MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1

Total Repeats: 85717

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012917	TGG	2	6	53494	53499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253686455
1002	NC_012917	GTG	2	6	53500	53505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253686455
1003	NC_012917	GAA	2	6	53705	53710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253686456
1004	NC_012917	GGT	2	6	53716	53721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253686456
1005	NC_012917	TCG	2	6	53727	53732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686456
1006	NC_012917	TGG	2	6	53871	53876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253686456
1007	NC_012917	GAT	2	6	53890	53895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686456
1008	NC_012917	GGT	2	6	53975	53980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253686456
1009	NC_012917	CGT	2	6	53993	53998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686456
1010	NC_012917	CTG	2	6	54014	54019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686456
1011	NC_012917	CGG	2	6	54079	54084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253686456
1012	NC_012917	TGA	2	6	54099	54104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686456
1013	NC_012917	GCT	2	6	54133	54138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686456
1014	NC_012917	ACG	2	6	54155	54160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686456
1015	NC_012917	ATT	2	6	54188	54193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253686456
1016	NC_012917	CTG	2	6	54197	54202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686456
1017	NC_012917	GCA	2	6	54211	54216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686456
1018	NC_012917	TGG	2	6	54261	54266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253686456
1019	NC_012917	CAC	2	6	54278	54283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253686456
1020	NC_012917	ATC	2	6	54284	54289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253686456
1021	NC_012917	GGT	2	6	54307	54312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253686456
1022	NC_012917	GCG	2	6	54326	54331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253686456
1023	NC_012917	GC	3	6	54342	54347	0 %	0 %	50 %	50 %	253686456
1024	NC_012917	TGCG	2	8	54375	54382	0 %	25 %	50 %	25 %	253686456
1025	NC_012917	CGG	2	6	54396	54401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253686456
1026	NC_012917	GTG	2	6	54431	54436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253686456
1027	NC_012917	CTGT	2	8	54463	54470	0 %	50 %	25 %	25 %	253686456
1028	NC_012917	GAA	2	6	54512	54517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253686456
1029	NC_012917	GTC	2	6	54540	54545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686456
1030	NC_012917	GAT	2	6	54569	54574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686456
1031	NC_012917	GACC	2	8	54582	54589	25 %	0 %	25 %	50 %	253686456
1032	NC_012917	TGAAC	2	10	54597	54606	40 %	20 %	20 %	20 %	253686457
1033	NC_012917	GATT	2	8	54636	54643	25 %	50 %	25 %	0 %	253686457
1034	NC_012917	A	6	6	54646	54651	100 %	0 %	0 %	0 %	253686457
1035	NC_012917	GAA	2	6	54663	54668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253686457
1036	NC_012917	GGT	2	6	54747	54752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253686457
1037	NC_012917	CTG	2	6	54790	54795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686457
1038	NC_012917	GAT	2	6	54798	54803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686457
1039	NC_012917	CTG	2	6	54847	54852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686457
1040	NC_012917	AGA	2	6	54887	54892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253686457
1041	NC_012917	GAA	2	6	54958	54963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253686457
1042	NC_012917	GCT	2	6	54966	54971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686457
1043	NC_012917	GAT	2	6	55020	55025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686457
1044	NC_012917	GGC	2	6	55081	55086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253686457
1045	NC_012917	CAGCGT	2	12	55087	55098	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	253686457
1046	NC_012917	ATCGCT	2	12	55099	55110	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	253686457
1047	NC_012917	CG	3	6	55180	55185	0 %	0 %	50 %	50 %	253686457
1048	NC_012917	TGA	2	6	55199	55204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686457
1049	NC_012917	GCA	2	6	55212	55217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686457
1050	NC_012917	CGT	2	6	55260	55265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686457
1051	NC_012917	TGA	2	6	55278	55283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686457
