MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pedobacter heparinus DSM 2366 chromosome

Total Repeats: 90248

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013061	ATG	2	6	7	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255529917
2	NC_013061	CTTAT	2	10	43	52	20 %	60 %	0 %	20 %	255529917
3	NC_013061	CAG	2	6	103	108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255529917
4	NC_013061	ATC	2	6	172	177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255529917
5	NC_013061	ATC	2	6	241	246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255529917
6	NC_013061	ATTG	2	8	258	265	25 %	50 %	25 %	0 %	255529917
7	NC_013061	GAA	2	6	322	327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	255529917
8	NC_013061	GGC	2	6	372	377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	255529917
9	NC_013061	A	6	6	405	410	100 %	0 %	0 %	0 %	255529917
10	NC_013061	CTG	2	6	457	462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255529917
11	NC_013061	TAT	2	6	466	471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	255529917
12	NC_013061	T	7	7	471	477	0 %	100 %	0 %	0 %	255529917
13	NC_013061	T	6	6	483	488	0 %	100 %	0 %	0 %	255529917
14	NC_013061	A	6	6	509	514	100 %	0 %	0 %	0 %	255529917
15	NC_013061	CTG	2	6	533	538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255529917
16	NC_013061	GCA	2	6	770	775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255529917
17	NC_013061	CCTT	2	8	787	794	0 %	50 %	0 %	50 %	255529917
18	NC_013061	GAT	2	6	847	852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255529917
19	NC_013061	ACATG	2	10	990	999	40 %	20 %	20 %	20 %	255529917
20	NC_013061	AGG	2	6	1022	1027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	255529917
21	NC_013061	A	6	6	1033	1038	100 %	0 %	0 %	0 %	255529917
22	NC_013061	ATT	2	6	1040	1045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	255529917
23	NC_013061	TCA	2	6	1046	1051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255529917
24	NC_013061	GAT	2	6	1191	1196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255529917
25	NC_013061	TGA	2	6	1223	1228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255529917
26	NC_013061	A	6	6	1290	1295	100 %	0 %	0 %	0 %	255529918
27	NC_013061	TTG	2	6	1309	1314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	255529918
28	NC_013061	CCA	2	6	1421	1426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	255529918
29	NC_013061	AGA	2	6	1520	1525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	255529918
30	NC_013061	T	7	7	1592	1598	0 %	100 %	0 %	0 %	255529918
31	NC_013061	G	6	6	1637	1642	0 %	0 %	100 %	0 %	255529918
32	NC_013061	A	7	7	1669	1675	100 %	0 %	0 %	0 %	255529918
33	NC_013061	CAG	2	6	1695	1700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255529918
34	NC_013061	A	7	7	1736	1742	100 %	0 %	0 %	0 %	255529918
35	NC_013061	AGA	2	6	1778	1783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	255529918
36	NC_013061	CTG	2	6	1806	1811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255529918
37	NC_013061	TCACGG	2	12	1854	1865	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	255529918
38	NC_013061	GAA	2	6	1900	1905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	255529918
39	NC_013061	GGCTG	2	10	1984	1993	0 %	20 %	60 %	20 %	255529918
40	NC_013061	GTG	2	6	2064	2069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	255529918
41	NC_013061	A	7	7	2245	2251	100 %	0 %	0 %	0 %	255529919
42	NC_013061	AGC	2	6	2261	2266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255529919
43	NC_013061	CGT	2	6	2308	2313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255529919
44	NC_013061	CT	3	6	2326	2331	0 %	50 %	0 %	50 %	255529919
45	NC_013061	CAG	2	6	2350	2355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255529919
46	NC_013061	AAG	2	6	2494	2499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	255529919
47	NC_013061	GTAA	2	8	2500	2507	50 %	25 %	25 %	0 %	255529919
48	NC_013061	ACCTG	2	10	2579	2588	20 %	20 %	20 %	40 %	255529919
49	NC_013061	CAA	2	6	2607	2612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	255529919
50	NC_013061	A	6	6	2687	2692	100 %	0 %	0 %	0 %	255529919
51	NC_013061	CAG	2	6	2787	2792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255529919
52	NC_013061	A	7	7	2971	2977	100 %	0 %	0 %	0 %	255529919
53	NC_013061	ATT	2	6	2989	2994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	255529919
