MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1

Total Repeats: 85717

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_012917	CTG	2	6	156794	156799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686538
3002	NC_012917	GGC	2	6	156814	156819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253686538
3003	NC_012917	TGGCGG	2	12	156897	156908	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	253686539
3004	NC_012917	GCT	2	6	156944	156949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686539
3005	NC_012917	TGC	2	6	156961	156966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686539
3006	NC_012917	GCT	2	6	156980	156985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686539
3007	NC_012917	GCT	2	6	156989	156994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686539
3008	NC_012917	TTGCTG	2	12	157002	157013	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	253686539
3009	NC_012917	CTG	2	6	157026	157031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686539
3010	NC_012917	CTG	2	6	157038	157043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686539
3011	NC_012917	GCT	2	6	157056	157061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686539
3012	NC_012917	CTG	3	9	157077	157085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686539
3013	NC_012917	AGC	2	6	157135	157140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686539
3014	NC_012917	AAT	2	6	157153	157158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253686539
3015	NC_012917	GGC	2	6	157434	157439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253686540
3016	NC_012917	AAC	2	6	157441	157446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253686540
3017	NC_012917	TTGA	2	8	157462	157469	25 %	50 %	25 %	0 %	253686540
3018	NC_012917	A	6	6	157495	157500	100 %	0 %	0 %	0 %	253686540
3019	NC_012917	GCC	2	6	157573	157578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253686540
3020	NC_012917	ACC	2	6	157606	157611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253686540
3021	NC_012917	CCAG	2	8	157632	157639	25 %	0 %	25 %	50 %	253686540
3022	NC_012917	CAA	2	6	157749	157754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253686540
3023	NC_012917	GGC	2	6	157805	157810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253686540
3024	NC_012917	CGG	2	6	157821	157826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253686540
3025	NC_012917	T	6	6	157868	157873	0 %	100 %	0 %	0 %	253686541
3026	NC_012917	ACC	2	6	157896	157901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253686541
3027	NC_012917	ATA	2	6	157910	157915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253686541
3028	NC_012917	GCT	2	6	157933	157938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686541
3029	NC_012917	TCA	2	6	157999	158004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253686541
3030	NC_012917	CAC	3	9	158060	158068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253686541
3031	NC_012917	AGC	2	6	158130	158135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686541
3032	NC_012917	AGCC	2	8	158200	158207	25 %	0 %	25 %	50 %	253686541
3033	NC_012917	AGCC	2	8	158339	158346	25 %	0 %	25 %	50 %	253686541
3034	NC_012917	CGG	2	6	158372	158377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253686541
3035	NC_012917	GGT	2	6	158522	158527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253686541
3036	NC_012917	CGC	2	6	158531	158536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253686541
3037	NC_012917	TGC	2	6	158552	158557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686541
3038	NC_012917	TAA	2	6	158624	158629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253686541
3039	NC_012917	CG	3	6	158758	158763	0 %	0 %	50 %	50 %	253686542
3040	NC_012917	CGA	2	6	158850	158855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686542
3041	NC_012917	TGC	2	6	158889	158894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686542
3042	NC_012917	GAA	2	6	158935	158940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253686542
3043	NC_012917	CG	3	6	158963	158968	0 %	0 %	50 %	50 %	253686542
3044	NC_012917	CGT	2	6	159000	159005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686542
3045	NC_012917	TCT	2	6	159026	159031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253686542
3046	NC_012917	GCT	2	6	159094	159099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686542
3047	NC_012917	GTG	2	6	159105	159110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253686542
3048	NC_012917	CTC	2	6	159205	159210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253686542
3049	NC_012917	CTG	2	6	159217	159222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686542
3050	NC_012917	CGG	2	6	159273	159278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253686542
3051	NC_012917	CGG	2	6	159309	159314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253686542
3052	NC_012917	GCCT	2	8	159334	159341	0 %	25 %	25 %	50 %	253686542
3053	NC_012917	GCG	2	6	159545	159550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253686542
3054	NC_012917	GGC	2	6	159577	159582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253686542
3055	NC_012917	TGT	2	6	159609	159614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253686542
3056	NC_012917	TTC	2	6	159646	159651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253686542
3057	NC_012917	GCCA	2	8	159671	159678	25 %	0 %	25 %	50 %	253686542
3058	NC_012917	GC	3	6	159738	159743	0 %	0 %	50 %	50 %	253686542
3059	NC_012917	CAG	2	6	159763	159768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686542
