MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1

Total Repeats: 85717

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012917	CCG	2	6	67	72	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253686410
2	NC_012917	GCA	2	6	89	94	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686410
3	NC_012917	ATG	2	6	112	117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686410
4	NC_012917	ATA	2	6	241	246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253686410
5	NC_012917	CTG	2	6	255	260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686410
6	NC_012917	GATG	2	8	275	282	25 %	25 %	50 %	0 %	253686410
7	NC_012917	GTA	2	6	307	312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686410
8	NC_012917	CAGC	2	8	332	339	25 %	0 %	25 %	50 %	253686410
9	NC_012917	CAT	2	6	351	356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253686410
10	NC_012917	TGC	2	6	368	373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686410
11	NC_012917	CAG	3	9	378	386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686410
12	NC_012917	TACC	2	8	443	450	25 %	25 %	0 %	50 %	253686410
13	NC_012917	GCG	3	9	519	527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253686410
14	NC_012917	GTT	2	6	566	571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253686410
15	NC_012917	CAT	2	6	629	634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253686410
16	NC_012917	GGT	2	6	656	661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253686410
17	NC_012917	GAA	2	6	723	728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253686410
18	NC_012917	CTA	2	6	737	742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253686410
19	NC_012917	GCT	2	6	758	763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686410
20	NC_012917	GAT	2	6	768	773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686410
21	NC_012917	TAA	2	6	788	793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253686410
22	NC_012917	TTC	2	6	813	818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253686410
23	NC_012917	GCT	2	6	833	838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686410
24	NC_012917	TGA	2	6	982	987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686410
25	NC_012917	GCCT	2	8	1012	1019	0 %	25 %	25 %	50 %	253686410
26	NC_012917	CGTG	2	8	1061	1068	0 %	25 %	50 %	25 %	253686410
27	NC_012917	CGT	2	6	1257	1262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686410
28	NC_012917	GATGGC	2	12	1289	1300	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	253686410
29	NC_012917	GGCG	2	8	1353	1360	0 %	0 %	75 %	25 %	253686410
30	NC_012917	ACG	2	6	1368	1373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686410
31	NC_012917	TGCC	2	8	1382	1389	0 %	25 %	25 %	50 %	253686410
32	NC_012917	GAA	2	6	1410	1415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253686410
33	NC_012917	AGA	2	6	1430	1435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253686410
34	NC_012917	TTG	2	6	1484	1489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253686411
35	NC_012917	ACA	2	6	1515	1520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253686411
36	NC_012917	CAG	2	6	1524	1529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686411
37	NC_012917	CCGA	2	8	1542	1549	25 %	0 %	25 %	50 %	253686411
38	NC_012917	CTG	2	6	1570	1575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686411
39	NC_012917	TGG	2	6	1631	1636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253686411
40	NC_012917	GCG	2	6	1810	1815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253686411
41	NC_012917	GAC	2	6	1831	1836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686411
42	NC_012917	CGA	2	6	1871	1876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686411
43	NC_012917	CTA	2	6	1929	1934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253686411
44	NC_012917	CTG	2	6	2089	2094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686411
45	NC_012917	GCA	2	6	2129	2134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686411
46	NC_012917	CG	3	6	2143	2148	0 %	0 %	50 %	50 %	253686411
47	NC_012917	CGC	2	6	2206	2211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253686411
48	NC_012917	GCG	2	6	2281	2286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253686411
49	NC_012917	GAA	2	6	2371	2376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253686411
50	NC_012917	ACG	2	6	2402	2407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686411
51	NC_012917	TTG	2	6	2485	2490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253686411
52	NC_012917	GCG	2	6	2539	2544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253686411
53	NC_012917	TCT	2	6	2638	2643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253686412
54	NC_012917	GGC	2	6	2668	2673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253686412
55	NC_012917	T	6	6	2701	2706	0 %	100 %	0 %	0 %	253686412
56	NC_012917	CGGG	2	8	2767	2774	0 %	0 %	75 %	25 %	253686412
