MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas fluorescens SBW25 chromosome

Total Repeats: 127366

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
124001	NC_012660	AAG	2	6	6554686	6554691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229593364
124002	NC_012660	TGG	2	6	6554728	6554733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229593364
124003	NC_012660	AGC	2	6	6554754	6554759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593364
124004	NC_012660	TCG	2	6	6554800	6554805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593364
124005	NC_012660	CAT	2	6	6554828	6554833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229593364
124006	NC_012660	ACC	2	6	6554865	6554870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229593364
124007	NC_012660	CGT	2	6	6554879	6554884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593364
124008	NC_012660	CTG	2	6	6554907	6554912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593364
124009	NC_012660	GGT	2	6	6554948	6554953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229593364
124010	NC_012660	CGG	2	6	6555013	6555018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593364
124011	NC_012660	CTG	3	9	6555024	6555032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593364
124012	NC_012660	CGA	3	9	6555131	6555139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593365
124013	NC_012660	TCG	2	6	6555142	6555147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593365
124014	NC_012660	TGC	2	6	6555193	6555198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593365
124015	NC_012660	ATC	2	6	6555201	6555206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229593365
124016	NC_012660	TGG	2	6	6555211	6555216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229593365
124017	NC_012660	AGG	2	6	6555343	6555348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229593365
124018	NC_012660	A	6	6	6555396	6555401	100 %	0 %	0 %	0 %	229593365
124019	NC_012660	ACG	2	6	6555405	6555410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593365
124020	NC_012660	TCT	2	6	6555412	6555417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229593365
124021	NC_012660	TGA	2	6	6555451	6555456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229593365
124022	NC_012660	GATG	2	8	6555461	6555468	25 %	25 %	50 %	0 %	229593365
124023	NC_012660	ACG	2	6	6555536	6555541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593366
124024	NC_012660	CGT	2	6	6555577	6555582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593366
124025	NC_012660	GCC	2	6	6555656	6555661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593366
124026	NC_012660	CCA	2	6	6555692	6555697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229593366
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124029	NC_012660	AGA	2	6	6555748	6555753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229593366
124030	NC_012660	CAAGCC	2	12	6555814	6555825	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	229593366
124031	NC_012660	GCC	2	6	6555835	6555840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593366
124032	NC_012660	GAA	2	6	6555853	6555858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229593366
124033	NC_012660	GCC	2	6	6555865	6555870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593366
124034	NC_012660	CCG	2	6	6555893	6555898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593366
124035	NC_012660	CCG	2	6	6555908	6555913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593366
124036	NC_012660	CGC	2	6	6555973	6555978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593366
124037	NC_012660	CTG	2	6	6556001	6556006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593366
124038	NC_012660	AAGG	2	8	6556058	6556065	50 %	0 %	50 %	0 %	229593366
124039	NC_012660	GTG	2	6	6556085	6556090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229593366
124040	NC_012660	TCG	2	6	6556174	6556179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593366
124041	NC_012660	GCC	2	6	6556198	6556203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593366
124042	NC_012660	GCA	2	6	6556224	6556229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593366
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124044	NC_012660	CGC	3	9	6556268	6556276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593366
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124047	NC_012660	GCA	2	6	6556596	6556601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593367
124048	NC_012660	GGTG	2	8	6556624	6556631	0 %	25 %	75 %	0 %	229593367
124049	NC_012660	AGCA	2	8	6556665	6556672	50 %	0 %	25 %	25 %	229593367
124050	NC_012660	CGC	2	6	6556797	6556802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593367
124051	NC_012660	GAA	2	6	6556820	6556825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229593367
124052	NC_012660	TGC	2	6	6556839	6556844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593367
124053	NC_012660	ATC	3	9	6556877	6556885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229593367
124054	NC_012660	ACG	2	6	6556929	6556934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593367
124055	NC_012660	CTG	3	9	6557018	6557026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593367
124056	NC_012660	ACG	2	6	6557091	6557096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593367
