MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Paenibacillus sp. JDR-2 chromosome

Total Repeats: 123957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012914	CAG	2	6	218591	218596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794229
3502	NC_012914	TCT	2	6	218650	218655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794229
3503	NC_012914	GCC	2	6	218691	218696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794229
3504	NC_012914	AAT	2	6	218856	218861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794230
3505	NC_012914	TGC	2	6	218885	218890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794230
3506	NC_012914	TC	3	6	218892	218897	0 %	50 %	0 %	50 %	251794230
3507	NC_012914	GCT	2	6	218898	218903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794230
3508	NC_012914	TGC	2	6	218915	218920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794230
3509	NC_012914	ACG	2	6	218935	218940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794230
3510	NC_012914	TC	3	6	218960	218965	0 %	50 %	0 %	50 %	251794230
3511	NC_012914	AAGG	2	8	219043	219050	50 %	0 %	50 %	0 %	251794230
3512	NC_012914	TCA	2	6	219062	219067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794230
3513	NC_012914	GAC	2	6	219150	219155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794230
3514	NC_012914	ACG	2	6	219164	219169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794230
3515	NC_012914	GCT	2	6	219189	219194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794230
3516	NC_012914	GCTT	2	8	219210	219217	0 %	50 %	25 %	25 %	251794230
3517	NC_012914	AAC	2	6	219394	219399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794230
3518	NC_012914	CGA	2	6	219450	219455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794230
3519	NC_012914	GCAA	2	8	219532	219539	50 %	0 %	25 %	25 %	251794230
3520	NC_012914	CGT	2	6	219546	219551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794230
3521	NC_012914	CGG	2	6	219651	219656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794230
3522	NC_012914	A	7	7	219658	219664	100 %	0 %	0 %	0 %	251794230
3523	NC_012914	TTC	2	6	219691	219696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794230
3524	NC_012914	ACGGC	2	10	219827	219836	20 %	0 %	40 %	40 %	251794230
3525	NC_012914	GATGC	2	10	219838	219847	20 %	20 %	40 %	20 %	251794230
3526	NC_012914	CTG	2	6	219912	219917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794230
3527	NC_012914	CGG	2	6	220152	220157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794230
3528	NC_012914	GCA	2	6	220188	220193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794230
3529	NC_012914	GAA	2	6	220272	220277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794230
3530	NC_012914	GCT	2	6	220371	220376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794230
3531	NC_012914	TGG	2	6	220480	220485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794230
3532	NC_012914	GCT	2	6	220581	220586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794230
3533	NC_012914	GGC	2	6	220609	220614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794230
3534	NC_012914	GGA	2	6	220650	220655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794230
3535	NC_012914	GGC	2	6	220710	220715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794230
3536	NC_012914	TCC	2	6	220758	220763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251794230
3537	NC_012914	CGG	2	6	220781	220786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794230
3538	NC_012914	CGT	2	6	221051	221056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794230
3539	NC_012914	GACG	2	8	221097	221104	25 %	0 %	50 %	25 %	251794230
3540	NC_012914	CGA	2	6	221114	221119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794230
3541	NC_012914	CAA	2	6	221145	221150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794230
3542	NC_012914	TACG	2	8	221244	221251	25 %	25 %	25 %	25 %	251794230
3543	NC_012914	CGG	2	6	221314	221319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794230
3544	NC_012914	TA	3	6	221362	221367	50 %	50 %	0 %	0 %	251794230
3545	NC_012914	ACA	2	6	221450	221455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794230
3546	NC_012914	CG	3	6	221488	221493	0 %	0 %	50 %	50 %	251794230
3547	NC_012914	GGA	2	6	221586	221591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794230
3548	NC_012914	TAT	2	6	221596	221601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794230
3549	NC_012914	AAC	2	6	221626	221631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794230
3550	NC_012914	AGC	2	6	221685	221690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794230
3551	NC_012914	GAA	2	6	221736	221741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794230
3552	NC_012914	GAC	2	6	221776	221781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794230
3553	NC_012914	AAC	2	6	221791	221796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794230
3554	NC_012914	CGA	2	6	221855	221860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794230
3555	NC_012914	GAC	2	6	221877	221882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794230
3556	NC_012914	GA	3	6	222486	222491	50 %	0 %	50 %	0 %	251794231
3557	NC_012914	TGTT	2	8	222558	222565	0 %	75 %	25 %	0 %	251794231
3558	NC_012914	CGG	2	6	222597	222602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794231
3559	NC_012914	GAT	2	6	222610	222615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794231
3560	NC_012914	ATG	2	6	222620	222625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794231
3561	NC_012914	GCT	2	6	222745	222750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794231
3562	NC_012914	GCG	2	6	222776	222781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794231
3563	NC_012914	GGC	2	6	222796	222801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794231
3564	NC_012914	CGG	2	6	222822	222827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794231
3565	NC_012914	CTG	2	6	222836	222841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794231
3566	NC_012914	ACGA	2	8	222848	222855	50 %	0 %	25 %	25 %	251794231
3567	NC_012914	CAT	2	6	222860	222865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794231
3568	NC_012914	ACA	2	6	222915	222920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794231
3569	NC_012914	TCG	2	6	223047	223052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794231
3570	NC_012914	GCG	2	6	223058	223063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794231
3571	NC_012914	GCT	2	6	223174	223179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794231
3572	NC_012914	CGC	2	6	223188	223193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794231
3573	NC_012914	CTG	2	6	223238	223243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794231
3574	NC_012914	GCT	2	6	223339	223344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794231
3575	NC_012914	GCT	2	6	223360	223365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794231
3576	NC_012914	GAA	2	6	223693	223698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794231
