MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Paenibacillus sp. JDR-2 chromosome

Total Repeats: 123957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012914	GGA	2	6	33902	33907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794067
502	NC_012914	GAT	2	6	33926	33931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794067
503	NC_012914	GGA	2	6	33968	33973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794067
504	NC_012914	ATT	2	6	33990	33995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794067
505	NC_012914	ATAC	2	8	34013	34020	50 %	25 %	0 %	25 %	251794067
506	NC_012914	GAA	2	6	34031	34036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794067
507	NC_012914	ACG	2	6	34075	34080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794067
508	NC_012914	TA	3	6	34095	34100	50 %	50 %	0 %	0 %	251794067
509	NC_012914	GCA	2	6	34144	34149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794067
510	NC_012914	GCTGC	2	10	34161	34170	0 %	20 %	40 %	40 %	251794067
511	NC_012914	GGA	2	6	34205	34210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794067
512	NC_012914	GCC	2	6	34219	34224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794067
513	NC_012914	CCG	2	6	34320	34325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794067
514	NC_012914	GC	3	6	34391	34396	0 %	0 %	50 %	50 %	251794067
515	NC_012914	GAA	2	6	34406	34411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794067
516	NC_012914	TGC	2	6	34525	34530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794067
517	NC_012914	GAAA	2	8	34535	34542	75 %	0 %	25 %	0 %	251794067
518	NC_012914	GAAG	2	8	34613	34620	50 %	0 %	50 %	0 %	251794067
519	NC_012914	AAG	2	6	34663	34668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794067
520	NC_012914	A	6	6	34779	34784	100 %	0 %	0 %	0 %	251794068
521	NC_012914	GTC	2	6	34831	34836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794068
522	NC_012914	GAA	3	9	34932	34940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794068
523	NC_012914	TGC	2	6	34970	34975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794068
524	NC_012914	AGG	2	6	34976	34981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794068
525	NC_012914	ACA	2	6	35032	35037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794068
526	NC_012914	GCC	2	6	35041	35046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794068
527	NC_012914	GCT	2	6	35117	35122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794068
528	NC_012914	CCGA	2	8	35158	35165	25 %	0 %	25 %	50 %	251794068
529	NC_012914	GCTT	2	8	35207	35214	0 %	50 %	25 %	25 %	251794068
530	NC_012914	GCCT	2	8	35226	35233	0 %	25 %	25 %	50 %	251794068
531	NC_012914	ATA	2	6	35263	35268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794068
532	NC_012914	CGG	2	6	35284	35289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794068
533	NC_012914	CAA	2	6	35315	35320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794068
534	NC_012914	TTA	2	6	35377	35382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794068
535	NC_012914	TGA	2	6	35384	35389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794068
536	NC_012914	CGG	2	6	35402	35407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794068
537	NC_012914	GAT	2	6	35420	35425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794068
538	NC_012914	GACA	2	8	35665	35672	50 %	0 %	25 %	25 %	251794069
539	NC_012914	CTG	2	6	35706	35711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794069
540	NC_012914	CTG	2	6	35750	35755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794069
541	NC_012914	GAA	2	6	35813	35818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794069
542	NC_012914	AGA	2	6	35857	35862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794069
543	NC_012914	TGT	2	6	35884	35889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794069
544	NC_012914	TTC	2	6	35947	35952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794069
545	NC_012914	TGT	2	6	36046	36051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794069
546	NC_012914	CCG	2	6	36211	36216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794070
547	NC_012914	GTT	2	6	36275	36280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794070
548	NC_012914	CGA	2	6	36384	36389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794070
549	NC_012914	GCT	2	6	36407	36412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794070
550	NC_012914	GAA	2	6	36443	36448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794070
551	NC_012914	GAA	2	6	36458	36463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794070
552	NC_012914	TA	3	6	36904	36909	50 %	50 %	0 %	0 %	251794071
553	NC_012914	TTC	2	6	36913	36918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794071
554	NC_012914	AGCG	2	8	36978	36985	25 %	0 %	50 %	25 %	251794071
555	NC_012914	GTT	2	6	36990	36995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794071
556	NC_012914	CG	3	6	37041	37046	0 %	0 %	50 %	50 %	251794071
557	NC_012914	TGC	2	6	37054	37059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794071
558	NC_012914	AGC	3	9	37063	37071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794071
559	NC_012914	GGA	2	6	37118	37123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794071
