MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas aeruginosa LESB58 chromosome

Total Repeats: 151669

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011770	TCCGTG	2	12	480	491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218888747
2	NC_011770	GCA	2	6	500	505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218888747
3	NC_011770	TCT	2	6	515	520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218888747
4	NC_011770	CAA	2	6	540	545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218888747
5	NC_011770	CGA	2	6	587	592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218888747
6	NC_011770	GT	3	6	598	603	0 %	50 %	50 %	0 %	218888747
7	NC_011770	TCGG	2	8	649	656	0 %	25 %	50 %	25 %	218888747
8	NC_011770	TTA	2	6	708	713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218888747
9	NC_011770	GCA	2	6	718	723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218888747
10	NC_011770	CGC	2	6	736	741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218888747
11	NC_011770	GC	3	6	740	745	0 %	0 %	50 %	50 %	218888747
12	NC_011770	CCG	3	9	795	803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218888747
13	NC_011770	GCC	2	6	857	862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218888747
14	NC_011770	GAC	2	6	866	871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218888747
15	NC_011770	GAA	2	6	906	911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218888747
16	NC_011770	GCC	3	9	930	938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218888747
17	NC_011770	GCCG	2	8	941	948	0 %	0 %	50 %	50 %	218888747
18	NC_011770	AGC	2	6	950	955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218888747
19	NC_011770	ACCTTC	2	12	1026	1037	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	218888747
20	NC_011770	CGC	3	9	1076	1084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218888747
21	NC_011770	ATGC	2	8	1167	1174	25 %	25 %	25 %	25 %	218888747
22	NC_011770	ACC	2	6	1183	1188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218888747
23	NC_011770	GAA	3	9	1193	1201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218888747
24	NC_011770	GGT	2	6	1214	1219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218888747
25	NC_011770	TCG	2	6	1240	1245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218888747
26	NC_011770	CGA	2	6	1325	1330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218888747
27	NC_011770	TTC	2	6	1338	1343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218888747
28	NC_011770	AGG	2	6	1363	1368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218888747
29	NC_011770	TTC	2	6	1371	1376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218888747
30	NC_011770	GGC	2	6	1401	1406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218888747
31	NC_011770	CAG	2	6	1407	1412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218888747
32	NC_011770	GCC	2	6	1508	1513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218888747
33	NC_011770	TGA	2	6	1540	1545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218888747
34	NC_011770	CTT	2	6	1589	1594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218888747
35	NC_011770	GCCG	2	8	1675	1682	0 %	0 %	50 %	50 %	218888747
36	NC_011770	ACA	2	6	1753	1758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218888747
37	NC_011770	TAC	2	6	1779	1784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218888747
38	NC_011770	TGT	2	6	1804	1809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218888747
39	NC_011770	GCG	2	6	1814	1819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218888747
40	NC_011770	GC	3	6	1833	1838	0 %	0 %	50 %	50 %	218888747
41	NC_011770	ACCA	2	8	1875	1882	50 %	0 %	0 %	50 %	218888747
42	NC_011770	CGG	2	6	1910	1915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218888747
43	NC_011770	CAC	2	6	1925	1930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218888747
44	NC_011770	CTG	2	6	2004	2009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218888747
45	NC_011770	CGT	2	6	2112	2117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218888748
46	NC_011770	CGC	2	6	2122	2127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218888748
47	NC_011770	TC	3	6	2142	2147	0 %	50 %	0 %	50 %	218888748
48	NC_011770	CTG	2	6	2155	2160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218888748
49	NC_011770	TGGT	2	8	2213	2220	0 %	50 %	50 %	0 %	218888748
50	NC_011770	GCC	2	6	2239	2244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218888748
51	NC_011770	GC	3	6	2269	2274	0 %	0 %	50 %	50 %	218888748
52	NC_011770	ACG	2	6	2306	2311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218888748
53	NC_011770	CAG	2	6	2497	2502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218888748
54	NC_011770	TAC	2	6	2512	2517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218888748
55	NC_011770	TGC	2	6	2528	2533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218888748
56	NC_011770	CGG	2	6	2544	2549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218888748
57	NC_011770	CCA	2	6	2628	2633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218888748
58	NC_011770	CCA	2	6	2732	2737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218888748
59	NC_011770	TGG	2	6	2765	2770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218888748
60	NC_011770	CG	3	6	2804	2809	0 %	0 %	50 %	50 %	218888748
