MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Pantoea vagans C9-1 plasmid pPag1

Total Repeats: 2928

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_014561	CTT	2	6	142407	142412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308185513
2502	NC_014561	CGC	2	6	142474	142479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185513
2503	NC_014561	CACG	2	8	142491	142498	25 %	0 %	25 %	50 %	308185513
2504	NC_014561	CTGC	2	8	143041	143048	0 %	25 %	25 %	50 %	308185514
2505	NC_014561	CTG	2	6	143061	143066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185514
2506	NC_014561	CTG	2	6	143082	143087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185514
2507	NC_014561	TGCTC	2	10	143138	143147	0 %	40 %	20 %	40 %	308185514
2508	NC_014561	CGC	2	6	143186	143191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185514
2509	NC_014561	GCA	2	6	143201	143206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185514
2510	NC_014561	CT	3	6	143230	143235	0 %	50 %	0 %	50 %	308185514
2511	NC_014561	GCC	2	6	143236	143241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185514
2512	NC_014561	CAT	2	6	143249	143254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185514
2513	NC_014561	TC	3	6	143291	143296	0 %	50 %	0 %	50 %	308185514
2514	NC_014561	GCA	2	6	143305	143310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185514
2515	NC_014561	ACC	2	6	143344	143349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308185514
2516	NC_014561	CG	3	6	143377	143382	0 %	0 %	50 %	50 %	308185514
2517	NC_014561	CGG	2	6	143390	143395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185514
2518	NC_014561	TGG	2	6	143438	143443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185514
2519	NC_014561	GTG	2	6	143539	143544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185514
2520	NC_014561	GGC	2	6	143547	143552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185514
2521	NC_014561	TCC	2	6	143608	143613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308185514
2522	NC_014561	CAGCG	2	10	143634	143643	20 %	0 %	40 %	40 %	308185514
2523	NC_014561	GA	3	6	143665	143670	50 %	0 %	50 %	0 %	308185514
2524	NC_014561	GAA	2	6	143708	143713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308185514
2525	NC_014561	TGC	2	6	143758	143763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185514
2526	NC_014561	AATT	2	8	143844	143851	50 %	50 %	0 %	0 %	308185515
2527	NC_014561	TACC	2	8	143871	143878	25 %	25 %	0 %	50 %	308185515
2528	NC_014561	CAG	2	6	143917	143922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185515
2529	NC_014561	CAG	2	6	143938	143943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185515
2530	NC_014561	GCC	2	6	143945	143950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185515
2531	NC_014561	AGC	2	6	143989	143994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185515
2532	NC_014561	GCT	2	6	144009	144014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185515
2533	NC_014561	CG	3	6	144034	144039	0 %	0 %	50 %	50 %	308185515
2534	NC_014561	TGC	2	6	144076	144081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185515
2535	NC_014561	GCT	2	6	144189	144194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185515
2536	NC_014561	CTG	2	6	144248	144253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185515
2537	NC_014561	TGAG	2	8	144330	144337	25 %	25 %	50 %	0 %	308185515
2538	NC_014561	GGA	2	6	144680	144685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308185516
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2540	NC_014561	ACG	2	6	144754	144759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185517
2541	NC_014561	GCCA	2	8	144798	144805	25 %	0 %	25 %	50 %	308185517
2542	NC_014561	GAT	2	6	144843	144848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185517
2543	NC_014561	GCA	2	6	144854	144859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185517
2544	NC_014561	GACAGT	2	12	144930	144941	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	308185517
2545	NC_014561	GTG	2	6	144948	144953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185517
2546	NC_014561	CTG	2	6	144963	144968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185517
2547	NC_014561	TGC	2	6	144980	144985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185517
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2549	NC_014561	GGCT	2	8	145175	145182	0 %	25 %	50 %	25 %	308185517
2550	NC_014561	GCC	2	6	145245	145250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185517
2551	NC_014561	CCACG	2	10	145261	145270	20 %	0 %	20 %	60 %	308185517
2552	NC_014561	GC	3	6	145320	145325	0 %	0 %	50 %	50 %	308185517
2553	NC_014561	CTG	2	6	145353	145358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185517
2554	NC_014561	CTG	2	6	145374	145379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185517
2555	NC_014561	CTGCGT	2	12	145383	145394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185517
2556	NC_014561	CTG	2	6	145443	145448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185517
2557	NC_014561	GCTG	2	8	145493	145500	0 %	25 %	50 %	25 %	308185517
2558	NC_014561	TGA	2	6	145540	145545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185517
