MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pantoea vagans C9-1 plasmid pPag3

Total Repeats: 9285

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014258	GCA	2	6	235	240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717100
2	NC_014258	GCAGC	2	10	243	252	20 %	0 %	40 %	40 %	298717100
3	NC_014258	GA	3	6	306	311	50 %	0 %	50 %	0 %	298717100
4	NC_014258	TG	3	6	395	400	0 %	50 %	50 %	0 %	298717100
5	NC_014258	CTG	2	6	574	579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717100
6	NC_014258	ACG	2	6	680	685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717100
7	NC_014258	GCGG	2	8	744	751	0 %	0 %	75 %	25 %	298717100
8	NC_014258	GCA	2	6	763	768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717100
9	NC_014258	GATCC	2	10	812	821	20 %	20 %	20 %	40 %	298717100
10	NC_014258	GCCGAT	2	12	835	846	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	298717100
11	NC_014258	TGA	2	6	849	854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717100
12	NC_014258	GGC	2	6	909	914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717100
13	NC_014258	GCAC	2	8	1033	1040	25 %	0 %	25 %	50 %	298717100
14	NC_014258	CGA	2	6	1050	1055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717100
15	NC_014258	GTG	2	6	1109	1114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717100
16	NC_014258	GGCAG	2	10	1122	1131	20 %	0 %	60 %	20 %	298717100
17	NC_014258	ACT	2	6	1136	1141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717100
18	NC_014258	CG	3	6	1227	1232	0 %	0 %	50 %	50 %	298717100
19	NC_014258	GCA	2	6	1239	1244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717100
20	NC_014258	GAA	2	6	1306	1311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298717100
21	NC_014258	ATCCG	2	10	1374	1383	20 %	20 %	20 %	40 %	298717100
22	NC_014258	CGG	2	6	1395	1400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717100
23	NC_014258	GAA	2	6	1404	1409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298717100
24	NC_014258	GAA	2	6	1476	1481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298717100
25	NC_014258	CCG	2	6	1482	1487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717100
26	NC_014258	AGGC	2	8	1515	1522	25 %	0 %	50 %	25 %	298717101
27	NC_014258	GCA	2	6	1551	1556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717101
28	NC_014258	CCA	2	6	1617	1622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717101
29	NC_014258	GCA	2	6	1800	1805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717101
30	NC_014258	GCA	2	6	1878	1883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717101
31	NC_014258	TCC	2	6	1891	1896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298717101
32	NC_014258	TCA	2	6	2096	2101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717101
33	NC_014258	TCAG	2	8	2138	2145	25 %	25 %	25 %	25 %	298717101
34	NC_014258	TTG	2	6	2159	2164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298717101
35	NC_014258	GC	3	6	2186	2191	0 %	0 %	50 %	50 %	298717101
36	NC_014258	GGGCA	2	10	2290	2299	20 %	0 %	60 %	20 %	298717101
37	NC_014258	TGC	2	6	2356	2361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717101
38	NC_014258	GC	3	6	2360	2365	0 %	0 %	50 %	50 %	298717101
39	NC_014258	GAT	2	6	2384	2389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717101
40	NC_014258	AGC	2	6	2423	2428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717101
41	NC_014258	GGT	2	6	2445	2450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717101
42	NC_014258	CTGG	2	8	2548	2555	0 %	25 %	50 %	25 %	298717101
43	NC_014258	CGG	2	6	2603	2608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717101
44	NC_014258	TCATC	2	10	2775	2784	20 %	40 %	0 %	40 %	298717102
45	NC_014258	CAGG	2	8	2789	2796	25 %	0 %	50 %	25 %	298717102
46	NC_014258	GCC	2	6	2834	2839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717102
47	NC_014258	CAG	2	6	2854	2859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717102
48	NC_014258	AAT	2	6	2878	2883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298717102
49	NC_014258	TGC	2	6	2885	2890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717102
50	NC_014258	CCA	2	6	3016	3021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717102
51	NC_014258	GCCA	2	8	3092	3099	25 %	0 %	25 %	50 %	298717102
52	NC_014258	CGC	2	6	3234	3239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717103
53	NC_014258	CAGC	2	8	3250	3257	25 %	0 %	25 %	50 %	298717103
54	NC_014258	CCGG	2	8	3289	3296	0 %	0 %	50 %	50 %	298717103
55	NC_014258	CAG	2	6	3301	3306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717103
56	NC_014258	GCA	2	6	3369	3374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717103
57	NC_014258	CCG	2	6	3396	3401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717103
58	NC_014258	CCA	2	6	3456	3461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717103
59	NC_014258	ACC	2	6	3470	3475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717103
60	NC_014258	CGC	2	6	3504	3509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717103
61	NC_014258	ATC	2	6	3520	3525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717103
62	NC_014258	CCA	2	6	3561	3566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717103
63	NC_014258	GGT	2	6	3684	3689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717103
64	NC_014258	GCA	2	6	3748	3753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717103
65	NC_014258	TCA	2	6	3785	3790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717103
