MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Pantoea vagans C9-1 plasmid pPag1

Total Repeats: 2928

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014561	GGC	2	6	88604	88609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185462
1502	NC_014561	ATGG	2	8	88628	88635	25 %	25 %	50 %	0 %	308185462
1503	NC_014561	GAT	2	6	88724	88729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185462
1504	NC_014561	ATCT	2	8	88736	88743	25 %	50 %	0 %	25 %	308185462
1505	NC_014561	AAT	2	6	88919	88924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308185462
1506	NC_014561	TCA	2	6	88946	88951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185462
1507	NC_014561	GAA	2	6	88978	88983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308185462
1508	NC_014561	TCA	2	6	89047	89052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185462
1509	NC_014561	TC	3	6	89095	89100	0 %	50 %	0 %	50 %	308185462
1510	NC_014561	GAT	2	6	89113	89118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185462
1511	NC_014561	AAC	2	6	89159	89164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308185462
1512	NC_014561	TGC	2	6	89218	89223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185462
1513	NC_014561	TC	3	6	89251	89256	0 %	50 %	0 %	50 %	308185462
1514	NC_014561	TAA	2	6	89396	89401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308185462
1515	NC_014561	GAA	2	6	89443	89448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308185463
1516	NC_014561	GAT	2	6	89458	89463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185463
1517	NC_014561	TCA	2	6	89472	89477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185463
1518	NC_014561	AGG	2	6	89502	89507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308185463
1519	NC_014561	CGA	2	6	89536	89541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185463
1520	NC_014561	GAT	3	9	89582	89590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185463
1521	NC_014561	ACT	2	6	89592	89597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185463
1522	NC_014561	GAT	5	15	89639	89653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185463
1523	NC_014561	GAT	2	6	89702	89707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185463
1524	NC_014561	CTT	2	6	91104	91109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308185464
1525	NC_014561	TCA	2	6	91156	91161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185464
1526	NC_014561	TCA	2	6	91193	91198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185464
1527	NC_014561	AGAA	2	8	91215	91222	75 %	0 %	25 %	0 %	308185464
1528	NC_014561	AGG	2	6	91326	91331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308185464
1529	NC_014561	ACA	2	6	91357	91362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308185464
1530	NC_014561	CAG	2	6	91410	91415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185464
1531	NC_014561	GAT	2	6	91466	91471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185464
1532	NC_014561	ACG	2	6	91473	91478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185464
1533	NC_014561	GAT	2	6	91536	91541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185464
1534	NC_014561	ATA	2	6	91570	91575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308185464
1535	NC_014561	GA	3	6	92610	92615	50 %	0 %	50 %	0 %	308185465
1536	NC_014561	T	7	7	92655	92661	0 %	100 %	0 %	0 %	308185465
1537	NC_014561	GCG	2	6	92732	92737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185465
1538	NC_014561	GCGG	2	8	92743	92750	0 %	0 %	75 %	25 %	308185465
1539	NC_014561	TAT	2	6	92766	92771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308185465
1540	NC_014561	AAC	2	6	92853	92858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308185465
1541	NC_014561	AAT	2	6	92872	92877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308185465
1542	NC_014561	TTG	2	6	92879	92884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308185465
1543	NC_014561	AAT	2	6	92931	92936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308185466
1544	NC_014561	GGC	2	6	92974	92979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185466
1545	NC_014561	A	6	6	93035	93040	100 %	0 %	0 %	0 %	308185466
1546	NC_014561	TGC	2	6	93120	93125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185466
1547	NC_014561	CTG	2	6	93142	93147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185466
1548	NC_014561	CTG	3	9	93291	93299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185467
1549	NC_014561	GCA	2	6	93318	93323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185467
1550	NC_014561	CGG	2	6	93392	93397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185467
