MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Paenibacillus sp. JDR-2 chromosome

Total Repeats: 123957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_012914	CAT	2	6	248451	248456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794241
4002	NC_012914	ATC	2	6	248480	248485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794241
4003	NC_012914	GCC	2	6	248512	248517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794241
4004	NC_012914	GAAGC	2	10	248611	248620	40 %	0 %	40 %	20 %	251794241
4005	NC_012914	GGC	2	6	248766	248771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794241
4006	NC_012914	TGGC	2	8	248779	248786	0 %	25 %	50 %	25 %	251794241
4007	NC_012914	GCA	2	6	248787	248792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794241
4008	NC_012914	GCG	2	6	248796	248801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794241
4009	NC_012914	GC	3	6	248812	248817	0 %	0 %	50 %	50 %	251794241
4010	NC_012914	GCC	2	6	248830	248835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794241
4011	NC_012914	ATT	2	6	248988	248993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794241
4012	NC_012914	CGG	2	6	249011	249016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794241
4013	NC_012914	CGC	2	6	249136	249141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794241
4014	NC_012914	GCAT	2	8	249236	249243	25 %	25 %	25 %	25 %	251794241
4015	NC_012914	ATG	2	6	249528	249533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794242
4016	NC_012914	GGC	2	6	249589	249594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794242
4017	NC_012914	GTT	2	6	249701	249706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794242
4018	NC_012914	CGC	2	6	249831	249836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794242
4019	NC_012914	GTA	2	6	249860	249865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794242
4020	NC_012914	GCC	2	6	249866	249871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794242
4021	NC_012914	TAT	2	6	249905	249910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794242
4022	NC_012914	CTT	2	6	249980	249985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794242
4023	NC_012914	G	6	6	250079	250084	0 %	0 %	100 %	0 %	251794242
4024	NC_012914	GT	3	6	250120	250125	0 %	50 %	50 %	0 %	251794242
4025	NC_012914	ATC	2	6	250181	250186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794242
4026	NC_012914	TAT	2	6	250228	250233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794242
4027	NC_012914	GCT	2	6	250261	250266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794242
4028	NC_012914	GGC	2	6	250282	250287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794242
4029	NC_012914	GCT	2	6	250336	250341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794242
4030	NC_012914	AGA	2	6	250377	250382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794242
4031	NC_012914	CGGG	2	8	250426	250433	0 %	0 %	75 %	25 %	251794243
4032	NC_012914	TGA	2	6	250460	250465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794243
4033	NC_012914	GTG	2	6	250474	250479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794243
4034	NC_012914	GTT	2	6	250578	250583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794243
4035	NC_012914	CTT	2	6	250743	250748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794243
4036	NC_012914	GCT	2	6	250773	250778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794243
4037	NC_012914	GTT	2	6	250785	250790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794243
4038	NC_012914	GCT	2	6	250806	250811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794243
4039	NC_012914	ATTG	2	8	250821	250828	25 %	50 %	25 %	0 %	251794243
4040	NC_012914	CT	3	6	250834	250839	0 %	50 %	0 %	50 %	251794243
4041	NC_012914	TTGCGG	2	12	250889	250900	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	251794243
4042	NC_012914	TTG	2	6	251033	251038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794243
4043	NC_012914	CGA	2	6	251094	251099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794243
4044	NC_012914	GCT	2	6	251145	251150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794243
4045	NC_012914	TGG	2	6	251243	251248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794243
4046	NC_012914	CGG	2	6	251318	251323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794243
4047	NC_012914	TTCC	2	8	251335	251342	0 %	50 %	0 %	50 %	251794243
4048	NC_012914	CCGG	2	8	251353	251360	0 %	0 %	50 %	50 %	251794243
4049	NC_012914	TATT	2	8	251398	251405	25 %	75 %	0 %	0 %	251794243
4050	NC_012914	ATG	2	6	251459	251464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794244
4051	NC_012914	A	7	7	251471	251477	100 %	0 %	0 %	0 %	251794244
4052	NC_012914	AAT	2	6	251482	251487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794244
4053	NC_012914	GCT	2	6	251488	251493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794244
4054	NC_012914	GGC	2	6	251563	251568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794244
4055	NC_012914	GCG	2	6	251576	251581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794244
4056	NC_012914	GCG	2	6	251589	251594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794244
4057	NC_012914	GGC	2	6	251602	251607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794244
4058	NC_012914	CGT	2	6	251634	251639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794244
4059	NC_012914	GAAG	2	8	251773	251780	50 %	0 %	50 %	0 %	251794244
4060	NC_012914	ATT	2	6	251816	251821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794244
4061	NC_012914	GA	3	6	251911	251916	50 %	0 %	50 %	0 %	251794244
4062	NC_012914	GAA	2	6	251923	251928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794244
4063	NC_012914	AGC	2	6	251932	251937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794244
4064	NC_012914	GAG	2	6	251984	251989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794244
4065	NC_012914	GAT	2	6	252119	252124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794244
4066	NC_012914	AGG	2	6	252189	252194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794244
4067	NC_012914	GTT	3	9	252227	252235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794244
4068	NC_012914	GAA	2	6	252239	252244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794244
4069	NC_012914	GAA	2	6	252253	252258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794244
4070	NC_012914	ATG	2	6	252264	252269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794244
4071	NC_012914	AGC	2	6	252278	252283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794244
4072	NC_012914	GAA	2	6	252310	252315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794244
4073	NC_012914	AGC	2	6	252339	252344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794244
4074	NC_012914	CAA	2	6	252370	252375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794244
4075	NC_012914	CGAAGC	2	12	252388	252399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794244
4076	NC_012914	T	6	6	252401	252406	0 %	100 %	0 %	0 %	251794244
4077	NC_012914	TTCCG	2	10	252496	252505	0 %	40 %	20 %	40 %	251794245