560	NC_012914	GCG	2	6	37144	37149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794071
561	NC_012914	CAATC	2	10	37174	37183	40 %	20 %	0 %	40 %	251794071
562	NC_012914	GCG	2	6	37207	37212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794071
563	NC_012914	CGCGG	2	10	37272	37281	0 %	0 %	60 %	40 %	251794071
564	NC_012914	GAA	2	6	37326	37331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794071
565	NC_012914	ACA	2	6	37372	37377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794071
566	NC_012914	TGC	2	6	37388	37393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794071
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570	NC_012914	TA	3	6	37664	37669	50 %	50 %	0 %	0 %	251794071
571	NC_012914	CGA	2	6	37780	37785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794071
572	NC_012914	TCG	2	6	37882	37887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794071
573	NC_012914	ACGCT	2	10	37897	37906	20 %	20 %	20 %	40 %	251794071
574	NC_012914	GCA	2	6	37915	37920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794071
575	NC_012914	ACG	2	6	38002	38007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794071
576	NC_012914	CAA	2	6	38012	38017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794071
577	NC_012914	GCA	2	6	38053	38058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794071
578	NC_012914	TTCC	2	8	38134	38141	0 %	50 %	0 %	50 %	251794071
579	NC_012914	GC	3	6	38157	38162	0 %	0 %	50 %	50 %	251794071
580	NC_012914	CCGCGC	2	12	38201	38212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794071
581	NC_012914	GAA	2	6	38219	38224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794071
582	NC_012914	AGAA	3	12	38221	38232	75 %	0 %	25 %	0 %	251794071
583	NC_012914	AAGA	2	8	38235	38242	75 %	0 %	25 %	0 %	251794071
584	NC_012914	GAT	2	6	38317	38322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794072
585	NC_012914	AAC	3	9	38335	38343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794072
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587	NC_012914	GCT	2	6	38449	38454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794072
588	NC_012914	CTG	2	6	38459	38464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794072
589	NC_012914	ATGA	2	8	38594	38601	50 %	25 %	25 %	0 %	251794072
590	NC_012914	ACG	2	6	38609	38614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794072
591	NC_012914	GGC	2	6	38660	38665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794072
592	NC_012914	TGC	2	6	38679	38684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794072
593	NC_012914	GCA	2	6	38712	38717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794072
594	NC_012914	GATTC	2	10	38723	38732	20 %	40 %	20 %	20 %	251794072
595	NC_012914	AGC	2	6	38762	38767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794072
596	NC_012914	CGG	2	6	38865	38870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794072
597	NC_012914	GAAG	2	8	38899	38906	50 %	0 %	50 %	0 %	251794072
598	NC_012914	GTT	2	6	39251	39256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794073
599	NC_012914	GAT	2	6	39356	39361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794073
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601	NC_012914	GCA	2	6	39454	39459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794073
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604	NC_012914	ATA	2	6	39827	39832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794074
605	NC_012914	GTT	2	6	39866	39871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794074
606	NC_012914	TCG	2	6	39918	39923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794074
607	NC_012914	GAT	2	6	40150	40155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794075
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609	NC_012914	GAT	2	6	40205	40210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794075
610	NC_012914	GCT	2	6	40222	40227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794075
611	NC_012914	TGT	2	6	40228	40233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794075
612	NC_012914	ATA	2	6	40239	40244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251794075
613	NC_012914	GAT	2	6	40295	40300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794075
614	NC_012914	GCG	2	6	40340	40345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794075
615	NC_012914	GCGCA	2	10	40367	40376	20 %	0 %	40 %	40 %	251794075
616	NC_012914	TTG	2	6	40416	40421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794075
617	NC_012914	CGTTC	2	10	40423	40432	0 %	40 %	20 %	40 %	251794075
618	NC_012914	CG	3	6	40556	40561	0 %	0 %	50 %	50 %	251794075
619	NC_012914	GA	3	6	40581	40586	50 %	0 %	50 %	0 %	251794075
620	NC_012914	CGG	2	6	40626	40631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794075
621	NC_012914	TTG	2	6	40752	40757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794075
622	NC_012914	GCG	2	6	40765	40770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794075
623	NC_012914	GCA	2	6	40793	40798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794075
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625	NC_012914	CGG	2	6	40867	40872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794075
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