MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pedobacter heparinus DSM 2366 chromosome

Total Repeats: 90248

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013061	AGA	2	6	233836	233841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	255530118
4002	NC_013061	TGC	2	6	233959	233964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530118
4003	NC_013061	AGTG	2	8	234181	234188	25 %	25 %	50 %	0 %	255530118
4004	NC_013061	GGAAA	2	10	234196	234205	60 %	0 %	40 %	0 %	255530118
4005	NC_013061	TCA	2	6	234384	234389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530118
4006	NC_013061	GCT	2	6	234397	234402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530118
4007	NC_013061	ATT	2	6	234496	234501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	255530118
4008	NC_013061	ACTC	2	8	234585	234592	25 %	25 %	0 %	50 %	255530118
4009	NC_013061	TTG	3	9	234635	234643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	255530118
4010	NC_013061	CAA	2	6	234724	234729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	255530118
4011	NC_013061	CCA	2	6	234759	234764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	255530118
4012	NC_013061	CAG	2	6	234823	234828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530118
4013	NC_013061	ATG	2	6	234846	234851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530118
4014	NC_013061	AAAG	2	8	234907	234914	75 %	0 %	25 %	0 %	255530118
4015	NC_013061	CGG	2	6	234960	234965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	255530118
4016	NC_013061	TGA	2	6	235051	235056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530118
4017	NC_013061	AATA	2	8	235100	235107	75 %	25 %	0 %	0 %	255530118
4018	NC_013061	CAC	2	6	235135	235140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	255530118
4019	NC_013061	CAT	2	6	235300	235305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530118
4020	NC_013061	AGA	2	6	235419	235424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	255530119
4021	NC_013061	GAA	2	6	235504	235509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	255530119
4022	NC_013061	ATG	2	6	235561	235566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530119
4023	NC_013061	ATCA	2	8	235609	235616	50 %	25 %	0 %	25 %	255530119
4024	NC_013061	ATT	2	6	235627	235632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	255530119
4025	NC_013061	ATG	2	6	235651	235656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530119
4026	NC_013061	TGA	2	6	235689	235694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530119
4027	NC_013061	GAG	2	6	235720	235725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	255530119
4028	NC_013061	CTG	3	9	235726	235734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530119
4029	NC_013061	AC	3	6	235773	235778	50 %	0 %	0 %	50 %	255530119
4030	NC_013061	CA	3	6	235836	235841	50 %	0 %	0 %	50 %	255530119
4031	NC_013061	ATG	2	6	235853	235858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530119
4032	NC_013061	GCA	2	6	235863	235868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530119
4033	NC_013061	AGG	2	6	235883	235888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	255530119
4034	NC_013061	GCT	2	6	235893	235898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530119
4035	NC_013061	AAG	2	6	235915	235920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	255530119
4036	NC_013061	GAA	2	6	235939	235944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	255530119
4037	NC_013061	ATG	2	6	235964	235969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530119
4038	NC_013061	ATT	2	6	235973	235978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	255530119
4039	NC_013061	GCA	2	6	235988	235993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530119
4040	NC_013061	GCT	2	6	236079	236084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530119
4041	NC_013061	TGC	2	6	236139	236144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530120
4042	NC_013061	CCT	2	6	236159	236164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	255530120
4043	NC_013061	CCGG	2	8	236225	236232	0 %	0 %	50 %	50 %	255530120
4044	NC_013061	GGCCA	2	10	236277	236286	20 %	0 %	40 %	40 %	255530120
4045	NC_013061	ATC	2	6	236290	236295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530120
4046	NC_013061	CAA	2	6	236357	236362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	255530120
4047	NC_013061	TAGA	2	8	236365	236372	50 %	25 %	25 %	0 %	255530120
4048	NC_013061	CAA	2	6	236378	236383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	255530120
4049	NC_013061	CCG	2	6	236394	236399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	255530120
4050	NC_013061	CAG	2	6	236469	236474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530120
4051	NC_013061	A	6	6	236487	236492	100 %	0 %	0 %	0 %	255530120
4052	NC_013061	T	8	8	236493	236500	0 %	100 %	0 %	0 %	255530120
4053	NC_013061	AAAC	2	8	236508	236515	75 %	0 %	0 %	25 %	255530120
4054	NC_013061	TGT	2	6	236517	236522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	255530120
4055	NC_013061	TGT	2	6	236540	236545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	255530120
