MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1 chromosome

Total Repeats: 51915

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011060	T	6	6	130	135	0 %	100 %	0 %	0 %	194335183
2	NC_011060	T	7	7	193	199	0 %	100 %	0 %	0 %	194335183
3	NC_011060	ATT	2	6	218	223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194335183
4	NC_011060	CCT	2	6	224	229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194335183
5	NC_011060	A	6	6	393	398	100 %	0 %	0 %	0 %	194335183
6	NC_011060	A	7	7	413	419	100 %	0 %	0 %	0 %	194335183
7	NC_011060	AC	3	6	436	441	50 %	0 %	0 %	50 %	194335183
8	NC_011060	TCA	2	6	470	475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194335183
9	NC_011060	TTAT	2	8	557	564	25 %	75 %	0 %	0 %	194335183
10	NC_011060	AC	3	6	586	591	50 %	0 %	0 %	50 %	194335183
11	NC_011060	ATG	2	6	592	597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194335183
12	NC_011060	ATT	2	6	748	753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194335183
13	NC_011060	T	7	7	766	772	0 %	100 %	0 %	0 %	194335183
14	NC_011060	A	6	6	782	787	100 %	0 %	0 %	0 %	194335183
15	NC_011060	AGG	2	6	791	796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194335183
16	NC_011060	ATT	2	6	841	846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194335183
17	NC_011060	CAGA	2	8	854	861	50 %	0 %	25 %	25 %	194335183
18	NC_011060	CAG	2	6	923	928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194335183
19	NC_011060	CCT	2	6	937	942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194335183
20	NC_011060	TAT	2	6	963	968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194335183
21	NC_011060	ATT	2	6	1147	1152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194335183
22	NC_011060	CA	3	6	1156	1161	50 %	0 %	0 %	50 %	194335183
23	NC_011060	CGATA	2	10	1179	1188	40 %	20 %	20 %	20 %	194335183
24	NC_011060	AAG	2	6	1249	1254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194335183
25	NC_011060	GAC	2	6	1268	1273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194335183
26	NC_011060	TTC	2	6	1308	1313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194335183
27	NC_011060	GGA	2	6	1339	1344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194335183
28	NC_011060	A	7	7	1386	1392	100 %	0 %	0 %	0 %	194335183
29	NC_011060	A	8	8	1416	1423	100 %	0 %	0 %	0 %	194335183
30	NC_011060	AGA	2	6	1425	1430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194335183
31	NC_011060	A	7	7	1435	1441	100 %	0 %	0 %	0 %	194335183
32	NC_011060	CT	3	6	1848	1853	0 %	50 %	0 %	50 %	194335184
33	NC_011060	AGCA	2	8	2097	2104	50 %	0 %	25 %	25 %	194335184
34	NC_011060	A	6	6	2116	2121	100 %	0 %	0 %	0 %	194335184
35	NC_011060	TC	3	6	2131	2136	0 %	50 %	0 %	50 %	194335184
36	NC_011060	CAG	2	6	2149	2154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194335184
37	NC_011060	TGATC	2	10	2162	2171	20 %	40 %	20 %	20 %	194335184
38	NC_011060	A	6	6	2173	2178	100 %	0 %	0 %	0 %	194335184
39	NC_011060	ATG	2	6	2217	2222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194335184
40	NC_011060	A	6	6	2297	2302	100 %	0 %	0 %	0 %	194335184
41	NC_011060	A	6	6	2329	2334	100 %	0 %	0 %	0 %	194335184
42	NC_011060	TTA	2	6	2389	2394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194335184
43	NC_011060	TAT	2	6	2432	2437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194335184
44	NC_011060	ATT	2	6	2466	2471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194335184
45	NC_011060	ATG	2	6	2488	2493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194335184
46	NC_011060	GAT	2	6	2540	2545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194335184
47	NC_011060	CGT	2	6	2559	2564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194335184
48	NC_011060	AAG	2	6	2662	2667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194335184
49	NC_011060	GAT	2	6	2691	2696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194335184
50	NC_011060	GCT	2	6	2730	2735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194335184
51	NC_011060	GAT	2	6	2748	2753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194335184
52	NC_011060	GAATT	2	10	2764	2773	40 %	40 %	20 %	0 %	194335184
53	NC_011060	CAA	2	6	2782	2787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194335184
54	NC_011060	GAT	2	6	2823	2828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194335184
55	NC_011060	AATA	2	8	2858	2865	75 %	25 %	0 %	0 %	194335184
56	NC_011060	GA	4	8	2869	2876	50 %	0 %	50 %	0 %	194335184
57	NC_011060	ACC	2	6	2920	2925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194335185
58	NC_011060	AGTG	2	8	3054	3061	25 %	25 %	50 %	0 %	194335185