3060	NC_012917	TTCAA	2	10	159788	159797	40 %	40 %	0 %	20 %	253686542
3061	NC_012917	GGT	2	6	159814	159819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253686542
3062	NC_012917	TCAT	2	8	159863	159870	25 %	50 %	0 %	25 %	253686542
3063	NC_012917	GCG	2	6	159883	159888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253686542
3064	NC_012917	TCA	2	6	159944	159949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253686542
3065	NC_012917	TGT	2	6	160005	160010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253686542
3066	NC_012917	TCA	2	6	160013	160018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253686542
3067	NC_012917	ATTG	2	8	160039	160046	25 %	50 %	25 %	0 %	253686542
3068	NC_012917	TGA	2	6	160096	160101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686542
3069	NC_012917	TCA	2	6	160130	160135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253686542
3070	NC_012917	AATA	2	8	160166	160173	75 %	25 %	0 %	0 %	253686542
3071	NC_012917	CAG	2	6	160279	160284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686542
3072	NC_012917	GAA	2	6	160330	160335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253686542
3073	NC_012917	ATC	2	6	160381	160386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253686542
3074	NC_012917	AAGG	2	8	160422	160429	50 %	0 %	50 %	0 %	253686542
3075	NC_012917	TTG	2	6	160445	160450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253686542
3076	NC_012917	CGC	2	6	160519	160524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253686542
3077	NC_012917	GCCA	2	8	160765	160772	25 %	0 %	25 %	50 %	253686542
3078	NC_012917	TGGT	2	8	160791	160798	0 %	50 %	50 %	0 %	253686542
3079	NC_012917	GAT	2	6	161006	161011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686543
3080	NC_012917	TCT	2	6	161037	161042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253686543
3081	NC_012917	TGC	2	6	161061	161066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686543
3082	NC_012917	GCC	2	6	161105	161110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253686543
3083	NC_012917	CG	3	6	161122	161127	0 %	0 %	50 %	50 %	253686543
3084	NC_012917	TCGGT	2	10	161133	161142	0 %	40 %	40 %	20 %	253686543
3085	NC_012917	TCA	2	6	161193	161198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253686543
3086	NC_012917	CGAG	2	8	161302	161309	25 %	0 %	50 %	25 %	253686543
3087	NC_012917	GGC	2	6	161387	161392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253686543
3088	NC_012917	GTTC	2	8	161446	161453	0 %	50 %	25 %	25 %	253686543
3089	NC_012917	GA	3	6	161467	161472	50 %	0 %	50 %	0 %	253686543
3090	NC_012917	GA	3	6	161611	161616	50 %	0 %	50 %	0 %	253686543
3091	NC_012917	CAG	2	6	161624	161629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686543
3092	NC_012917	GC	3	6	161659	161664	0 %	0 %	50 %	50 %	253686543
3093	NC_012917	TCG	2	6	161757	161762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686543
3094	NC_012917	GCG	2	6	161763	161768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253686543
3095	NC_012917	CAG	2	6	161852	161857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686543
3096	NC_012917	CAG	2	6	161873	161878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686543
3097	NC_012917	TGA	2	6	161881	161886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686543
3098	NC_012917	GCT	2	6	161900	161905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686543
3099	NC_012917	TCA	2	6	161937	161942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253686543
3100	NC_012917	CGG	2	6	162110	162115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253686543
3101	NC_012917	CCA	2	6	162149	162154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253686543
3102	NC_012917	GT	3	6	162172	162177	0 %	50 %	50 %	0 %	253686543
3103	NC_012917	ATG	2	6	162210	162215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686543
3104	NC_012917	GCT	2	6	162223	162228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686543
3105	NC_012917	CAG	2	6	162236	162241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686543
3106	NC_012917	CCAGCG	2	12	162295	162306	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	253686543
3107	NC_012917	A	6	6	162313	162318	100 %	0 %	0 %	0 %	253686543
3108	NC_012917	ACG	2	6	162430	162435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686544
3109	NC_012917	ATCG	2	8	162454	162461	25 %	25 %	25 %	25 %	253686544
3110	NC_012917	ACC	2	6	162521	162526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253686544
3111	NC_012917	CAG	2	6	162544	162549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686544
3112	NC_012917	AGC	2	6	162554	162559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686544
3113	NC_012917	GC	3	6	162654	162659	0 %	0 %	50 %	50 %	253686544
3114	NC_012917	CGG	2	6	162698	162703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253686544
3115	NC_012917	CG	3	6	162709	162714	0 %	0 %	50 %	50 %	253686544
3116	NC_012917	GC	3	6	162718	162723	0 %	0 %	50 %	50 %	253686544
3117	NC_012917	ATG	2	6	162821	162826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686544
3118	NC_012917	TGC	2	6	162839	162844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686544
3119	NC_012917	CAT	2	6	162886	162891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253686544
3120	NC_012917	TAA	2	6	162901	162906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253686544
3121	NC_012917	CGT	2	6	162948	162953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686544
3122	NC_012917	ACG	2	6	162962	162967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686544
3123	NC_012917	CT	3	6	163012	163017	0 %	50 %	0 %	50 %	253686544