4056	NC_013061	T	6	6	236649	236654	0 %	100 %	0 %	0 %	255530120
4057	NC_013061	T	6	6	236728	236733	0 %	100 %	0 %	0 %	255530120
4058	NC_013061	TGGT	2	8	236779	236786	0 %	50 %	50 %	0 %	255530120
4059	NC_013061	AAT	2	6	236835	236840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	255530120
4060	NC_013061	TTA	2	6	236892	236897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	255530121
4061	NC_013061	CCG	2	6	236927	236932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	255530121
4062	NC_013061	GAT	2	6	236954	236959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530121
4063	NC_013061	TCC	2	6	237039	237044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	255530121
4064	NC_013061	T	6	6	237053	237058	0 %	100 %	0 %	0 %	255530121
4065	NC_013061	TTG	2	6	237093	237098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	255530121
4066	NC_013061	TGC	2	6	237113	237118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530121
4067	NC_013061	TTG	2	6	237207	237212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	255530121
4068	NC_013061	TGT	3	9	237219	237227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	255530121
4069	NC_013061	CTGG	2	8	237236	237243	0 %	25 %	50 %	25 %	255530121
4070	NC_013061	T	7	7	237281	237287	0 %	100 %	0 %	0 %	255530121
4071	NC_013061	TTG	2	6	237351	237356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	255530121
4072	NC_013061	GATTT	2	10	237417	237426	20 %	60 %	20 %	0 %	255530121
4073	NC_013061	CCA	2	6	237435	237440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	255530121
4074	NC_013061	GCA	2	6	237507	237512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530121
4075	NC_013061	AGG	2	6	237556	237561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	255530121
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4077	NC_013061	GCTGGG	2	12	237709	237720	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	255530121
4078	NC_013061	TTG	2	6	237723	237728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	255530121
4079	NC_013061	CGAAA	2	10	237739	237748	60 %	0 %	20 %	20 %	255530121
4080	NC_013061	CTG	2	6	237755	237760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530121
4081	NC_013061	TGA	2	6	237799	237804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530121
4082	NC_013061	CAT	2	6	237835	237840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530121
4083	NC_013061	TGG	2	6	237883	237888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	255530121
4084	NC_013061	TTGTT	2	10	237891	237900	0 %	80 %	20 %	0 %	255530121
4085	NC_013061	AGG	2	6	237972	237977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	255530121
4086	NC_013061	CTGC	2	8	237990	237997	0 %	25 %	25 %	50 %	255530121
4087	NC_013061	ATT	2	6	238028	238033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	255530121
4088	NC_013061	CAT	2	6	238123	238128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530121
4089	NC_013061	A	6	6	238181	238186	100 %	0 %	0 %	0 %	255530121
4090	NC_013061	GCG	2	6	238259	238264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	255530121
4091	NC_013061	T	6	6	238268	238273	0 %	100 %	0 %	0 %	255530121
4092	NC_013061	TA	3	6	238285	238290	50 %	50 %	0 %	0 %	255530121
4093	NC_013061	CAT	2	6	238321	238326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530121
4094	NC_013061	TGC	2	6	238375	238380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530121
4095	NC_013061	GTTT	2	8	238397	238404	0 %	75 %	25 %	0 %	255530121
4096	NC_013061	CAGG	2	8	238543	238550	25 %	0 %	50 %	25 %	255530121
4097	NC_013061	TTTG	2	8	238621	238628	0 %	75 %	25 %	0 %	255530121
4098	NC_013061	CCA	2	6	238659	238664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	255530121
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4100	NC_013061	TTG	2	6	238689	238694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	255530121
4101	NC_013061	CCGT	2	8	238697	238704	0 %	25 %	25 %	50 %	255530121
4102	NC_013061	TCA	2	6	238719	238724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530121
4103	NC_013061	C	6	6	238731	238736	0 %	0 %	0 %	100 %	255530121
4104	NC_013061	ATC	2	6	238743	238748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530121
4105	NC_013061	GCC	2	6	238751	238756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	255530121
4106	NC_013061	ATC	2	6	238757	238762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530121
4107	NC_013061	TGT	2	6	238775	238780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	255530121
4108	NC_013061	CTG	2	6	238797	238802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530121
4109	NC_013061	TTTG	2	8	238861	238868	0 %	75 %	25 %	0 %	255530121
4110	NC_013061	T	6	6	238949	238954	0 %	100 %	0 %	0 %	255530121
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4112	NC_013061	T	7	7	239032	239038	0 %	100 %	0 %	0 %	255530121
4113	NC_013061	GGGTC	2	10	239092	239101	0 %	20 %	60 %	20 %	255530121
4114	NC_013061	A	6	6	239108	239113	100 %	0 %	0 %	0 %	255530121
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4117	NC_013061	GGC	2	6	239285	239290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	255530121