2559	NC_014561	GCA	2	6	145817	145822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185517
2560	NC_014561	GCG	2	6	145831	145836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185517
2561	NC_014561	CAG	3	9	145979	145987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185517
2562	NC_014561	TGA	2	6	146012	146017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185517
2563	NC_014561	GAA	2	6	146022	146027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308185517
2564	NC_014561	GCT	2	6	146057	146062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185517
2565	NC_014561	ACGGA	2	10	146082	146091	40 %	0 %	40 %	20 %	308185517
2566	NC_014561	GCG	2	6	146198	146203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185517
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2569	NC_014561	GCTG	2	8	146324	146331	0 %	25 %	50 %	25 %	308185517
2570	NC_014561	T	6	6	146396	146401	0 %	100 %	0 %	0 %	308185517
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2573	NC_014561	ATCGCG	2	12	146607	146618	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	308185518
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2581	NC_014561	GCA	2	6	146813	146818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185518
2582	NC_014561	CGC	2	6	146820	146825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185518
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2584	NC_014561	CTGC	2	8	146930	146937	0 %	25 %	25 %	50 %	308185518
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2591	NC_014561	GCA	2	6	147251	147256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185518
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2594	NC_014561	CGA	2	6	147428	147433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185518
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2602	NC_014561	ACC	4	12	147766	147777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308185518
2603	NC_014561	GTC	2	6	147889	147894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185518
2604	NC_014561	GGT	2	6	147906	147911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185518
2605	NC_014561	CAG	3	9	147981	147989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185518
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2607	NC_014561	CAG	2	6	148044	148049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185518
2608	NC_014561	CGAA	2	8	148050	148057	50 %	0 %	25 %	25 %	308185518
2609	NC_014561	T	6	6	148064	148069	0 %	100 %	0 %	0 %	308185518
2610	NC_014561	CAGG	2	8	148202	148209	25 %	0 %	50 %	25 %	308185519
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2621	NC_014561	T	7	7	148907	148913	0 %	100 %	0 %	0 %	308185521
2622	NC_014561	CAA	2	6	148917	148922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308185521
2623	NC_014561	ATA	2	6	148933	148938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308185521
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2652	NC_014561	GCT	2	6	150125	150130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185525
2653	NC_014561	T	6	6	150185	150190	0 %	100 %	0 %	0 %	308185525
2654	NC_014561	TGC	2	6	150206	150211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185525
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2742	NC_014561	GTCA	2	8	154959	154966	25 %	25 %	25 %	25 %	308185530
2743	NC_014561	CAA	2	6	154979	154984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308185530
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2746	NC_014561	TCG	2	6	155047	155052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185530
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2750	NC_014561	TAC	2	6	155145	155150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185530
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2754	NC_014561	GC	3	6	155445	155450	0 %	0 %	50 %	50 %	308185531
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2760	NC_014561	CGG	2	6	155562	155567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185531
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2765	NC_014561	GCT	2	6	155800	155805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185531
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2842	NC_014561	CTG	3	9	159551	159559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185533
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2850	NC_014561	T	7	7	159778	159784	0 %	100 %	0 %	0 %	308185533
2851	NC_014561	GAT	2	6	159933	159938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185534
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2855	NC_014561	TGG	2	6	160158	160163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185534
2856	NC_014561	GGC	2	6	160238	160243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185534
2857	NC_014561	GCT	2	6	160263	160268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185534
2858	NC_014561	AG	3	6	160304	160309	50 %	0 %	50 %	0 %	308185534
2859	NC_014561	CAC	2	6	160313	160318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308185534
2860	NC_014561	CGT	2	6	160336	160341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185534
2861	NC_014561	CAC	2	6	160343	160348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308185534
2862	NC_014561	GGA	2	6	160354	160359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308185534
