MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pantoea vagans C9-1 plasmid pPag3

Total Repeats: 9285

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_014258	GCA	2	6	236305	236310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717333
4002	NC_014258	GCTG	2	8	236404	236411	0 %	25 %	50 %	25 %	298717333
4003	NC_014258	CGT	2	6	236432	236437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717333
4004	NC_014258	CTG	2	6	236552	236557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717333
4005	NC_014258	CTC	2	6	236576	236581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298717333
4006	NC_014258	GGT	2	6	236615	236620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717333
4007	NC_014258	GCA	2	6	236626	236631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717333
4008	NC_014258	CTG	2	6	236633	236638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717333
4009	NC_014258	ATC	2	6	236672	236677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717333
4010	NC_014258	CTT	2	6	236692	236697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298717333
4011	NC_014258	CAG	2	6	236762	236767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717333
4012	NC_014258	CAGAAT	2	12	236789	236800	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	298717333
4013	NC_014258	CAG	2	6	236804	236809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717333
4014	NC_014258	ACCAC	2	10	236814	236823	40 %	0 %	0 %	60 %	298717333
4015	NC_014258	CAT	2	6	236878	236883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717333
4016	NC_014258	CTG	2	6	236915	236920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717333
4017	NC_014258	CCA	2	6	236962	236967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717333
4018	NC_014258	CAC	3	9	237092	237100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717333
4019	NC_014258	CAG	2	6	237104	237109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717333
4020	NC_014258	GC	3	6	237122	237127	0 %	0 %	50 %	50 %	298717333
4021	NC_014258	GCT	2	6	237152	237157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717333
4022	NC_014258	AGC	2	6	237291	237296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717333
4023	NC_014258	TCA	2	6	237316	237321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717333
4024	NC_014258	GGT	2	6	237326	237331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717333
4025	NC_014258	ATG	2	6	237700	237705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717334
4026	NC_014258	AAAG	2	8	237711	237718	75 %	0 %	25 %	0 %	298717334
4027	NC_014258	TTC	2	6	237753	237758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298717334
4028	NC_014258	GGC	3	9	237808	237816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717334
4029	NC_014258	CTGG	2	8	237860	237867	0 %	25 %	50 %	25 %	298717334
4030	NC_014258	TGGCG	2	10	237894	237903	0 %	20 %	60 %	20 %	298717334
4031	NC_014258	TCGA	2	8	237991	237998	25 %	25 %	25 %	25 %	298717334
4032	NC_014258	TCA	2	6	238097	238102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717334
4033	NC_014258	CA	3	6	238112	238117	50 %	0 %	0 %	50 %	298717334
4034	NC_014258	GCG	2	6	238165	238170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717334
4035	NC_014258	CAG	2	6	238267	238272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717334
4036	NC_014258	GAA	3	9	238350	238358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298717334
4037	NC_014258	AACG	2	8	238456	238463	50 %	0 %	25 %	25 %	298717334
4038	NC_014258	GGC	3	9	238498	238506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717334
4039	NC_014258	GC	3	6	238505	238510	0 %	0 %	50 %	50 %	298717334
4040	NC_014258	AGA	2	6	238523	238528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298717334
4041	NC_014258	CGGT	2	8	238565	238572	0 %	25 %	50 %	25 %	298717334
4042	NC_014258	CCG	2	6	238654	238659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717334
4043	NC_014258	CGT	2	6	238704	238709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717334
4044	NC_014258	CTG	2	6	238771	238776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717334
4045	NC_014258	CAC	3	9	238779	238787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717334
4046	NC_014258	TGA	2	6	238872	238877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717334
4047	NC_014258	TAC	2	6	238903	238908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717334
4048	NC_014258	GAA	2	6	238917	238922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298717334
4049	NC_014258	AAGA	2	8	238969	238976	75 %	0 %	25 %	0 %	298717334
4050	NC_014258	CAG	2	6	239026	239031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717334
4051	NC_014258	GGC	2	6	239040	239045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717334
4052	NC_014258	CTG	2	6	239047	239052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717334
4053	NC_014258	TC	3	6	239087	239092	0 %	50 %	0 %	50 %	298717334
4054	NC_014258	TGC	2	6	239204	239209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717334
4055	NC_014258	CGC	2	6	239252	239257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717334
4056	NC_014258	CAG	2	6	239308	239313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717334
4057	NC_014258	CAG	2	6	239461	239466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717335
4058	NC_014258	CTT	2	6	239479	239484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298717335
4059	NC_014258	TGC	2	6	239501	239506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717335
4060	NC_014258	GT	3	6	239718	239723	0 %	50 %	50 %	0 %	298717335
4061	NC_014258	TCA	2	6	239728	239733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717335
4062	NC_014258	CTG	2	6	239949	239954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717336
4063	NC_014258	CT	3	6	239963	239968	0 %	50 %	0 %	50 %	298717336
4064	NC_014258	TCGG	2	8	240002	240009	0 %	25 %	50 %	25 %	298717336
4065	NC_014258	TGC	2	6	240111	240116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717336
4066	NC_014258	CGT	2	6	240126	240131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717336
