MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Paenibacillus sp. JDR-2 chromosome

Total Repeats: 123957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_012914	CGGA	2	8	809794	809801	25 %	0 %	50 %	25 %	251794730
14002	NC_012914	ATG	2	6	809822	809827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794730
14003	NC_012914	CAA	2	6	809843	809848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794730
14004	NC_012914	TTA	2	6	809861	809866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794730
14005	NC_012914	CGG	2	6	809943	809948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794730
14006	NC_012914	GGA	2	6	810033	810038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794730
14007	NC_012914	GCT	2	6	810090	810095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794730
14008	NC_012914	GCT	2	6	810099	810104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794730
14009	NC_012914	GCT	2	6	810111	810116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794730
14010	NC_012914	TCA	2	6	810124	810129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794730
14011	NC_012914	GAT	2	6	810141	810146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794730
14012	NC_012914	GCT	2	6	810147	810152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794730
14013	NC_012914	GAA	2	6	810156	810161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794730
14014	NC_012914	TGC	2	6	810191	810196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794730
14015	NC_012914	GCA	2	6	810210	810215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794730
14016	NC_012914	AAGC	2	8	810221	810228	50 %	0 %	25 %	25 %	251794730
14017	NC_012914	GAA	2	6	810241	810246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794730
14018	NC_012914	GATT	2	8	810369	810376	25 %	50 %	25 %	0 %	251794730
14019	NC_012914	GCT	2	6	810411	810416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794730
14020	NC_012914	AAG	2	6	810450	810455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794730
14021	NC_012914	TAT	2	6	810475	810480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794730
14022	NC_012914	AAG	2	6	810496	810501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794730
14023	NC_012914	TCA	2	6	810534	810539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794730
14024	NC_012914	CAT	2	6	810554	810559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794730
14025	NC_012914	GCT	3	9	810709	810717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794731
14026	NC_012914	GCG	2	6	810726	810731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794731
14027	NC_012914	CGG	2	6	810739	810744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794731
14028	NC_012914	AAT	2	6	810773	810778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794731
14029	NC_012914	GACA	2	8	810783	810790	50 %	0 %	25 %	25 %	251794731
14030	NC_012914	CAA	2	6	810798	810803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794731
14031	NC_012914	AGC	2	6	810888	810893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794731
14032	NC_012914	A	7	7	810896	810902	100 %	0 %	0 %	0 %	251794731
14033	NC_012914	GCT	3	9	810934	810942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794731
14034	NC_012914	ATT	2	6	811109	811114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794731
14035	NC_012914	TAA	2	6	811129	811134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794731
14036	NC_012914	AGC	2	6	811185	811190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794731
14037	NC_012914	AAG	2	6	811251	811256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794731
14038	NC_012914	GA	3	6	811452	811457	50 %	0 %	50 %	0 %	251794731
14039	NC_012914	GAA	2	6	811576	811581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794731
14040	NC_012914	AAC	2	6	811598	811603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794731
14041	NC_012914	GAG	3	9	811962	811970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794732
14042	NC_012914	GTT	2	6	811973	811978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794732
14043	NC_012914	TCG	2	6	811991	811996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794732
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14045	NC_012914	AAT	2	6	812221	812226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794732
14046	NC_012914	AAT	2	6	812255	812260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794732
14047	NC_012914	TAA	2	6	812298	812303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794732
14048	NC_012914	CCTT	2	8	812342	812349	0 %	50 %	0 %	50 %	251794732
14049	NC_012914	CAA	2	6	812361	812366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794732
14050	NC_012914	AGA	2	6	812367	812372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794732
14051	NC_012914	AAGTT	2	10	812438	812447	40 %	40 %	20 %	0 %	251794732
14052	NC_012914	AT	3	6	812473	812478	50 %	50 %	0 %	0 %	251794732
14053	NC_012914	CATT	2	8	812556	812563	25 %	50 %	0 %	25 %	251794732
14054	NC_012914	GTC	2	6	812667	812672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794733
14055	NC_012914	CTT	2	6	812725	812730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794733
14056	NC_012914	CTT	2	6	812735	812740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794733