61	NC_011770	TGG	2	6	2822	2827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218888748
62	NC_011770	GCA	2	6	2838	2843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218888748
63	NC_011770	AAC	2	6	2941	2946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218888748
64	NC_011770	GAA	2	6	2968	2973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218888748
65	NC_011770	CGG	2	6	2991	2996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218888748
66	NC_011770	CAG	2	6	3090	3095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218888748
67	NC_011770	GTC	2	6	3136	3141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218888748
68	NC_011770	CTCCCC	2	12	3225	3236	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	218888749
69	NC_011770	C	6	6	3233	3238	0 %	0 %	0 %	100 %	218888749
70	NC_011770	CTG	2	6	3301	3306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218888749
71	NC_011770	GC	3	6	3331	3336	0 %	0 %	50 %	50 %	218888749
72	NC_011770	CCG	2	6	3564	3569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218888749
73	NC_011770	TGACC	2	10	3816	3825	20 %	20 %	20 %	40 %	218888749
74	NC_011770	CTA	2	6	3831	3836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218888749
75	NC_011770	CCT	2	6	3861	3866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218888749
76	NC_011770	CAG	2	6	3898	3903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218888749
77	NC_011770	CGC	2	6	3966	3971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218888749
78	NC_011770	TC	3	6	3978	3983	0 %	50 %	0 %	50 %	218888749
79	NC_011770	CAG	2	6	3991	3996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218888749
80	NC_011770	TGG	2	6	4001	4006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218888749
81	NC_011770	TGG	2	6	4073	4078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218888749
82	NC_011770	AGC	2	6	4103	4108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218888749
83	NC_011770	GCTT	2	8	4127	4134	0 %	50 %	25 %	25 %	218888749
84	NC_011770	TCA	2	6	4157	4162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218888749
85	NC_011770	TC	3	6	4244	4249	0 %	50 %	0 %	50 %	218888749
86	NC_011770	AAC	2	6	4284	4289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218888750
87	NC_011770	CGA	2	6	4370	4375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218888750
88	NC_011770	CAC	2	6	4389	4394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218888750
89	NC_011770	GGT	2	6	4406	4411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218888750
90	NC_011770	CGA	2	6	4424	4429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218888750
91	NC_011770	CCAT	2	8	4465	4472	25 %	25 %	0 %	50 %	218888750
92	NC_011770	GAA	2	6	4533	4538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218888750
93	NC_011770	GCG	2	6	4548	4553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218888750
94	NC_011770	TCC	2	6	4570	4575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218888750
95	NC_011770	CGG	2	6	4580	4585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218888750
96	NC_011770	CGA	2	6	4592	4597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218888750
97	NC_011770	CGG	2	6	4616	4621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218888750
98	NC_011770	GGT	2	6	4643	4648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218888750
99	NC_011770	CAA	2	6	4691	4696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218888750
100	NC_011770	ACC	2	6	4714	4719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218888750
101	NC_011770	TCCT	2	8	4860	4867	0 %	50 %	0 %	50 %	218888750
102	NC_011770	CTG	2	6	4887	4892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218888750
103	NC_011770	CGA	2	6	4895	4900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218888750
104	NC_011770	AGG	2	6	4912	4917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218888750
105	NC_011770	TCG	2	6	4951	4956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218888750
106	NC_011770	CAA	2	6	4970	4975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218888750
107	NC_011770	CTGCT	2	10	5076	5085	0 %	40 %	20 %	40 %	218888750
108	NC_011770	CAA	2	6	5090	5095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218888750
109	NC_011770	CGG	2	6	5111	5116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218888750
110	NC_011770	AAC	2	6	5160	5165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218888750
111	NC_011770	GAA	2	6	5189	5194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218888750
112	NC_011770	CCA	2	6	5206	5211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218888750
113	NC_011770	CGA	2	6	5216	5221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218888750
114	NC_011770	ATC	2	6	5244	5249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218888750
115	NC_011770	TCC	2	6	5304	5309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218888750
116	NC_011770	CTG	2	6	5361	5366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218888750
117	NC_011770	GAT	2	6	5402	5407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218888750
118	NC_011770	CGC	2	6	5411	5416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218888750
119	NC_011770	CG	3	6	5432	5437	0 %	0 %	50 %	50 %	218888750
120	NC_011770	GC	3	6	5442	5447	0 %	0 %	50 %	50 %	218888750
121	NC_011770	CGC	2	6	5457	5462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218888750