2863	NC_014561	GCC	2	6	160412	160417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185534
2864	NC_014561	CG	3	6	160421	160426	0 %	0 %	50 %	50 %	308185534
2865	NC_014561	CCG	2	6	160468	160473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185534
2866	NC_014561	CAG	2	6	160488	160493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185534
2867	NC_014561	TAAAGG	2	12	160567	160578	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	308185534
2868	NC_014561	ACC	2	6	160605	160610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308185534
2869	NC_014561	TTC	2	6	160664	160669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308185534
2870	NC_014561	ATT	2	6	161047	161052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308185535
2871	NC_014561	AG	3	6	161060	161065	50 %	0 %	50 %	0 %	308185535
2872	NC_014561	TCTG	2	8	161068	161075	0 %	50 %	25 %	25 %	308185535
2873	NC_014561	GAC	2	6	161113	161118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185535
2874	NC_014561	TCA	2	6	161145	161150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185535
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2877	NC_014561	T	7	7	161231	161237	0 %	100 %	0 %	0 %	308185535
2878	NC_014561	GAC	2	6	161242	161247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185535
2879	NC_014561	GC	3	6	161248	161253	0 %	0 %	50 %	50 %	308185535
2880	NC_014561	CTT	2	6	161279	161284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308185535
2881	NC_014561	CAT	2	6	161311	161316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185535
2882	NC_014561	CCT	2	6	161380	161385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308185535
2883	NC_014561	AGC	2	6	161397	161402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185535
2884	NC_014561	TCAT	2	8	161550	161557	25 %	50 %	0 %	25 %	308185535
2885	NC_014561	CAG	2	6	161614	161619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185535
2886	NC_014561	CCAT	2	8	161715	161722	25 %	25 %	0 %	50 %	308185535
2887	NC_014561	TGC	2	6	161769	161774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185535
2888	NC_014561	GCT	3	9	161945	161953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185535
2889	NC_014561	AT	3	6	162032	162037	50 %	50 %	0 %	0 %	308185536
2890	NC_014561	TGG	2	6	162363	162368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185536
2891	NC_014561	CGG	2	6	162388	162393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185536
2892	NC_014561	CAG	2	6	162403	162408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185536
2893	NC_014561	TTC	2	6	162562	162567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308185536
2894	NC_014561	TCG	2	6	162590	162595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185536
2895	NC_014561	TAA	2	6	162639	162644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308185536
2896	NC_014561	GCT	2	6	162692	162697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185536
2897	NC_014561	GCA	2	6	162795	162800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185536
2898	NC_014561	GC	3	6	162812	162817	0 %	0 %	50 %	50 %	308185536
2899	NC_014561	ACA	2	6	162875	162880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308185536
2900	NC_014561	CAT	2	6	162897	162902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185536
2901	NC_014561	CGA	2	6	162945	162950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185536
2902	NC_014561	CTG	2	6	163014	163019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185536
2903	NC_014561	CGA	2	6	163041	163046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185536
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2905	NC_014561	GCT	3	9	163131	163139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185536
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2911	NC_014561	AAGAA	2	10	165581	165590	80 %	0 %	20 %	0 %	308185539
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2913	NC_014561	TAA	2	6	165671	165676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308185539
2914	NC_014561	TTGT	2	8	165711	165718	0 %	75 %	25 %	0 %	308185539
2915	NC_014561	GC	3	6	165738	165743	0 %	0 %	50 %	50 %	308185539
2916	NC_014561	GATG	2	8	165767	165774	25 %	25 %	50 %	0 %	308185539
2917	NC_014561	ACA	2	6	165823	165828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308185539
2918	NC_014561	TGGATA	2	12	165850	165861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185539
2919	NC_014561	TCGT	2	8	165936	165943	0 %	50 %	25 %	25 %	308185539
2920	NC_014561	GC	3	6	165975	165980	0 %	0 %	50 %	50 %	308185539
2921	NC_014561	GA	3	6	166063	166068	50 %	0 %	50 %	0 %	308185539
2922	NC_014561	CTG	2	6	166179	166184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185539
2923	NC_014561	CG	3	6	166315	166320	0 %	0 %	50 %	50 %	308185539
2924	NC_014561	CGC	2	6	166398	166403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185539
2925	NC_014561	GAT	2	6	166488	166493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185539
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2927	NC_014561	GGTG	2	8	166559	166566	0 %	25 %	75 %	0 %	308185539
2928	NC_014561	ATC	2	6	167660	167665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185540

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