MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Paenibacillus sp. JDR-2 chromosome

Total Repeats: 123957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
120001	NC_012914	GCC	2	6	6964002	6964007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251800038
120002	NC_012914	GAT	2	6	6964073	6964078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251800038
120003	NC_012914	CTG	2	6	6964127	6964132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251800038
120004	NC_012914	TCGT	2	8	6964134	6964141	0 %	50 %	25 %	25 %	251800038
120005	NC_012914	TTC	2	6	6964235	6964240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251800038
120006	NC_012914	AGC	2	6	6964382	6964387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251800038
120007	NC_012914	TCC	2	6	6964407	6964412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251800038
120008	NC_012914	GAACA	2	10	6964424	6964433	60 %	0 %	20 %	20 %	251800038
120009	NC_012914	GAT	2	6	6964450	6964455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251800038
120010	NC_012914	AGC	2	6	6964457	6964462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251800038
120011	NC_012914	GC	3	6	6964513	6964518	0 %	0 %	50 %	50 %	251800038
120012	NC_012914	AAAG	2	8	6964750	6964757	75 %	0 %	25 %	0 %	251800039
120013	NC_012914	TTC	2	6	6964786	6964791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251800039
120014	NC_012914	TGC	2	6	6964910	6964915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251800039
120015	NC_012914	TAA	2	6	6964947	6964952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251800039
120016	NC_012914	GCT	2	6	6964970	6964975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251800039
120017	NC_012914	ATA	2	6	6965020	6965025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251800039
120018	NC_012914	ATA	2	6	6965066	6965071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251800039
120019	NC_012914	CAAC	2	8	6965094	6965101	50 %	0 %	0 %	50 %	251800039
120020	NC_012914	CAT	2	6	6965193	6965198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251800039
120021	NC_012914	CATT	2	8	6965211	6965218	25 %	50 %	0 %	25 %	251800039
120022	NC_012914	GAA	2	6	6965411	6965416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251800040
120023	NC_012914	GAA	2	6	6965439	6965444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251800040
120024	NC_012914	TGC	2	6	6965554	6965559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251800040
120025	NC_012914	CCA	2	6	6965653	6965658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	251800040
120026	NC_012914	ATG	2	6	6965670	6965675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251800040
120027	NC_012914	GAA	2	6	6965730	6965735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251800040
120028	NC_012914	GCC	2	6	6965784	6965789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251800040
120029	NC_012914	ATGC	2	8	6965821	6965828	25 %	25 %	25 %	25 %	251800040
120030	NC_012914	C	6	6	6965830	6965835	0 %	0 %	0 %	100 %	251800040
120031	NC_012914	GGGA	2	8	6965853	6965860	25 %	0 %	75 %	0 %	251800040
120032	NC_012914	TGAA	2	8	6966264	6966271	50 %	25 %	25 %	0 %	251800041
120033	NC_012914	TTG	2	6	6966360	6966365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251800041
120034	NC_012914	CAA	2	6	6966398	6966403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251800041
120035	NC_012914	TGA	2	6	6966549	6966554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251800041
120036	NC_012914	CCT	2	6	6966575	6966580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251800041
120037	NC_012914	GGC	2	6	6966625	6966630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251800041
120038	NC_012914	TTA	2	6	6966660	6966665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251800041
120039	NC_012914	GCTG	2	8	6966684	6966691	0 %	25 %	50 %	25 %	251800041
120040	NC_012914	TCT	2	6	6966729	6966734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251800041
120041	NC_012914	GAA	2	6	6966748	6966753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251800041
120042	NC_012914	CGG	2	6	6966817	6966822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251800041
120043	NC_012914	GGT	2	6	6966871	6966876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251800041
120044	NC_012914	TTATCT	2	12	6966912	6966923	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	251800041
120045	NC_012914	ATG	2	6	6967016	6967021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251800041
120046	NC_012914	GCT	2	6	6967042	6967047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251800041
120047	NC_012914	TGA	2	6	6967074	6967079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251800041
120048	NC_012914	CAT	2	6	6967096	6967101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251800041
120049	NC_012914	GCA	2	6	6967113	6967118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251800041
120050	NC_012914	GCAA	2	8	6967247	6967254	50 %	0 %	25 %	25 %	251800041
120051	NC_012914	ATC	2	6	6967262	6967267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251800041
120052	NC_012914	ATT	2	6	6967277	6967282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251800041
120053	NC_012914	ATG	2	6	6967283	6967288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251800041
120054	NC_012914	TGA	2	6	6967305	6967310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251800041
120055	NC_012914	GCA	2	6	6967387	6967392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251800041
