MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pantoea ananatis LMG 20103 chromosome

Total Repeats: 83347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013956	CG	3	6	213	218	0 %	0 %	50 %	50 %	291615554
2	NC_013956	CCA	2	6	311	316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615554
3	NC_013956	CCG	2	6	347	352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615554
4	NC_013956	TCA	2	6	353	358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615554
5	NC_013956	GGCT	2	8	397	404	0 %	25 %	50 %	25 %	291615554
6	NC_013956	CTT	2	6	488	493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615554
7	NC_013956	TGG	2	6	531	536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291615554
8	NC_013956	ATG	3	9	541	549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615554
9	NC_013956	GC	3	6	556	561	0 %	0 %	50 %	50 %	291615554
10	NC_013956	GC	3	6	573	578	0 %	0 %	50 %	50 %	291615554
11	NC_013956	AT	3	6	750	755	50 %	50 %	0 %	0 %	291615554
12	NC_013956	TAC	2	6	765	770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615554
13	NC_013956	CGC	2	6	778	783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615554
14	NC_013956	TGA	2	6	824	829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615554
15	NC_013956	TG	3	6	893	898	0 %	50 %	50 %	0 %	291615554
16	NC_013956	GTGTT	2	10	902	911	0 %	60 %	40 %	0 %	291615554
17	NC_013956	CTT	2	6	916	921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615554
18	NC_013956	TTA	2	6	956	961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291615554
19	NC_013956	GGTA	2	8	993	1000	25 %	25 %	50 %	0 %	291615554
20	NC_013956	TG	3	6	1036	1041	0 %	50 %	50 %	0 %	291615554
21	NC_013956	ATG	2	6	1105	1110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615554
22	NC_013956	GCT	2	6	1158	1163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615554
23	NC_013956	TGGTT	2	10	1168	1177	0 %	60 %	40 %	0 %	291615554
24	NC_013956	CGC	2	6	1180	1185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615554
25	NC_013956	ATT	3	9	1263	1271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291615554
26	NC_013956	CTG	2	6	1285	1290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615554
27	NC_013956	GCTG	2	8	1335	1342	0 %	25 %	50 %	25 %	291615554
28	NC_013956	GAC	2	6	1351	1356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615554
29	NC_013956	GGC	2	6	1366	1371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615554
30	NC_013956	ACA	2	6	1392	1397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291615554
31	NC_013956	GCT	2	6	1429	1434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615554
32	NC_013956	ACG	2	6	1465	1470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615554
33	NC_013956	TTCCA	2	10	1480	1489	20 %	40 %	0 %	40 %	291615554
34	NC_013956	ATG	2	6	1537	1542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615554
35	NC_013956	AAAAAG	2	12	1585	1596	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	291615554
36	NC_013956	GCTG	2	8	1646	1653	0 %	25 %	50 %	25 %	291615555
37	NC_013956	TATC	2	8	1685	1692	25 %	50 %	0 %	25 %	291615555
38	NC_013956	TGA	2	6	1720	1725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615555
39	NC_013956	GCG	2	6	1736	1741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615555
40	NC_013956	CGT	2	6	1850	1855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615555
41	NC_013956	GCG	3	9	1874	1882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615555
42	NC_013956	GCC	2	6	1917	1922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615555
43	NC_013956	ACA	2	6	1945	1950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291615555
44	NC_013956	TAA	2	6	1993	1998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291615555
45	NC_013956	TGC	2	6	2080	2085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615555
46	NC_013956	AAC	2	6	2104	2109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291615555
47	NC_013956	AAT	2	6	2121	2126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291615555
48	NC_013956	CAT	2	6	2157	2162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615555
49	NC_013956	AAGC	2	8	2232	2239	50 %	0 %	25 %	25 %	291615555
50	NC_013956	GCA	2	6	2255	2260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615555
51	NC_013956	GC	3	6	2283	2288	0 %	0 %	50 %	50 %	291615555
52	NC_013956	TCG	2	6	2290	2295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615555
53	NC_013956	CACG	2	8	2354	2361	25 %	0 %	25 %	50 %	291615555
54	NC_013956	CAG	2	6	2394	2399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615555
55	NC_013956	TTGGT	2	10	2413	2422	0 %	60 %	40 %	0 %	291615555
56	NC_013956	T	6	6	2486	2491	0 %	100 %	0 %	0 %	291615555
57	NC_013956	CACG	2	8	2492	2499	25 %	0 %	25 %	50 %	291615555
58	NC_013956	TTG	2	6	2521	2526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291615555
59	NC_013956	CTG	3	9	2602	2610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615555
60	NC_013956	GTC	2	6	2617	2622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615555
61	NC_013956	CGG	2	6	2682	2687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615556
62	NC_013956	CAT	2	6	2706	2711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615556
63	NC_013956	CAG	2	6	2766	2771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615556
64	NC_013956	GCG	3	9	2894	2902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615556
65	NC_013956	TGC	2	6	2908	2913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615556
66	NC_013956	ATC	3	9	2914	2922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615556
67	NC_013956	ATT	2	6	2923	2928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291615556
