MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Propionibacterium freudenreichii subsp. shermanii CIRM-BIA1 chromosome

Total Repeats: 57134

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014215	ACAG	2	8	253	260	50 %	0 %	25 %	25 %	297625199
2	NC_014215	CT	3	6	304	309	0 %	50 %	0 %	50 %	297625199
3	NC_014215	TGA	2	6	377	382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297625199
4	NC_014215	CG	3	6	404	409	0 %	0 %	50 %	50 %	297625199
5	NC_014215	ATCGA	2	10	415	424	40 %	20 %	20 %	20 %	297625199
6	NC_014215	ACC	2	6	464	469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297625199
7	NC_014215	CGAGC	2	10	495	504	20 %	0 %	40 %	40 %	297625199
8	NC_014215	C	6	6	523	528	0 %	0 %	0 %	100 %	297625199
9	NC_014215	CGA	2	6	534	539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625199
10	NC_014215	TGCG	2	8	605	612	0 %	25 %	50 %	25 %	297625199
11	NC_014215	CCG	2	6	644	649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625199
12	NC_014215	TCG	2	6	715	720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625199
13	NC_014215	TGC	2	6	735	740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625199
14	NC_014215	GTGGCC	2	12	745	756	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	297625199
15	NC_014215	TGA	2	6	785	790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297625199
16	NC_014215	CTG	2	6	823	828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625199
17	NC_014215	ACT	3	9	854	862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297625199
18	NC_014215	GAG	2	6	892	897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297625199
19	NC_014215	TCA	2	6	911	916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297625199
20	NC_014215	CCG	2	6	948	953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625199
21	NC_014215	CGA	2	6	963	968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625199
22	NC_014215	CGA	2	6	987	992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625199
23	NC_014215	AGACCC	2	12	1013	1024	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	297625199
24	NC_014215	AGG	2	6	1025	1030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297625199
25	NC_014215	TTC	2	6	1033	1038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297625199
26	NC_014215	GCC	2	6	1170	1175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625199
27	NC_014215	GCC	2	6	1213	1218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625199
28	NC_014215	GGAG	2	8	1293	1300	25 %	0 %	75 %	0 %	297625199
29	NC_014215	GAG	2	6	1339	1344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297625199
30	NC_014215	TGGCCG	2	12	1352	1363	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	297625199
31	NC_014215	TGC	2	6	1370	1375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625199
32	NC_014215	CGA	2	6	1418	1423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625199
33	NC_014215	ACT	2	6	1442	1447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297625199
34	NC_014215	CGA	2	6	1461	1466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625199
35	NC_014215	ACCAC	2	10	1586	1595	40 %	0 %	0 %	60 %	297625199
36	NC_014215	TGA	2	6	1628	1633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297625199
37	NC_014215	CG	3	6	1695	1700	0 %	0 %	50 %	50 %	297625199
38	NC_014215	CAC	2	6	1742	1747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297625200
39	NC_014215	GCA	2	6	1777	1782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625200
40	NC_014215	CGA	2	6	1789	1794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625200
41	NC_014215	GCC	2	6	1935	1940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625200
42	NC_014215	CGA	2	6	1981	1986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625200
43	NC_014215	ACA	2	6	2026	2031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297625200
44	NC_014215	CAG	2	6	2045	2050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625200
45	NC_014215	CAG	2	6	2219	2224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625200
46	NC_014215	AAG	2	6	2256	2261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297625200
47	NC_014215	GGC	2	6	2264	2269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297625200
48	NC_014215	GGC	2	6	2273	2278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297625200
49	NC_014215	CG	4	8	2325	2332	0 %	0 %	50 %	50 %	297625200
50	NC_014215	GAC	2	6	2354	2359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625200
51	NC_014215	CG	3	6	2511	2516	0 %	0 %	50 %	50 %	297625200
52	NC_014215	GCG	3	9	2514	2522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297625200
53	NC_014215	CCA	2	6	2557	2562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297625200
54	NC_014215	AGA	2	6	2584	2589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297625200
55	NC_014215	CGA	2	6	2626	2631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625200
56	NC_014215	CGG	2	6	2699	2704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297625200
57	NC_014215	CGC	3	9	2744	2752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625200
58	NC_014215	CGC	2	6	2774	2779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625200
59	NC_014215	CAA	2	6	2897	2902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297625200
60	NC_014215	TCA	2	6	2998	3003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297625200
61	NC_014215	GTC	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625200
62	NC_014215	TCA	2	6	3022	3027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297625200
63	NC_014215	GCG	3	9	3039	3047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297625200
64	NC_014215	GC	3	6	3075	3080	0 %	0 %	50 %	50 %	297625200
65	NC_014215	GC	3	6	3092	3097	0 %	0 %	50 %	50 %	297625200
66	NC_014215	GTC	2	6	3144	3149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625200
67	NC_014215	GCG	2	6	3417	3422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297625201
68	NC_014215	TAC	2	6	3447	3452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297625201
69	NC_014215	GCT	2	6	3464	3469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625201
70	NC_014215	C	6	6	3471	3476	0 %	0 %	0 %	100 %	297625201
71	NC_014215	GAG	2	6	3513	3518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297625201
