MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pedobacter heparinus DSM 2366 chromosome

Total Repeats: 90248

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013061	CAA	2	6	288578	288583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	255530160
5002	NC_013061	AGC	3	9	288871	288879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530161
5003	NC_013061	GCC	2	6	288949	288954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	255530161
5004	NC_013061	CAA	2	6	289005	289010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	255530161
5005	NC_013061	TAA	2	6	289018	289023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	255530161
5006	NC_013061	TGC	2	6	289077	289082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530161
5007	NC_013061	CAC	2	6	289086	289091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	255530161
5008	NC_013061	ACC	3	9	289102	289110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	255530161
5009	NC_013061	AAAC	2	8	289128	289135	75 %	0 %	0 %	25 %	255530161
5010	NC_013061	ACAA	2	8	289150	289157	75 %	0 %	0 %	25 %	255530161
5011	NC_013061	AATAA	2	10	289163	289172	80 %	20 %	0 %	0 %	255530161
5012	NC_013061	A	7	7	289175	289181	100 %	0 %	0 %	0 %	255530161
5013	NC_013061	ATA	2	6	289184	289189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	255530161
5014	NC_013061	TGT	2	6	289195	289200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	255530162
5015	NC_013061	TTTTC	2	10	289205	289214	0 %	80 %	0 %	20 %	255530162
5016	NC_013061	T	6	6	289247	289252	0 %	100 %	0 %	0 %	255530162
5017	NC_013061	TCT	2	6	289357	289362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	255530162
5018	NC_013061	TAA	2	6	289433	289438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	255530162
5019	NC_013061	TTGG	2	8	289462	289469	0 %	50 %	50 %	0 %	255530162
5020	NC_013061	GGT	2	6	289485	289490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	255530162
5021	NC_013061	CTT	3	9	289496	289504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	255530162
5022	NC_013061	AT	3	6	289529	289534	50 %	50 %	0 %	0 %	255530162
5023	NC_013061	CTC	2	6	289593	289598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	255530162
5024	NC_013061	T	9	9	289606	289614	0 %	100 %	0 %	0 %	255530162
5025	NC_013061	CTG	2	6	289638	289643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530162
5026	NC_013061	GCCA	2	8	289663	289670	25 %	0 %	25 %	50 %	255530162
5027	NC_013061	A	6	6	289675	289680	100 %	0 %	0 %	0 %	255530162
5028	NC_013061	ATC	3	9	289695	289703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530162
5029	NC_013061	CAC	2	6	289716	289721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	255530162
5030	NC_013061	CTG	2	6	289749	289754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530162
5031	NC_013061	TCT	2	6	289777	289782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	255530162
5032	NC_013061	ATC	2	6	289854	289859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530162
5033	NC_013061	TTC	2	6	289917	289922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	255530162
5034	NC_013061	CCT	2	6	289928	289933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	255530162
5035	NC_013061	ATTT	2	8	289952	289959	25 %	75 %	0 %	0 %	255530162
5036	NC_013061	CAG	2	6	289967	289972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530162
5037	NC_013061	TCA	2	6	289978	289983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530162
5038	NC_013061	CACATC	2	12	289986	289997	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	255530162
5039	NC_013061	CAA	2	6	290027	290032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	255530162
5040	NC_013061	GCA	2	6	290057	290062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530162
5041	NC_013061	TTC	2	6	290064	290069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	255530162
5042	NC_013061	AGC	2	6	290092	290097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530162
5043	NC_013061	GTT	3	9	290130	290138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	255530162
5044	NC_013061	GTT	3	9	290276	290284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	255530162
5045	NC_013061	CTC	2	6	290467	290472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	255530163
5046	NC_013061	CTG	2	6	290541	290546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530163
5047	NC_013061	GTT	2	6	290554	290559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	255530163
5048	NC_013061	A	6	6	290607	290612	100 %	0 %	0 %	0 %	255530163
5049	NC_013061	CAT	2	6	290622	290627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530163
5050	NC_013061	CTGGT	2	10	290645	290654	0 %	40 %	40 %	20 %	255530163
5051	NC_013061	CTC	2	6	290674	290679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	255530163
5052	NC_013061	GTT	2	6	290719	290724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	255530163
5053	NC_013061	T	6	6	290833	290838	0 %	100 %	0 %	0 %	255530163
5054	NC_013061	AGTTC	2	10	290852	290861	20 %	40 %	20 %	20 %	255530164
5055	NC_013061	GCA	2	6	290908	290913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530164
5056	NC_013061	T	6	6	290935	290940	0 %	100 %	0 %	0 %	255530164
5057	NC_013061	T	6	6	290946	290951	0 %	100 %	0 %	0 %	255530164
5058	NC_013061	TTC	2	6	290988	290993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	255530164
5059	NC_013061	TGAT	2	8	291106	291113	25 %	50 %	25 %	0 %	255530164
5060	NC_013061	T	6	6	291180	291185	0 %	100 %	0 %	0 %	255530164
5061	NC_013061	CAT	2	6	291192	291197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530164
5062	NC_013061	ATC	2	6	291249	291254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530164
5063	NC_013061	CCA	2	6	291262	291267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	255530164
5064	NC_013061	CAG	2	6	291318	291323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530164
