MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Paenibacillus sp. JDR-2 chromosome

Total Repeats: 123957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_012914	CCG	2	6	277266	277271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794264
4502	NC_012914	CG	3	6	277349	277354	0 %	0 %	50 %	50 %	251794264
4503	NC_012914	CAA	2	6	277401	277406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794264
4504	NC_012914	GC	4	8	277449	277456	0 %	0 %	50 %	50 %	251794264
4505	NC_012914	CCT	2	6	277523	277528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251794264
4506	NC_012914	GGC	2	6	277551	277556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794264
4507	NC_012914	TTC	2	6	277583	277588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794264
4508	NC_012914	GCG	2	6	277589	277594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794264
4509	NC_012914	TGG	2	6	277627	277632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794264
4510	NC_012914	ATGA	2	8	277639	277646	50 %	25 %	25 %	0 %	251794264
4511	NC_012914	TGT	2	6	277647	277652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794264
4512	NC_012914	GGC	2	6	277657	277662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794264
4513	NC_012914	GTTC	2	8	277693	277700	0 %	50 %	25 %	25 %	251794264
4514	NC_012914	GAACG	2	10	277782	277791	40 %	0 %	40 %	20 %	251794264
4515	NC_012914	GCAGC	2	10	277809	277818	20 %	0 %	40 %	40 %	251794264
4516	NC_012914	TAT	2	6	277839	277844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794264
4517	NC_012914	AG	3	6	277864	277869	50 %	0 %	50 %	0 %	251794264
4518	NC_012914	GGA	2	6	277878	277883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794264
4519	NC_012914	CCGCG	2	10	277919	277928	0 %	0 %	40 %	60 %	251794264
4520	NC_012914	GACC	2	8	277941	277948	25 %	0 %	25 %	50 %	251794264
4521	NC_012914	CGG	2	6	277967	277972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794264
4522	NC_012914	TGA	2	6	277985	277990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794264
4523	NC_012914	GCG	2	6	278003	278008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794264
4524	NC_012914	TGA	2	6	278090	278095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794264
4525	NC_012914	GGCA	2	8	278163	278170	25 %	0 %	50 %	25 %	251794264
4526	NC_012914	ATT	2	6	278387	278392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794265
4527	NC_012914	GCA	2	6	278405	278410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794265
4528	NC_012914	CTG	2	6	278496	278501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794265
4529	NC_012914	GAA	2	6	278537	278542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794265
4530	NC_012914	ATC	2	6	278574	278579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794265
4531	NC_012914	GAA	2	6	278586	278591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794265
4532	NC_012914	CTC	2	6	278604	278609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251794265
4533	NC_012914	TGC	2	6	278635	278640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794265
4534	NC_012914	GAT	2	6	278670	278675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794265
4535	NC_012914	TGC	2	6	278758	278763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794265
4536	NC_012914	CAG	2	6	278832	278837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794265
4537	NC_012914	CCG	2	6	278972	278977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251794265
4538	NC_012914	GCA	2	6	279001	279006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794265
4539	NC_012914	GCT	2	6	279008	279013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794265
4540	NC_012914	ATT	2	6	279019	279024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794265
4541	NC_012914	AGG	2	6	279040	279045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794265
4542	NC_012914	GCT	2	6	279056	279061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794265
4543	NC_012914	ACAA	2	8	279097	279104	75 %	0 %	0 %	25 %	251794265
4544	NC_012914	TAT	2	6	279132	279137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794265
4545	NC_012914	ATCTC	2	10	279214	279223	20 %	40 %	0 %	40 %	251794265
4546	NC_012914	AATTC	2	10	279227	279236	40 %	40 %	0 %	20 %	251794265
4547	NC_012914	ATG	2	6	279270	279275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794265
4548	NC_012914	AG	3	6	279309	279314	50 %	0 %	50 %	0 %	251794265
4549	NC_012914	GTT	2	6	279327	279332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794265
4550	NC_012914	ACA	2	6	279352	279357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794265
4551	NC_012914	GGC	2	6	279378	279383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794265
4552	NC_012914	CGT	2	6	279437	279442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794265
4553	NC_012914	A	6	6	279510	279515	100 %	0 %	0 %	0 %	251794265
4554	NC_012914	TGC	2	6	279525	279530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794265
