MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pantoea vagans C9-1 plasmid pPag1

Total Repeats: 2928

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014561	CGCC	2	8	58388	58395	0 %	0 %	25 %	75 %	308185436
1002	NC_014561	CGG	2	6	58463	58468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185436
1003	NC_014561	GCG	3	9	58495	58503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185436
1004	NC_014561	GCC	3	9	58540	58548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185436
1005	NC_014561	AG	3	6	58599	58604	50 %	0 %	50 %	0 %	308185436
1006	NC_014561	ACC	2	6	58636	58641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308185436
1007	NC_014561	AGC	2	6	58719	58724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185436
1008	NC_014561	GCC	2	6	58734	58739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185436
1009	NC_014561	CGG	2	6	58770	58775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185436
1010	NC_014561	CAG	2	6	58839	58844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185436
1011	NC_014561	CAC	2	6	58934	58939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308185436
1012	NC_014561	GCC	2	6	58965	58970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185436
1013	NC_014561	GA	3	6	58972	58977	50 %	0 %	50 %	0 %	308185436
1014	NC_014561	CGC	2	6	58989	58994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185436
1015	NC_014561	CGC	2	6	59001	59006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185436
1016	NC_014561	AC	3	6	59126	59131	50 %	0 %	0 %	50 %	308185436
1017	NC_014561	GTA	2	6	59133	59138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185436
1018	NC_014561	GCC	2	6	59152	59157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185436
1019	NC_014561	CTG	2	6	59166	59171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185436
1020	NC_014561	GCC	2	6	59196	59201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185436
1021	NC_014561	GGT	2	6	59205	59210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185436
1022	NC_014561	AGA	2	6	59249	59254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308185436
1023	NC_014561	CG	3	6	59597	59602	0 %	0 %	50 %	50 %	308185437
1024	NC_014561	ATC	2	6	59653	59658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185437
1025	NC_014561	ACCGGC	2	12	59665	59676	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	308185437
1026	NC_014561	GC	3	6	59689	59694	0 %	0 %	50 %	50 %	308185437
1027	NC_014561	CAC	2	6	59704	59709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308185437
1028	NC_014561	GCG	2	6	59747	59752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185437
1029	NC_014561	ACAGG	2	10	59817	59826	40 %	0 %	40 %	20 %	308185437
1030	NC_014561	GGC	2	6	59844	59849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185437
1031	NC_014561	GCT	3	9	59862	59870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185437
1032	NC_014561	GCT	2	6	59910	59915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185437
1033	NC_014561	TGC	2	6	59921	59926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185437
1034	NC_014561	CTA	2	6	60048	60053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185437
1035	NC_014561	GCC	2	6	60081	60086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185437
1036	NC_014561	GC	3	6	60145	60150	0 %	0 %	50 %	50 %	308185437
1037	NC_014561	GTC	2	6	60158	60163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185437
1038	NC_014561	TGA	2	6	60180	60185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185437
1039	NC_014561	TGA	2	6	60200	60205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185437
1040	NC_014561	TGC	2	6	60260	60265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185437
1041	NC_014561	CGC	2	6	60287	60292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185437
1042	NC_014561	AGC	2	6	60293	60298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185437
1043	NC_014561	GAG	2	6	60340	60345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308185437
1044	NC_014561	CAG	2	6	60367	60372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185437
1045	NC_014561	GCA	2	6	60375	60380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185437
1046	NC_014561	TGC	2	6	60411	60416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185437
1047	NC_014561	GGC	2	6	60462	60467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185437
1048	NC_014561	GCT	2	6	60471	60476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185437
1049	NC_014561	ACAT	2	8	60489	60496	50 %	25 %	0 %	25 %	308185437
1050	NC_014561	CA	3	6	60501	60506	50 %	0 %	0 %	50 %	308185437
1051	NC_014561	CCGCG	2	10	60532	60541	0 %	0 %	40 %	60 %	308185437
1052	NC_014561	TGC	2	6	60561	60566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185437
1053	NC_014561	CAG	2	6	60574	60579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185437
1054	NC_014561	GAGCGG	2	12	60583	60594	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	308185437
1055	NC_014561	AGC	3	9	60659	60667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185437
1056	NC_014561	C	6	6	60775	60780	0 %	0 %	0 %	100 %	308185437
1057	NC_014561	GCC	2	6	60832	60837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185437
1058	NC_014561	GCT	2	6	60852	60857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185437
1059	NC_014561	CAG	2	6	60867	60872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185437
1060	NC_014561	TGT	2	6	60944	60949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308185437
1061	NC_014561	GAT	2	6	60982	60987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185437