1052	NC_012917	GTGATG	2	12	55285	55296	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	253686457
1053	NC_012917	CAA	2	6	55341	55346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253686457
1054	NC_012917	CGC	2	6	55385	55390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253686457
1055	NC_012917	CCG	2	6	55459	55464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253686457
1056	NC_012917	GCT	2	6	55493	55498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686457
1057	NC_012917	CA	3	6	55509	55514	50 %	0 %	0 %	50 %	253686457
1058	NC_012917	CAG	2	6	55546	55551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686457
1059	NC_012917	TTTTA	2	10	56135	56144	20 %	80 %	0 %	0 %	253686458
1060	NC_012917	CTT	2	6	56159	56164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253686458
1061	NC_012917	ATTA	2	8	56169	56176	50 %	50 %	0 %	0 %	253686458
1062	NC_012917	TCA	2	6	56224	56229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253686458
1063	NC_012917	AT	3	6	56238	56243	50 %	50 %	0 %	0 %	253686458
1064	NC_012917	AAT	2	6	56265	56270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253686458
1065	NC_012917	AT	3	6	56269	56274	50 %	50 %	0 %	0 %	253686458
1066	NC_012917	TA	3	6	56345	56350	50 %	50 %	0 %	0 %	253686458
1067	NC_012917	TA	3	6	56376	56381	50 %	50 %	0 %	0 %	253686458
1068	NC_012917	CAT	2	6	56399	56404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253686458
1069	NC_012917	GAA	2	6	56450	56455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253686458
1070	NC_012917	TCCA	2	8	56698	56705	25 %	25 %	0 %	50 %	253686459
1071	NC_012917	TTCT	2	8	56778	56785	0 %	75 %	0 %	25 %	253686459
1072	NC_012917	ATA	2	6	56833	56838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253686459
1073	NC_012917	ACTT	2	8	56886	56893	25 %	50 %	0 %	25 %	253686459
1074	NC_012917	C	6	6	57026	57031	0 %	0 %	0 %	100 %	253686459
1075	NC_012917	CCA	2	6	57065	57070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253686459
1076	NC_012917	GTA	2	6	57079	57084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686459
1077	NC_012917	TGCC	2	8	57205	57212	0 %	25 %	25 %	50 %	253686459
1078	NC_012917	GCT	2	6	57262	57267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686459
1079	NC_012917	CGTC	2	8	57290	57297	0 %	25 %	25 %	50 %	253686459
1080	NC_012917	CAG	2	6	57319	57324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686459
1081	NC_012917	ACC	2	6	57578	57583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253686459
1082	NC_012917	TCG	2	6	57629	57634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686459
1083	NC_012917	CCGT	2	8	57729	57736	0 %	25 %	25 %	50 %	253686459
1084	NC_012917	GGAC	2	8	57753	57760	25 %	0 %	50 %	25 %	253686459
1085	NC_012917	CCCG	2	8	57765	57772	0 %	0 %	25 %	75 %	253686459
1086	NC_012917	GCCA	2	8	57817	57824	25 %	0 %	25 %	50 %	253686459
1087	NC_012917	CGT	2	6	57837	57842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686459
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1089	NC_012917	CTG	3	9	57883	57891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686459
1090	NC_012917	CG	3	6	57903	57908	0 %	0 %	50 %	50 %	253686459
1091	NC_012917	CGA	2	6	57964	57969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686459
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1093	NC_012917	CAT	2	6	57984	57989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253686459
1094	NC_012917	GTGC	2	8	58115	58122	0 %	25 %	50 %	25 %	253686459
1095	NC_012917	CAC	2	6	58171	58176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253686459
1096	NC_012917	TGG	2	6	58212	58217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253686459
1097	NC_012917	GCCT	2	8	58236	58243	0 %	25 %	25 %	50 %	253686459
1098	NC_012917	GCG	2	6	58244	58249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253686459
1099	NC_012917	CGTC	2	8	58304	58311	0 %	25 %	25 %	50 %	253686459
1100	NC_012917	TTCGCC	2	12	58330	58341	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	253686459
1101	NC_012917	TCG	2	6	58370	58375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686459
1102	NC_012917	CCA	2	6	58441	58446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253686459
1103	NC_012917	GCT	2	6	58485	58490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686459
1104	NC_012917	CT	3	6	58493	58498	0 %	50 %	0 %	50 %	253686459
1105	NC_012917	CGTG	2	8	58537	58544	0 %	25 %	50 %	25 %	253686459
1106	NC_012917	CAG	2	6	58609	58614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686459
1107	NC_012917	GTT	2	6	58615	58620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253686459
1108	NC_012917	TCT	2	6	58643	58648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253686459
1109	NC_012917	TCA	2	6	58652	58657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253686459
1110	NC_012917	GGAC	2	8	58658	58665	25 %	0 %	50 %	25 %	253686459
