %	0 %	50 %	308188547
62449	NC_014562	CGG	2	6	3249806	3249811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308188547
62450	NC_014562	GC	3	6	3249845	3249850	0 %	0 %	50 %	50 %	308188547
62451	NC_014562	ACC	2	6	3249868	3249873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308188547
62452	NC_014562	CATA	2	8	3249959	3249966	50 %	25 %	0 %	25 %	308188547
62453	NC_014562	TGT	2	6	3249974	3249979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308188547
62454	NC_014562	GC	3	6	3249981	3249986	0 %	0 %	50 %	50 %	308188547
62455	NC_014562	TCA	3	9	3250012	3250020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308188547
62456	NC_014562	GCA	2	6	3250163	3250168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188547
62457	NC_014562	CGC	2	6	3250290	3250295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308188547
62458	NC_014562	AAC	2	6	3250324	3250329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308188547
62459	NC_014562	AAGG	2	8	3250338	3250345	50 %	0 %	50 %	0 %	308188547
62460	NC_014562	CAG	2	6	3250487	3250492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188548
62461	NC_014562	CAG	2	6	3250523	3250528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188548
62462	NC_014562	GC	3	6	3250549	3250554	0 %	0 %	50 %	50 %	308188548
62463	NC_014562	GTC	2	6	3250623	3250628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188548
62464	NC_014562	CGC	2	6	3250633	3250638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308188548
62465	NC_014562	CCG	2	6	3250710	3250715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308188548
62466	NC_014562	CCG	2	6	3250725	3250730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308188548
62467	NC_014562	CAG	2	6	3250742	3250747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188548
62468	NC_014562	GGC	2	6	3250755	3250760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308188548
62469	NC_014562	CAGC	2	8	3250796	3250803	25 %	0 %	25 %	50 %	308188548
62470	NC_014562	GCC	2	6	3250823	3250828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308188548
62471	NC_014562	CAC	2	6	3250832	3250837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308188548
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62474	NC_014562	GCA	2	6	3251199	3251204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188550
62475	NC_014562	CTG	2	6	3251206	3251211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308188550
62476	NC_014562	CGG	2	6	3251297	3251302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308188550
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62479	NC_014562	ATT	2	6	3251527	3251532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308188550
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62481	NC_014562	CGC	2	6	3251637	3251642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308188550
62482	NC_014562	GCG	2	6	3251714	3251719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308188550
62483	NC_014562	GTGGC	2	10	3251833	3251842	0 %	20 %	60 %	20 %	308188550
62484	NC_014562	GC	3	6	3251933	3251938	0 %	0 %	50 %	50 %	308188550
62485	NC_014562	CTT	2	6	3252021	3252026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308188550
62486	NC_014562	GTT	2	6	3252094	3252099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308188551
62487	NC_014562	CAT	2	6	3252157	3252162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308188551
62488	NC_014562	GC	3	6	3252167	3252172	0 %	0 %	50 %	50 %	308188551
62489	NC_014562	ACGC	2	8	3252192	3252199	25 %	0 %	25 %	50 %	308188551
62490	NC_014562	T	6	6	3252253	3252258	0 %	100 %	0 %	0 %	308188551
62491	NC_014562	GCC	2	6	3252319	3252324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308188551
62492	NC_014562	CGC	2	6	3252355	3252360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308188551
62493	NC_014562	CCA	2	6	3252401	3252406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308188551
62494	NC_014562	TCA	2	6	3252437	3252442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308188551
62495	NC_014562	GCC	2	6	3252455	3252460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308188551
62496	NC_014562	CGA	2	6	3252488	3252493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308188551
62497	NC_014562	ACC	3	9	3252512	3252520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308188551
62498	NC_014562	CAC	2	6	3252525	3252530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308188551
62499	NC_014562	GGC	3	9	3252532	3252540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308188551
62500	NC_014562	GGC	2	6	3252544	3252549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308188551

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