59	NC_011060	TCT	2	6	3072	3077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194335185
60	NC_011060	CAA	2	6	3124	3129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194335185
61	NC_011060	GAAAAA	2	12	3153	3164	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	194335185
62	NC_011060	A	9	9	3160	3168	100 %	0 %	0 %	0 %	194335185
63	NC_011060	TTG	2	6	3172	3177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194335185
64	NC_011060	CAG	2	6	3271	3276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194335185
65	NC_011060	AAG	2	6	3278	3283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194335185
66	NC_011060	CAA	2	6	3360	3365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194335185
67	NC_011060	CT	3	6	3514	3519	0 %	50 %	0 %	50 %	194335185
68	NC_011060	GCT	2	6	3562	3567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194335185
69	NC_011060	TGA	2	6	3689	3694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194335185
70	NC_011060	T	7	7	3700	3706	0 %	100 %	0 %	0 %	194335185
71	NC_011060	A	6	6	3726	3731	100 %	0 %	0 %	0 %	194335185
72	NC_011060	TCTT	2	8	3757	3764	0 %	75 %	0 %	25 %	194335185
73	NC_011060	TGA	2	6	3833	3838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194335185
74	NC_011060	ATT	2	6	3909	3914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194335185
75	NC_011060	CTG	2	6	3919	3924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194335185
76	NC_011060	A	6	6	4006	4011	100 %	0 %	0 %	0 %	194335186
77	NC_011060	AGT	2	6	4027	4032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194335186
78	NC_011060	CAG	2	6	4076	4081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194335186
79	NC_011060	GTT	2	6	4109	4114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194335186
80	NC_011060	CAA	3	9	4134	4142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194335186
81	NC_011060	GTT	2	6	4165	4170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194335186
82	NC_011060	A	6	6	4180	4185	100 %	0 %	0 %	0 %	194335186
83	NC_011060	TGC	2	6	4243	4248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194335186
84	NC_011060	ATT	2	6	4274	4279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194335186
85	NC_011060	TAAA	2	8	4282	4289	75 %	25 %	0 %	0 %	194335186
86	NC_011060	T	6	6	4366	4371	0 %	100 %	0 %	0 %	194335187
87	NC_011060	CT	3	6	4482	4487	0 %	50 %	0 %	50 %	194335187
88	NC_011060	TACG	2	8	4492	4499	25 %	25 %	25 %	25 %	194335187
89	NC_011060	CAC	2	6	4504	4509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194335187
90	NC_011060	TGC	2	6	4529	4534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194335187
91	NC_011060	TTG	2	6	4567	4572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194335187
92	NC_011060	TTG	2	6	4612	4617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194335187
93	NC_011060	AAT	2	6	4628	4633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194335187
94	NC_011060	TTC	2	6	4655	4660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194335187
95	NC_011060	TGT	2	6	4754	4759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194335187
96	NC_011060	T	7	7	4794	4800	0 %	100 %	0 %	0 %	194335187
97	NC_011060	GTT	2	6	4821	4826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194335187
98	NC_011060	ATA	2	6	4896	4901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194335187
99	NC_011060	T	6	6	4921	4926	0 %	100 %	0 %	0 %	194335187
100	NC_011060	AGT	2	6	4975	4980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194335187
101	NC_011060	GTC	2	6	4991	4996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194335187
102	NC_011060	CAT	2	6	5011	5016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194335187
103	NC_011060	TTA	2	6	5145	5150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194335187
104	NC_011060	GAC	2	6	5177	5182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194335187
105	NC_011060	GAA	2	6	5215	5220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194335187
106	NC_011060	CAA	2	6	5242	5247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194335187
107	NC_011060	TGT	2	6	5393	5398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194335187
108	NC_011060	TTTTC	2	10	5410	5419	0 %	80 %	0 %	20 %	194335187
109	NC_011060	CGT	2	6	5518	5523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194335187
110	NC_011060	CTGT	2	8	5544	5551	0 %	50 %	25 %	25 %	194335187
111	NC_011060	ATT	2	6	5553	5558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194335187
112	NC_011060	GTCAA	2	10	5680	5689	40 %	20 %	20 %	20 %	194335188
113	NC_011060	AGAAAA	2	12	5753	5764	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	194335188
