MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Pantoea vagans C9-1 plasmid pPag1

Total Repeats: 2928

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_014561	GCC	2	6	118390	118395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185492
2002	NC_014561	CTG	2	6	118413	118418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185492
2003	NC_014561	TC	3	6	118466	118471	0 %	50 %	0 %	50 %	308185492
2004	NC_014561	GGCT	2	8	118494	118501	0 %	25 %	50 %	25 %	308185492
2005	NC_014561	AGA	2	6	118514	118519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308185492
2006	NC_014561	GTC	2	6	118527	118532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185492
2007	NC_014561	CTG	2	6	118557	118562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185492
2008	NC_014561	CAT	2	6	118601	118606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185492
2009	NC_014561	TGCGC	2	10	118616	118625	0 %	20 %	40 %	40 %	308185492
2010	NC_014561	CGC	2	6	118628	118633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185492
2011	NC_014561	TGG	2	6	118637	118642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185492
2012	NC_014561	GCCA	2	8	118659	118666	25 %	0 %	25 %	50 %	308185492
2013	NC_014561	CTC	2	6	118763	118768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308185492
2014	NC_014561	CGG	2	6	118784	118789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185492
2015	NC_014561	GGGCTG	2	12	118794	118805	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	308185492
2016	NC_014561	CGG	2	6	118835	118840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185492
2017	NC_014561	CACGC	2	10	118848	118857	20 %	0 %	20 %	60 %	308185492
2018	NC_014561	TGCC	2	8	118858	118865	0 %	25 %	25 %	50 %	308185492
2019	NC_014561	CGG	2	6	118868	118873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185492
2020	NC_014561	CTG	2	6	118875	118880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185492
2021	NC_014561	CTT	2	6	119009	119014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308185493
2022	NC_014561	TGC	2	6	119021	119026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185493
2023	NC_014561	TGC	2	6	119083	119088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185493
2024	NC_014561	TCA	2	6	119098	119103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185493
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2026	NC_014561	TGC	2	6	119126	119131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185493
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2034	NC_014561	CGC	2	6	119387	119392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185493
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2038	NC_014561	GC	3	6	119494	119499	0 %	0 %	50 %	50 %	308185493
2039	NC_014561	CCG	2	6	119504	119509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185493
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2044	NC_014561	TGA	2	6	119641	119646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185493
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2051	NC_014561	GCT	2	6	119957	119962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185493
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2062	NC_014561	A	7	7	120485	120491	100 %	0 %	0 %	0 %	308185494
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2118	NC_014561	CGC	2	6	122617	122622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185494
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2120	NC_014561	CTGC	2	8	122636	122643	0 %	25 %	25 %	50 %	308185494
2121	NC_014561	GAA	2	6	122657	122662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308185494
2122	NC_014561	CTG	2	6	122711	122716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185494
2123	NC_014561	CTG	2	6	122744	122749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185494
2124	NC_014561	CTT	2	6	122767	122772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308185494
2125	NC_014561	TGC	2	6	122778	122783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185494
2126	NC_014561	TGC	2	6	122832	122837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185494
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2241	NC_014561	ATG	2	6	128245	128250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185500
2242	NC_014561	TCG	2	6	128293	128298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185500
2243	NC_014561	CTG	2	6	128301	128306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185500
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2247	NC_014561	CTG	2	6	128751	128756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185500
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2352	NC_014561	CCGGG	2	10	134275	134284	0 %	0 %	60 %	40 %	308185505
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2356	NC_014561	AGC	2	6	134385	134390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185505
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2358	NC_014561	AGC	2	6	134508	134513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185505
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2360	NC_014561	GCC	2	6	134616	134621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185505
2361	NC_014561	GGCA	2	8	134624	134631	25 %	0 %	50 %	25 %	308185505
2362	NC_014561	TGA	3	9	134636	134644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185505
2363	NC_014561	CTCA	2	8	134693	134700	25 %	25 %	0 %	50 %	308185505
2364	NC_014561	AC	3	6	134765	134770	50 %	0 %	0 %	50 %	308185505
2365	NC_014561	CGTGAC	2	12	134780	134791	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	308185505
2366	NC_014561	GC	3	6	134795	134800	0 %	0 %	50 %	50 %	308185505
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2368	NC_014561	CGT	2	6	134813	134818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185505
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2464	NC_014561	CAGC	2	8	140444	140451	25 %	0 %	25 %	50 %	308185511
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2479	NC_014561	AG	3	6	141327	141332	50 %	0 %	50 %	0 %	308185511
2480	NC_014561	GGC	2	6	141337	141342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185511
2481	NC_014561	GCCGC	2	10	141361	141370	0 %	0 %	40 %	60 %	308185511
2482	NC_014561	GCT	2	6	141423	141428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185511
2483	NC_014561	GCA	2	6	141485	141490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185511
2484	NC_014561	CG	3	6	141531	141536	0 %	0 %	50 %	50 %	308185511
2485	NC_014561	TGA	2	6	141569	141574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185511
2486	NC_014561	TGG	2	6	141707	141712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185511
2487	NC_014561	TCA	2	6	141782	141787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185511
2488	NC_014561	GCA	2	6	141827	141832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185511
2489	NC_014561	CGG	2	6	141862	141867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185511
2490	NC_014561	GAT	2	6	141879	141884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185512
2491	NC_014561	GCC	2	6	141908	141913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185512
2492	NC_014561	CAT	2	6	141918	141923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185512
2493	NC_014561	CTG	2	6	141965	141970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185512
2494	NC_014561	GCA	2	6	141984	141989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185512
2495	NC_014561	GAA	2	6	142048	142053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308185512
2496	NC_014561	GCA	2	6	142073	142078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185512
2497	NC_014561	ATA	2	6	142101	142106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308185512
2498	NC_014561	CAG	2	6	142351	142356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185513
2499	NC_014561	CAG	2	6	142360	142365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185513
2500	NC_014561	AGC	2	6	142385	142390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185513

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