MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Persephonella marina EX-H1 plasmid unnamed

Total Repeats: 1065

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012439	AAGC	2	8	192	199	50 %	0 %	25 %	25 %	225685374
2	NC_012439	AGAT	2	8	255	262	50 %	25 %	25 %	0 %	225685374
3	NC_012439	AGAA	2	8	274	281	75 %	0 %	25 %	0 %	225685374
4	NC_012439	GAA	2	6	326	331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225685374
5	NC_012439	TACA	2	8	395	402	50 %	25 %	0 %	25 %	225685374
6	NC_012439	T	6	6	429	434	0 %	100 %	0 %	0 %	225685374
7	NC_012439	AAGG	2	8	446	453	50 %	0 %	50 %	0 %	225685374
8	NC_012439	ATT	2	6	462	467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225685374
9	NC_012439	TATGAA	2	12	514	525	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	225685374
10	NC_012439	T	6	6	545	550	0 %	100 %	0 %	0 %	225685374
11	NC_012439	TTA	2	6	612	617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225685374
12	NC_012439	AGT	2	6	652	657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225685374
13	NC_012439	ATT	2	6	704	709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225685374
14	NC_012439	A	8	8	812	819	100 %	0 %	0 %	0 %	225685374
15	NC_012439	TAA	2	6	820	825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225685374
16	NC_012439	AATT	2	8	887	894	50 %	50 %	0 %	0 %	225685374
17	NC_012439	AAG	2	6	982	987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225685384
18	NC_012439	T	6	6	1159	1164	0 %	100 %	0 %	0 %	225685384
19	NC_012439	T	6	6	1207	1212	0 %	100 %	0 %	0 %	225685384
20	NC_012439	AATA	2	8	1349	1356	75 %	25 %	0 %	0 %	225685384
21	NC_012439	TTC	2	6	1417	1422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225685384
22	NC_012439	ACT	2	6	1531	1536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225685384
23	NC_012439	GGA	2	6	1656	1661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225685384
24	NC_012439	AGC	2	6	1883	1888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225685384
25	NC_012439	GA	3	6	2065	2070	50 %	0 %	50 %	0 %	225685384
26	NC_012439	GCA	2	6	2115	2120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225685384
27	NC_012439	GA	4	8	2129	2136	50 %	0 %	50 %	0 %	225685384
28	NC_012439	TGA	2	6	2171	2176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225685384
29	NC_012439	CAC	2	6	2179	2184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225685384
30	NC_012439	ACC	2	6	2192	2197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225685384
31	NC_012439	ATA	2	6	2278	2283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225685384
32	NC_012439	AT	3	6	2305	2310	50 %	50 %	0 %	0 %	225685384
33	NC_012439	A	6	6	2439	2444	100 %	0 %	0 %	0 %	225685384
34	NC_012439	TTTG	2	8	2570	2577	0 %	75 %	25 %	0 %	225685384
35	NC_012439	CAA	2	6	2605	2610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225685384
36	NC_012439	GGAA	2	8	2615	2622	50 %	0 %	50 %	0 %	225685384
37	NC_012439	ATG	2	6	2656	2661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225685384
38	NC_012439	TGA	2	6	2732	2737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225685384
39	NC_012439	A	6	6	2763	2768	100 %	0 %	0 %	0 %	225685384
40	NC_012439	AAT	2	6	2778	2783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225685384
41	NC_012439	AG	3	6	2808	2813	50 %	0 %	50 %	0 %	225685384
42	NC_012439	AATA	2	8	2834	2841	75 %	25 %	0 %	0 %	225685384
43	NC_012439	TGA	2	6	2846	2851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225685384
44	NC_012439	TGA	2	6	2879	2884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225685384
45	NC_012439	ACTA	2	8	2885	2892	50 %	25 %	0 %	25 %	225685384
46	NC_012439	AT	3	6	2893	2898	50 %	50 %	0 %	0 %	225685384
47	NC_012439	AATG	2	8	2929	2936	50 %	25 %	25 %	0 %	225685372
48	NC_012439	GAA	2	6	2953	2958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225685372
49	NC_012439	CAC	2	6	2966	2971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225685372
50	NC_012439	AG	3	6	2974	2979	50 %	0 %	50 %	0 %	225685372
51	NC_012439	GAT	2	6	3019	3024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225685372
52	NC_012439	GGA	2	6	3066	3071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225685372
53	NC_012439	TGA	2	6	3161	3166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225685376
54	NC_012439	T	6	6	3239	3244	0 %	100 %	0 %	0 %	225685376
55	NC_012439	AAT	2	6	3281	3286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225685376
56	NC_012439	T	7	7	3304	3310	0 %	100 %	0 %	0 %	225685376
57	NC_012439	A	6	6	3384	3389	100 %	0 %	0 %	0 %	225685376
58	NC_012439	A	6	6	3393	3398	100 %	0 %	0 %	0 %	225685376
59	NC_012439	GCG	2	6	3402	3407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225685376
