MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pantoea vagans C9-1 plasmid pPag3

Total Repeats: 9285

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014258	CCG	2	6	25611	25616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717126
502	NC_014258	CAG	2	6	25618	25623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717126
503	NC_014258	CAC	2	6	25656	25661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717126
504	NC_014258	GCC	2	6	25700	25705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717126
505	NC_014258	GC	3	6	25732	25737	0 %	0 %	50 %	50 %	298717126
506	NC_014258	CG	3	6	25948	25953	0 %	0 %	50 %	50 %	298717127
507	NC_014258	AGC	2	6	25990	25995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717127
508	NC_014258	CTG	2	6	26005	26010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717127
509	NC_014258	GCCCGA	2	12	26072	26083	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	298717127
510	NC_014258	TGC	2	6	26087	26092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717127
511	NC_014258	GGC	2	6	26120	26125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717127
512	NC_014258	CGCT	2	8	26128	26135	0 %	25 %	25 %	50 %	298717127
513	NC_014258	GAC	2	6	26154	26159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717127
514	NC_014258	CAC	2	6	26171	26176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717127
515	NC_014258	GCC	2	6	26243	26248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717127
516	NC_014258	CTGG	2	8	26279	26286	0 %	25 %	50 %	25 %	298717127
517	NC_014258	GATTT	2	10	26290	26299	20 %	60 %	20 %	0 %	298717127
518	NC_014258	CAA	2	6	26331	26336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717127
519	NC_014258	AAT	2	6	26338	26343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298717127
520	NC_014258	T	6	6	26497	26502	0 %	100 %	0 %	0 %	298717128
521	NC_014258	A	6	6	26588	26593	100 %	0 %	0 %	0 %	298717128
522	NC_014258	TTG	2	6	26596	26601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298717128
523	NC_014258	CAC	2	6	26627	26632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717128
524	NC_014258	GCC	2	6	26652	26657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717128
525	NC_014258	GAAGG	2	10	26676	26685	40 %	0 %	60 %	0 %	298717128
526	NC_014258	GCC	2	6	26715	26720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717128
527	NC_014258	CT	3	6	26750	26755	0 %	50 %	0 %	50 %	298717128
528	NC_014258	AACA	2	8	26769	26776	75 %	0 %	0 %	25 %	298717128
529	NC_014258	A	7	7	26841	26847	100 %	0 %	0 %	0 %	298717128
530	NC_014258	ATG	2	6	26974	26979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717128
531	NC_014258	GCG	2	6	27146	27151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717129
532	NC_014258	ATT	2	6	27205	27210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298717129
533	NC_014258	AGA	2	6	27240	27245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298717129
534	NC_014258	TCC	2	6	27248	27253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298717129
535	NC_014258	ACT	2	6	27287	27292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717129
536	NC_014258	CGAT	2	8	27350	27357	25 %	25 %	25 %	25 %	298717129
537	NC_014258	GAAGCG	2	12	27406	27417	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	298717129
538	NC_014258	GAC	2	6	27442	27447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717129
539	NC_014258	CTG	2	6	27452	27457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717129
540	NC_014258	TCGC	2	8	27517	27524	0 %	25 %	25 %	50 %	298717129
541	NC_014258	TAT	2	6	27526	27531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298717129
542	NC_014258	AGCC	2	8	27568	27575	25 %	0 %	25 %	50 %	298717129
543	NC_014258	CG	3	6	27604	27609	0 %	0 %	50 %	50 %	298717129
544	NC_014258	GAT	2	6	27657	27662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717130
545	NC_014258	GGT	2	6	27758	27763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717130
546	NC_014258	GAC	2	6	27797	27802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717130
547	NC_014258	AGG	2	6	27805	27810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298717130
548	NC_014258	GCA	2	6	27833	27838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717130
549	NC_014258	CAG	2	6	27891	27896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717130
550	NC_014258	CGC	2	6	27926	27931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717130
551	NC_014258	AC	3	6	27981	27986	50 %	0 %	0 %	50 %	298717130
552	NC_014258	GCG	2	6	28012	28017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717130
553	NC_014258	GATC	2	8	28163	28170	25 %	25 %	25 %	25 %	298717130
554	NC_014258	ATA	2	6	28213	28218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298717130
555	NC_014258	GGT	2	6	28251	28256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717130
556	NC_014258	GCT	2	6	28307	28312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717130