54	NC_013061	GTT	2	6	3022	3027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	255529919
55	NC_013061	AAG	2	6	3204	3209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	255529920
56	NC_013061	T	6	6	3221	3226	0 %	100 %	0 %	0 %	255529920
57	NC_013061	TAT	2	6	3250	3255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	255529920
58	NC_013061	CGA	2	6	3304	3309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255529920
59	NC_013061	A	6	6	3353	3358	100 %	0 %	0 %	0 %	255529920
60	NC_013061	TGG	2	6	3504	3509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	255529921
61	NC_013061	AGC	2	6	3533	3538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255529921
62	NC_013061	GCTTTA	2	12	3593	3604	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	255529921
63	NC_013061	ACT	2	6	3809	3814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255529921
64	NC_013061	GTT	2	6	3881	3886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	255529921
65	NC_013061	T	6	6	3885	3890	0 %	100 %	0 %	0 %	255529921
66	NC_013061	T	6	6	3949	3954	0 %	100 %	0 %	0 %	255529921
67	NC_013061	CAG	2	6	3958	3963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255529921
68	NC_013061	ATGC	2	8	3988	3995	25 %	25 %	25 %	25 %	255529921
69	NC_013061	CAC	2	6	4018	4023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	255529921
70	NC_013061	AAC	2	6	4068	4073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	255529921
71	NC_013061	TTC	3	9	4124	4132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	255529921
72	NC_013061	C	6	6	4137	4142	0 %	0 %	0 %	100 %	255529921
73	NC_013061	TCA	2	6	4218	4223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255529921
74	NC_013061	T	7	7	4267	4273	0 %	100 %	0 %	0 %	255529921
75	NC_013061	TTG	3	9	4308	4316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	255529921
76	NC_013061	AGC	2	6	4417	4422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255529922
77	NC_013061	GCA	2	6	4493	4498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255529922
78	NC_013061	CTG	2	6	4516	4521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255529922
79	NC_013061	TAT	2	6	4552	4557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	255529922
80	NC_013061	CTA	2	6	4574	4579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255529922
81	NC_013061	T	6	6	4591	4596	0 %	100 %	0 %	0 %	255529922
82	NC_013061	CCT	2	6	4614	4619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	255529922
83	NC_013061	CTG	2	6	4630	4635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255529922
84	NC_013061	GCCCT	2	10	4643	4652	0 %	20 %	20 %	60 %	255529922
85	NC_013061	T	7	7	4716	4722	0 %	100 %	0 %	0 %	255529922
86	NC_013061	GCT	2	6	4737	4742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255529922
87	NC_013061	AGA	2	6	4817	4822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	255529922
88	NC_013061	ACA	2	6	4871	4876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	255529922
89	NC_013061	A	6	6	4876	4881	100 %	0 %	0 %	0 %	255529922
90	NC_013061	CTG	2	6	4918	4923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255529922
91	NC_013061	TGC	2	6	5018	5023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255529922
92	NC_013061	GAT	2	6	5053	5058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255529922
93	NC_013061	CGGA	2	8	5114	5121	25 %	0 %	50 %	25 %	255529922
94	NC_013061	A	6	6	5186	5191	100 %	0 %	0 %	0 %	255529922
95	NC_013061	CCAT	2	8	5260	5267	25 %	25 %	0 %	50 %	255529922
96	NC_013061	CTG	3	9	5344	5352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255529922
97	NC_013061	GCA	2	6	5388	5393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255529922
98	NC_013061	CAA	2	6	5421	5426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	255529922
99	NC_013061	CAA	2	6	5448	5453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	255529922
100	NC_013061	CAG	2	6	5718	5723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255529922
101	NC_013061	GAC	2	6	5744	5749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255529922
102	NC_013061	CTT	2	6	5760	5765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	255529922
103	NC_013061	ATG	2	6	5840	5845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255529922
104	NC_013061	C	7	7	5891	5897	0 %	0 %	0 %	100 %	255529922
105	NC_013061	TTC	2	6	5898	5903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	255529922