57	NC_012917	TGC	2	6	2829	2834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686412
58	NC_012917	CTG	2	6	2954	2959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686412
59	NC_012917	CGG	2	6	3001	3006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253686412
60	NC_012917	TCG	2	6	3016	3021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686412
61	NC_012917	GTT	2	6	3039	3044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253686412
62	NC_012917	T	6	6	3062	3067	0 %	100 %	0 %	0 %	253686412
63	NC_012917	CTG	2	6	3092	3097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686412
64	NC_012917	TGC	2	6	3109	3114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686412
65	NC_012917	GCG	2	6	3212	3217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253686412
66	NC_012917	AAAG	2	8	3299	3306	75 %	0 %	25 %	0 %	253686412
67	NC_012917	CTG	2	6	3320	3325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686412
68	NC_012917	GCG	2	6	3405	3410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253686412
69	NC_012917	GCT	2	6	3448	3453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686412
70	NC_012917	GC	3	6	3459	3464	0 %	0 %	50 %	50 %	253686412
71	NC_012917	GGCT	2	8	3468	3475	0 %	25 %	50 %	25 %	253686412
72	NC_012917	CTGT	2	8	3511	3518	0 %	50 %	25 %	25 %	253686412
73	NC_012917	GAT	2	6	3527	3532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686412
74	NC_012917	CGC	2	6	3557	3562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253686412
75	NC_012917	TGGT	2	8	3642	3649	0 %	50 %	50 %	0 %	253686412
76	NC_012917	CTC	2	6	3745	3750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253686413
77	NC_012917	GTAT	2	8	3798	3805	25 %	50 %	25 %	0 %	253686413
78	NC_012917	CGA	2	6	3871	3876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686413
79	NC_012917	ATC	2	6	3905	3910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253686413
80	NC_012917	CCAT	2	8	3912	3919	25 %	25 %	0 %	50 %	253686413
81	NC_012917	TCGGTG	2	12	3929	3940	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	253686413
82	NC_012917	GAT	2	6	3944	3949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686413
83	NC_012917	GAA	3	9	3977	3985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253686413
84	NC_012917	GCT	2	6	3995	4000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686413
85	NC_012917	TCA	2	6	4005	4010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253686413
86	NC_012917	TGC	2	6	4017	4022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686413
87	NC_012917	GCGG	2	8	4025	4032	0 %	0 %	75 %	25 %	253686413
88	NC_012917	TGA	2	6	4039	4044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686413
89	NC_012917	CGG	2	6	4063	4068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253686413
90	NC_012917	AAACTG	2	12	4112	4123	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	253686413
91	NC_012917	TGG	2	6	4263	4268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253686413
92	NC_012917	CGA	2	6	4345	4350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686413
93	NC_012917	ATG	2	6	4383	4388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686413
94	NC_012917	CAA	2	6	4540	4545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253686413
95	NC_012917	GGT	2	6	4562	4567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253686413
96	NC_012917	AAG	2	6	4626	4631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253686413
97	NC_012917	CGT	2	6	4693	4698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686413
98	NC_012917	TTC	2	6	4753	4758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253686413
99	NC_012917	CCG	2	6	4770	4775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253686413
100	NC_012917	TGA	2	6	4785	4790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686413
101	NC_012917	TGG	2	6	4800	4805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253686413
102	NC_012917	ATT	2	6	4853	4858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253686413
103	NC_012917	GCG	2	6	4880	4885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253686413
104	NC_012917	GC	3	6	4917	4922	0 %	0 %	50 %	50 %	253686413
105	NC_012917	CTGG	2	8	4928	4935	0 %	25 %	50 %	25 %	253686413
106	NC_012917	TGG	2	6	4995	5000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253686413
107	NC_012917	GGC	2	6	5015	5020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253686413
108	NC_012917	CAT	4	12	5206	5217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253686413
109	NC_012917	TGT	2	6	5256	5261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253686413
110	NC_012917	CTT	2	6	5266	5271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253686413
111	NC_012917	TTG	2	6	5292	5297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253686413
112	NC_012917	GCC	2	6	5323	5328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253686413
113	NC_012917	GAT	2	6	5372	5377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686413
114	NC_012917	CG	3	6	5535	5540	0 %	0 %	50 %	50 %	253686413