60	NC_012439	AAG	2	6	3516	3521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225685376
61	NC_012439	A	7	7	3536	3542	100 %	0 %	0 %	0 %	225685376
62	NC_012439	A	7	7	3720	3726	100 %	0 %	0 %	0 %	225685376
63	NC_012439	A	6	6	3791	3796	100 %	0 %	0 %	0 %	225685376
64	NC_012439	T	7	7	3996	4002	0 %	100 %	0 %	0 %	225685377
65	NC_012439	T	6	6	4021	4026	0 %	100 %	0 %	0 %	225685377
66	NC_012439	CCA	2	6	4047	4052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225685377
67	NC_012439	TAT	2	6	4068	4073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225685377
68	NC_012439	CTT	2	6	4074	4079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225685377
69	NC_012439	CTT	2	6	4128	4133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225685377
70	NC_012439	TCT	2	6	4134	4139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225685377
71	NC_012439	ATT	3	9	4214	4222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225685377
72	NC_012439	T	7	7	4379	4385	0 %	100 %	0 %	0 %	225685404
73	NC_012439	T	6	6	4415	4420	0 %	100 %	0 %	0 %	225685404
74	NC_012439	TGT	2	6	4493	4498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225685404
75	NC_012439	TTTC	2	8	4532	4539	0 %	75 %	0 %	25 %	225685404
76	NC_012439	CAG	2	6	4562	4567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225685404
77	NC_012439	TATT	2	8	4732	4739	25 %	75 %	0 %	0 %	225685404
78	NC_012439	CT	3	6	4766	4771	0 %	50 %	0 %	50 %	225685404
79	NC_012439	TGT	2	6	4781	4786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225685404
80	NC_012439	ATG	2	6	4800	4805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225685404
81	NC_012439	CTGGAG	2	12	4822	4833	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	225685404
82	NC_012439	AT	3	6	4848	4853	50 %	50 %	0 %	0 %	225685404
83	NC_012439	TTC	2	6	4866	4871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225685404
84	NC_012439	A	7	7	4878	4884	100 %	0 %	0 %	0 %	225685404
85	NC_012439	CTTT	2	8	4948	4955	0 %	75 %	0 %	25 %	225685368
86	NC_012439	T	6	6	4953	4958	0 %	100 %	0 %	0 %	225685368
87	NC_012439	CTA	2	6	4972	4977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225685368
88	NC_012439	TCC	2	6	5032	5037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225685368
89	NC_012439	T	7	7	5146	5152	0 %	100 %	0 %	0 %	225685342
90	NC_012439	CAT	2	6	5165	5170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225685342
91	NC_012439	CTT	2	6	5176	5181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225685342
92	NC_012439	ATC	2	6	5205	5210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225685342
93	NC_012439	ATC	2	6	5215	5220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225685342
94	NC_012439	AAT	2	6	5255	5260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225685342
95	NC_012439	ATG	2	6	5375	5380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225685342
96	NC_012439	TG	3	6	5390	5395	0 %	50 %	50 %	0 %	225685342
97	NC_012439	T	8	8	5465	5472	0 %	100 %	0 %	0 %	225685342
98	NC_012439	TTC	2	6	5487	5492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225685342
99	NC_012439	TGA	2	6	5502	5507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225685342
100	NC_012439	A	6	6	5507	5512	100 %	0 %	0 %	0 %	225685342
101	NC_012439	TCA	2	6	5560	5565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225685342
102	NC_012439	AGT	2	6	5570	5575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225685342
103	NC_012439	AT	3	6	5578	5583	50 %	50 %	0 %	0 %	225685342
104	NC_012439	CTT	2	6	5585	5590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225685342
105	NC_012439	TATTC	2	10	5875	5884	20 %	60 %	0 %	20 %	225685351
106	NC_012439	TTTG	2	8	5891	5898	0 %	75 %	25 %	0 %	225685351
107	NC_012439	TA	3	6	5921	5926	50 %	50 %	0 %	0 %	225685351
108	NC_012439	ACC	2	6	5940	5945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225685351
109	NC_012439	AGAA	2	8	5949	5956	75 %	0 %	25 %	0 %	225685351
110	NC_012439	CTG	2	6	5983	5988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225685351
111	NC_012439	ATT	2	6	6033	6038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225685351
112	NC_012439	CCT	2	6	6075	6080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225685360
113	NC_012439	CAG	2	6	6200	6205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225685360
114	NC_012439	TCA	2	6	6284	6289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225685360
115	NC_012439	TTC	2	6	6303	6308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225685360
116	NC_012439	A	6	6	6337	6342	100 %	0 %	0 %	0 %	225685360
117	NC_012439	CCTC	2	8	6383	6390	0 %	25 %	0 %	75 %	225685357
118	NC_012439	TTCCT	2	10	6426	6435	0 %	60 %	0 %	40 %	225685357
119	NC_012439	CTT	2	6	6439	6444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225685357