72	NC_014215	GTG	2	6	3537	3542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297625201
73	NC_014215	CGA	2	6	3646	3651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625201
74	NC_014215	CGA	2	6	3695	3700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625201
75	NC_014215	GC	3	6	3716	3721	0 %	0 %	50 %	50 %	297625201
76	NC_014215	CAT	2	6	3737	3742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297625201
77	NC_014215	GGCC	2	8	3755	3762	0 %	0 %	50 %	50 %	297625201
78	NC_014215	GGC	2	6	3785	3790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297625201
79	NC_014215	CTC	2	6	3819	3824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297625201
80	NC_014215	GTG	2	6	3927	3932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297625201
81	NC_014215	GAG	2	6	3972	3977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297625201
82	NC_014215	GGA	2	6	3992	3997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297625201
83	NC_014215	CGA	2	6	3998	4003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625201
84	NC_014215	GC	3	6	4041	4046	0 %	0 %	50 %	50 %	297625202
85	NC_014215	CCA	2	6	4084	4089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297625202
86	NC_014215	CTCGGC	2	12	4121	4132	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	297625202
87	NC_014215	GCC	2	6	4137	4142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625202
88	NC_014215	CG	3	6	4167	4172	0 %	0 %	50 %	50 %	297625202
89	NC_014215	CGT	3	9	4174	4182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625202
90	NC_014215	CAG	2	6	4187	4192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625202
91	NC_014215	CGT	2	6	4255	4260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625202
92	NC_014215	GCCC	2	8	4276	4283	0 %	0 %	25 %	75 %	297625202
93	NC_014215	GCCGCG	2	12	4284	4295	0 %	0 %	50 %	50 %	297625202
94	NC_014215	CCA	2	6	4330	4335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297625202
95	NC_014215	GGT	2	6	4349	4354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297625202
96	NC_014215	GGC	2	6	4388	4393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297625202
97	NC_014215	CGGGC	2	10	4467	4476	0 %	0 %	60 %	40 %	297625202
98	NC_014215	CCA	2	6	4483	4488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297625202
99	NC_014215	GC	3	6	4507	4512	0 %	0 %	50 %	50 %	297625202
100	NC_014215	CCA	2	6	4531	4536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297625202
101	NC_014215	GCC	2	6	4564	4569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625202
102	NC_014215	CAG	2	6	4580	4585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625202
103	NC_014215	GC	3	6	4617	4622	0 %	0 %	50 %	50 %	297625202
104	NC_014215	GCCC	2	8	4635	4642	0 %	0 %	25 %	75 %	297625202
105	NC_014215	CGC	2	6	4696	4701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625202
106	NC_014215	TCG	2	6	4723	4728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625202
107	NC_014215	CGC	2	6	4791	4796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625202
108	NC_014215	CGC	2	6	4895	4900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625202
109	NC_014215	CAC	2	6	4925	4930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297625202
110	NC_014215	TGGC	2	8	5049	5056	0 %	25 %	50 %	25 %	297625202
111	NC_014215	GCT	2	6	5107	5112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625202
112	NC_014215	ACC	2	6	5136	5141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297625202
113	NC_014215	TCGG	2	8	5230	5237	0 %	25 %	50 %	25 %	297625203
114	NC_014215	GCC	2	6	5241	5246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625203
115	NC_014215	GGC	2	6	5349	5354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297625203
116	NC_014215	AGC	2	6	5374	5379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625203
117	NC_014215	GTG	2	6	5392	5397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297625203
118	NC_014215	CGG	2	6	5426	5431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297625203
119	NC_014215	GTTC	2	8	5441	5448	0 %	50 %	25 %	25 %	297625203
120	NC_014215	TCG	2	6	5449	5454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625203
121	NC_014215	CCA	2	6	5483	5488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297625203
122	NC_014215	CCA	2	6	5507	5512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297625203
123	NC_014215	CGC	2	6	5573	5578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625203
124	NC_014215	TGGATG	2	12	5626	5637	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	297625203
125	NC_014215	CCG	2	6	5653	5658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625203
126	NC_014215	CGT	2	6	5732	5737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625203
127	NC_014215	GAT	2	6	5796	5801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297625203
128	NC_014215	CGT	2	6	5831	5836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625203
129	NC_014215	GTA	2	6	5844	5849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297625203
130	NC_014215	TGG	2	6	5903	5908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297625203
131	NC_014215	CGG	2	6	5987	5992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297625203
132	NC_014215	GCCGTA	2	12	5994	6005	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	297625203
133	NC_014215	CGA	2	6	6053	6058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625203
134	NC_014215	GCACA	2	10	6063	6072	40 %	0 %	20 %	40 %	297625203
135	NC_014215	GTT	3	9	6090	6098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297625203
136	NC_014215	CAG	2	6	6192	6197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625203
137	NC_014215	CCA	2	6	6236	6241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297625203
138	NC_014215	GCA	2	6	6274	6279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625203
139	NC_014215	TCG	2	6	6331	6336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625203
140	NC_014215	GCG	2	6	6339	6344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297625203
141	NC_014215	CGA	2	6	6359	6364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625203
142	NC_014215	CGT	2	6	6926	6931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625204
143	NC_014215	CGT	2	6	6957	6962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625204