3124	NC_012917	TCA	2	6	163022	163027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253686544
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3130	NC_012917	TGA	2	6	163482	163487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686545
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3223	NC_012917	CG	3	6	169284	169289	0 %	0 %	50 %	50 %	253686550
3224	NC_012917	GCGAT	2	10	169295	169304	20 %	20 %	40 %	20 %	253686550
3225	NC_012917	CCAG	2	8	169326	169333	25 %	0 %	25 %	50 %	253686550
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3230	NC_012917	GTCA	2	8	169546	169553	25 %	25 %	25 %	25 %	253686550
3231	NC_012917	GCC	2	6	169573	169578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253686550
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3234	NC_012917	CAG	2	6	169620	169625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686551
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3237	NC_012917	GCC	2	6	169791	169796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253686551
3238	NC_012917	GC	3	6	169822	169827	0 %	0 %	50 %	50 %	253686551
3239	NC_012917	CGT	2	6	169852	169857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686551
3240	NC_012917	CAGT	2	8	169868	169875	25 %	25 %	25 %	25 %	253686551
3241	NC_012917	AGT	2	6	169961	169966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686551
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3342	NC_012917	CCG	2	6	176694	176699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253686554
3343	NC_012917	ACTC	2	8	176702	176709	25 %	25 %	0 %	50 %	253686554
3344	NC_012917	CGT	2	6	176714	176719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686554
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3347	NC_012917	GA	3	6	176778	176783	50 %	0 %	50 %	0 %	253686554
3348	NC_012917	CCCG	2	8	176840	176847	0 %	0 %	25 %	75 %	253686554
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3353	NC_012917	GTT	2	6	177201	177206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253686554
3354	NC_012917	CTG	2	6	177302	177307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686555
3355	NC_012917	GCT	2	6	177334	177339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686555
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3357	NC_012917	GCG	2	6	177367	177372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253686555
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3362	NC_012917	GGC	2	6	177667	177672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253686555
3363	NC_012917	ACT	2	6	177795	177800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253686555
3364	NC_012917	ATG	2	6	177849	177854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686555
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3366	NC_012917	GA	3	6	177946	177951	50 %	0 %	50 %	0 %	253686555
3367	NC_012917	GGT	2	6	177952	177957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253686555
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3371	NC_012917	CGG	2	6	178111	178116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253686556
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3375	NC_012917	TGG	2	6	178252	178257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253686556
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3395	NC_012917	TGC	2	6	178966	178971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686557
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3475	NC_012917	GCA	2	6	183522	183527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686561
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3479	NC_012917	GCCTGC	2	12	183615	183626	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	253686561
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3481	NC_012917	TCG	2	6	183849	183854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686561
3482	NC_012917	CTTT	2	8	183855	183862	0 %	75 %	0 %	25 %	253686561
3483	NC_012917	GCG	2	6	183872	183877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253686561
3484	NC_012917	GAT	3	9	183890	183898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686561
3485	NC_012917	AG	3	6	183956	183961	50 %	0 %	50 %	0 %	253686561
3486	NC_012917	GC	3	6	183979	183984	0 %	0 %	50 %	50 %	253686561
3487	NC_012917	GCCA	2	8	184001	184008	25 %	0 %	25 %	50 %	253686561
3488	NC_012917	GGT	2	6	184041	184046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253686561
3489	NC_012917	TGC	2	6	184123	184128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686561
3490	NC_012917	CAT	2	6	184393	184398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253686562
3491	NC_012917	CAG	2	6	184463	184468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686562
3492	NC_012917	T	6	6	184478	184483	0 %	100 %	0 %	0 %	253686562
3493	NC_012917	TTC	2	6	184493	184498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253686562
3494	NC_012917	GCC	2	6	184530	184535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253686562
3495	NC_012917	ACG	2	6	184556	184561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686562
3496	NC_012917	GGT	2	6	184660	184665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253686562
3497	NC_012917	GGAAC	2	10	184769	184778	40 %	0 %	40 %	20 %	253686562
3498	NC_012917	CAG	2	6	184814	184819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686562
3499	NC_012917	GCT	2	6	184863	184868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686562
3500	NC_012917	GAT	2	6	184893	184898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686562

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