106	NC_013061	CAG	2	6	5905	5910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255529922
107	NC_013061	AGC	2	6	5932	5937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255529922
108	NC_013061	AAAG	2	8	5992	5999	75 %	0 %	25 %	0 %	255529922
109	NC_013061	CTG	2	6	6019	6024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255529922
110	NC_013061	CTTA	2	8	6037	6044	25 %	50 %	0 %	25 %	255529922
111	NC_013061	GCT	2	6	6069	6074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255529922
112	NC_013061	AAGCAA	2	12	6079	6090	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	255529922
113	NC_013061	AGA	2	6	6147	6152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	255529922
114	NC_013061	CGA	2	6	6198	6203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255529922
115	NC_013061	A	6	6	6227	6232	100 %	0 %	0 %	0 %	255529922
116	NC_013061	CTG	2	6	6241	6246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255529922
117	NC_013061	AAC	2	6	6274	6279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	255529922
118	NC_013061	GAAT	2	8	6294	6301	50 %	25 %	25 %	0 %	255529922
119	NC_013061	GAC	2	6	6399	6404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255529922
120	NC_013061	AGC	3	9	6494	6502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255529922
121	NC_013061	A	6	6	6529	6534	100 %	0 %	0 %	0 %	255529922
122	NC_013061	A	7	7	6554	6560	100 %	0 %	0 %	0 %	255529922
123	NC_013061	CAG	2	6	6562	6567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255529922
124	NC_013061	AAC	2	6	6620	6625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	255529922
125	NC_013061	A	6	6	6667	6672	100 %	0 %	0 %	0 %	255529922
126	NC_013061	GCT	2	6	6673	6678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255529922
127	NC_013061	AAC	2	6	6680	6685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	255529922
128	NC_013061	GGC	2	6	6693	6698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	255529922
129	NC_013061	AGC	2	6	6710	6715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255529922
130	NC_013061	GCA	2	6	6738	6743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255529922
131	NC_013061	CAA	2	6	6895	6900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	255529922
132	NC_013061	ACA	2	6	6914	6919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	255529922
133	NC_013061	GAG	2	6	6988	6993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	255529922
134	NC_013061	CAG	2	6	7072	7077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255529922
135	NC_013061	CTTT	2	8	7102	7109	0 %	75 %	0 %	25 %	255529922
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138	NC_013061	GCA	3	9	7206	7214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255529922
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151	NC_013061	AAAAT	2	10	7676	7685	80 %	20 %	0 %	0 %	255529922
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257	NC_013061	AAC	2	6	12841	12846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	255529926
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262	NC_013061	A	7	7	13074	13080	100 %	0 %	0 %	0 %	255529926
263	NC_013061	GTG	2	6	13087	13092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	255529926
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265	NC_013061	GGAA	2	8	13217	13224	50 %	0 %	50 %	0 %	255529926
266	NC_013061	A	6	6	13252	13257	100 %	0 %	0 %	0 %	255529926
267	NC_013061	TC	3	6	13440	13445	0 %	50 %	0 %	50 %	255529926
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271	NC_013061	CT	3	6	13831	13836	0 %	50 %	0 %	50 %	255529926
272	NC_013061	CTC	2	6	13951	13956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	255529927
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275	NC_013061	CTC	2	6	14059	14064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	255529927
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279	NC_013061	A	6	6	14403	14408	100 %	0 %	0 %	0 %	255529928
280	NC_013061	TG	3	6	14423	14428	0 %	50 %	50 %	0 %	255529928
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286	NC_013061	AT	3	6	14788	14793	50 %	50 %	0 %	0 %	255529928
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293	NC_013061	AT	4	8	15010	15017	50 %	50 %	0 %	0 %	255529928
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394	NC_013061	TCT	2	6	21507	21512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	255529934
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