557	NC_014258	CAGC	2	8	28454	28461	25 %	0 %	25 %	50 %	298717131
558	NC_014258	GC	3	6	28520	28525	0 %	0 %	50 %	50 %	298717132
559	NC_014258	CAG	2	6	28598	28603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717133
560	NC_014258	GA	3	6	28646	28651	50 %	0 %	50 %	0 %	298717133
561	NC_014258	GT	3	6	28690	28695	0 %	50 %	50 %	0 %	298717133
562	NC_014258	CCT	2	6	28771	28776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298717133
563	NC_014258	C	6	6	28823	28828	0 %	0 %	0 %	100 %	298717133
564	NC_014258	CCTG	2	8	28843	28850	0 %	25 %	25 %	50 %	298717133
565	NC_014258	AGC	2	6	28881	28886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717133
566	NC_014258	TGC	2	6	28911	28916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717133
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568	NC_014258	GCC	3	9	29025	29033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717133
569	NC_014258	CGTC	2	8	29215	29222	0 %	25 %	25 %	50 %	298717133
570	NC_014258	TGA	2	6	29245	29250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717133
571	NC_014258	GCC	2	6	29294	29299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717133
572	NC_014258	GCA	2	6	29359	29364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717133
573	NC_014258	GCAG	2	8	29409	29416	25 %	0 %	50 %	25 %	298717133
574	NC_014258	TCC	2	6	29432	29437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298717133
575	NC_014258	ATC	2	6	29462	29467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717133
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578	NC_014258	ATA	2	6	29550	29555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298717133
579	NC_014258	GGCA	2	8	29567	29574	25 %	0 %	50 %	25 %	298717133
580	NC_014258	GAC	3	9	29594	29602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717133
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583	NC_014258	CGG	2	6	29714	29719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717133
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586	NC_014258	CG	3	6	29851	29856	0 %	0 %	50 %	50 %	298717134
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588	NC_014258	CAGCG	2	10	29941	29950	20 %	0 %	40 %	40 %	298717134
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591	NC_014258	CGGT	2	8	30099	30106	0 %	25 %	50 %	25 %	298717134
592	NC_014258	GT	3	6	30214	30219	0 %	50 %	50 %	0 %	298717134
593	NC_014258	CGG	2	6	30276	30281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717134
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596	NC_014258	CTT	2	6	30435	30440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298717134
597	NC_014258	GCC	2	6	30463	30468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717134
598	NC_014258	CAGG	2	8	30558	30565	25 %	0 %	50 %	25 %	298717134
599	NC_014258	TGG	2	6	30570	30575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717134
600	NC_014258	GCAGAC	2	12	30615	30626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717134
601	NC_014258	CAT	2	6	30721	30726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717134
602	NC_014258	TAA	2	6	30743	30748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298717134
603	NC_014258	GCA	2	6	30869	30874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717134
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605	NC_014258	AG	3	6	30960	30965	50 %	0 %	50 %	0 %	298717135
606	NC_014258	AAC	2	6	30972	30977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717135
607	NC_014258	CAGAG	2	10	30978	30987	40 %	0 %	40 %	20 %	298717135
608	NC_014258	CTG	2	6	31038	31043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717135
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610	NC_014258	CCG	2	6	31078	31083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717135
611	NC_014258	CGC	2	6	31116	31121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717135
612	NC_014258	CGA	2	6	31208	31213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717135
613	NC_014258	CAGC	2	8	31262	31269	25 %	0 %	25 %	50 %	298717135
614	NC_014258	CCAGCG	2	12	31469	31480	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	298717135
615	NC_014258	TGC	2	6	31533	31538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717135
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617	NC_014258	CCAG	2	8	31571	31578	25 %	0 %	25 %	50 %	298717135
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619	NC_014258	CGGT	2	8	31618	31625	0 %	25 %	50 %	25 %	298717135
620	NC_014258	AAGA	2	8	31626	31633	75 %	0 %	25 %	0 %	298717135
621	NC_014258	CAA	2	6	31673	31678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717135
622	NC_014258	CAG	2	6	31725	31730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717135
623	NC_014258	CGC	2	6	31731	31736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717135
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626	NC_014258	GAT	2	6	31839	31844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717135
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