1551	NC_014561	AGC	2	6	93431	93436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185467
1552	NC_014561	CAA	2	6	93508	93513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308185467
1553	NC_014561	CTG	2	6	93609	93614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185467
1554	NC_014561	GCAG	2	8	93639	93646	25 %	0 %	50 %	25 %	308185467
1555	NC_014561	CAG	2	6	93685	93690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185467
1556	NC_014561	CTCAG	2	10	93710	93719	20 %	20 %	20 %	40 %	308185467
1557	NC_014561	CTG	3	9	93730	93738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185467
1558	NC_014561	TCAA	2	8	93774	93781	50 %	25 %	0 %	25 %	308185467
1559	NC_014561	A	10	10	93856	93865	100 %	0 %	0 %	0 %	308185468
1560	NC_014561	TGCT	2	8	93886	93893	0 %	50 %	25 %	25 %	308185468
1561	NC_014561	TAT	2	6	93933	93938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308185468
1562	NC_014561	ATC	2	6	94004	94009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185468
1563	NC_014561	ATAAA	2	10	94061	94070	80 %	20 %	0 %	0 %	308185468
1564	NC_014561	TTA	2	6	94084	94089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308185468
1565	NC_014561	CCT	2	6	94204	94209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308185468
1566	NC_014561	AACCAG	2	12	94228	94239	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	308185468
1567	NC_014561	T	6	6	94271	94276	0 %	100 %	0 %	0 %	308185468
1568	NC_014561	CAAC	2	8	94367	94374	50 %	0 %	0 %	50 %	308185468
1569	NC_014561	AGA	2	6	94413	94418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308185468
1570	NC_014561	ACA	2	6	94519	94524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308185468
1571	NC_014561	GAC	2	6	94543	94548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185468
1572	NC_014561	GCA	2	6	94555	94560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185468
1573	NC_014561	ATG	3	9	94614	94622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185469
1574	NC_014561	T	6	6	94635	94640	0 %	100 %	0 %	0 %	308185469
1575	NC_014561	T	6	6	94660	94665	0 %	100 %	0 %	0 %	308185469
1576	NC_014561	T	6	6	94673	94678	0 %	100 %	0 %	0 %	308185469
1577	NC_014561	GCA	2	6	94695	94700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185469
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1580	NC_014561	CTG	2	6	95085	95090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185469
1581	NC_014561	ACG	2	6	95185	95190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185469
1582	NC_014561	ATG	2	6	95260	95265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185469
1583	NC_014561	TCA	2	6	95303	95308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185469
1584	NC_014561	GTG	2	6	95389	95394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185469
1585	NC_014561	ACA	2	6	95550	95555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308185469
1586	NC_014561	CTACC	2	10	95588	95597	20 %	20 %	0 %	60 %	308185469
1587	NC_014561	GGT	2	6	95604	95609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185469
1588	NC_014561	AAG	2	6	95629	95634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308185469
1589	NC_014561	GT	3	6	95725	95730	0 %	50 %	50 %	0 %	308185469
1590	NC_014561	ACA	2	6	95740	95745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308185469
1591	NC_014561	TC	3	6	95887	95892	0 %	50 %	0 %	50 %	308185469
1592	NC_014561	CTAC	2	8	95956	95963	25 %	25 %	0 %	50 %	308185469
1593	NC_014561	A	6	6	95967	95972	100 %	0 %	0 %	0 %	308185469
1594	NC_014561	TCA	2	6	96021	96026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185469
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1596	NC_014561	TAT	2	6	96066	96071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308185469
1597	NC_014561	TC	3	6	96101	96106	0 %	50 %	0 %	50 %	308185469
1598	NC_014561	AAC	2	6	96115	96120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308185469
1599	NC_014561	ACTG	2	8	96128	96135	25 %	25 %	25 %	25 %	308185469
1600	NC_014561	ATCT	2	8	96168	96175	25 %	50 %	0 %	25 %	308185469
1601	NC_014561	ATA	3	9	96238	96246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308185469
1602	NC_014561	ATT	2	6	96284	96289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308185469
1603	NC_014561	CA	3	6	96380	96385	50 %	0 %	0 %	50 %	308185469
1604	NC_014561	TAA	2	6	96386	96391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308185469
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1606	NC_014561	ATA	2	6	96481	96486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308185469
1607	NC_014561	A	6	6	96486	96491	100 %	0 %	0 %	0 %	308185469
1608	NC_014561	TAT	2	6	96564	96569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308185469
