MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Prevotella melaninogenica ATCC 25845 chromosome II

Total Repeats: 22837

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014371	AGC	2	6	263	268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302346167
2	NC_014371	AGA	2	6	498	503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302346167
3	NC_014371	CAA	2	6	630	635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302346167
4	NC_014371	AACAC	2	10	676	685	60 %	0 %	0 %	40 %	302346167
5	NC_014371	AGC	2	6	764	769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302346167
6	NC_014371	GT	3	6	785	790	0 %	50 %	50 %	0 %	302346167
7	NC_014371	AGTAC	2	10	816	825	40 %	20 %	20 %	20 %	302346167
8	NC_014371	TAC	2	6	846	851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302346167
9	NC_014371	GAT	2	6	898	903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302346167
10	NC_014371	CAA	2	6	923	928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302346167
11	NC_014371	CTT	2	6	942	947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302346167
12	NC_014371	ACC	2	6	959	964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302346167
13	NC_014371	ATC	2	6	985	990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302346167
14	NC_014371	AGCG	2	8	993	1000	25 %	0 %	50 %	25 %	302346167
15	NC_014371	CCA	2	6	1006	1011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302346167
16	NC_014371	CTG	2	6	1039	1044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302346167
17	NC_014371	TG	3	6	1099	1104	0 %	50 %	50 %	0 %	302346167
18	NC_014371	CGT	2	6	1236	1241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302346167
19	NC_014371	GAC	2	6	1303	1308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302346167
20	NC_014371	AAGA	2	8	1393	1400	75 %	0 %	25 %	0 %	302346167
21	NC_014371	TGG	2	6	1478	1483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302346167
22	NC_014371	GAA	2	6	2412	2417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302346168
23	NC_014371	GCA	2	6	2445	2450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302346168
24	NC_014371	GCC	2	6	2464	2469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302346168
25	NC_014371	TTG	2	6	2470	2475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302346168
26	NC_014371	CTG	2	6	2485	2490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302346168
27	NC_014371	A	6	6	2536	2541	100 %	0 %	0 %	0 %	302346168
28	NC_014371	GTG	2	6	2828	2833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302346169
29	NC_014371	GCC	2	6	2904	2909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302346169
30	NC_014371	GCG	2	6	2923	2928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302346169
31	NC_014371	ATA	2	6	2968	2973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302346169
32	NC_014371	TTG	2	6	3011	3016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302346169
33	NC_014371	T	6	6	3066	3071	0 %	100 %	0 %	0 %	302346169
34	NC_014371	C	6	6	3091	3096	0 %	0 %	0 %	100 %	302346169
35	NC_014371	GCC	2	6	3112	3117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302346169
36	NC_014371	TCA	2	6	3197	3202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302346169
37	NC_014371	TG	3	6	3243	3248	0 %	50 %	50 %	0 %	302346169
38	NC_014371	ATGG	2	8	3273	3280	25 %	25 %	50 %	0 %	302346169
39	NC_014371	GGC	2	6	3286	3291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302346169
40	NC_014371	TGC	2	6	3305	3310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302346169
41	NC_014371	ATT	2	6	3322	3327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302346169
42	NC_014371	TGC	2	6	3417	3422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302346169
43	NC_014371	GTG	2	6	3454	3459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302346169
44	NC_014371	GTG	2	6	3461	3466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302346169
45	NC_014371	CGC	2	6	3484	3489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302346169
46	NC_014371	TCG	3	9	3505	3513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302346169
47	NC_014371	TG	3	6	3531	3536	0 %	50 %	50 %	0 %	302346169
48	NC_014371	AGA	2	6	3618	3623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302346169
49	NC_014371	TCA	2	6	3662	3667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302346169
50	NC_014371	CAGTG	2	10	3705	3714	20 %	20 %	40 %	20 %	302346169
51	NC_014371	CAAA	2	8	3762	3769	75 %	0 %	0 %	25 %	302346169
52	NC_014371	GCTG	2	8	3822	3829	0 %	25 %	50 %	25 %	302346169
53	NC_014371	CGAA	2	8	3879	3886	50 %	0 %	25 %	25 %	302346169
54	NC_014371	TGC	2	6	3956	3961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302346169
55	NC_014371	ACG	2	6	3986	3991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302346169
56	NC_014371	CAT	2	6	4020	4025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302346169
57	NC_014371	CAA	2	6	4068	4073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302346169
58	NC_014371	CGG	2	6	4097	4102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302346169
