MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pedobacter heparinus DSM 2366 chromosome

Total Repeats: 90248

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013061	AGA	2	6	205687	205692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	255530092
3502	NC_013061	G	6	6	205704	205709	0 %	0 %	100 %	0 %	255530092
3503	NC_013061	CGG	2	6	205740	205745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	255530092
3504	NC_013061	TGA	2	6	205822	205827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530092
3505	NC_013061	AAT	2	6	205883	205888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	255530092
3506	NC_013061	AACTT	2	10	206019	206028	40 %	40 %	0 %	20 %	255530092
3507	NC_013061	ATT	2	6	206136	206141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	255530092
3508	NC_013061	CGA	2	6	206170	206175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530092
3509	NC_013061	AGAA	2	8	206182	206189	75 %	0 %	25 %	0 %	255530092
3510	NC_013061	GAA	2	6	206312	206317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	255530092
3511	NC_013061	A	6	6	206561	206566	100 %	0 %	0 %	0 %	255530092
3512	NC_013061	TGGA	2	8	206568	206575	25 %	25 %	50 %	0 %	255530092
3513	NC_013061	GAG	2	6	206597	206602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	255530092
3514	NC_013061	TGG	2	6	206608	206613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	255530092
3515	NC_013061	TATC	2	8	206890	206897	25 %	50 %	0 %	25 %	255530092
3516	NC_013061	ATG	2	6	206910	206915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530092
3517	NC_013061	AAT	2	6	206933	206938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	255530092
3518	NC_013061	GCA	2	6	206940	206945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530092
3519	NC_013061	AACG	2	8	206977	206984	50 %	0 %	25 %	25 %	255530092
3520	NC_013061	CTGCC	2	10	207090	207099	0 %	20 %	20 %	60 %	255530092
3521	NC_013061	CTG	2	6	207108	207113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530092
3522	NC_013061	CAA	2	6	207121	207126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	255530092
3523	NC_013061	TAAA	2	8	207327	207334	75 %	25 %	0 %	0 %	255530092
3524	NC_013061	TAT	2	6	207559	207564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	255530093
3525	NC_013061	A	8	8	207568	207575	100 %	0 %	0 %	0 %	255530093
3526	NC_013061	TGC	2	6	207599	207604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530093
3527	NC_013061	A	6	6	207627	207632	100 %	0 %	0 %	0 %	255530093
3528	NC_013061	AAC	2	6	207697	207702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	255530093
3529	NC_013061	GGA	2	6	207797	207802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	255530093
3530	NC_013061	CAG	2	6	207835	207840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530093
3531	NC_013061	GGT	2	6	207850	207855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	255530093
3532	NC_013061	CCAGA	2	10	207860	207869	40 %	0 %	20 %	40 %	255530093
3533	NC_013061	GCC	2	6	207923	207928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	255530093
3534	NC_013061	GCT	2	6	208045	208050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530093
3535	NC_013061	AGA	2	6	208072	208077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	255530093
3536	NC_013061	GGA	2	6	208108	208113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	255530093
3537	NC_013061	TAT	2	6	208160	208165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	255530093
3538	NC_013061	GAA	2	6	208202	208207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	255530093
3539	NC_013061	GGT	2	6	208223	208228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	255530093
3540	NC_013061	GAT	2	6	208285	208290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530093
3541	NC_013061	AGC	2	6	208296	208301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530093
3542	NC_013061	AGA	2	6	208357	208362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	255530093
3543	NC_013061	TAG	2	6	208371	208376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530093
3544	NC_013061	GCT	2	6	208384	208389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530093
3545	NC_013061	CAAA	2	8	208435	208442	75 %	0 %	0 %	25 %	255530093
3546	NC_013061	ATT	2	6	208469	208474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	255530093
3547	NC_013061	CTG	2	6	208535	208540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530093
3548	NC_013061	CAG	2	6	208589	208594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530094
3549	NC_013061	A	6	6	208664	208669	100 %	0 %	0 %	0 %	255530094
3550	NC_013061	TGC	2	6	208725	208730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530094