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4119	NC_013061	CAT	2	6	239311	239316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530121
4120	NC_013061	GGTA	2	8	239416	239423	25 %	25 %	50 %	0 %	255530121
4121	NC_013061	AAAT	2	8	239431	239438	75 %	25 %	0 %	0 %	255530121
4122	NC_013061	TTG	2	6	239513	239518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	255530121
4123	NC_013061	GTG	2	6	239535	239540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	255530121
4124	NC_013061	AATT	2	8	239648	239655	50 %	50 %	0 %	0 %	255530121
4125	NC_013061	CT	3	6	239900	239905	0 %	50 %	0 %	50 %	255530122
4126	NC_013061	AGA	2	6	239965	239970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	255530122
4127	NC_013061	GCTG	2	8	240019	240026	0 %	25 %	50 %	25 %	255530122
4128	NC_013061	CTG	2	6	240164	240169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530122
4129	NC_013061	CTG	2	6	240185	240190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530122
4130	NC_013061	TAA	2	6	240244	240249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	255530122
4131	NC_013061	TGG	2	6	240321	240326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	255530122
4132	NC_013061	TGGC	2	8	240355	240362	0 %	25 %	50 %	25 %	255530122
4133	NC_013061	GTT	2	6	240376	240381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	255530122
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4136	NC_013061	CTGG	2	8	240419	240426	0 %	25 %	50 %	25 %	255530122
4137	NC_013061	GAA	2	6	240458	240463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	255530122
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4139	NC_013061	TGC	2	6	240636	240641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530122
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4142	NC_013061	TGA	2	6	240708	240713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530122
4143	NC_013061	TGG	2	6	240723	240728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	255530122
4144	NC_013061	ATC	2	6	240797	240802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530122
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4149	NC_013061	A	6	6	240986	240991	100 %	0 %	0 %	0 %	255530122
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4153	NC_013061	CTTT	2	8	241496	241503	0 %	75 %	0 %	25 %	255530122
4154	NC_013061	TGA	2	6	241573	241578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530122
4155	NC_013061	CTG	2	6	241616	241621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530122
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4161	NC_013061	GCA	2	6	241909	241914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530123
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4240	NC_013061	GTA	2	6	245426	245431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530125
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4244	NC_013061	GAA	2	6	245594	245599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	255530125
4245	NC_013061	GTG	3	9	245688	245696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	255530125
4246	NC_013061	GCA	2	6	245735	245740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530125
4247	NC_013061	TGA	2	6	245812	245817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530125
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4249	NC_013061	TGG	3	9	245947	245955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	255530125
4250	NC_013061	TGC	3	9	245956	245964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530125
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4252	NC_013061	A	6	6	245990	245995	100 %	0 %	0 %	0 %	255530125
4253	NC_013061	CTT	2	6	246201	246206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	255530125
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4255	NC_013061	TCATT	2	10	246884	246893	20 %	60 %	0 %	20 %	255530126
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4259	NC_013061	ACTT	2	8	247053	247060	25 %	50 %	0 %	25 %	255530126
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4350	NC_013061	GCT	3	9	251759	251767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530129
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4355	NC_013061	T	7	7	251988	251994	0 %	100 %	0 %	0 %	255530129
4356	NC_013061	A	6	6	252040	252045	100 %	0 %	0 %	0 %	255530129
4357	NC_013061	TGCC	2	8	252051	252058	0 %	25 %	25 %	50 %	255530129
4358	NC_013061	TCA	2	6	252129	252134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530129
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4362	NC_013061	TGTGC	2	10	252344	252353	0 %	40 %	40 %	20 %	255530129
4363	NC_013061	TCT	2	6	252424	252429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	255530130
4364	NC_013061	AAG	2	6	252436	252441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	255530130
4365	NC_013061	AAT	2	6	252470	252475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	255530130
4366	NC_013061	AGC	2	6	252481	252486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530130
4367	NC_013061	TCT	2	6	252511	252516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	255530130
