MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Planctomyces limnophilus DSM 3776 plasmid pPLIM01

Total Repeats: 661

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014149	CAT	2	6	28341	28346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296051618
502	NC_014149	CTG	2	6	28469	28474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296051618
503	NC_014149	GAT	2	6	28494	28499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296051618
504	NC_014149	CGA	2	6	28589	28594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296051618
505	NC_014149	TCA	2	6	28646	28651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296051618
506	NC_014149	GGC	2	6	28799	28804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296051619
507	NC_014149	GTC	2	6	28893	28898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296051619
508	NC_014149	TGT	2	6	28911	28916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296051619
509	NC_014149	CTC	2	6	28942	28947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296051620
510	NC_014149	GCT	2	6	28988	28993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296051620
511	NC_014149	ACG	3	9	29018	29026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296051620
512	NC_014149	CAG	2	6	29035	29040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296051620
513	NC_014149	CTG	2	6	29043	29048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296051620
514	NC_014149	TGG	2	6	29071	29076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296051620
515	NC_014149	TGC	2	6	29110	29115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296051620
516	NC_014149	GCG	3	9	29150	29158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296051620
517	NC_014149	GAA	2	6	29236	29241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296051621
518	NC_014149	AG	3	6	29246	29251	50 %	0 %	50 %	0 %	296051621
519	NC_014149	AAG	2	6	29256	29261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296051621
520	NC_014149	CGC	2	6	29269	29274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296051621
521	NC_014149	GATT	2	8	29290	29297	25 %	50 %	25 %	0 %	296051621
522	NC_014149	GGC	2	6	29324	29329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296051621
523	NC_014149	GTCGAT	2	12	29336	29347	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	296051621
524	NC_014149	GAG	2	6	29354	29359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296051621
525	NC_014149	CTG	2	6	29360	29365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296051621
526	NC_014149	CGC	2	6	29371	29376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296051621
527	NC_014149	CCG	2	6	29377	29382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296051621
528	NC_014149	CAA	2	6	29395	29400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296051621
529	NC_014149	GGC	2	6	29441	29446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296051621
530	NC_014149	CAG	2	6	29497	29502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296051622
531	NC_014149	GCA	2	6	29513	29518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296051622
532	NC_014149	GGCTG	2	10	29534	29543	0 %	20 %	60 %	20 %	296051622
533	NC_014149	AGC	2	6	29609	29614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296051622
534	NC_014149	GGT	2	6	29637	29642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296051622
535	NC_014149	GAT	3	9	29677	29685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296051622
536	NC_014149	TCCAG	2	10	29769	29778	20 %	20 %	20 %	40 %	296051622
537	NC_014149	CAAC	2	8	29827	29834	50 %	0 %	0 %	50 %	296051623
538	NC_014149	GAA	2	6	30080	30085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296051623
539	NC_014149	TCG	2	6	30089	30094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296051623
540	NC_014149	GCC	2	6	30228	30233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296051624
541	NC_014149	ATC	2	6	30254	30259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296051624
542	NC_014149	ATC	2	6	30282	30287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296051624
543	NC_014149	GAAG	2	8	30337	30344	50 %	0 %	50 %	0 %	296051624
544	NC_014149	GAA	2	6	30383	30388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296051624
545	NC_014149	TCAC	2	8	30416	30423	25 %	25 %	0 %	50 %	296051624
546	NC_014149	GCA	3	9	30479	30487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296051624
547	NC_014149	TGAA	2	8	30508	30515	50 %	25 %	25 %	0 %	296051624
548	NC_014149	TCG	2	6	30713	30718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296051625
549	NC_014149	TCA	2	6	30728	30733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296051625
550	NC_014149	TGC	2	6	30737	30742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296051625