14057	NC_012914	GTT	2	6	812760	812765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794733
14058	NC_012914	GTCA	2	8	812796	812803	25 %	25 %	25 %	25 %	251794733
14059	NC_012914	GAG	2	6	812932	812937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794733
14060	NC_012914	TTC	2	6	813024	813029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794733
14061	NC_012914	CGGA	2	8	813048	813055	25 %	0 %	50 %	25 %	251794733
14062	NC_012914	GCC	2	6	813168	813173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794733
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14064	NC_012914	ATA	2	6	813190	813195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794733
14065	NC_012914	GTCTC	2	10	813280	813289	0 %	40 %	20 %	40 %	251794733
14066	NC_012914	CAG	2	6	813339	813344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794733
14067	NC_012914	TGGC	2	8	813349	813356	0 %	25 %	50 %	25 %	251794733
14068	NC_012914	AAG	2	6	813381	813386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794733
14069	NC_012914	ACTTC	2	10	813410	813419	20 %	40 %	0 %	40 %	251794733
14070	NC_012914	TTG	2	6	813475	813480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794733
14071	NC_012914	GCC	2	6	813492	813497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794733
14072	NC_012914	CAGG	2	8	813524	813531	25 %	0 %	50 %	25 %	251794733
14073	NC_012914	GTT	2	6	813570	813575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794733
14074	NC_012914	CTG	2	6	813599	813604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794733
14075	NC_012914	CTT	3	9	813608	813616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794733
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14085	NC_012914	TCG	2	6	814331	814336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794733
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14087	NC_012914	TGA	2	6	814433	814438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794733
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14090	NC_012914	GCCGTC	2	12	814530	814541	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	251794733
14091	NC_012914	TGC	2	6	814667	814672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794733
14092	NC_012914	TAGCCG	2	12	814685	814696	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	251794733
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14095	NC_012914	GTCA	2	8	814860	814867	25 %	25 %	25 %	25 %	251794733
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14101	NC_012914	AGA	2	6	815283	815288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794733
14102	NC_012914	GGAA	2	8	815325	815332	50 %	0 %	50 %	0 %	251794733
14103	NC_012914	GTCT	2	8	815367	815374	0 %	50 %	25 %	25 %	251794733
14104	NC_012914	CCAAC	2	10	815554	815563	40 %	0 %	0 %	60 %	251794733
14105	NC_012914	TGC	2	6	815648	815653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794733
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14107	NC_012914	GTT	2	6	815691	815696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794733
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14110	NC_012914	CAT	2	6	815759	815764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794733
14111	NC_012914	ATC	2	6	815814	815819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794733
14112	NC_012914	CGTATA	2	12	815943	815954	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	251794733
14113	NC_012914	GTAG	2	8	816009	816016	25 %	25 %	50 %	0 %	251794733
14114	NC_012914	GCGTT	2	10	816074	816083	0 %	40 %	40 %	20 %	251794733
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14117	NC_012914	AAT	2	6	816246	816251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794733
14118	NC_012914	GCTT	2	8	816309	816316	0 %	50 %	25 %	25 %	251794733
14119	NC_012914	TCT	2	6	816340	816345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794733
14120	NC_012914	CAT	2	6	816380	816385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794733
14121	NC_012914	ATC	2	6	816426	816431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794733
14122	NC_012914	CGT	2	6	816437	816442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794733
14123	NC_012914	CGTATA	2	12	816489	816500	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	251794733
14124	NC_012914	ACCGT	2	10	816523	816532	20 %	20 %	20 %	40 %	251794733
14125	NC_012914	GCG	2	6	816536	816541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794733
14126	NC_012914	GT	3	6	816608	816613	0 %	50 %	50 %	0 %	251794733
14127	NC_012914	GTT	2	6	816622	816627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794733
14128	NC_012914	GCC	2	6	816699	816704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794733
14129	NC_012914	CGT	2	6	816851	816856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794733
14130	NC_012914	TTG	2	6	816871	816876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794733
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14133	NC_012914	TCCAGA	2	12	817333	817344	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	251794733
14134	NC_012914	GGCT	2	8	817357	817364	0 %	25 %	50 %	25 %	251794733
14135	NC_012914	ATC	2	6	817386	817391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794733
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14138	NC_012914	GAC	2	6	817611	817616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794733