1111	NC_012917	ACG	2	6	58693	58698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686459
1112	NC_012917	TAGCC	2	10	58700	58709	20 %	20 %	20 %	40 %	253686459
1113	NC_012917	CAC	2	6	58741	58746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253686459
1114	NC_012917	CTG	2	6	58753	58758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686459
1115	NC_012917	CTG	2	6	58771	58776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686459
1116	NC_012917	GAT	2	6	58818	58823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686459
1117	NC_012917	CAG	2	6	58873	58878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686459
1118	NC_012917	TCG	2	6	59012	59017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686459
1119	NC_012917	ACC	2	6	59096	59101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253686459
1120	NC_012917	GTC	2	6	59140	59145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686459
1121	NC_012917	CGCTG	2	10	59220	59229	0 %	20 %	40 %	40 %	253686459
1122	NC_012917	TCA	2	6	59244	59249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253686459
1123	NC_012917	TCG	2	6	59258	59263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686459
1124	NC_012917	GGT	2	6	59302	59307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253686459
1125	NC_012917	GTCGTA	2	12	59392	59403	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	253686459
1126	NC_012917	GGC	2	6	59422	59427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253686459
1127	NC_012917	CAGC	2	8	59469	59476	25 %	0 %	25 %	50 %	253686459
1128	NC_012917	TCG	2	6	59552	59557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686459
1129	NC_012917	CCG	2	6	59719	59724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253686459
1130	NC_012917	TGA	2	6	59814	59819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686459
1131	NC_012917	GGC	2	6	60203	60208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253686459
1132	NC_012917	CCA	2	6	60244	60249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253686459
1133	NC_012917	CAGG	2	8	60271	60278	25 %	0 %	50 %	25 %	253686459
1134	NC_012917	A	6	6	60295	60300	100 %	0 %	0 %	0 %	253686459
1135	NC_012917	TCCT	2	8	60313	60320	0 %	50 %	0 %	50 %	253686459
1136	NC_012917	CAC	2	6	60330	60335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253686459
1137	NC_012917	TCG	2	6	60347	60352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686459
1138	NC_012917	CAAT	2	8	60402	60409	50 %	25 %	0 %	25 %	253686459
1139	NC_012917	GAG	2	6	60411	60416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253686459
1140	NC_012917	TCT	2	6	60462	60467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253686459
1141	NC_012917	GAA	2	6	60497	60502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253686459
1142	NC_012917	CGG	2	6	60514	60519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253686459
1143	NC_012917	GCT	2	6	60559	60564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686459
1144	NC_012917	GCC	2	6	60643	60648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253686459
1145	NC_012917	GCG	2	6	60692	60697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253686459
1146	NC_012917	ACC	2	6	60704	60709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253686459
1147	NC_012917	GC	3	6	60744	60749	0 %	0 %	50 %	50 %	253686459
1148	NC_012917	GGC	2	6	60827	60832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253686459
1149	NC_012917	ATG	2	6	60896	60901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686459
1150	NC_012917	GGC	2	6	60915	60920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253686460
1151	NC_012917	ACC	2	6	60934	60939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253686460
1152	NC_012917	TACGGT	2	12	60981	60992	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	253686460
1153	NC_012917	TAA	2	6	61002	61007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253686460
1154	NC_012917	CTG	2	6	61164	61169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686460
1155	NC_012917	AATC	2	8	61196	61203	50 %	25 %	0 %	25 %	253686460
1156	NC_012917	GAA	2	6	61241	61246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253686460
1157	NC_012917	TCG	2	6	61264	61269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686460
1158	NC_012917	TTCA	2	8	61299	61306	25 %	50 %	0 %	25 %	253686460
1159	NC_012917	CGA	2	6	61369	61374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686461
1160	NC_012917	TTGA	2	8	61395	61402	25 %	50 %	25 %	0 %	253686461
1161	NC_012917	TGC	2	6	61432	61437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686461
1162	NC_012917	TGT	2	6	61459	61464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253686461
1163	NC_012917	ACG	2	6	61494	61499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686461
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1165	NC_012917	TGC	2	6	61584	61589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686461