68	NC_013956	ATG	2	6	2975	2980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615556
69	NC_013956	ATC	2	6	2998	3003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615556
70	NC_013956	CGC	2	6	3067	3072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615556
71	NC_013956	CTG	2	6	3136	3141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615556
72	NC_013956	GCG	2	6	3159	3164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615556
73	NC_013956	TTCGCC	2	12	3205	3216	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	291615556
74	NC_013956	ATC	2	6	3227	3232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615556
75	NC_013956	GCT	2	6	3297	3302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615556
76	NC_013956	TCA	2	6	3323	3328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615556
77	NC_013956	GGA	2	6	3527	3532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291615556
78	NC_013956	ATTT	2	8	3585	3592	25 %	75 %	0 %	0 %	291615557
79	NC_013956	CAG	2	6	3655	3660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615557
80	NC_013956	CGA	2	6	3763	3768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615557
81	NC_013956	GC	3	6	3808	3813	0 %	0 %	50 %	50 %	291615557
82	NC_013956	GCA	2	6	3868	3873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615557
83	NC_013956	GGCT	2	8	3918	3925	0 %	25 %	50 %	25 %	291615557
84	NC_013956	CAG	2	6	3952	3957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615557
85	NC_013956	GCA	2	6	3987	3992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615557
86	NC_013956	GCC	2	6	4073	4078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615557
87	NC_013956	TGAC	2	8	4101	4108	25 %	25 %	25 %	25 %	291615557
88	NC_013956	TCGG	2	8	4200	4207	0 %	25 %	50 %	25 %	291615557
89	NC_013956	GTT	2	6	4274	4279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291615557
90	NC_013956	CTT	2	6	4321	4326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615557
91	NC_013956	GAA	2	6	4352	4357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291615557
92	NC_013956	GTT	2	6	4361	4366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291615557
93	NC_013956	GCGCTG	2	12	4407	4418	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	291615557
94	NC_013956	TCA	2	6	4459	4464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615557
95	NC_013956	TGC	2	6	4494	4499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615558
96	NC_013956	CCA	2	6	4509	4514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615558
97	NC_013956	CAG	2	6	4522	4527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615558
98	NC_013956	ATC	2	6	4547	4552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615558
99	NC_013956	ACG	2	6	4560	4565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615558
100	NC_013956	CAA	2	6	4629	4634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291615558
101	NC_013956	CGG	2	6	4677	4682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615558
102	NC_013956	GCC	2	6	4763	4768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615558
103	NC_013956	GA	3	6	4823	4828	50 %	0 %	50 %	0 %	291615558
104	NC_013956	C	7	7	4846	4852	0 %	0 %	0 %	100 %	291615558
105	NC_013956	GTG	2	6	4882	4887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291615558
106	NC_013956	GCC	2	6	4901	4906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615558
107	NC_013956	GAC	2	6	4953	4958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615558
108	NC_013956	CAT	2	6	5056	5061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615558
109	NC_013956	CG	4	8	5094	5101	0 %	0 %	50 %	50 %	291615558
110	NC_013956	CCGCAA	2	12	5151	5162	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	291615558
111	NC_013956	CCA	2	6	5184	5189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615558
112	NC_013956	GCC	2	6	5195	5200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615558
113	NC_013956	AG	3	6	5233	5238	50 %	0 %	50 %	0 %	291615558
114	NC_013956	CTG	2	6	5302	5307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615558
115	NC_013956	CTGG	2	8	5350	5357	0 %	25 %	50 %	25 %	291615558
116	NC_013956	AGC	2	6	5405	5410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615558
117	NC_013956	GGT	2	6	5452	5457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291615558
118	NC_013956	CGC	2	6	5540	5545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615559
119	NC_013956	CGA	2	6	5607	5612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615559
120	NC_013956	AAT	2	6	5619	5624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291615559
121	NC_013956	T	7	7	5670	5676	0 %	100 %	0 %	0 %	291615559
122	NC_013956	CG	3	6	5693	5698	0 %	0 %	50 %	50 %	291615559
123	NC_013956	CCG	2	6	5770	5775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615559
124	NC_013956	GCT	2	6	5792	5797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615559
125	NC_013956	GCT	2	6	5849	5854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615559
126	NC_013956	GCC	2	6	5874	5879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615559
127	NC_013956	TGAC	2	8	5924	5931	25 %	25 %	25 %	25 %	291615559
128	NC_013956	CAC	2	6	6015	6020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615559
129	NC_013956	GCA	2	6	6061	6066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615559
130	NC_013956	TCA	2	6	6080	6085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615559
131	NC_013956	CAT	2	6	6255	6260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615559
132	NC_013956	TTC	2	6	6273	6278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615559