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14143	NC_012914	CGAAAC	2	12	817965	817976	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	251794733
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14148	NC_012914	TCA	2	6	818122	818127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794733
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14151	NC_012914	TA	3	6	818469	818474	50 %	50 %	0 %	0 %	251794733
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14154	NC_012914	TTCG	2	8	818732	818739	0 %	50 %	25 %	25 %	251794733
14155	NC_012914	CCG	2	6	818854	818859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794733
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14159	NC_012914	GC	3	6	818999	819004	0 %	0 %	50 %	50 %	251794733
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14182	NC_012914	ATGGG	2	10	820689	820698	20 %	20 %	60 %	0 %	251794734
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14212	NC_012914	ATGGAT	2	12	821836	821847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794736
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14225	NC_012914	TGA	2	6	822282	822287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794736
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14227	NC_012914	AGCC	2	8	822322	822329	25 %	0 %	25 %	50 %	251794736
14228	NC_012914	GCC	2	6	822334	822339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794736
14229	NC_012914	AT	3	6	822349	822354	50 %	50 %	0 %	0 %	251794736
14230	NC_012914	CGA	2	6	822369	822374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794736
14231	NC_012914	TATCG	2	10	822463	822472	20 %	40 %	20 %	20 %	251794736
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14234	NC_012914	TCG	2	6	822851	822856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794737
14235	NC_012914	CCAT	2	8	822864	822871	25 %	25 %	0 %	50 %	251794737
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14237	NC_012914	TGA	2	6	822935	822940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794737
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14343	NC_012914	CATCA	2	10	828819	828828	40 %	20 %	0 %	40 %	251794743
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14356	NC_012914	AGG	2	6	829793	829798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794744
14357	NC_012914	ATC	2	6	829826	829831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794744
14358	NC_012914	ATA	2	6	829858	829863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794744
14359	NC_012914	GTT	2	6	829910	829915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794744
14360	NC_012914	TCC	2	6	829952	829957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251794744
14361	NC_012914	ATC	2	6	829958	829963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794744
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14363	NC_012914	A	6	6	830182	830187	100 %	0 %	0 %	0 %	251794745
14364	NC_012914	CGG	2	6	830189	830194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794745
14365	NC_012914	CGC	2	6	830240	830245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794745
14366	NC_012914	GGA	2	6	830280	830285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794745
14367	NC_012914	GAA	2	6	830457	830462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794745
14368	NC_012914	CAT	2	6	830482	830487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794745
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14370	NC_012914	CGCTG	2	10	830716	830725	0 %	20 %	40 %	40 %	251794745
14371	NC_012914	A	6	6	830782	830787	100 %	0 %	0 %	0 %	251794745
14372	NC_012914	GC	3	6	830813	830818	0 %	0 %	50 %	50 %	251794745
14373	NC_012914	TGC	2	6	830828	830833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794745
14374	NC_012914	TGA	2	6	830835	830840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794745
14375	NC_012914	GCA	2	6	830887	830892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794745
14376	NC_012914	GAA	2	6	830895	830900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794745
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14378	NC_012914	GGTT	2	8	830946	830953	0 %	50 %	50 %	0 %	251794745
14379	NC_012914	GCA	2	6	830976	830981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794745
14380	NC_012914	GCT	2	6	830991	830996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794745
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14384	NC_012914	CGT	2	6	831114	831119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794745
14385	NC_012914	GCA	2	6	831152	831157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794745
14386	NC_012914	GGC	2	6	831358	831363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794745
14387	NC_012914	CTG	2	6	831493	831498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794745
14388	NC_012914	CGA	2	6	831503	831508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794745
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14390	NC_012914	GAT	2	6	831790	831795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794745
14391	NC_012914	ACG	2	6	831835	831840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794745
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14393	NC_012914	CGT	2	6	831915	831920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794745