4078	NC_012914	GCT	2	6	252558	252563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794245
4079	NC_012914	CTG	2	6	252572	252577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794245
4080	NC_012914	GCC	2	6	252595	252600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794245
4081	NC_012914	AGA	3	9	252620	252628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794245
4082	NC_012914	AAC	2	6	252637	252642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794245
4083	NC_012914	CTG	2	6	252652	252657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794245
4084	NC_012914	GCG	2	6	252736	252741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794245
4085	NC_012914	AAC	2	6	252750	252755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794245
4086	NC_012914	AGA	2	6	252784	252789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794245
4087	NC_012914	TAA	2	6	252815	252820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794245
4088	NC_012914	CGGC	2	8	252865	252872	0 %	0 %	50 %	50 %	251794245
4089	NC_012914	GGCC	2	8	252950	252957	0 %	0 %	50 %	50 %	251794245
4090	NC_012914	GGT	2	6	252972	252977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794245
4091	NC_012914	CGC	2	6	252993	252998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794245
4092	NC_012914	GCG	3	9	253023	253031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794245
4093	NC_012914	GCA	2	6	253049	253054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794245
4094	NC_012914	GCC	2	6	253055	253060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794245
4095	NC_012914	CGG	2	6	253157	253162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794245
4096	NC_012914	GAA	2	6	253188	253193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794245
4097	NC_012914	CAA	2	6	253199	253204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794245
4098	NC_012914	AGA	2	6	253240	253245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794245
4099	NC_012914	ACG	2	6	253264	253269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794245
4100	NC_012914	AGG	2	6	253298	253303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794245
4101	NC_012914	GGC	2	6	253323	253328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794245
4102	NC_012914	AAGAA	2	10	253363	253372	80 %	0 %	20 %	0 %	251794245
4103	NC_012914	CTGC	2	8	253531	253538	0 %	25 %	25 %	50 %	251794245
4104	NC_012914	GGA	2	6	253551	253556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794245
4105	NC_012914	AGC	2	6	253596	253601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794245
4106	NC_012914	GGC	2	6	253892	253897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794246
4107	NC_012914	CTT	2	6	253934	253939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794246
4108	NC_012914	A	6	6	253982	253987	100 %	0 %	0 %	0 %	251794246
4109	NC_012914	GC	3	6	253995	254000	0 %	0 %	50 %	50 %	251794246
4110	NC_012914	CGA	2	6	254015	254020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794246
4111	NC_012914	TA	3	6	254021	254026	50 %	50 %	0 %	0 %	251794246
4112	NC_012914	TGG	2	6	254029	254034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794246
4113	NC_012914	GGC	2	6	254043	254048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794246
4114	NC_012914	CGT	2	6	254049	254054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794246
4115	NC_012914	ATGG	2	8	254056	254063	25 %	25 %	50 %	0 %	251794246
4116	NC_012914	TCAT	2	8	254129	254136	25 %	50 %	0 %	25 %	251794246
4117	NC_012914	TTA	2	6	254180	254185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794246
4118	NC_012914	TCG	2	6	254192	254197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794246
4119	NC_012914	CGA	2	6	254211	254216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794246
4120	NC_012914	A	6	6	254311	254316	100 %	0 %	0 %	0 %	251794246
4121	NC_012914	CTG	2	6	254371	254376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794246
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4242	NC_012914	GGA	2	6	262140	262145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794255
4243	NC_012914	GCA	2	6	262168	262173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794255
4244	NC_012914	TGT	2	6	262201	262206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794255
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4246	NC_012914	CTG	2	6	262308	262313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794255
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4259	NC_012914	ATT	2	6	263337	263342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794256
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4261	NC_012914	TGG	2	6	263396	263401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794256
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4272	NC_012914	CAG	2	6	263951	263956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794256
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4282	NC_012914	AAT	2	6	264743	264748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794256
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4353	NC_012914	GCG	2	6	268727	268732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794257
4354	NC_012914	TCCGA	2	10	268754	268763	20 %	20 %	20 %	40 %	251794257
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4362	NC_012914	CTG	2	6	269058	269063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794257
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4483	NC_012914	CTG	2	6	275926	275931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794264
4484	NC_012914	TGC	2	6	275951	275956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794264
4485	NC_012914	GAAAT	3	15	276035	276049	60 %	20 %	20 %	0 %	251794264
4486	NC_012914	TCCA	2	8	276054	276061	25 %	25 %	0 %	50 %	251794264
4487	NC_012914	GGC	2	6	276091	276096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794264
4488	NC_012914	CAA	2	6	276210	276215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794264
4489	NC_012914	GAA	2	6	276223	276228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794264
4490	NC_012914	GGAA	2	8	276359	276366	50 %	0 %	50 %	0 %	251794264
4491	NC_012914	CTA	2	6	276435	276440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794264
4492	NC_012914	GGC	2	6	276483	276488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794264
4493	NC_012914	TTC	2	6	276594	276599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794264
4494	NC_012914	CGG	2	6	276662	276667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794264
4495	NC_012914	AGC	2	6	276719	276724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794264
4496	NC_012914	AAC	2	6	276856	276861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794264
4497	NC_012914	AGCG	2	8	276915	276922	25 %	0 %	50 %	25 %	251794264
4498	NC_012914	CGG	2	6	277088	277093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794264
4499	NC_012914	AGA	2	6	277188	277193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794264
4500	NC_012914	GCT	2	6	277218	277223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794264

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