3551	NC_013061	CAGGG	2	10	208755	208764	20 %	0 %	60 %	20 %	255530094
3552	NC_013061	CAG	2	6	208823	208828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530094
3553	NC_013061	TCT	2	6	208863	208868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	255530094
3554	NC_013061	ATC	2	6	208908	208913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530094
3555	NC_013061	TTTC	2	8	208953	208960	0 %	75 %	0 %	25 %	255530094
3556	NC_013061	TCC	2	6	208961	208966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	255530094
3557	NC_013061	TTA	2	6	208983	208988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	255530094
3558	NC_013061	GGCT	2	8	209174	209181	0 %	25 %	50 %	25 %	255530094
3559	NC_013061	GCA	2	6	209241	209246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530094
3560	NC_013061	TAAAA	2	10	209276	209285	80 %	20 %	0 %	0 %	255530094
3561	NC_013061	GAT	2	6	209294	209299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530094
3562	NC_013061	ATAA	2	8	209316	209323	75 %	25 %	0 %	0 %	255530094
3563	NC_013061	TG	3	6	209360	209365	0 %	50 %	50 %	0 %	255530095
3564	NC_013061	ATG	2	6	209495	209500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530095
3565	NC_013061	CAG	2	6	209566	209571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530095
3566	NC_013061	TTC	2	6	209575	209580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	255530095
3567	NC_013061	ATC	2	6	209719	209724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530095
3568	NC_013061	TTA	2	6	209759	209764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	255530095
3569	NC_013061	TTC	2	6	209851	209856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	255530095
3570	NC_013061	ACC	2	6	209942	209947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	255530095
3571	NC_013061	CTG	2	6	210045	210050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530095
3572	NC_013061	GT	3	6	210135	210140	0 %	50 %	50 %	0 %	255530095
3573	NC_013061	CTG	2	6	210216	210221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530095
3574	NC_013061	T	8	8	210226	210233	0 %	100 %	0 %	0 %	255530095
3575	NC_013061	TGA	2	6	210499	210504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530096
3576	NC_013061	GTC	2	6	210518	210523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530096
3577	NC_013061	AGAA	2	8	210582	210589	75 %	0 %	25 %	0 %	255530096
3578	NC_013061	TTA	2	6	210617	210622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	255530096
3579	NC_013061	TGGC	2	8	210664	210671	0 %	25 %	50 %	25 %	255530096
3580	NC_013061	CTT	2	6	210699	210704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	255530096
3581	NC_013061	ATG	2	6	210710	210715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530096
3582	NC_013061	CTG	3	9	210725	210733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530096
3583	NC_013061	GAA	2	6	210758	210763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	255530096
3584	NC_013061	ATCT	2	8	210772	210779	25 %	50 %	0 %	25 %	255530096
3585	NC_013061	ATT	2	6	210853	210858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	255530097
3586	NC_013061	TTG	2	6	210863	210868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	255530097
3587	NC_013061	CTT	2	6	210874	210879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	255530097
3588	NC_013061	T	6	6	210878	210883	0 %	100 %	0 %	0 %	255530097
3589	NC_013061	CAA	2	6	210898	210903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	255530097
3590	NC_013061	CAC	2	6	210905	210910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	255530097
3591	NC_013061	AGC	2	6	210926	210931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530097
3592	NC_013061	CTG	3	9	211036	211044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530097
3593	NC_013061	CTT	2	6	211047	211052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	255530097
3594	NC_013061	TAT	2	6	211087	211092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	255530097
3595	NC_013061	AAATA	2	10	211202	211211	80 %	20 %	0 %	0 %	255530097
3596	NC_013061	ACCTTC	2	12	211235	211246	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	255530097
3597	NC_013061	CAG	2	6	211285	211290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530097
3598	NC_013061	CCA	2	6	211320	211325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	255530097
3599	NC_013061	ACC	2	6	211331	211336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	255530097
3600	NC_013061	CAG	2	6	211339	211344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530097
3601	NC_013061	AAT	2	6	211349	211354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	255530097