1062	NC_014561	GAT	2	6	61056	61061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185437
1063	NC_014561	GCT	2	6	61263	61268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185437
1064	NC_014561	CAT	2	6	61353	61358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185437
1065	NC_014561	CAG	2	6	61366	61371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185437
1066	NC_014561	ATT	2	6	61401	61406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308185437
1067	NC_014561	GA	3	6	61540	61545	50 %	0 %	50 %	0 %	308185438
1068	NC_014561	A	6	6	61548	61553	100 %	0 %	0 %	0 %	308185438
1069	NC_014561	ATT	2	6	61572	61577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308185438
1070	NC_014561	GCC	2	6	61578	61583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185438
1071	NC_014561	GCA	2	6	61611	61616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185438
1072	NC_014561	GCT	2	6	61667	61672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185438
1073	NC_014561	CCGG	2	8	61740	61747	0 %	0 %	50 %	50 %	308185438
1074	NC_014561	CTA	2	6	62106	62111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185439
1075	NC_014561	CG	3	6	62136	62141	0 %	0 %	50 %	50 %	308185439
1076	NC_014561	CA	3	6	62219	62224	50 %	0 %	0 %	50 %	308185439
1077	NC_014561	GGT	2	6	62235	62240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308185439
1078	NC_014561	GAA	2	6	62284	62289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308185439
1079	NC_014561	GC	4	8	62340	62347	0 %	0 %	50 %	50 %	308185439
1080	NC_014561	GCGGA	2	10	62368	62377	20 %	0 %	60 %	20 %	308185439
1081	NC_014561	CAG	3	9	62398	62406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185439
1082	NC_014561	AAG	2	6	62485	62490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308185439
1083	NC_014561	TCGT	2	8	62917	62924	0 %	50 %	25 %	25 %	308185440
1084	NC_014561	ACC	3	9	62949	62957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308185440
1085	NC_014561	GTT	2	6	63045	63050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308185440
1086	NC_014561	CTGC	2	8	63095	63102	0 %	25 %	25 %	50 %	308185440
1087	NC_014561	GCC	2	6	63189	63194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185440
1088	NC_014561	GCC	2	6	63281	63286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185440
1089	NC_014561	AGG	2	6	63301	63306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308185440
1090	NC_014561	GGC	2	6	63422	63427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185440
1091	NC_014561	TGC	2	6	63615	63620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185440
1092	NC_014561	TTG	2	6	63664	63669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308185440
1093	NC_014561	CGGG	2	8	63727	63734	0 %	0 %	75 %	25 %	308185440
1094	NC_014561	GTCA	2	8	63796	63803	25 %	25 %	25 %	25 %	308185440
1095	NC_014561	GAC	2	6	63942	63947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185440
1096	NC_014561	GGTC	2	8	64704	64711	0 %	25 %	50 %	25 %	308185441
1097	NC_014561	GTA	2	6	64801	64806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185441
1098	NC_014561	TGAC	2	8	65006	65013	25 %	25 %	25 %	25 %	308185441
1099	NC_014561	GATCAT	2	12	65089	65100	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	308185441
1100	NC_014561	CCG	2	6	65102	65107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185441
1101	NC_014561	T	7	7	65266	65272	0 %	100 %	0 %	0 %	308185441
1102	NC_014561	TGC	2	6	65311	65316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185441
1103	NC_014561	GAAC	2	8	65352	65359	50 %	0 %	25 %	25 %	308185441
1104	NC_014561	CAT	2	6	65482	65487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185441
1105	NC_014561	GCA	2	6	65498	65503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185441
1106	NC_014561	TAA	2	6	65544	65549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308185441
1107	NC_014561	GT	3	6	65562	65567	0 %	50 %	50 %	0 %	308185441
1108	NC_014561	AGGG	2	8	65580	65587	25 %	0 %	75 %	0 %	308185441
1109	NC_014561	AT	3	6	65610	65615	50 %	50 %	0 %	0 %	308185441
1110	NC_014561	ACC	2	6	65927	65932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308185442
1111	NC_014561	GTT	2	6	65945	65950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308185442
1112	NC_014561	CCGG	2	8	65968	65975	0 %	0 %	50 %	50 %	308185442
1113	NC_014561	GC	3	6	65977	65982	0 %	0 %	50 %	50 %	308185442
1114	NC_014561	CAT	2	6	66008	66013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308185442
1115	NC_014561	GACGC	2	10	66116	66125	20 %	0 %	40 %	40 %	308185442
1116	NC_014561	GCTG	2	8	66127	66134	0 %	25 %	50 %	25 %	308185442
1117	NC_014561	CGC	2	6	66142	66147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308185442
1118	NC_014561	GCCC	2	8	66151	66158	0 %	0 %	25 %	75 %	308185442
1119	NC_014561	AGC	2	6	66192	66197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308185442
1120	NC_014561	CAGGTG	2	12	66305	66316	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	308185442
1121	NC_014561	ATG	2	6	66383	66388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308185442
1122	NC_014561	GGC	2	6	66391	66396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308185442
1123	NC_014561	GCACCT	2	12	66482	66493	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	308185442
1124	NC_014561	CA	3	6	66526	66531	50 %	0 %	0 %	50 %	308185442
1125	NC_014561	CTG	2	6	66544	66549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308185442
1126	NC_014561	CTGC	2	8	66593	66600	0 %	25 %	25 %	50 %	308185443
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