115	NC_012917	TTG	2	6	5543	5548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253686413
116	NC_012917	GAAC	2	8	5590	5597	50 %	0 %	25 %	25 %	253686413
117	NC_012917	TACA	2	8	5665	5672	50 %	25 %	0 %	25 %	253686413
118	NC_012917	TCAT	2	8	5679	5686	25 %	50 %	0 %	25 %	253686413
119	NC_012917	ATG	2	6	5688	5693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686413
120	NC_012917	GCGT	2	8	5724	5731	0 %	25 %	50 %	25 %	253686413
121	NC_012917	TTGA	2	8	5828	5835	25 %	50 %	25 %	0 %	253686413
122	NC_012917	AGA	2	6	5836	5841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253686413
123	NC_012917	CGT	2	6	5864	5869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686413
124	NC_012917	CCG	2	6	5920	5925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253686413
125	NC_012917	GCC	2	6	6006	6011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253686413
126	NC_012917	TGC	2	6	6015	6020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686413
127	NC_012917	TGA	2	6	6049	6054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686413
128	NC_012917	GAA	2	6	6107	6112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253686413
129	NC_012917	AGC	2	6	6528	6533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686414
130	NC_012917	GCA	2	6	6630	6635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686414
131	NC_012917	CCG	2	6	6636	6641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253686414
132	NC_012917	CGG	2	6	6689	6694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253686414
133	NC_012917	GCA	2	6	6753	6758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686414
134	NC_012917	CAA	2	6	6802	6807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253686414
135	NC_012917	GCT	2	6	6837	6842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686414
136	NC_012917	GCCA	2	8	6887	6894	25 %	0 %	25 %	50 %	253686414
137	NC_012917	GCGACA	2	12	6946	6957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686414
138	NC_012917	CAG	3	9	7019	7027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686414
139	NC_012917	CAG	2	6	7037	7042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686414
140	NC_012917	GC	4	8	7069	7076	0 %	0 %	50 %	50 %	253686414
141	NC_012917	TCA	2	6	7128	7133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253686414
142	NC_012917	AGC	2	6	7146	7151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686414
143	NC_012917	GGC	2	6	7211	7216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253686414
144	NC_012917	TCA	2	6	7302	7307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253686414
145	NC_012917	CG	3	6	7312	7317	0 %	0 %	50 %	50 %	253686414
146	NC_012917	CCG	2	6	7333	7338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253686414
147	NC_012917	GCCA	2	8	7361	7368	25 %	0 %	25 %	50 %	253686414
148	NC_012917	CA	3	6	7389	7394	50 %	0 %	0 %	50 %	253686414
149	NC_012917	CGAG	2	8	7411	7418	25 %	0 %	50 %	25 %	253686414
150	NC_012917	GC	4	8	7463	7470	0 %	0 %	50 %	50 %	253686414
151	NC_012917	CCA	2	6	7480	7485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253686414
152	NC_012917	GCTGA	2	10	7570	7579	20 %	20 %	40 %	20 %	253686414
153	NC_012917	CAG	2	6	7580	7585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686414
154	NC_012917	GCA	2	6	7600	7605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686414
155	NC_012917	CAT	2	6	7607	7612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253686414
156	NC_012917	TGA	2	6	7637	7642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686414
157	NC_012917	CAG	2	6	7945	7950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686415
158	NC_012917	TGT	2	6	7970	7975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253686415
159	NC_012917	CG	3	6	8028	8033	0 %	0 %	50 %	50 %	253686415
160	NC_012917	TCGT	2	8	8037	8044	0 %	50 %	25 %	25 %	253686415
161	NC_012917	GCA	2	6	8081	8086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686415
162	NC_012917	TGA	3	9	8100	8108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686415
163	NC_012917	TGA	2	6	8139	8144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686415
164	NC_012917	TTCG	2	8	8178	8185	0 %	50 %	25 %	25 %	253686415
165	NC_012917	CTG	2	6	8190	8195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686415
166	NC_012917	AAT	2	6	8207	8212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253686415
167	NC_012917	TTC	2	6	8309	8314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253686416
168	NC_012917	GGC	2	6	8321	8326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253686416
169	NC_012917	GCG	2	6	8352	8357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253686416
170	NC_012917	CTG	2	6	8360	8365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686416
171	NC_012917	CTGA	2	8	8402	8409	25 %	25 %	25 %	25 %	253686416
172	NC_012917	CG	3	6	8413	8418	0 %	0 %	50 %	50 %	253686416
173	NC_012917	ATG	2	6	8451	8456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686416