124057	NC_012660	CAC	2	6	6557107	6557112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229593367
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124060	NC_012660	GC	3	6	6557278	6557283	0 %	0 %	50 %	50 %	229593367
124061	NC_012660	GCC	2	6	6557350	6557355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593367
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124073	NC_012660	GC	4	8	6558114	6558121	0 %	0 %	50 %	50 %	229593368
124074	NC_012660	CAG	2	6	6558193	6558198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593368
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124080	NC_012660	TCA	2	6	6558377	6558382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229593368
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124085	NC_012660	GGGC	2	8	6558618	6558625	0 %	0 %	75 %	25 %	229593368
124086	NC_012660	CGA	2	6	6558717	6558722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593368
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124095	NC_012660	TG	3	6	6559150	6559155	0 %	50 %	50 %	0 %	229593368
124096	NC_012660	ACC	2	6	6559163	6559168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229593368
124097	NC_012660	GTC	2	6	6559187	6559192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593368
124098	NC_012660	CAT	2	6	6559203	6559208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229593368
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124100	NC_012660	CTG	2	6	6559297	6559302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593368
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124103	NC_012660	GCA	2	6	6559431	6559436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593368
124104	NC_012660	CCGCC	2	10	6559564	6559573	0 %	0 %	20 %	80 %	229593369
124105	NC_012660	CGC	2	6	6559755	6559760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593369
124106	NC_012660	CG	3	6	6559787	6559792	0 %	0 %	50 %	50 %	229593369
124107	NC_012660	CTG	2	6	6559818	6559823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593369
124108	NC_012660	GCC	2	6	6559832	6559837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593369
124109	NC_012660	CTG	2	6	6559890	6559895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593369
124110	NC_012660	GCT	3	9	6559916	6559924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593369
124111	NC_012660	CGA	2	6	6559937	6559942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593369
124112	NC_012660	ACG	2	6	6560026	6560031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593369
124113	NC_012660	CG	3	6	6560069	6560074	0 %	0 %	50 %	50 %	229593369
124114	NC_012660	AGA	2	6	6560134	6560139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229593369
124115	NC_012660	TCA	2	6	6560140	6560145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229593369
124116	NC_012660	CCA	2	6	6560167	6560172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229593369
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124118	NC_012660	GTG	2	6	6560223	6560228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229593369
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124124	NC_012660	CTG	3	9	6560517	6560525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593369
124125	NC_012660	CGC	2	6	6560539	6560544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593369
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124198	NC_012660	CCACT	2	10	6563599	6563608	20 %	20 %	0 %	60 %	229593372
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124203	NC_012660	TCA	2	6	6563694	6563699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229593372
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124208	NC_012660	GCG	2	6	6563931	6563936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229593372
124209	NC_012660	TGA	2	6	6563988	6563993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229593372
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124211	NC_012660	CTG	2	6	6564022	6564027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229593372
124212	NC_012660	CGCCT	2	10	6564034	6564043	0 %	20 %	20 %	60 %	229593372
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124214	NC_012660	TAA	2	6	6564199	6564204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229593372
124215	NC_012660	ACC	2	6	6564314	6564319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229593373
124216	NC_012660	GCC	3	9	6564324	6564332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593373
124217	NC_012660	TGGC	2	8	6564390	6564397	0 %	25 %	50 %	25 %	229593373
124218	NC_012660	CGC	2	6	6564434	6564439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593373
124219	NC_012660	GCA	2	6	6564474	6564479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229593373
124220	NC_012660	CAC	3	9	6564503	6564511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229593373
124221	NC_012660	AACAGC	2	12	6564513	6564524	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	229593373
124222	NC_012660	GC	3	6	6564575	6564580	0 %	0 %	50 %	50 %	229593373
124223	NC_012660	CGC	2	6	6564608	6564613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229593373
124224	NC_012660	CCGCCA	2	12	6564622	6564633	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	229593373
124225	NC_012660	ATC	2	6	6564642	6564647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229593373
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