59	NC_014371	AAC	2	6	4108	4113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302346169
60	NC_014371	AAC	2	6	4234	4239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302346169
61	NC_014371	CATCG	2	10	4282	4291	20 %	20 %	20 %	40 %	302346169
62	NC_014371	AGA	3	9	4296	4304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302346169
63	NC_014371	TC	3	6	4950	4955	0 %	50 %	0 %	50 %	302346170
64	NC_014371	TCG	2	6	4967	4972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302346170
65	NC_014371	GAA	2	6	5014	5019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302346170
66	NC_014371	TTCC	2	8	5064	5071	0 %	50 %	0 %	50 %	302346170
67	NC_014371	CATC	2	8	5140	5147	25 %	25 %	0 %	50 %	302346170
68	NC_014371	TGA	2	6	5154	5159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302346170
69	NC_014371	TAG	2	6	5189	5194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302346170
70	NC_014371	GCC	2	6	5236	5241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302346170
71	NC_014371	TCA	2	6	5346	5351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302346170
72	NC_014371	CAT	2	6	5419	5424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302346170
73	NC_014371	GGCA	2	8	5464	5471	25 %	0 %	50 %	25 %	302346170
74	NC_014371	TGA	2	6	5607	5612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302346170
75	NC_014371	AAATC	2	10	5655	5664	60 %	20 %	0 %	20 %	302346170
76	NC_014371	CGT	2	6	5676	5681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302346170
77	NC_014371	CGG	2	6	5691	5696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302346170
78	NC_014371	GCC	3	9	5725	5733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302346170
79	NC_014371	TCT	2	6	5754	5759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302346170
80	NC_014371	GGGTT	2	10	5807	5816	0 %	40 %	60 %	0 %	302346170
81	NC_014371	TCT	2	6	5883	5888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302346170
82	NC_014371	TGC	2	6	5892	5897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302346170
83	NC_014371	TCA	2	6	5910	5915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302346170
84	NC_014371	TC	3	6	5957	5962	0 %	50 %	0 %	50 %	302346170
85	NC_014371	AAT	2	6	6000	6005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302346170
86	NC_014371	TTA	2	6	6039	6044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302346170
87	NC_014371	CGTAT	2	10	6051	6060	20 %	40 %	20 %	20 %	302346170
88	NC_014371	TCG	2	6	6064	6069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302346170
89	NC_014371	TTCG	2	8	6087	6094	0 %	50 %	25 %	25 %	302346170
90	NC_014371	TGC	2	6	6130	6135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302346171
91	NC_014371	GGC	2	6	6150	6155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302346171
92	NC_014371	CCT	2	6	6218	6223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302346171
93	NC_014371	CGGC	2	8	6247	6254	0 %	0 %	50 %	50 %	302346171
94	NC_014371	TGA	2	6	6283	6288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302346171
95	NC_014371	GTT	2	6	6297	6302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302346171
96	NC_014371	C	6	6	6337	6342	0 %	0 %	0 %	100 %	302346171
97	NC_014371	TTC	2	6	6441	6446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302346171
98	NC_014371	CCT	2	6	6473	6478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302346171
99	NC_014371	TA	3	6	6516	6521	50 %	50 %	0 %	0 %	302346171
100	NC_014371	GCG	2	6	6526	6531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302346171
101	NC_014371	ATC	2	6	6538	6543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302346171
102	NC_014371	GA	3	6	6634	6639	50 %	0 %	50 %	0 %	302346171
103	NC_014371	AGCG	2	8	6649	6656	25 %	0 %	50 %	25 %	302346171
104	NC_014371	TTTC	2	8	6776	6783	0 %	75 %	0 %	25 %	302346171
105	NC_014371	CAG	2	6	6818	6823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302346171
106	NC_014371	TGACA	2	10	6979	6988	40 %	20 %	20 %	20 %	302346172
107	NC_014371	CCCTTT	2	12	7208	7219	0 %	50 %	0 %	50 %	302346172
108	NC_014371	ATG	2	6	7241	7246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302346172
109	NC_014371	GAA	2	6	7261	7266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302346172
110	NC_014371	TCTATC	2	12	7269	7280	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	302346172
111	NC_014371	TA	3	6	7407	7412	50 %	50 %	0 %	0 %	302346172
112	NC_014371	CTA	2	6	7423	7428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302346172
113	NC_014371	TGT	2	6	7991	7996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302346173
114	NC_014371	AG	3	6	8024	8029	50 %	0 %	50 %	0 %	302346173
115	NC_014371	A	9	9	8047	8055	100 %	0 %	0 %	0 %	302346173
116	NC_014371	TAA	2	6	8066	8071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302346173
117	NC_014371	GAT	2	6	8100	8105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302346173
118	NC_014371	TGAT	2	8	8146	8153	25 %	50 %	25 %	0 %	302346173
119	NC_014371	AAT	2	6	8159	8164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302346173
120	NC_014371	AT	3	6	8184	8189	50 %	50 %	0 %	0 %	302346173
121	NC_014371	TAT	2	6	8201	8206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302346173