1166	NC_012917	ACG	2	6	61590	61595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686461
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1182	NC_012917	ATTCG	2	10	62303	62312	20 %	40 %	20 %	20 %	253686461
1183	NC_012917	CTG	2	6	62512	62517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686461
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1186	NC_012917	GAC	2	6	62636	62641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686461
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1189	NC_012917	GCGCA	2	10	62765	62774	20 %	0 %	40 %	40 %	253686461
1190	NC_012917	CTT	2	6	62797	62802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253686461
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1193	NC_012917	GCG	2	6	62912	62917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253686461
1194	NC_012917	GCTGA	2	10	63092	63101	20 %	20 %	40 %	20 %	253686461
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1201	NC_012917	CTT	2	6	64370	64375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253686463
1202	NC_012917	TGA	2	6	64441	64446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686463
1203	NC_012917	GAA	2	6	64476	64481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253686463
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1210	NC_012917	CGT	2	6	64682	64687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686463
1211	NC_012917	GCA	2	6	64697	64702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686463
1212	NC_012917	ATC	2	6	64717	64722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253686463
1213	NC_012917	ATG	2	6	64765	64770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686463
1214	NC_012917	GAT	2	6	64869	64874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686463
1215	NC_012917	GCG	2	6	64889	64894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253686463
1216	NC_012917	ATCA	2	8	64941	64948	50 %	25 %	0 %	25 %	253686463
1217	NC_012917	TGC	3	9	64963	64971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686463
1218	NC_012917	TCG	3	9	64996	65004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686463
1219	NC_012917	ATC	2	6	65058	65063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253686463
1220	NC_012917	TGT	2	6	65150	65155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253686463
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1226	NC_012917	TTCA	2	8	65520	65527	25 %	50 %	0 %	25 %	253686463
1227	NC_012917	GTC	2	6	65529	65534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686463
1228	NC_012917	A	6	6	65991	65996	100 %	0 %	0 %	0 %	253686464
1229	NC_012917	CAT	2	6	66028	66033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253686464
1230	NC_012917	CGG	2	6	66164	66169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253686464
1231	NC_012917	GATTAC	2	12	66191	66202	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	253686464
1232	NC_012917	TGA	2	6	66302	66307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686464
1233	NC_012917	GCTG	2	8	66355	66362	0 %	25 %	50 %	25 %	253686464
1234	NC_012917	GAT	2	6	66377	66382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686464
1235	NC_012917	GTC	2	6	66417	66422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686464
1236	NC_012917	AC	3	6	66463	66468	50 %	0 %	0 %	50 %	253686464
1237	NC_012917	GTG	3	9	66480	66488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253686464
1238	NC_012917	CTG	2	6	66531	66536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253686464
1239	NC_012917	AAG	2	6	66552	66557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253686464
1240	NC_012917	ATG	2	6	66619	66624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686464
1241	NC_012917	CAA	2	6	66632	66637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253686464
1242	NC_012917	CG	4	8	66647	66654	0 %	0 %	50 %	50 %	253686464
1243	NC_012917	TATC	2	8	66665	66672	25 %	50 %	0 %	25 %	253686464
1244	NC_012917	GGA	2	6	66698	66703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253686464
1245	NC_012917	TGA	2	6	66809	66814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686464
1246	NC_012917	GGGCA	2	10	66846	66855	20 %	0 %	60 %	20 %	253686464
1247	NC_012917	GGC	2	6	66863	66868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253686464
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1497	NC_012917	CGA	2	6	80384	80389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686473
1498	NC_012917	GTT	3	9	80505	80513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253686473
1499	NC_012917	GAT	2	6	80577	80582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253686473
1500	NC_012917	CAG	2	6	80648	80653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253686473

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