1609	NC_014561	CAG	2	6	96577	96582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185469
1610	NC_014561	TTGCC	2	10	96601	96610	0 %	40 %	20 %	40 %	308185469
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1618	NC_014561	CAT	2	6	97211	97216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185470
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1620	NC_014561	CAG	2	6	97399	97404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185470
1621	NC_014561	ACGGC	2	10	97432	97441	20 %	0 %	40 %	40 %	308185470
1622	NC_014561	GCA	2	6	97475	97480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185470
1623	NC_014561	TA	3	6	97561	97566	50 %	50 %	0 %	0 %	308185470
1624	NC_014561	GA	3	6	97579	97584	50 %	0 %	50 %	0 %	308185470
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1750	NC_014561	GTT	2	6	104223	104228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308185475
1751	NC_014561	CCG	2	6	104395	104400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185476
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1753	NC_014561	TTA	2	6	104563	104568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308185476
1754	NC_014561	CATT	2	8	104630	104637	25 %	50 %	0 %	25 %	308185476
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1763	NC_014561	CGT	2	6	104988	104993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185477
1764	NC_014561	GATT	2	8	105006	105013	25 %	50 %	25 %	0 %	308185477
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1770	NC_014561	GAT	2	6	105267	105272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185477
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1772	NC_014561	CTGG	2	8	105287	105294	0 %	25 %	50 %	25 %	308185477
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1776	NC_014561	ACTCAG	2	12	105596	105607	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	308185477
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1780	NC_014561	CTG	2	6	106043	106048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185479
1781	NC_014561	TCA	2	6	106134	106139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185479
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1789	NC_014561	CTG	2	6	106571	106576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185479
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1822	NC_014561	TAGCAA	2	12	108421	108432	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	308185481
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1841	NC_014561	GTG	2	6	109820	109825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185483
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1863	NC_014561	GC	3	6	110959	110964	0 %	0 %	50 %	50 %	308185483
1864	NC_014561	ACA	2	6	111024	111029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308185483
1865	NC_014561	TCAA	2	8	111033	111040	50 %	25 %	0 %	25 %	308185483
1866	NC_014561	CG	3	6	111258	111263	0 %	0 %	50 %	50 %	308185484
1867	NC_014561	GCA	2	6	111310	111315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185484
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1870	NC_014561	GAT	2	6	111451	111456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185484
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1874	NC_014561	T	6	6	111554	111559	0 %	100 %	0 %	0 %	308185484
1875	NC_014561	CG	3	6	111597	111602	0 %	0 %	50 %	50 %	308185484
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1879	NC_014561	TGAGGC	2	12	111784	111795	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	308185484
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1990	NC_014561	TGA	2	6	118054	118059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185492
1991	NC_014561	CAGC	2	8	118097	118104	25 %	0 %	25 %	50 %	308185492
1992	NC_014561	CGG	2	6	118111	118116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185492
1993	NC_014561	CGG	3	9	118150	118158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185492
1994	NC_014561	AAG	2	6	118165	118170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308185492
1995	NC_014561	ACA	2	6	118217	118222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308185492
1996	NC_014561	GC	3	6	118227	118232	0 %	0 %	50 %	50 %	308185492
1997	NC_014561	CAG	2	6	118294	118299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185492
1998	NC_014561	GCC	2	6	118306	118311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185492
1999	NC_014561	GCA	2	6	118349	118354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185492
2000	NC_014561	GAT	2	6	118361	118366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185492

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