551	NC_014149	AGCCAG	2	12	30776	30787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296051625
552	NC_014149	CTGG	2	8	30796	30803	0 %	25 %	50 %	25 %	296051625
553	NC_014149	GCA	2	6	30828	30833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296051625
554	NC_014149	GCCG	2	8	30846	30853	0 %	0 %	50 %	50 %	296051625
555	NC_014149	TCAG	2	8	31081	31088	25 %	25 %	25 %	25 %	296051626
556	NC_014149	CGA	2	6	31161	31166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296051627
557	NC_014149	AAG	2	6	31167	31172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296051627
558	NC_014149	CAA	2	6	31243	31248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296051627
559	NC_014149	GAA	2	6	31405	31410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296051627
560	NC_014149	GCT	2	6	31623	31628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296051628
561	NC_014149	CGC	2	6	31644	31649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296051628
562	NC_014149	GAAGAG	2	12	31774	31785	50 %	0 %	50 %	0 %	296051628
563	NC_014149	T	6	6	31786	31791	0 %	100 %	0 %	0 %	296051628
564	NC_014149	ACGAAA	2	12	31798	31809	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	296051628
565	NC_014149	CCA	2	6	31826	31831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296051628
566	NC_014149	GAAA	2	8	31854	31861	75 %	0 %	25 %	0 %	296051628
567	NC_014149	TCG	2	6	31916	31921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296051628
568	NC_014149	CT	3	6	31942	31947	0 %	50 %	0 %	50 %	296051628
569	NC_014149	AAG	2	6	31978	31983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296051628
570	NC_014149	CAG	2	6	31986	31991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296051628
571	NC_014149	GAT	2	6	32026	32031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296051628
572	NC_014149	TAAT	2	8	32069	32076	50 %	50 %	0 %	0 %	296051628
573	NC_014149	GGC	2	6	32289	32294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296051628
574	NC_014149	GCC	2	6	32317	32322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296051628
575	NC_014149	GCT	3	9	32364	32372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296051628
576	NC_014149	GCC	2	6	32376	32381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296051628
577	NC_014149	CCGC	2	8	32426	32433	0 %	0 %	25 %	75 %	296051628
578	NC_014149	TGC	2	6	32447	32452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296051628
579	NC_014149	GGA	2	6	32514	32519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296051628
580	NC_014149	GAG	2	6	32536	32541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296051628
581	NC_014149	TGA	2	6	32555	32560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296051628
582	NC_014149	TCGT	2	8	32576	32583	0 %	50 %	25 %	25 %	296051628
583	NC_014149	CTA	2	6	32613	32618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296051628
584	NC_014149	GAG	2	6	32665	32670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296051628
585	NC_014149	TTG	2	6	32681	32686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296051628
586	NC_014149	CGA	2	6	32713	32718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296051628
587	NC_014149	CAA	2	6	32727	32732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296051628
588	NC_014149	A	6	6	32731	32736	100 %	0 %	0 %	0 %	296051628
589	NC_014149	GAG	2	6	32743	32748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296051628
590	NC_014149	AAG	3	9	32770	32778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296051628
591	NC_014149	AAG	2	6	32818	32823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296051628
592	NC_014149	CAG	2	6	32839	32844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296051628
593	NC_014149	AGC	2	6	32858	32863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296051628
594	NC_014149	GATTG	2	10	32929	32938	20 %	40 %	40 %	0 %	296051628
595	NC_014149	GCGA	2	8	32947	32954	25 %	0 %	50 %	25 %	296051628
596	NC_014149	GCA	2	6	32997	33002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296051628
597	NC_014149	TGA	2	6	33078	33083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296051628
598	NC_014149	CTG	2	6	33103	33108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296051628
599	NC_014149	GAT	2	6	33127	33132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296051628
600	NC_014149	TTC	2	6	33173	33178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296051628
601	NC_014149	GAG	2	6	33295	33300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296051628
602	NC_014149	CAG	2	6	33363	33368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296051628
603	NC_014149	AAG	2	6	33373	33378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296051628
604	NC_014149	CGA	2	6	33390	33395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296051628