144	NC_014215	CGA	2	6	6971	6976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625204
145	NC_014215	CCG	2	6	7012	7017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625204
146	NC_014215	CGA	2	6	7028	7033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625204
147	NC_014215	GCG	2	6	7123	7128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297625204
148	NC_014215	GGT	2	6	7136	7141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297625204
149	NC_014215	CCG	2	6	7186	7191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625204
150	NC_014215	GGCC	2	8	7238	7245	0 %	0 %	50 %	50 %	297625204
151	NC_014215	CACC	2	8	7252	7259	25 %	0 %	0 %	75 %	297625204
152	NC_014215	GGT	2	6	7268	7273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297625204
153	NC_014215	GCC	2	6	7477	7482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625204
154	NC_014215	CGG	2	6	7508	7513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297625204
155	NC_014215	CAG	3	9	7515	7523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625204
156	NC_014215	TGG	2	6	7546	7551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297625204
157	NC_014215	CAT	2	6	7562	7567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297625204
158	NC_014215	CGA	2	6	7574	7579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625204
159	NC_014215	CGG	2	6	7600	7605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297625204
160	NC_014215	CCG	2	6	7609	7614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625204
161	NC_014215	GCC	2	6	7692	7697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625204
162	NC_014215	GTT	2	6	7712	7717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297625204
163	NC_014215	TCG	2	6	7735	7740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625204
164	NC_014215	GAGCT	2	10	7788	7797	20 %	20 %	40 %	20 %	297625204
165	NC_014215	CGT	2	6	7877	7882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625205
166	NC_014215	GCT	2	6	7911	7916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625205
167	NC_014215	GGT	2	6	7932	7937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297625205
168	NC_014215	CGC	2	6	7998	8003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625205
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170	NC_014215	GAA	2	6	8088	8093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297625205
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172	NC_014215	GGT	2	6	8205	8210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297625205
173	NC_014215	CAC	2	6	8247	8252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297625205
174	NC_014215	CACC	2	8	8303	8310	25 %	0 %	0 %	75 %	297625205
175	NC_014215	CGA	3	9	8313	8321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625205
176	NC_014215	AAG	2	6	8410	8415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297625205
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184	NC_014215	TGG	3	9	8711	8719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297625205
185	NC_014215	TGG	2	6	8753	8758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297625205
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189	NC_014215	CGT	2	6	8960	8965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625205
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249	NC_014215	GTG	2	6	12920	12925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297625206
250	NC_014215	CGAGGG	2	12	12960	12971	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	297625206
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252	NC_014215	CGC	2	6	13006	13011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625206
253	NC_014215	CAC	2	6	13017	13022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297625206
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255	NC_014215	GAG	2	6	13102	13107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297625206
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257	NC_014215	CGC	2	6	13197	13202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625206
258	NC_014215	CGG	2	6	13260	13265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297625206
259	NC_014215	CCTG	2	8	13373	13380	0 %	25 %	25 %	50 %	297625206
260	NC_014215	TCG	2	6	13539	13544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625207
261	NC_014215	ACC	2	6	13545	13550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297625207
262	NC_014215	GCC	2	6	13580	13585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297625207
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266	NC_014215	TGG	3	9	13752	13760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297625207
267	NC_014215	CGA	2	6	13768	13773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625207
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273	NC_014215	TGC	2	6	14013	14018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297625207
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285	NC_014215	CGA	2	6	14398	14403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625207
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292	NC_014215	CGA	2	6	14554	14559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625207
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372	NC_014215	CGTGG	2	10	18130	18139	0 %	20 %	60 %	20 %	297625210
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383	NC_014215	TC	3	6	18781	18786	0 %	50 %	0 %	50 %	297625212
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387	NC_014215	GGC	2	6	18861	18866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297625212
388	NC_014215	CGA	2	6	18913	18918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297625212
389	NC_014215	AC	3	6	18931	18936	50 %	0 %	0 %	50 %	297625212
390	NC_014215	ACGT	2	8	18950	18957	25 %	25 %	25 %	25 %	297625212
391	NC_014215	ATC	2	6	18965	18970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297625212
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491	NC_014215	GAG	2	6	23578	23583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297625215
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500	NC_014215	GAAG	2	8	23955	23962	50 %	0 %	50 %	0 %	297625215

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