5065	NC_013061	GCT	2	6	291325	291330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530164
5066	NC_013061	CAG	2	6	291501	291506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530164
5067	NC_013061	TCT	2	6	291514	291519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	255530164
5068	NC_013061	TGCAG	2	10	291529	291538	20 %	20 %	40 %	20 %	255530164
5069	NC_013061	GTA	2	6	291567	291572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530164
5070	NC_013061	TGT	2	6	291605	291610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	255530164
5071	NC_013061	TGG	2	6	291623	291628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	255530164
5072	NC_013061	T	6	6	291650	291655	0 %	100 %	0 %	0 %	255530164
5073	NC_013061	TTCC	2	8	291854	291861	0 %	50 %	0 %	50 %	255530164
5074	NC_013061	ATA	2	6	291922	291927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	255530164
5075	NC_013061	GA	3	6	291929	291934	50 %	0 %	50 %	0 %	255530164
5076	NC_013061	TACCAC	2	12	291944	291955	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	255530164
5077	NC_013061	CAG	2	6	292023	292028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530164
5078	NC_013061	CCT	2	6	292036	292041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	255530164
5079	NC_013061	TTAA	2	8	292153	292160	50 %	50 %	0 %	0 %	255530165
5080	NC_013061	CTG	2	6	292162	292167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530165
5081	NC_013061	CTT	2	6	292171	292176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	255530165
5082	NC_013061	AAG	2	6	292193	292198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	255530165
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5084	NC_013061	T	6	6	292319	292324	0 %	100 %	0 %	0 %	255530165
5085	NC_013061	CAA	2	6	292360	292365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	255530165
5086	NC_013061	TTG	2	6	292367	292372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	255530165
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5088	NC_013061	TGT	2	6	292395	292400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	255530165
5089	NC_013061	T	7	7	292427	292433	0 %	100 %	0 %	0 %	255530165
5090	NC_013061	CTT	2	6	292435	292440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	255530165
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5092	NC_013061	GGC	2	6	292466	292471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	255530165
5093	NC_013061	TTC	3	9	292556	292564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	255530165
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5095	NC_013061	TCTG	2	8	292621	292628	0 %	50 %	25 %	25 %	255530165
5096	NC_013061	TCA	2	6	292675	292680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530165
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5098	NC_013061	TCA	2	6	292887	292892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530165
5099	NC_013061	CAG	2	6	292934	292939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530165
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5104	NC_013061	CGGAC	2	10	293109	293118	20 %	0 %	40 %	40 %	255530165
5105	NC_013061	TTCA	2	8	293183	293190	25 %	50 %	0 %	25 %	255530165
5106	NC_013061	ACC	2	6	293226	293231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	255530165
5107	NC_013061	CCA	2	6	293236	293241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	255530165
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5109	NC_013061	CAA	2	6	293299	293304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	255530165
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5113	NC_013061	ATCA	2	8	293606	293613	50 %	25 %	0 %	25 %	255530165
5114	NC_013061	TTTA	2	8	293828	293835	25 %	75 %	0 %	0 %	255530166
5115	NC_013061	TTAT	2	8	293843	293850	25 %	75 %	0 %	0 %	255530166
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5118	NC_013061	TTG	2	6	293911	293916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	255530166
5119	NC_013061	TGA	2	6	293921	293926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530166
5120	NC_013061	ATG	2	6	293935	293940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530166
5121	NC_013061	CTG	2	6	294006	294011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530166
5122	NC_013061	CTG	2	6	294044	294049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530166
5123	NC_013061	TTC	2	6	294056	294061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	255530166
5124	NC_013061	TGT	2	6	294127	294132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	255530166
5125	NC_013061	T	6	6	294132	294137	0 %	100 %	0 %	0 %	255530166
5126	NC_013061	ATG	2	6	294157	294162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530166
5127	NC_013061	TGG	2	6	294297	294302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	255530166
5128	NC_013061	ATA	2	6	294343	294348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	255530166
5129	NC_013061	GAC	2	6	294372	294377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530166
5130	NC_013061	TGG	3	9	294419	294427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	255530166
5131	NC_013061	GCA	2	6	294446	294451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530166
5132	NC_013061	T	6	6	294495	294500	0 %	100 %	0 %	0 %	255530166
5133	NC_013061	CAA	2	6	294503	294508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	255530166
5134	NC_013061	T	6	6	294523	294528	0 %	100 %	0 %	0 %	255530166
5135	NC_013061	AAC	2	6	294558	294563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	255530166
5136	NC_013061	ATCAG	2	10	294604	294613	40 %	20 %	20 %	20 %	255530166
5137	NC_013061	GAA	2	6	294705	294710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	255530166
5138	NC_013061	TTC	2	6	294750	294755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	255530166
5139	NC_013061	TAT	2	6	294777	294782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	255530166