174	NC_012917	GCA	2	6	8479	8484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686416
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177	NC_012917	CCG	2	6	8668	8673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253686416
178	NC_012917	ATG	2	6	8715	8720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686416
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193	NC_012917	GA	3	6	9475	9480	50 %	0 %	50 %	0 %	253686416
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197	NC_012917	CAG	2	6	9635	9640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686416
198	NC_012917	CTT	2	6	9685	9690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253686416
199	NC_012917	TTC	2	6	9699	9704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253686416
200	NC_012917	GTA	2	6	9713	9718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686416
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229	NC_012917	T	6	6	11532	11537	0 %	100 %	0 %	0 %	253686417
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237	NC_012917	CCAG	2	8	12168	12175	25 %	0 %	25 %	50 %	253686419
238	NC_012917	TGT	2	6	12181	12186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253686419
239	NC_012917	ATG	2	6	12242	12247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686419
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241	NC_012917	TGG	2	6	12312	12317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253686419
242	NC_012917	ATG	2	6	12338	12343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686419
243	NC_012917	CAT	2	6	12364	12369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253686419
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245	NC_012917	G	6	6	12514	12519	0 %	0 %	100 %	0 %	253686419
246	NC_012917	T	6	6	12574	12579	0 %	100 %	0 %	0 %	253686419
247	NC_012917	CCG	2	6	12620	12625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253686419
248	NC_012917	TGC	2	6	12801	12806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686419
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250	NC_012917	TCG	2	6	12849	12854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686419
251	NC_012917	AATC	2	8	12892	12899	50 %	25 %	0 %	25 %	253686419
252	NC_012917	TTC	2	6	12959	12964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253686419
253	NC_012917	GGTG	2	8	12970	12977	0 %	25 %	75 %	0 %	253686419
254	NC_012917	GTG	2	6	13058	13063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253686419
255	NC_012917	CGT	2	6	13108	13113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686419
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257	NC_012917	TTA	2	6	13140	13145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253686419
258	NC_012917	CGC	2	6	13149	13154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253686419
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260	NC_012917	TGG	2	6	13290	13295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253686419
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383	NC_012917	GCTG	2	8	19731	19738	0 %	25 %	50 %	25 %	253686425
384	NC_012917	GCG	2	6	19746	19751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253686425
385	NC_012917	GCC	2	6	19787	19792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253686425
386	NC_012917	TAT	3	9	19979	19987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253686426
387	NC_012917	TTA	2	6	20022	20027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253686426
388	NC_012917	AACC	2	8	20082	20089	50 %	0 %	0 %	50 %	253686426
389	NC_012917	TTG	2	6	20122	20127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253686426
390	NC_012917	GCT	2	6	20177	20182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686426
391	NC_012917	TGC	2	6	20236	20241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686426
392	NC_012917	GCA	2	6	20267	20272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686426
393	NC_012917	TAT	2	6	20285	20290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253686426
394	NC_012917	GC	3	6	20406	20411	0 %	0 %	50 %	50 %	253686426
395	NC_012917	TGA	2	6	20416	20421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686426
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421	NC_012917	ATG	2	6	21647	21652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686427
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495	NC_012917	GAGC	2	8	25138	25145	25 %	0 %	50 %	25 %	253686430
496	NC_012917	CGG	2	6	25204	25209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253686430
497	NC_012917	GCAGCG	2	12	25210	25221	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	253686430
498	NC_012917	GT	3	6	25223	25228	0 %	50 %	50 %	0 %	253686430
499	NC_012917	GCGCTG	2	12	25238	25249	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	253686430
500	NC_012917	ATT	2	6	25262	25267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253686430

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