4067	NC_014258	TCCG	2	8	240150	240157	0 %	25 %	25 %	50 %	298717336
4068	NC_014258	ATG	2	6	240230	240235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717336
4069	NC_014258	GGCGG	2	10	240353	240362	0 %	0 %	80 %	20 %	298717336
4070	NC_014258	TGA	2	6	240369	240374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717336
4071	NC_014258	CAC	2	6	240384	240389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717336
4072	NC_014258	TGC	2	6	240480	240485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717336
4073	NC_014258	GC	3	6	240549	240554	0 %	0 %	50 %	50 %	298717336
4074	NC_014258	CAG	3	9	240602	240610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717336
4075	NC_014258	CTG	2	6	240665	240670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717336
4076	NC_014258	CGG	2	6	240696	240701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717336
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4078	NC_014258	CTG	2	6	240773	240778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717336
4079	NC_014258	GCC	2	6	240806	240811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717336
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4081	NC_014258	GCC	2	6	240849	240854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717336
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4084	NC_014258	GCAG	2	8	240919	240926	25 %	0 %	50 %	25 %	298717336
4085	NC_014258	AG	3	6	240925	240930	50 %	0 %	50 %	0 %	298717336
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4087	NC_014258	TGG	2	6	240954	240959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717336
4088	NC_014258	CG	3	6	241032	241037	0 %	0 %	50 %	50 %	298717336
4089	NC_014258	GGCCT	2	10	241055	241064	0 %	20 %	40 %	40 %	298717336
4090	NC_014258	CT	3	6	241070	241075	0 %	50 %	0 %	50 %	298717336
4091	NC_014258	TTG	2	6	241185	241190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298717336
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4102	NC_014258	CAT	2	6	241803	241808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717338
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4104	NC_014258	T	7	7	242025	242031	0 %	100 %	0 %	0 %	298717339
4105	NC_014258	GAT	2	6	242075	242080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717339
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4110	NC_014258	CAG	2	6	242267	242272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717340
4111	NC_014258	CAG	2	6	242336	242341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717340
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4118	NC_014258	ACG	2	6	242582	242587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717340
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4120	NC_014258	TCA	2	6	242634	242639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717340
4121	NC_014258	GCC	2	6	242658	242663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717340
4122	NC_014258	CCT	2	6	242692	242697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298717340
4123	NC_014258	CAG	2	6	242699	242704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717340
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4221	NC_014258	A	6	6	248269	248274	100 %	0 %	0 %	0 %	298717346
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4233	NC_014258	TCT	2	6	248800	248805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298717346
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4348	NC_014258	CTGG	2	8	254625	254632	0 %	25 %	50 %	25 %	298717352
4349	NC_014258	TCGC	2	8	254649	254656	0 %	25 %	25 %	50 %	298717352
4350	NC_014258	TATGAC	2	12	254707	254718	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	298717352
4351	NC_014258	GGAGTG	2	12	254733	254744	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	298717352
4352	NC_014258	AGG	2	6	254753	254758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298717352
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4355	NC_014258	TGA	2	6	254829	254834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717352
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4361	NC_014258	GAT	2	6	255142	255147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717353
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4480	NC_014258	GGGC	2	8	260245	260252	0 %	0 %	75 %	25 %	298717358
4481	NC_014258	GCC	2	6	260274	260279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717358
4482	NC_014258	CCAG	2	8	260297	260304	25 %	0 %	25 %	50 %	298717358
4483	NC_014258	CGG	2	6	260394	260399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717358
4484	NC_014258	TGC	2	6	260464	260469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717358
4485	NC_014258	CGAT	2	8	260500	260507	25 %	25 %	25 %	25 %	298717358
4486	NC_014258	CCA	2	6	260654	260659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717358
4487	NC_014258	GCC	2	6	260740	260745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717358
4488	NC_014258	CTGGC	2	10	260796	260805	0 %	20 %	40 %	40 %	298717358
4489	NC_014258	GTCC	2	8	260814	260821	0 %	25 %	25 %	50 %	298717358
4490	NC_014258	T	6	6	260895	260900	0 %	100 %	0 %	0 %	298717358
4491	NC_014258	GCC	3	9	260949	260957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717358
4492	NC_014258	CTG	2	6	261024	261029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717358
4493	NC_014258	ATC	2	6	261073	261078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717358
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4495	NC_014258	CAC	2	6	261137	261142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717358
4496	NC_014258	CGG	2	6	261144	261149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717358
4497	NC_014258	GCG	2	6	261187	261192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717358
4498	NC_014258	GCA	2	6	261221	261226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717358
4499	NC_014258	CGA	2	6	261314	261319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717358
4500	NC_014258	CGC	2	6	261431	261436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717358

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