120056	NC_012914	TCA	2	6	6967422	6967427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251800041
120057	NC_012914	TAT	2	6	6967429	6967434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251800041
120058	NC_012914	TCC	2	6	6967466	6967471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251800041
120059	NC_012914	TGC	2	6	6967555	6967560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251800041
120060	NC_012914	ATT	2	6	6967562	6967567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251800041
120061	NC_012914	GTTT	2	8	6967572	6967579	0 %	75 %	25 %	0 %	251800041
120062	NC_012914	GCC	2	6	6967594	6967599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251800041
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120064	NC_012914	CTT	2	6	6967722	6967727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251800042
120065	NC_012914	GTA	2	6	6967754	6967759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251800042
120066	NC_012914	GTT	2	6	6967804	6967809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251800042
120067	NC_012914	TTC	2	6	6967826	6967831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251800042
120068	NC_012914	GCT	2	6	6967867	6967872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251800042
120069	NC_012914	CTG	2	6	6967874	6967879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251800042
120070	NC_012914	ACA	2	6	6967908	6967913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251800042
120071	NC_012914	GTA	2	6	6967930	6967935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251800042
120072	NC_012914	CGTC	2	8	6968049	6968056	0 %	25 %	25 %	50 %	251800042
120073	NC_012914	TCG	2	6	6968102	6968107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251800042
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120081	NC_012914	GTAA	2	8	6968500	6968507	50 %	25 %	25 %	0 %	251800042
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120083	NC_012914	GTT	2	6	6968599	6968604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251800042
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120093	NC_012914	ATGGC	2	10	6969289	6969298	20 %	20 %	40 %	20 %	251800043
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120095	NC_012914	A	6	6	6969328	6969333	100 %	0 %	0 %	0 %	251800043
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120099	NC_012914	CTG	2	6	6969558	6969563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251800044
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120113	NC_012914	CTC	2	6	6970217	6970222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251800045
120114	NC_012914	TTC	2	6	6970230	6970235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251800045
120115	NC_012914	TCA	2	6	6970249	6970254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251800045
120116	NC_012914	AAG	2	6	6970264	6970269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251800045
120117	NC_012914	CAT	2	6	6970354	6970359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251800045
120118	NC_012914	TGA	2	6	6970371	6970376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251800045
120119	NC_012914	TGC	2	6	6970382	6970387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251800045
120120	NC_012914	T	6	6	6970388	6970393	0 %	100 %	0 %	0 %	251800045
120121	NC_012914	ATA	2	6	6970529	6970534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251800046
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120131	NC_012914	TCT	2	6	6971371	6971376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251800047
120132	NC_012914	CTG	2	6	6971520	6971525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251800047
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120213	NC_012914	TCGA	2	8	6976183	6976190	25 %	25 %	25 %	25 %	251800052
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120221	NC_012914	TGC	2	6	6976710	6976715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251800052
120222	NC_012914	T	7	7	6976985	6976991	0 %	100 %	0 %	0 %	251800053
120223	NC_012914	CAG	2	6	6977005	6977010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251800053
120224	NC_012914	GCTC	2	8	6977106	6977113	0 %	25 %	25 %	50 %	251800053
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120226	NC_012914	ACA	2	6	6977195	6977200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251800053
120227	NC_012914	GCA	2	6	6977205	6977210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251800053
120228	NC_012914	GCAG	2	8	6977254	6977261	25 %	0 %	50 %	25 %	251800053
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120331	NC_012914	TTG	2	6	6982274	6982279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251800057
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120337	NC_012914	AGCCA	2	10	6982879	6982888	40 %	0 %	20 %	40 %	251800058
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120339	NC_012914	GGC	2	6	6982921	6982926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251800058
120340	NC_012914	GAA	2	6	6982932	6982937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251800058
120341	NC_012914	GTT	2	6	6982946	6982951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251800058
120342	NC_012914	GGA	2	6	6982954	6982959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251800058
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120351	NC_012914	GGC	2	6	6983434	6983439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251800059
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