66	NC_014258	CGT	2	6	3875	3880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717103
67	NC_014258	AGC	2	6	3908	3913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717103
68	NC_014258	GA	3	6	3941	3946	50 %	0 %	50 %	0 %	298717103
69	NC_014258	AGAGA	2	10	3980	3989	60 %	0 %	40 %	0 %	298717103
70	NC_014258	GCA	2	6	4121	4126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717104
71	NC_014258	AGG	2	6	4195	4200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298717104
72	NC_014258	CAG	2	6	4236	4241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717104
73	NC_014258	TGC	2	6	4345	4350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717104
74	NC_014258	CA	3	6	4409	4414	50 %	0 %	0 %	50 %	298717104
75	NC_014258	TGA	2	6	4445	4450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717104
76	NC_014258	CAG	2	6	4476	4481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717105
77	NC_014258	TCG	2	6	4522	4527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717105
78	NC_014258	GTAAT	2	10	4537	4546	40 %	40 %	20 %	0 %	298717105
79	NC_014258	CCA	2	6	4583	4588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717105
80	NC_014258	AAT	3	9	4605	4613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298717105
81	NC_014258	CAG	2	6	4674	4679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717105
82	NC_014258	CGGG	2	8	4700	4707	0 %	0 %	75 %	25 %	298717105
83	NC_014258	CGG	2	6	4771	4776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717105
84	NC_014258	GAC	2	6	4787	4792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717105
85	NC_014258	CAG	2	6	4806	4811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717105
86	NC_014258	CG	3	6	4924	4929	0 %	0 %	50 %	50 %	298717105
87	NC_014258	ATG	2	6	4984	4989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717105
88	NC_014258	CCG	2	6	5224	5229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717106
89	NC_014258	GGC	2	6	5319	5324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717106
90	NC_014258	CTG	2	6	5352	5357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717106
91	NC_014258	CAT	2	6	5438	5443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717106
92	NC_014258	ATG	2	6	5446	5451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717106
93	NC_014258	GTG	2	6	5457	5462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717106
94	NC_014258	GCG	2	6	5562	5567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717106
95	NC_014258	GCG	2	6	5660	5665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717106
96	NC_014258	CGC	2	6	5713	5718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717106
97	NC_014258	GCT	2	6	5750	5755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717106
98	NC_014258	CTG	2	6	5760	5765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717106
99	NC_014258	ATC	2	6	5801	5806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717107
100	NC_014258	GCC	2	6	5825	5830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717107
101	NC_014258	AGCG	2	8	5885	5892	25 %	0 %	50 %	25 %	298717107
102	NC_014258	CAG	2	6	5897	5902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717107
103	NC_014258	CTG	2	6	5930	5935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717107
104	NC_014258	ACC	2	6	5948	5953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717107
105	NC_014258	CTGGC	2	10	6020	6029	0 %	20 %	40 %	40 %	298717107
106	NC_014258	ATT	2	6	6050	6055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298717107
107	NC_014258	GCA	2	6	6065	6070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717107
108	NC_014258	GCT	2	6	6079	6084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717107
109	NC_014258	GCAC	2	8	6305	6312	25 %	0 %	25 %	50 %	298717108
110	NC_014258	ATCTG	2	10	6330	6339	20 %	40 %	20 %	20 %	298717108
111	NC_014258	GCCAG	2	10	6442	6451	20 %	0 %	40 %	40 %	298717108
112	NC_014258	TTC	2	6	6486	6491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298717108
113	NC_014258	GTG	2	6	6647	6652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717108
114	NC_014258	GCG	2	6	6672	6677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717108
115	NC_014258	TGG	2	6	6714	6719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717108
116	NC_014258	CCG	2	6	6782	6787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717108
117	NC_014258	CGC	2	6	6801	6806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717108
118	NC_014258	CGC	2	6	6813	6818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717108
119	NC_014258	GAG	2	6	6821	6826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298717108
120	NC_014258	GCA	2	6	6875	6880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717108
121	NC_014258	CG	3	6	6892	6897	0 %	0 %	50 %	50 %	298717108
122	NC_014258	CAG	3	9	6941	6949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717108
123	NC_014258	AGC	2	6	7022	7027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717109
124	NC_014258	GGT	2	6	7088	7093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717109
125	NC_014258	CAC	2	6	7160	7165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717109
126	NC_014258	CAG	2	6	7166	7171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717109
127	NC_014258	CGT	2	6	7198	7203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717109
128	NC_014258	GC	3	6	7220	7225	0 %	0 %	50 %	50 %	298717109
129	NC_014258	GCA	4	12	7273	7284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717109
130	NC_014258	GCCG	2	8	7345	7352	0 %	0 %	50 %	50 %	298717109
