MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Prosthecochloris aestuarii DSM 271 plasmid pPAES01

Total Repeats: 1097

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011061	CAA	2	6	27597	27602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194335147
502	NC_011061	ATG	2	6	27717	27722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194335147
503	NC_011061	ATC	2	6	28051	28056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194335148
504	NC_011061	TTG	2	6	28238	28243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194335148
505	NC_011061	AAC	2	6	28339	28344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194335148
506	NC_011061	AAAC	2	8	28450	28457	75 %	0 %	0 %	25 %	194335148
507	NC_011061	ACA	2	6	28495	28500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194335148
508	NC_011061	CAT	2	6	28536	28541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194335148
509	NC_011061	CAG	2	6	28570	28575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194335148
510	NC_011061	CAG	2	6	28625	28630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194335148
511	NC_011061	TCATG	2	10	28656	28665	20 %	40 %	20 %	20 %	194335148
512	NC_011061	CAGT	2	8	28674	28681	25 %	25 %	25 %	25 %	194335148
513	NC_011061	AAC	2	6	28714	28719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194335148
514	NC_011061	AAT	2	6	28741	28746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194335148
515	NC_011061	AG	3	6	28946	28951	50 %	0 %	50 %	0 %	194335148
516	NC_011061	TGA	2	6	28958	28963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194335148
517	NC_011061	AAG	2	6	28972	28977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194335148
518	NC_011061	TCT	2	6	29034	29039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194335148
519	NC_011061	CGATAT	2	12	29079	29090	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	194335148
520	NC_011061	AC	3	6	29158	29163	50 %	0 %	0 %	50 %	194335148
521	NC_011061	TCA	2	6	29168	29173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194335148
522	NC_011061	GAC	2	6	29242	29247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194335148
523	NC_011061	GAA	2	6	29344	29349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194335148
524	NC_011061	ACC	2	6	29430	29435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194335149
525	NC_011061	CTG	2	6	29477	29482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194335149
526	NC_011061	CCT	2	6	29500	29505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194335149
527	NC_011061	CA	3	6	29540	29545	50 %	0 %	0 %	50 %	194335149
528	NC_011061	TCT	2	6	29553	29558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194335149
529	NC_011061	TCA	2	6	29568	29573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194335149
530	NC_011061	GAT	2	6	29792	29797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194335149
531	NC_011061	ATC	2	6	29819	29824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194335149
532	NC_011061	GCT	2	6	29879	29884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194335149
533	NC_011061	GCA	2	6	29888	29893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194335149
534	NC_011061	A	6	6	29904	29909	100 %	0 %	0 %	0 %	194335149
535	NC_011061	CTG	2	6	29955	29960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194335149
536	NC_011061	AACA	2	8	29993	30000	75 %	0 %	0 %	25 %	194335149
537	NC_011061	AGA	2	6	30194	30199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194335149
538	NC_011061	TCA	2	6	30212	30217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194335149
539	NC_011061	GATC	2	8	30221	30228	25 %	25 %	25 %	25 %	194335149
540	NC_011061	TCA	2	6	30317	30322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194335150
541	NC_011061	A	7	7	30337	30343	100 %	0 %	0 %	0 %	194335150
542	NC_011061	CTT	2	6	30356	30361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194335150
543	NC_011061	GAA	2	6	30362	30367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194335150
544	NC_011061	ACT	2	6	30398	30403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194335150
545	NC_011061	A	8	8	30418	30425	100 %	0 %	0 %	0 %	194335150
546	NC_011061	TCT	2	6	30475	30480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194335150
547	NC_011061	T	6	6	30480	30485	0 %	100 %	0 %	0 %	194335150
548	NC_011061	GAA	2	6	30506	30511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194335150
549	NC_011061	A	6	6	30510	30515	100 %	0 %	0 %	0 %	194335150
550	NC_011061	GAA	2	6	30530	30535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194335150
551	NC_011061	AGA	2	6	30802	30807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194335151
552	NC_011061	T	6	6	30841	30846	0 %	100 %	0 %	0 %	194335151
553	NC_011061	AAATG	2	10	30880	30889	60 %	20 %	20 %	0 %	194335151
554	NC_011061	AGC	2	6	30972	30977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194335151
555	NC_011061	TTGT	2	8	31046	31053	0 %	75 %	25 %	0 %	194335151
556	NC_011061	AGA	2	6	31131	31136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194335151
557	NC_011061	CGT	2	6	31246	31251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194335151
558	NC_011061	AAG	2	6	31286	31291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194335151
559	NC_011061	ACG	2	6	31414	31419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194335151
560	NC_011061	CA	3	6	31453	31458	50 %	0 %	0 %	50 %	194335151
561	NC_011061	TCA	2	6	31605	31610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194335151
562	NC_011061	AGA	3	9	31612	31620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194335151
563	NC_011061	A	6	6	31627	31632	100 %	0 %	0 %	0 %	194335151