14394	NC_012914	CGGC	2	8	831932	831939	0 %	0 %	50 %	50 %	251794745
14395	NC_012914	CG	3	6	831944	831949	0 %	0 %	50 %	50 %	251794745
14396	NC_012914	AGG	2	6	831992	831997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794745
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14400	NC_012914	ATCG	2	8	832287	832294	25 %	25 %	25 %	25 %	251794745
14401	NC_012914	GAC	2	6	832320	832325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794745
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14404	NC_012914	GCT	2	6	832389	832394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794745
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14412	NC_012914	TAC	3	9	833161	833169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794747
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14420	NC_012914	GCT	2	6	833708	833713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794748
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14422	NC_012914	TTG	2	6	833794	833799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794748
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14431	NC_012914	AAAGA	2	10	834063	834072	80 %	0 %	20 %	0 %	251794749
14432	NC_012914	TGG	2	6	834135	834140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794749
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14445	NC_012914	TAAG	2	8	834998	835005	50 %	25 %	25 %	0 %	251794750
14446	NC_012914	GCCAT	2	10	835039	835048	20 %	20 %	20 %	40 %	251794750
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14453	NC_012914	A	6	6	835670	835675	100 %	0 %	0 %	0 %	251794751
14454	NC_012914	GCT	2	6	835723	835728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794751
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14459	NC_012914	TAC	2	6	835925	835930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794751
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14462	NC_012914	ACA	2	6	836017	836022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794751
14463	NC_012914	GCG	2	6	836045	836050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794751
14464	NC_012914	ATT	2	6	836066	836071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794751
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14466	NC_012914	GAA	2	6	836186	836191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794751
14467	NC_012914	ATCA	2	8	836222	836229	50 %	25 %	0 %	25 %	251794751
14468	NC_012914	AAC	2	6	836275	836280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794751
14469	NC_012914	AACG	2	8	836317	836324	50 %	0 %	25 %	25 %	251794751
14470	NC_012914	TGGAA	2	10	836358	836367	40 %	20 %	40 %	0 %	251794751
14471	NC_012914	ACCG	2	8	836399	836406	25 %	0 %	25 %	50 %	251794751
14472	NC_012914	GGC	2	6	836465	836470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794751
14473	NC_012914	TCCAC	2	10	836496	836505	20 %	20 %	0 %	60 %	251794751
14474	NC_012914	GCT	2	6	836577	836582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794752
14475	NC_012914	CCGT	2	8	836588	836595	0 %	25 %	25 %	50 %	251794752
14476	NC_012914	CCG	2	6	836598	836603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794752
14477	NC_012914	TAT	2	6	836622	836627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794752
14478	NC_012914	GTT	2	6	836632	836637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794752
14479	NC_012914	TAT	2	6	836704	836709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794752
14480	NC_012914	CCT	2	6	836753	836758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251794752
14481	NC_012914	GA	3	6	836775	836780	50 %	0 %	50 %	0 %	251794752
14482	NC_012914	TTA	2	6	836867	836872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794752
14483	NC_012914	TAT	2	6	836880	836885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794752
14484	NC_012914	GTT	2	6	836899	836904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794752
14485	NC_012914	TTGC	2	8	836948	836955	0 %	50 %	25 %	25 %	251794752
14486	NC_012914	TTTATC	2	12	836962	836973	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	251794752
14487	NC_012914	GATC	2	8	837011	837018	25 %	25 %	25 %	25 %	251794752
14488	NC_012914	GGT	2	6	837079	837084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794752
14489	NC_012914	CCGA	2	8	837094	837101	25 %	0 %	25 %	50 %	251794752
14490	NC_012914	GTG	3	9	837229	837237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794752
14491	NC_012914	A	6	6	837265	837270	100 %	0 %	0 %	0 %	251794752
14492	NC_012914	C	6	6	837330	837335	0 %	0 %	0 %	100 %	251794753
14493	NC_012914	AGG	2	6	837338	837343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794753
14494	NC_012914	GCC	2	6	837344	837349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794753
14495	NC_012914	GAG	2	6	837420	837425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794753
14496	NC_012914	TTGTT	2	10	837448	837457	0 %	80 %	20 %	0 %	251794753
14497	NC_012914	TTA	2	6	837511	837516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794753
14498	NC_012914	ATG	2	6	837553	837558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794753
14499	NC_012914	T	6	6	837579	837584	0 %	100 %	0 %	0 %	251794753
14500	NC_012914	TGC	2	6	837604	837609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794753

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