131	NC_014258	TAA	2	6	7359	7364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298717109
132	NC_014258	GCA	2	6	7393	7398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717109
133	NC_014258	CCAGCA	2	12	7453	7464	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	298717109
134	NC_014258	CTG	2	6	7477	7482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717109
135	NC_014258	AGA	2	6	7618	7623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298717109
136	NC_014258	CAG	2	6	7631	7636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717109
137	NC_014258	CGT	2	6	7768	7773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717109
138	NC_014258	AGC	2	6	7889	7894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717110
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140	NC_014258	GCA	2	6	7988	7993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717110
141	NC_014258	GCA	2	6	7997	8002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717110
142	NC_014258	GTA	2	6	8014	8019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717110
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144	NC_014258	CGC	2	6	8055	8060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717110
145	NC_014258	AAT	2	6	8064	8069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298717110
146	NC_014258	CTG	2	6	8073	8078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717110
147	NC_014258	ATC	2	6	8224	8229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717110
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149	NC_014258	GATC	2	8	8411	8418	25 %	25 %	25 %	25 %	298717110
150	NC_014258	CG	3	6	8495	8500	0 %	0 %	50 %	50 %	298717110
151	NC_014258	ACG	2	6	8508	8513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717110
152	NC_014258	TGC	2	6	8578	8583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717110
153	NC_014258	TCA	2	6	8638	8643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717110
154	NC_014258	ATCC	2	8	8675	8682	25 %	25 %	0 %	50 %	298717110
155	NC_014258	CGC	2	6	8702	8707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717110
156	NC_014258	ATTC	2	8	8712	8719	25 %	50 %	0 %	25 %	298717110
157	NC_014258	GCTG	2	8	8864	8871	0 %	25 %	50 %	25 %	298717110
158	NC_014258	GCA	2	6	8882	8887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717110
159	NC_014258	TCCGGG	2	12	8890	8901	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	298717110
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162	NC_014258	GC	3	6	9078	9083	0 %	0 %	50 %	50 %	298717110
163	NC_014258	GGT	2	6	9126	9131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717110
164	NC_014258	CGC	2	6	9138	9143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717110
165	NC_014258	A	6	6	9237	9242	100 %	0 %	0 %	0 %	298717110
166	NC_014258	CAG	2	6	9309	9314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717110
167	NC_014258	ACG	2	6	9441	9446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717110
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170	NC_014258	CAG	2	6	9612	9617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717110
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172	NC_014258	GCG	2	6	9630	9635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717110
173	NC_014258	CTG	2	6	9654	9659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717110
174	NC_014258	TGG	2	6	9676	9681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717110
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255	NC_014258	TGC	2	6	13950	13955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717113
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257	NC_014258	CAC	2	6	14029	14034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717113
258	NC_014258	TGC	2	6	14062	14067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717113
259	NC_014258	A	7	7	14075	14081	100 %	0 %	0 %	0 %	298717113
260	NC_014258	TGC	2	6	14133	14138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717113
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384	NC_014258	ATC	2	6	20406	20411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717119
385	NC_014258	GCA	2	6	20442	20447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717119
386	NC_014258	GCC	2	6	20450	20455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717119
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388	NC_014258	TAA	3	9	20498	20506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298717119
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392	NC_014258	GAC	2	6	20653	20658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717120
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409	NC_014258	CAG	3	9	21187	21195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717120
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413	NC_014258	TGA	2	6	21381	21386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717121
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489	NC_014258	GC	3	6	25029	25034	0 %	0 %	50 %	50 %	298717125
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497	NC_014258	GCA	2	6	25467	25472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717126
498	NC_014258	CCA	2	6	25527	25532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717126
499	NC_014258	CATC	2	8	25541	25548	25 %	25 %	0 %	50 %	298717126
500	NC_014258	GCT	2	6	25565	25570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717126

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