133	NC_013956	CAT	2	6	6335	6340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615559
134	NC_013956	GTCG	2	8	6456	6463	0 %	25 %	50 %	25 %	291615559
135	NC_013956	ATG	2	6	6475	6480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615559
136	NC_013956	CCA	2	6	6548	6553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615559
137	NC_013956	AGC	2	6	6589	6594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615559
138	NC_013956	ATA	2	6	6715	6720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291615559
139	NC_013956	CGT	2	6	6759	6764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615559
140	NC_013956	TTC	2	6	6765	6770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615559
141	NC_013956	TCA	2	6	6824	6829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615559
142	NC_013956	CCA	2	6	6857	6862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615559
143	NC_013956	TGTT	2	8	7054	7061	0 %	75 %	25 %	0 %	291615560
144	NC_013956	TGC	2	6	7166	7171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615560
145	NC_013956	TTC	2	6	7177	7182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615560
146	NC_013956	ACC	2	6	7229	7234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615560
147	NC_013956	GGCG	2	8	7341	7348	0 %	0 %	75 %	25 %	291615560
148	NC_013956	AG	3	6	7357	7362	50 %	0 %	50 %	0 %	291615560
149	NC_013956	T	6	6	7384	7389	0 %	100 %	0 %	0 %	291615561
150	NC_013956	ACA	2	6	7825	7830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291615562
151	NC_013956	CTG	3	9	7857	7865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615562
152	NC_013956	CGGC	2	8	7871	7878	0 %	0 %	50 %	50 %	291615562
153	NC_013956	CAA	2	6	7895	7900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291615562
154	NC_013956	TTG	2	6	7908	7913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291615562
155	NC_013956	GCA	2	6	7915	7920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615562
156	NC_013956	GCA	2	6	7960	7965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615562
157	NC_013956	GTA	2	6	8017	8022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615562
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159	NC_013956	CGG	2	6	8258	8263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615563
160	NC_013956	CAG	2	6	8338	8343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615563
161	NC_013956	CCGC	2	8	8372	8379	0 %	0 %	25 %	75 %	291615563
162	NC_013956	CGC	3	9	8485	8493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615563
163	NC_013956	GAAA	2	8	8560	8567	75 %	0 %	25 %	0 %	291615563
164	NC_013956	GAA	2	6	8659	8664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291615563
165	NC_013956	CAT	2	6	8719	8724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615563
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168	NC_013956	GTTT	2	8	8809	8816	0 %	75 %	25 %	0 %	291615564
169	NC_013956	TTG	2	6	8855	8860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291615564
170	NC_013956	TGC	2	6	8932	8937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615564
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172	NC_013956	ACG	2	6	8967	8972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615564
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174	NC_013956	ACG	2	6	9088	9093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615564
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248	NC_013956	GCT	2	6	12684	12689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615566
249	NC_013956	AACG	2	8	12700	12707	50 %	0 %	25 %	25 %	291615566
250	NC_013956	GAA	2	6	12730	12735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291615566
251	NC_013956	A	6	6	12734	12739	100 %	0 %	0 %	0 %	291615566
252	NC_013956	CTG	2	6	12751	12756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615566
253	NC_013956	GCA	2	6	12866	12871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615566
254	NC_013956	CAT	2	6	12880	12885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291615566
255	NC_013956	CGA	2	6	12930	12935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615566
256	NC_013956	GCA	2	6	12951	12956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615566
257	NC_013956	CAG	2	6	13015	13020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615566
258	NC_013956	CGC	2	6	13057	13062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615566
259	NC_013956	GATCT	2	10	13132	13141	20 %	40 %	20 %	20 %	291615566
260	NC_013956	CAG	2	6	13231	13236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615566
261	NC_013956	GCA	2	6	13254	13259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615566
262	NC_013956	CAG	2	6	13288	13293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615566
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265	NC_013956	GGC	2	6	13486	13491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615566
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290	NC_013956	TGA	2	6	14582	14587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615567
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388	NC_013956	T	6	6	20163	20168	0 %	100 %	0 %	0 %	291615571
389	NC_013956	CAC	2	6	20186	20191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615571
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391	NC_013956	GCA	2	6	20208	20213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615571
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395	NC_013956	TGC	2	6	20380	20385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615571
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