MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas fluorescens SBW25 chromosome

Total Repeats: 127366

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_012660	TCGG	2	8	1118159	1118166	0 %	25 %	50 %	25 %	229588549
21502	NC_012660	CCA	2	6	1118200	1118205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229588549
21503	NC_012660	GCT	2	6	1118210	1118215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229588549
21504	NC_012660	CAC	2	6	1118399	1118404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229588550
21505	NC_012660	GCT	2	6	1118408	1118413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229588550
21506	NC_012660	GCC	2	6	1118501	1118506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229588550
21507	NC_012660	CACC	2	8	1118536	1118543	25 %	0 %	0 %	75 %	229588550
21508	NC_012660	CGG	2	6	1118581	1118586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229588550
21509	NC_012660	TGG	2	6	1118587	1118592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229588550
21510	NC_012660	CCAGGC	2	12	1118686	1118697	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	229588550
21511	NC_012660	GTA	2	6	1118699	1118704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229588550
21512	NC_012660	CCA	2	6	1118863	1118868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229588550
21513	NC_012660	C	7	7	1118869	1118875	0 %	0 %	0 %	100 %	229588550
21514	NC_012660	GC	3	6	1118916	1118921	0 %	0 %	50 %	50 %	229588550
21515	NC_012660	GGC	2	6	1118939	1118944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229588550
21516	NC_012660	GC	3	6	1119075	1119080	0 %	0 %	50 %	50 %	229588550
21517	NC_012660	CAC	2	6	1119086	1119091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229588550
21518	NC_012660	GCCAA	2	10	1119106	1119115	40 %	0 %	20 %	40 %	229588550
21519	NC_012660	GCG	2	6	1119120	1119125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229588550
21520	NC_012660	GGC	2	6	1119135	1119140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229588550
21521	NC_012660	CGTGA	2	10	1119284	1119293	20 %	20 %	40 %	20 %	229588550
21522	NC_012660	GAC	2	6	1119390	1119395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229588550
21523	NC_012660	GGCTCA	2	12	1119397	1119408	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	229588550
21524	NC_012660	GCCA	2	8	1119453	1119460	25 %	0 %	25 %	50 %	229588550
21525	NC_012660	CTC	2	6	1119508	1119513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229588551
21526	NC_012660	GTA	2	6	1119545	1119550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229588551
21527	NC_012660	TGA	2	6	1119682	1119687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229588551
21528	NC_012660	CTG	2	6	1119702	1119707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229588551
21529	NC_012660	GGT	2	6	1119743	1119748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229588551
21530	NC_012660	GCG	2	6	1119764	1119769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229588551
21531	NC_012660	GTT	2	6	1119836	1119841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229588551
21532	NC_012660	CGG	2	6	1119883	1119888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229588551
21533	NC_012660	ACG	2	6	1119915	1119920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229588551
21534	NC_012660	ACCGC	2	10	1120059	1120068	20 %	0 %	20 %	60 %	229588551
21535	NC_012660	GCT	2	6	1120073	1120078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229588551
21536	NC_012660	GCT	2	6	1120228	1120233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229588551
21537	NC_012660	TCAGGT	2	12	1120318	1120329	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	229588551
21538	NC_012660	GTC	2	6	1120337	1120342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229588551
21539	NC_012660	CG	3	6	1120402	1120407	0 %	0 %	50 %	50 %	229588551
21540	NC_012660	GCT	2	6	1120430	1120435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229588551
21541	NC_012660	CGTC	2	8	1120440	1120447	0 %	25 %	25 %	50 %	229588551
21542	NC_012660	TCG	2	6	1120548	1120553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229588551
21543	NC_012660	TCG	2	6	1120676	1120681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229588551
21544	NC_012660	TG	4	8	1120683	1120690	0 %	50 %	50 %	0 %	229588551
21545	NC_012660	GCG	2	6	1120691	1120696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229588551
21546	NC_012660	CG	3	6	1120695	1120700	0 %	0 %	50 %	50 %	229588551
21547	NC_012660	CGG	2	6	1120765	1120770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229588551
21548	NC_012660	GCA	2	6	1120819	1120824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229588551
21549	NC_012660	CGC	3	9	1120825	1120833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229588551