3577	NC_012914	AAG	2	6	223718	223723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794231
3578	NC_012914	TCCG	2	8	223797	223804	0 %	25 %	25 %	50 %	251794231
3579	NC_012914	GCA	2	6	223819	223824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794231
3580	NC_012914	CCG	2	6	223917	223922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794231
3581	NC_012914	CTG	2	6	223955	223960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794231
3582	NC_012914	CGG	2	6	223987	223992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794231
3583	NC_012914	GAA	2	6	224069	224074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794231
3584	NC_012914	TGC	2	6	224082	224087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794231
3585	NC_012914	TTC	2	6	224105	224110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794231
3586	NC_012914	CGG	2	6	224140	224145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794231
3587	NC_012914	CGG	2	6	224194	224199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794231
3588	NC_012914	GGAA	2	8	224227	224234	50 %	0 %	50 %	0 %	251794231
3589	NC_012914	CAGA	2	8	224292	224299	50 %	0 %	25 %	25 %	251794231
3590	NC_012914	AGG	2	6	224428	224433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794232
3591	NC_012914	GAAG	2	8	224539	224546	50 %	0 %	50 %	0 %	251794232
3592	NC_012914	ATT	2	6	224614	224619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794232
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3594	NC_012914	TCCG	2	8	224766	224773	0 %	25 %	25 %	50 %	251794232
3595	NC_012914	CTG	3	9	224832	224840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794232
3596	NC_012914	GCT	2	6	224870	224875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794232
3597	NC_012914	GA	3	6	224972	224977	50 %	0 %	50 %	0 %	251794232
3598	NC_012914	ACG	2	6	224995	225000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794232
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3600	NC_012914	GCA	2	6	225139	225144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794232
3601	NC_012914	CG	3	6	225185	225190	0 %	0 %	50 %	50 %	251794232
3602	NC_012914	GGC	2	6	225212	225217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794232
3603	NC_012914	CGG	2	6	225244	225249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794232
3604	NC_012914	GCT	2	6	225260	225265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794232
3605	NC_012914	GAA	2	6	225320	225325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794232
3606	NC_012914	AAG	2	6	225345	225350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794232
3607	NC_012914	GCT	2	6	225422	225427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794232
3608	NC_012914	GGA	2	6	225840	225845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794233
3609	NC_012914	TTAA	2	8	225874	225881	50 %	50 %	0 %	0 %	251794233
3610	NC_012914	TTA	2	6	225917	225922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794233
3611	NC_012914	GCT	2	6	225954	225959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794233
3612	NC_012914	GGC	2	6	226032	226037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794233
3613	NC_012914	GCG	2	6	226111	226116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794233
3614	NC_012914	GTT	2	6	226141	226146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794233
3615	NC_012914	ACGGG	2	10	226149	226158	20 %	0 %	60 %	20 %	251794233
3616	NC_012914	CAG	2	6	226282	226287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794233
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3618	NC_012914	CAG	2	6	226330	226335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794233
3619	NC_012914	GCA	2	6	226369	226374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794233
3620	NC_012914	TCG	3	9	226439	226447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794233
3621	NC_012914	CGT	2	6	226617	226622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794233
3622	NC_012914	GAA	2	6	226629	226634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794233
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3625	NC_012914	GTC	2	6	226672	226677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794233
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3627	NC_012914	ATTACG	2	12	226735	226746	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	251794233
3628	NC_012914	GCG	2	6	226747	226752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794233
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3732	NC_012914	GTT	2	6	233035	233040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794233
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3734	NC_012914	CGGCG	2	10	233133	233142	0 %	0 %	60 %	40 %	251794233
3735	NC_012914	ATGA	2	8	233188	233195	50 %	25 %	25 %	0 %	251794233
3736	NC_012914	TCC	2	6	233254	233259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251794233
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3789	NC_012914	CGG	2	6	236270	236275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794233
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3854	NC_012914	GC	3	6	240228	240233	0 %	0 %	50 %	50 %	251794234
3855	NC_012914	TGG	2	6	240329	240334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794234
3856	NC_012914	CGGA	2	8	240362	240369	25 %	0 %	50 %	25 %	251794234
3857	NC_012914	TTG	2	6	240377	240382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794234
3858	NC_012914	AGC	2	6	240493	240498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794234
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3860	NC_012914	TTA	2	6	240627	240632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794234
3861	NC_012914	TGA	2	6	240692	240697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794234
3862	NC_012914	TGC	2	6	240716	240721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794234
3863	NC_012914	GGC	2	6	240722	240727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794234
3864	NC_012914	CGA	2	6	240816	240821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794234
3865	NC_012914	TGA	2	6	240959	240964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794234
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3975	NC_012914	GCA	2	6	246822	246827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794239
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3978	NC_012914	CAT	2	6	246913	246918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794239
3979	NC_012914	ATCC	2	8	246922	246929	25 %	25 %	0 %	50 %	251794240
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3981	NC_012914	AGC	3	9	247066	247074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794240
3982	NC_012914	AGCA	2	8	247149	247156	50 %	0 %	25 %	25 %	251794240
3983	NC_012914	ATAA	2	8	247288	247295	75 %	25 %	0 %	0 %	251794240
3984	NC_012914	AGG	2	6	247297	247302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794240
3985	NC_012914	TCA	2	6	247334	247339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794240
3986	NC_012914	ACC	2	6	247384	247389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	251794240
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