605	NC_014149	GCA	2	6	33402	33407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296051628
606	NC_014149	CTG	2	6	33408	33413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296051628
607	NC_014149	GGC	2	6	33450	33455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296051628
608	NC_014149	GTG	2	6	33471	33476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296051628
609	NC_014149	CAGC	2	8	33611	33618	25 %	0 %	25 %	50 %	296051629
610	NC_014149	GCCA	2	8	33651	33658	25 %	0 %	25 %	50 %	296051629
611	NC_014149	CGC	2	6	33750	33755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296051629
612	NC_014149	CGC	2	6	33777	33782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296051629
613	NC_014149	CAG	2	6	33891	33896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296051630
614	NC_014149	ACGA	2	8	33920	33927	50 %	0 %	25 %	25 %	296051630
615	NC_014149	T	6	6	33974	33979	0 %	100 %	0 %	0 %	296051630
616	NC_014149	CT	3	6	34249	34254	0 %	50 %	0 %	50 %	296051631
617	NC_014149	TTGA	2	8	34285	34292	25 %	50 %	25 %	0 %	296051631
618	NC_014149	ATC	2	6	34336	34341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296051631
619	NC_014149	ATC	2	6	34408	34413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296051631
620	NC_014149	GAT	2	6	34419	34424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296051631
621	NC_014149	A	6	6	34435	34440	100 %	0 %	0 %	0 %	296051631
622	NC_014149	CAT	2	6	34563	34568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296051631
623	NC_014149	GCG	2	6	34569	34574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296051631
624	NC_014149	GCT	2	6	34587	34592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296051631
625	NC_014149	ATC	2	6	34597	34602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296051631
626	NC_014149	GAG	2	6	34744	34749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296051631
627	NC_014149	TCC	2	6	34755	34760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296051631
628	NC_014149	CGCT	2	8	35020	35027	0 %	25 %	25 %	50 %	296051632
629	NC_014149	TCA	2	6	35146	35151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296051632
630	NC_014149	A	6	6	35156	35161	100 %	0 %	0 %	0 %	296051632
631	NC_014149	CA	3	6	35256	35261	50 %	0 %	0 %	50 %	296051632
632	NC_014149	CAG	2	6	35337	35342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296051632
633	NC_014149	ACG	2	6	35353	35358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296051632
634	NC_014149	TCG	2	6	35490	35495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296051633
635	NC_014149	GCAG	2	8	35516	35523	25 %	0 %	50 %	25 %	296051633
636	NC_014149	TGA	2	6	35545	35550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296051633
637	NC_014149	TCGC	2	8	35588	35595	0 %	25 %	25 %	50 %	296051633
638	NC_014149	GTC	2	6	35786	35791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296051634
639	NC_014149	CAAT	2	8	36008	36015	50 %	25 %	0 %	25 %	296051635
640	NC_014149	GACT	2	8	36035	36042	25 %	25 %	25 %	25 %	296051635
641	NC_014149	AGC	2	6	36097	36102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296051635
642	NC_014149	TGT	2	6	36131	36136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296051635
643	NC_014149	CTGA	2	8	36223	36230	25 %	25 %	25 %	25 %	296051635
644	NC_014149	CGA	2	6	36338	36343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296051636
645	NC_014149	CGAT	2	8	36352	36359	25 %	25 %	25 %	25 %	296051636
646	NC_014149	TGA	2	6	36371	36376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296051636
647	NC_014149	GCA	2	6	36407	36412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296051636
648	NC_014149	AGCG	2	8	36433	36440	25 %	0 %	50 %	25 %	296051636
649	NC_014149	CTCG	2	8	36443	36450	0 %	25 %	25 %	50 %	296051636
650	NC_014149	ATC	2	6	36555	36560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296051636
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652	NC_014149	TCGA	2	8	36612	36619	25 %	25 %	25 %	25 %	296051636
653	NC_014149	CGA	2	6	36658	36663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296051636
654	NC_014149	GAC	2	6	36690	36695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296051636
655	NC_014149	ATC	2	6	36732	36737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296051636
656	NC_014149	TTC	2	6	36780	36785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296051636
657	NC_014149	CGT	2	6	36797	36802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296051636
658	NC_014149	AGCC	2	8	36856	36863	25 %	0 %	25 %	50 %	296051636
659	NC_014149	GAA	2	6	36869	36874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296051636
660	NC_014149	TTC	2	6	36912	36917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296051636
661	NC_014149	AGCG	2	8	36944	36951	25 %	0 %	50 %	25 %	296051636

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