21550	NC_012660	ACC	2	6	1120848	1120853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229588551
21551	NC_012660	CGC	2	6	1120898	1120903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229588551
21552	NC_012660	GCC	2	6	1120944	1120949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229588551
21553	NC_012660	CGGCC	2	10	1121045	1121054	0 %	0 %	40 %	60 %	229588551
21554	NC_012660	CAC	2	6	1121057	1121062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229588551
21555	NC_012660	GTGGA	2	10	1121064	1121073	20 %	20 %	60 %	0 %	229588551
21556	NC_012660	TCT	2	6	1121148	1121153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229588551
21557	NC_012660	GC	3	6	1121194	1121199	0 %	0 %	50 %	50 %	229588551
21558	NC_012660	TGC	2	6	1121250	1121255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229588551
21559	NC_012660	GGTG	2	8	1121287	1121294	0 %	25 %	75 %	0 %	229588551
21560	NC_012660	GTC	3	9	1121303	1121311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229588551
21561	NC_012660	GGC	2	6	1121329	1121334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229588551
21562	NC_012660	CAC	2	6	1121486	1121491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229588551
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21565	NC_012660	CAG	2	6	1121642	1121647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229588551
21566	NC_012660	GGC	2	6	1121707	1121712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229588551
21567	NC_012660	GCC	3	9	1121741	1121749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229588551
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21569	NC_012660	GTG	2	6	1121811	1121816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229588551
21570	NC_012660	GCTG	2	8	1121835	1121842	0 %	25 %	50 %	25 %	229588551
21571	NC_012660	GCCA	2	8	1121856	1121863	25 %	0 %	25 %	50 %	229588551
21572	NC_012660	GC	3	6	1121925	1121930	0 %	0 %	50 %	50 %	229588551
21573	NC_012660	ACTC	2	8	1121987	1121994	25 %	25 %	0 %	50 %	229588551
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21585	NC_012660	GCA	2	6	1122574	1122579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229588552
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21588	NC_012660	CAG	2	6	1122704	1122709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229588552
21589	NC_012660	GCG	2	6	1122720	1122725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229588552
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21594	NC_012660	GGTG	2	8	1123081	1123088	0 %	25 %	75 %	0 %	229588553
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21606	NC_012660	G	6	6	1124069	1124074	0 %	0 %	100 %	0 %	229588554
21607	NC_012660	TGG	2	6	1124160	1124165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229588555
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21610	NC_012660	GGACCG	2	12	1124256	1124267	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	229588555
21611	NC_012660	GCCA	2	8	1124278	1124285	25 %	0 %	25 %	50 %	229588555
21612	NC_012660	CCGA	2	8	1124291	1124298	25 %	0 %	25 %	50 %	229588555
21613	NC_012660	GAA	2	6	1124302	1124307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229588555
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21731	NC_012660	GCGT	2	8	1130790	1130797	0 %	25 %	50 %	25 %	229588563
21732	NC_012660	CGG	2	6	1130807	1130812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229588563
21733	NC_012660	GCG	2	6	1130870	1130875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229588563
21734	NC_012660	GTCCA	2	10	1130908	1130917	20 %	20 %	20 %	40 %	229588563
21735	NC_012660	GCG	2	6	1130966	1130971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229588563
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21747	NC_012660	GCT	2	6	1131471	1131476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229588563
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21761	NC_012660	CTAC	2	8	1132382	1132389	25 %	25 %	0 %	50 %	229588563
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21964	NC_012660	TGC	2	6	1142745	1142750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229588573
21965	NC_012660	ATTT	2	8	1142786	1142793	25 %	75 %	0 %	0 %	229588573
21966	NC_012660	ACCA	2	8	1142798	1142805	50 %	0 %	0 %	50 %	229588573
21967	NC_012660	CTG	2	6	1142855	1142860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229588573
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21975	NC_012660	GTA	2	6	1143087	1143092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229588574
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22000	NC_012660	AACG	2	8	1144418	1144425	50 %	0 %	25 %	25 %	229588575

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