122	NC_014371	A	6	6	8273	8278	100 %	0 %	0 %	0 %	302346173
123	NC_014371	TTA	2	6	8371	8376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302346173
124	NC_014371	ATT	2	6	8418	8423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302346173
125	NC_014371	AAT	2	6	8454	8459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302346173
126	NC_014371	A	6	6	8476	8481	100 %	0 %	0 %	0 %	302346173
127	NC_014371	TA	3	6	8482	8487	50 %	50 %	0 %	0 %	302346173
128	NC_014371	AT	3	6	8514	8519	50 %	50 %	0 %	0 %	302346173
129	NC_014371	AC	3	6	8531	8536	50 %	0 %	0 %	50 %	302346173
130	NC_014371	AAAT	2	8	9391	9398	75 %	25 %	0 %	0 %	302346174
131	NC_014371	ATGA	2	8	9810	9817	50 %	25 %	25 %	0 %	302346175
132	NC_014371	ATT	2	6	9828	9833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302346175
133	NC_014371	GAG	2	6	9849	9854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302346175
134	NC_014371	GATA	2	8	9875	9882	50 %	25 %	25 %	0 %	302346175
135	NC_014371	TAAT	2	8	9889	9896	50 %	50 %	0 %	0 %	302346175
136	NC_014371	AGA	2	6	9917	9922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302346175
137	NC_014371	A	6	6	9943	9948	100 %	0 %	0 %	0 %	302346175
138	NC_014371	TAA	2	6	9961	9966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302346175
139	NC_014371	ATC	2	6	9985	9990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302346175
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141	NC_014371	GGA	2	6	10071	10076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302346175
142	NC_014371	ATGTAA	2	12	10078	10089	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	302346175
143	NC_014371	AAT	2	6	10104	10109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302346175
144	NC_014371	CTG	2	6	10120	10125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302346175
145	NC_014371	ATA	2	6	10165	10170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302346175
146	NC_014371	TAA	3	9	10181	10189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302346175
147	NC_014371	TAC	2	6	10238	10243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302346175
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149	NC_014371	AT	3	6	10273	10278	50 %	50 %	0 %	0 %	302346175
150	NC_014371	CATA	2	8	10281	10288	50 %	25 %	0 %	25 %	302346175
151	NC_014371	GTT	2	6	11551	11556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302346176
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158	NC_014371	A	6	6	11887	11892	100 %	0 %	0 %	0 %	302346176
159	NC_014371	GTT	2	6	11896	11901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302346176
160	NC_014371	GCT	2	6	11908	11913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302346176
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163	NC_014371	TGA	2	6	12153	12158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302346176
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175	NC_014371	GTT	2	6	12986	12991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302346177
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231	NC_014371	CATA	2	8	16150	16157	50 %	25 %	0 %	25 %	302346179
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249	NC_014371	TCT	2	6	18068	18073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302346180
250	NC_014371	TGT	2	6	18253	18258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302346181
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254	NC_014371	GAT	2	6	18654	18659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302346182
255	NC_014371	AT	4	8	18664	18671	50 %	50 %	0 %	0 %	302346182
256	NC_014371	TCT	2	6	18790	18795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302346182
257	NC_014371	GAAG	2	8	18866	18873	50 %	0 %	50 %	0 %	302346182
258	NC_014371	AT	3	6	18879	18884	50 %	50 %	0 %	0 %	302346182
259	NC_014371	CTT	2	6	19038	19043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302346183
260	NC_014371	GATA	2	8	19093	19100	50 %	25 %	25 %	0 %	302346183
261	NC_014371	TCT	2	6	19147	19152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302346183
262	NC_014371	T	6	6	19152	19157	0 %	100 %	0 %	0 %	302346183
263	NC_014371	GA	3	6	19336	19341	50 %	0 %	50 %	0 %	302346183
264	NC_014371	GAA	2	6	19409	19414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302346183
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271	NC_014371	AG	3	6	19652	19657	50 %	0 %	50 %	0 %	302346183
272	NC_014371	TGA	2	6	19671	19676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302346183
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392	NC_014371	CTT	2	6	26895	26900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302346187
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496	NC_014371	GC	3	6	33770	33775	0 %	0 %	50 %	50 %	302346193
497	NC_014371	AGAGAT	2	12	33793	33804	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	302346193
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500	NC_014371	GGA	2	6	33971	33976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302346193

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