120	NC_012439	ATT	2	6	6496	6501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225685357
121	NC_012439	TTC	2	6	6516	6521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225685357
122	NC_012439	TA	3	6	6549	6554	50 %	50 %	0 %	0 %	225685357
123	NC_012439	ATT	2	6	6568	6573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225685357
124	NC_012439	ATA	2	6	6616	6621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225685357
125	NC_012439	TTTC	2	8	6689	6696	0 %	75 %	0 %	25 %	225685357
126	NC_012439	TTTC	2	8	6715	6722	0 %	75 %	0 %	25 %	225685357
127	NC_012439	TAT	2	6	6807	6812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225685357
128	NC_012439	GGT	2	6	6844	6849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225685357
129	NC_012439	T	6	6	6921	6926	0 %	100 %	0 %	0 %	225685357
130	NC_012439	AAG	2	6	6946	6951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225685357
131	NC_012439	CTTT	2	8	7017	7024	0 %	75 %	0 %	25 %	225685357
132	NC_012439	CAACC	2	10	7058	7067	40 %	0 %	0 %	60 %	225685357
133	NC_012439	T	6	6	7117	7122	0 %	100 %	0 %	0 %	225685340
134	NC_012439	TAG	2	6	7144	7149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225685340
135	NC_012439	GTG	2	6	7173	7178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225685340
136	NC_012439	TCTA	2	8	7331	7338	25 %	50 %	0 %	25 %	225685340
137	NC_012439	ATT	2	6	7344	7349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225685340
138	NC_012439	TTC	2	6	7350	7355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225685340
139	NC_012439	CAT	2	6	7360	7365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225685340
140	NC_012439	AGTA	2	8	7369	7376	50 %	25 %	25 %	0 %	225685340
141	NC_012439	ATC	2	6	7433	7438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225685340
142	NC_012439	TTA	2	6	7479	7484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225685340
143	NC_012439	AAT	2	6	7535	7540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225685340
144	NC_012439	ATC	2	6	7541	7546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225685340
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148	NC_012439	TCT	2	6	7878	7883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225685340
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151	NC_012439	TTTA	2	8	7958	7965	25 %	75 %	0 %	0 %	225685340
152	NC_012439	TTTAT	2	10	7974	7983	20 %	80 %	0 %	0 %	225685340
153	NC_012439	AGTA	2	8	8024	8031	50 %	25 %	25 %	0 %	225685350
154	NC_012439	CATA	2	8	8040	8047	50 %	25 %	0 %	25 %	225685350
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170	NC_012439	TA	3	6	8467	8472	50 %	50 %	0 %	0 %	225685350
171	NC_012439	CTTT	2	8	8473	8480	0 %	75 %	0 %	25 %	225685350
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174	NC_012439	T	6	6	8575	8580	0 %	100 %	0 %	0 %	225685341
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198	NC_012439	T	7	7	9433	9439	0 %	100 %	0 %	0 %	225685341
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256	NC_012439	TTAT	2	8	12446	12453	25 %	75 %	0 %	0 %	225685356
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266	NC_012439	TTC	2	6	12927	12932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225685356
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268	NC_012439	TAG	2	6	12993	12998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225685356
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271	NC_012439	TTG	2	6	13087	13092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225685356
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391	NC_012439	ATC	2	6	19459	19464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225685353
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395	NC_012439	AT	3	6	19757	19762	50 %	50 %	0 %	0 %	225685362
396	NC_012439	A	6	6	19776	19781	100 %	0 %	0 %	0 %	225685362
397	NC_012439	ATT	2	6	19852	19857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225685362
398	NC_012439	TA	4	8	19941	19948	50 %	50 %	0 %	0 %	225685343
399	NC_012439	CA	3	6	19953	19958	50 %	0 %	0 %	50 %	225685343
400	NC_012439	TTTTA	2	10	19963	19972	20 %	80 %	0 %	0 %	225685343
401	NC_012439	AT	3	6	19993	19998	50 %	50 %	0 %	0 %	225685343
402	NC_012439	TA	3	6	20031	20036	50 %	50 %	0 %	0 %	225685343
403	NC_012439	TCC	2	6	20059	20064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225685343
404	NC_012439	ACCAT	2	10	20066	20075	40 %	20 %	0 %	40 %	225685343
405	NC_012439	TTC	2	6	20095	20100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225685343
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433	NC_012439	CCG	2	6	21565	21570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225685392
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