3602	NC_013061	T	6	6	211379	211384	0 %	100 %	0 %	0 %	255530097
3603	NC_013061	ACC	2	6	211406	211411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	255530097
3604	NC_013061	TCA	2	6	211528	211533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530097
3605	NC_013061	GAT	2	6	211784	211789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530098
3606	NC_013061	CTGAT	2	10	211842	211851	20 %	40 %	20 %	20 %	255530098
3607	NC_013061	GTT	3	9	211852	211860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	255530098
3608	NC_013061	TCA	2	6	211923	211928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530098
3609	NC_013061	CAGCG	2	10	211955	211964	20 %	0 %	40 %	40 %	255530098
3610	NC_013061	A	6	6	212039	212044	100 %	0 %	0 %	0 %	255530098
3611	NC_013061	TTC	2	6	212045	212050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	255530098
3612	NC_013061	AAG	2	6	212164	212169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	255530098
3613	NC_013061	CGGA	2	8	212237	212244	25 %	0 %	50 %	25 %	255530098
3614	NC_013061	ATC	2	6	212256	212261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530098
3615	NC_013061	CGT	2	6	212359	212364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530098
3616	NC_013061	T	6	6	212370	212375	0 %	100 %	0 %	0 %	255530098
3617	NC_013061	TATGC	2	10	212402	212411	20 %	40 %	20 %	20 %	255530099
3618	NC_013061	TGA	2	6	212459	212464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530099
3619	NC_013061	ATC	2	6	212491	212496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530099
3620	NC_013061	CAG	2	6	212544	212549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530099
3621	NC_013061	CAG	2	6	212598	212603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530099
3622	NC_013061	ATTG	2	8	212606	212613	25 %	50 %	25 %	0 %	255530099
3623	NC_013061	GCA	2	6	212738	212743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530099
3624	NC_013061	ATA	2	6	212744	212749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	255530099
3625	NC_013061	GTAAT	2	10	212783	212792	40 %	40 %	20 %	0 %	255530099
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3636	NC_013061	TACT	2	8	213134	213141	25 %	50 %	0 %	25 %	255530099
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3733	NC_013061	GCT	2	6	218308	218313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530103
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3735	NC_013061	CAG	2	6	218339	218344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530103
3736	NC_013061	GCAG	2	8	218406	218413	25 %	0 %	50 %	25 %	255530103
3737	NC_013061	TTTC	2	8	218429	218436	0 %	75 %	0 %	25 %	255530103
3738	NC_013061	AAT	2	6	218548	218553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	255530103
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3741	NC_013061	CAA	2	6	218791	218796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	255530103
3742	NC_013061	T	7	7	218803	218809	0 %	100 %	0 %	0 %	255530103
3743	NC_013061	ACT	2	6	218832	218837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530103
3744	NC_013061	TAC	2	6	218867	218872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530103
3745	NC_013061	AAGCTT	2	12	218931	218942	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	255530103
3746	NC_013061	TGC	2	6	219324	219329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530104
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3748	NC_013061	GAG	2	6	219436	219441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	255530104
3749	NC_013061	TGG	2	6	219479	219484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	255530104
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3763	NC_013061	A	6	6	220196	220201	100 %	0 %	0 %	0 %	255530105
3764	NC_013061	TGT	2	6	220249	220254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	255530105
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3774	NC_013061	TGGT	2	8	220458	220465	0 %	50 %	50 %	0 %	255530105
3775	NC_013061	TGC	2	6	220579	220584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530105
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3851	NC_013061	T	7	7	224974	224980	0 %	100 %	0 %	0 %	255530110
3852	NC_013061	GGC	2	6	225026	225031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	255530110
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3854	NC_013061	ATTC	2	8	225130	225137	25 %	50 %	0 %	25 %	255530110
3855	NC_013061	TGT	2	6	225229	225234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	255530110
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4000	NC_013061	AAGG	2	8	233776	233783	50 %	0 %	50 %	0 %	255530118

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