564	NC_011061	GGA	2	6	31663	31668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194335151
565	NC_011061	A	6	6	31696	31701	100 %	0 %	0 %	0 %	194335151
566	NC_011061	GC	3	6	31702	31707	0 %	0 %	50 %	50 %	194335151
567	NC_011061	GCA	2	6	31720	31725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194335151
568	NC_011061	CAGT	2	8	31738	31745	25 %	25 %	25 %	25 %	194335151
569	NC_011061	GCT	2	6	31751	31756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194335151
570	NC_011061	CTG	2	6	31766	31771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194335151
571	NC_011061	ATC	2	6	31788	31793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194335151
572	NC_011061	GCC	2	6	31802	31807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194335151
573	NC_011061	TAC	2	6	31976	31981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194335151
574	NC_011061	TGG	2	6	32017	32022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194335151
575	NC_011061	AGA	2	6	32041	32046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194335151
576	NC_011061	AT	3	6	32086	32091	50 %	50 %	0 %	0 %	194335151
577	NC_011061	TCCC	2	8	32145	32152	0 %	25 %	0 %	75 %	194335151
578	NC_011061	ATG	2	6	32265	32270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194335152
579	NC_011061	CAT	2	6	32316	32321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194335152
580	NC_011061	GAC	2	6	32328	32333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194335152
581	NC_011061	CTG	2	6	32351	32356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194335152
582	NC_011061	ATC	3	9	32359	32367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194335152
583	NC_011061	TCA	3	9	32483	32491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194335152
584	NC_011061	T	6	6	32492	32497	0 %	100 %	0 %	0 %	194335152
585	NC_011061	ATA	2	6	32534	32539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194335152
586	NC_011061	AAC	3	9	33097	33105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194335153
587	NC_011061	ATCC	2	8	33208	33215	25 %	25 %	0 %	50 %	194335153
588	NC_011061	TCT	2	6	33248	33253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194335153
589	NC_011061	CT	3	6	33296	33301	0 %	50 %	0 %	50 %	194335153
590	NC_011061	ATC	2	6	33322	33327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194335153
591	NC_011061	GAT	2	6	33336	33341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194335153
592	NC_011061	ATC	2	6	33437	33442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194335153
593	NC_011061	CAG	2	6	33462	33467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194335153
594	NC_011061	GCT	2	6	33510	33515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194335153
595	NC_011061	CAT	2	6	33537	33542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194335153
596	NC_011061	TAT	2	6	33691	33696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194335154
597	NC_011061	CGA	2	6	33771	33776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194335154
598	NC_011061	CTG	2	6	33794	33799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194335154
599	NC_011061	GAAA	2	8	33824	33831	75 %	0 %	25 %	0 %	194335154
600	NC_011061	TGA	2	6	34066	34071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194335154
601	NC_011061	AGGA	2	8	34095	34102	50 %	0 %	50 %	0 %	194335154
602	NC_011061	GC	4	8	34118	34125	0 %	0 %	50 %	50 %	194335154
603	NC_011061	CAG	2	6	34136	34141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194335154
604	NC_011061	GAT	2	6	34395	34400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194335155
605	NC_011061	GAT	3	9	34404	34412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194335155
606	NC_011061	TCGA	2	8	34472	34479	25 %	25 %	25 %	25 %	194335155
607	NC_011061	CAA	2	6	34589	34594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194335155
608	NC_011061	AGC	2	6	34622	34627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194335155
609	NC_011061	CGG	2	6	34630	34635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194335155
610	NC_011061	GGC	2	6	34659	34664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194335155
611	NC_011061	ATG	2	6	34705	34710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194335156
612	NC_011061	ATC	2	6	34783	34788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194335156
613	NC_011061	TTA	2	6	35039	35044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194335157
614	NC_011061	GTA	2	6	35076	35081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194335157
615	NC_011061	ATC	2	6	35207	35212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194335157
616	NC_011061	TCA	2	6	35229	35234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194335157
617	NC_011061	TCC	2	6	35252	35257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194335157
618	NC_011061	TGC	2	6	35348	35353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194335157
619	NC_011061	AGC	2	6	35423	35428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194335157
620	NC_011061	TGA	2	6	35461	35466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194335157
621	NC_011061	CA	3	6	35473	35478	50 %	0 %	0 %	50 %	194335157
622	NC_011061	CCTT	2	8	35481	35488	0 %	50 %	0 %	50 %	194335157
623	NC_011061	CCT	2	6	35608	35613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194335157
624	NC_011061	AGGC	2	8	35618	35625	25 %	0 %	50 %	25 %	194335157
625	NC_011061	GAC	2	6	35677	35682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194335157
626	NC_011061	GCA	2	6	35740	35745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194335157
627	NC_011061	CTGT	2	8	35788	35795	0 %	50 %	25 %	25 %	194335157
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