4555	NC_012914	TGA	2	6	279737	279742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794266
4556	NC_012914	AAG	2	6	279802	279807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794266
4557	NC_012914	CAG	2	6	279904	279909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794266
4558	NC_012914	ATGA	2	8	279943	279950	50 %	25 %	25 %	0 %	251794266
4559	NC_012914	CAT	2	6	280134	280139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794266
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4561	NC_012914	GAT	2	6	280203	280208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794266
4562	NC_012914	GTATCG	2	12	280234	280245	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	251794266
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4564	NC_012914	TTA	3	9	280289	280297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794266
4565	NC_012914	CTT	2	6	280335	280340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794266
4566	NC_012914	AGGCA	2	10	280415	280424	40 %	0 %	40 %	20 %	251794266
4567	NC_012914	GAT	2	6	280491	280496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251794266
4568	NC_012914	CG	3	6	280497	280502	0 %	0 %	50 %	50 %	251794266
4569	NC_012914	TGT	2	6	280524	280529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251794266
4570	NC_012914	ACG	2	6	280636	280641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251794266
4571	NC_012914	GC	3	6	280652	280657	0 %	0 %	50 %	50 %	251794266
4572	NC_012914	TCA	2	6	280659	280664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794266
4573	NC_012914	GAA	2	6	280678	280683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794266
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4579	NC_012914	TTCA	2	8	281200	281207	25 %	50 %	0 %	25 %	251794266
4580	NC_012914	GAA	2	6	281245	281250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794266
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4586	NC_012914	CGTT	2	8	281658	281665	0 %	50 %	25 %	25 %	251794267
4587	NC_012914	CAT	2	6	281692	281697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794267
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4589	NC_012914	GA	3	6	281956	281961	50 %	0 %	50 %	0 %	251794267
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4592	NC_012914	CAGCG	2	10	282150	282159	20 %	0 %	40 %	40 %	251794267
4593	NC_012914	CTC	2	6	282188	282193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251794267
4594	NC_012914	CA	3	6	282271	282276	50 %	0 %	0 %	50 %	251794267
4595	NC_012914	T	6	6	282628	282633	0 %	100 %	0 %	0 %	251794268
4596	NC_012914	TCG	2	6	282713	282718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251794268
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4600	NC_012914	GAA	2	6	283028	283033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794269
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4602	NC_012914	GCG	2	6	283109	283114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794269
4603	NC_012914	TGGA	2	8	283224	283231	25 %	25 %	50 %	0 %	251794269
4604	NC_012914	CCGT	2	8	283290	283297	0 %	25 %	25 %	50 %	251794269
4605	NC_012914	GAG	2	6	283320	283325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	251794269
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4608	NC_012914	CTT	2	6	283417	283422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794269
4609	NC_012914	GGT	2	6	283463	283468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251794269
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4613	NC_012914	TGCC	2	8	283740	283747	0 %	25 %	25 %	50 %	251794269
4614	NC_012914	T	6	6	284089	284094	0 %	100 %	0 %	0 %	251794270
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4622	NC_012914	CAA	2	6	284406	284411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251794270
4623	NC_012914	TAT	2	6	284447	284452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251794270
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4625	NC_012914	CAT	2	6	284548	284553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251794270
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4632	NC_012914	CTT	2	6	284824	284829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251794270
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4741	NC_012914	AGA	2	6	290334	290339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794279
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4866	NC_012914	CGG	3	9	297586	297594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794284
4867	NC_012914	AT	3	6	297607	297612	50 %	50 %	0 %	0 %	251794284
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4986	NC_012914	AAG	2	6	304741	304746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251794287
4987	NC_012914	GCG	2	6	304768	304773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251794287
4988	NC_012914	AGCAA	2	10	304785	304794	60 %	0 %	20 %	20 %	251794287
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