4368	NC_013061	CTG	2	6	252517	252522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530130
4369	NC_013061	AAT	2	6	252638	252643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	255530130
4370	NC_013061	GAT	2	6	252681	252686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530130
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4372	NC_013061	TAA	2	6	253046	253051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	255530131
4373	NC_013061	CTGC	2	8	253108	253115	0 %	25 %	25 %	50 %	255530131
4374	NC_013061	CAT	2	6	253131	253136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530131
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4376	NC_013061	TTG	2	6	253679	253684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	255530132
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4378	NC_013061	ATC	2	6	253747	253752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530132
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4380	NC_013061	TAC	2	6	253825	253830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530132
4381	NC_013061	CGT	2	6	253845	253850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530132
4382	NC_013061	T	6	6	253873	253878	0 %	100 %	0 %	0 %	255530132
4383	NC_013061	GTG	3	9	253879	253887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	255530132
4384	NC_013061	ACA	2	6	254024	254029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	255530132
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4386	NC_013061	TAAG	2	8	254138	254145	50 %	25 %	25 %	0 %	255530132
4387	NC_013061	TGA	2	6	254235	254240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530132
4388	NC_013061	GGT	2	6	254247	254252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	255530132
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4390	NC_013061	TGGG	2	8	254405	254412	0 %	25 %	75 %	0 %	255530132
4391	NC_013061	TAAAT	2	10	254466	254475	60 %	40 %	0 %	0 %	255530132
4392	NC_013061	AT	3	6	254519	254524	50 %	50 %	0 %	0 %	255530132
4393	NC_013061	TGA	2	6	254549	254554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530133
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4395	NC_013061	GCAG	2	8	254657	254664	25 %	0 %	50 %	25 %	255530133
4396	NC_013061	ATTTT	2	10	254962	254971	20 %	80 %	0 %	0 %	255530133
4397	NC_013061	GCA	2	6	255184	255189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530133
4398	NC_013061	CAG	2	6	255285	255290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530134
4399	NC_013061	TGATC	2	10	255310	255319	20 %	40 %	20 %	20 %	255530134
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4412	NC_013061	CGGAT	2	10	256326	256335	20 %	20 %	40 %	20 %	255530135
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4422	NC_013061	GGT	2	6	257106	257111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	255530136
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4442	NC_013061	TGCTAT	2	12	258113	258124	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	255530136
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4450	NC_013061	TGATC	2	10	258620	258629	20 %	40 %	20 %	20 %	255530136
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4473	NC_013061	GAGCTG	2	12	259834	259845	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	255530137
4474	NC_013061	T	6	6	260006	260011	0 %	100 %	0 %	0 %	255530137
4475	NC_013061	GGT	2	6	260106	260111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	255530137
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4479	NC_013061	CAT	2	6	260244	260249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530137
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4484	NC_013061	T	6	6	260468	260473	0 %	100 %	0 %	0 %	255530137
4485	NC_013061	CCG	2	6	260534	260539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	255530137
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4487	NC_013061	CCA	2	6	260684	260689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	255530137
4488	NC_013061	AGTG	2	8	260794	260801	25 %	25 %	50 %	0 %	255530137
4489	NC_013061	TGA	2	6	260850	260855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530137
4490	NC_013061	A	6	6	261117	261122	100 %	0 %	0 %	0 %	255530137
4491	NC_013061	TG	3	6	261234	261239	0 %	50 %	50 %	0 %	255530137
4492	NC_013061	TGA	2	6	261390	261395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530137
4493	NC_013061	TGG	2	6	261492	261497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	255530137
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4495	NC_013061	TGT	2	6	261771	261776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	255530138
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4497	NC_013061	AGT	2	6	261813	261818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530138
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4499	NC_013061	TCA	2	6	261866	261871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530138
4500	NC_013061	TCT	2	6	261917	261922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	255530138

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