5140	NC_013061	T	6	6	294792	294797	0 %	100 %	0 %	0 %	255530166
5141	NC_013061	TTAA	2	8	294811	294818	50 %	50 %	0 %	0 %	255530166
5142	NC_013061	GAT	2	6	294913	294918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530167
5143	NC_013061	CAT	2	6	294940	294945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530167
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5145	NC_013061	CCGG	2	8	295056	295063	0 %	0 %	50 %	50 %	255530167
5146	NC_013061	CAG	2	6	295173	295178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530167
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5150	NC_013061	GTA	2	6	295461	295466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530168
5151	NC_013061	A	6	6	295482	295487	100 %	0 %	0 %	0 %	255530168
5152	NC_013061	ATG	2	6	295534	295539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530168
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5154	NC_013061	A	7	7	295653	295659	100 %	0 %	0 %	0 %	255530168
5155	NC_013061	G	6	6	295691	295696	0 %	0 %	100 %	0 %	255530168
5156	NC_013061	TTG	2	6	295747	295752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	255530168
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5172	NC_013061	CTG	2	6	296225	296230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530169
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5181	NC_013061	A	8	8	296619	296626	100 %	0 %	0 %	0 %	255530170
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5183	NC_013061	CTG	2	6	296676	296681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530170
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5190	NC_013061	ATG	2	6	297049	297054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530170
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5229	NC_013061	ATC	2	6	298889	298894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530171
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5241	NC_013061	AACTAA	2	12	299594	299605	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	255530171
5242	NC_013061	AAC	2	6	299623	299628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	255530171
5243	NC_013061	TAT	2	6	299692	299697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	255530171
5244	NC_013061	ATG	2	6	299702	299707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530171
5245	NC_013061	GAAG	2	8	299728	299735	50 %	0 %	50 %	0 %	255530171
5246	NC_013061	GCC	2	6	299762	299767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	255530171
5247	NC_013061	GCA	2	6	299823	299828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	255530171
5248	NC_013061	TA	3	6	299855	299860	50 %	50 %	0 %	0 %	255530171
5249	NC_013061	A	6	6	299865	299870	100 %	0 %	0 %	0 %	255530171
5250	NC_013061	CTC	2	6	299892	299897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	255530171
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5252	NC_013061	TGC	2	6	300006	300011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530172
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5254	NC_013061	GAT	2	6	300053	300058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	255530172
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5259	NC_013061	CAA	2	6	300463	300468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	255530172
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5263	NC_013061	ATT	2	6	300930	300935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	255530173
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5265	NC_013061	A	6	6	301179	301184	100 %	0 %	0 %	0 %	255530173
5266	NC_013061	AAAG	2	8	301225	301232	75 %	0 %	25 %	0 %	255530173
5267	NC_013061	AATG	2	8	301238	301245	50 %	25 %	25 %	0 %	255530173
5268	NC_013061	A	8	8	301292	301299	100 %	0 %	0 %	0 %	255530173
5269	NC_013061	A	6	6	301424	301429	100 %	0 %	0 %	0 %	255530173
5270	NC_013061	TAC	2	6	301499	301504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530173
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5273	NC_013061	TCAG	2	8	301966	301973	25 %	25 %	25 %	25 %	255530173
5274	NC_013061	CTGG	2	8	302001	302008	0 %	25 %	50 %	25 %	255530173
5275	NC_013061	ACGA	2	8	302025	302032	50 %	0 %	25 %	25 %	255530173
5276	NC_013061	CTGA	2	8	302127	302134	25 %	25 %	25 %	25 %	255530173
5277	NC_013061	TGC	2	6	302141	302146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530173
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5283	NC_013061	A	6	6	302364	302369	100 %	0 %	0 %	0 %	255530173
5284	NC_013061	TCCT	2	8	302379	302386	0 %	50 %	0 %	50 %	255530173
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5289	NC_013061	A	8	8	302608	302615	100 %	0 %	0 %	0 %	255530173
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5352	NC_013061	ATCA	2	8	306954	306961	50 %	25 %	0 %	25 %	255530177
5353	NC_013061	CAT	2	6	307004	307009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	255530177
5354	NC_013061	ACA	2	6	307015	307020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	255530177
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5361	NC_013061	TGC	2	6	307480	307485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530177
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5489	NC_013061	CTG	2	6	315422	315427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	255530184
5490	NC_013061	TTG	2	6	315448	315453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	255530184
5491	NC_013061	TAA	2	6	315476	315481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	255530184
5492	NC_013061	TCT	2	6	315497	315502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	255530184
5493	NC_013061	T	6	6	315505	315510	0 %	100 %	0 %	0 %	255530184
5494	NC_013061	TCAA	2	8	315547	315554	50 %	25 %	0 %	25 %	255530184
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5499	NC_013061	GCTG	2	8	315868	315875	0 %	25 %	50 %	25 %	255530184
5500	NC_013061	A	6	6	315932	315937	100 %	0 %	0 %	0 %	255530184

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