122	NC_011770	GC	3	6	5467	5472	0 %	0 %	50 %	50 %	218888750
123	NC_011770	GC	3	6	5646	5651	0 %	0 %	50 %	50 %	218888750
124	NC_011770	CTC	2	6	5666	5671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218888750
125	NC_011770	AGG	2	6	5674	5679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218888750
126	NC_011770	ACA	2	6	5728	5733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218888750
127	NC_011770	CAT	4	12	5756	5767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218888750
128	NC_011770	CTG	2	6	5805	5810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218888750
129	NC_011770	CTT	3	9	5816	5824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218888750
130	NC_011770	CTACAT	2	12	5855	5866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218888750
131	NC_011770	GAC	2	6	5922	5927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218888750
132	NC_011770	AGC	2	6	6011	6016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218888750
133	NC_011770	GAC	2	6	6132	6137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218888750
134	NC_011770	CCG	3	9	6193	6201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218888750
135	NC_011770	TGG	2	6	6277	6282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218888750
136	NC_011770	CTT	2	6	6320	6325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218888750
137	NC_011770	GCT	2	6	6353	6358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218888750
138	NC_011770	CTG	2	6	6378	6383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218888750
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142	NC_011770	GCCGC	2	10	6638	6647	0 %	0 %	40 %	60 %	218888750
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144	NC_011770	GCT	2	6	7042	7047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218888751
145	NC_011770	GC	3	6	7092	7097	0 %	0 %	50 %	50 %	218888751
146	NC_011770	GC	3	6	7116	7121	0 %	0 %	50 %	50 %	218888751
147	NC_011770	GCCTTC	2	12	7124	7135	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	218888751
148	NC_011770	GGCCG	2	10	7145	7154	0 %	0 %	60 %	40 %	218888751
149	NC_011770	CAC	2	6	7157	7162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218888751
150	NC_011770	TGC	2	6	7267	7272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218888751
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152	NC_011770	TCG	2	6	7356	7361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218888751
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154	NC_011770	CGATGG	2	12	7408	7419	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	218888751
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159	NC_011770	GAA	2	6	7511	7516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218888751
160	NC_011770	GAA	2	6	7694	7699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218888751
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163	NC_011770	TCG	2	6	7826	7831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218888752
164	NC_011770	CGTA	2	8	7867	7874	25 %	25 %	25 %	25 %	218888752
165	NC_011770	CGC	2	6	7921	7926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218888752
166	NC_011770	CGA	2	6	7950	7955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218888752
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172	NC_011770	TGGT	2	8	8168	8175	0 %	50 %	50 %	0 %	218888752
173	NC_011770	GGCG	2	8	8208	8215	0 %	0 %	75 %	25 %	218888752
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246	NC_011770	CGGCGC	2	12	11168	11179	0 %	0 %	50 %	50 %	218888754
247	NC_011770	CG	3	6	11180	11185	0 %	0 %	50 %	50 %	218888754
248	NC_011770	CGC	2	6	11228	11233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218888754
249	NC_011770	GTGG	2	8	11235	11242	0 %	25 %	75 %	0 %	218888754
250	NC_011770	GTA	3	9	11244	11252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218888754
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252	NC_011770	GCC	2	6	11349	11354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218888754
253	NC_011770	GGC	2	6	11373	11378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218888754
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256	NC_011770	ACC	2	6	11524	11529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218888754
257	NC_011770	TGA	2	6	11585	11590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218888754
258	NC_011770	GCA	2	6	11597	11602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218888754
259	NC_011770	CAG	2	6	11619	11624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218888754
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261	NC_011770	CTC	2	6	11691	11696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218888754
262	NC_011770	TCG	2	6	11743	11748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218888754
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264	NC_011770	CGG	2	6	11786	11791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218888754
265	NC_011770	TCG	2	6	11977	11982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218888754
266	NC_011770	CTC	2	6	12021	12026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218888754
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281	NC_011770	GGC	2	6	12427	12432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218888754
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