114	NC_011060	ATC	2	6	5771	5776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194335188
115	NC_011060	A	6	6	5779	5784	100 %	0 %	0 %	0 %	194335188
116	NC_011060	A	6	6	5807	5812	100 %	0 %	0 %	0 %	194335188
117	NC_011060	GAA	2	6	5815	5820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194335188
118	NC_011060	GT	3	6	5858	5863	0 %	50 %	50 %	0 %	194335188
119	NC_011060	GAT	2	6	5922	5927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194335188
120	NC_011060	TA	3	6	5945	5950	50 %	50 %	0 %	0 %	194335188
121	NC_011060	TC	3	6	5960	5965	0 %	50 %	0 %	50 %	194335188
122	NC_011060	CAC	2	6	6220	6225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194335188
123	NC_011060	CTG	2	6	6228	6233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194335188
124	NC_011060	GAA	2	6	6240	6245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194335188
125	NC_011060	TCA	2	6	6256	6261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194335188
126	NC_011060	AAG	2	6	6275	6280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194335188
127	NC_011060	T	8	8	6288	6295	0 %	100 %	0 %	0 %	194335188
128	NC_011060	T	7	7	6310	6316	0 %	100 %	0 %	0 %	194335188
129	NC_011060	GGT	2	6	6414	6419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194335188
130	NC_011060	T	8	8	6487	6494	0 %	100 %	0 %	0 %	194335188
131	NC_011060	GTT	3	9	6510	6518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194335188
132	NC_011060	GCA	2	6	6627	6632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194335188
133	NC_011060	CT	4	8	6667	6674	0 %	50 %	0 %	50 %	194335188
134	NC_011060	TCA	2	6	6732	6737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194335188
135	NC_011060	AG	3	6	6778	6783	50 %	0 %	50 %	0 %	194335188
136	NC_011060	CT	3	6	6902	6907	0 %	50 %	0 %	50 %	194335188
137	NC_011060	TGC	2	6	6994	6999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194335188
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142	NC_011060	AG	3	6	7083	7088	50 %	0 %	50 %	0 %	194335188
143	NC_011060	CAT	2	6	7189	7194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194335188
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153	NC_011060	TGT	2	6	7733	7738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194335188
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159	NC_011060	A	6	6	7916	7921	100 %	0 %	0 %	0 %	194335188
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163	NC_011060	TCA	2	6	8228	8233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194335189
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167	NC_011060	GTC	2	6	8397	8402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194335189
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172	NC_011060	TGT	2	6	8499	8504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194335189
173	NC_011060	T	7	7	8603	8609	0 %	100 %	0 %	0 %	194335189
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267	NC_011060	GCC	2	6	13893	13898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194335195
268	NC_011060	ATG	2	6	13975	13980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194335195
269	NC_011060	TGT	2	6	14036	14041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194335195
270	NC_011060	ATT	2	6	14072	14077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194335195
271	NC_011060	ATCT	2	8	14148	14155	25 %	50 %	0 %	25 %	194335195
272	NC_011060	GGT	2	6	14181	14186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194335195
273	NC_011060	TTA	2	6	14188	14193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194335195
274	NC_011060	TGGA	2	8	14323	14330	25 %	25 %	50 %	0 %	194335195
275	NC_011060	TGT	2	6	14348	14353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194335195
276	NC_011060	ATT	2	6	14466	14471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194335195
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280	NC_011060	TTA	2	6	14573	14578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194335195
281	NC_011060	CTG	2	6	14856	14861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194335195
282	NC_011060	TGA	2	6	14905	14910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194335195
283	NC_011060	AG	3	6	14952	14957	50 %	0 %	50 %	0 %	194335195
284	NC_011060	TGT	2	6	14968	14973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194335195
285	NC_011060	TCA	2	6	14974	14979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194335195
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288	NC_011060	GTG	2	6	15180	15185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194335196
289	NC_011060	TTCG	2	8	15220	15227	0 %	50 %	25 %	25 %	194335196
290	NC_011060	GTATG	2	10	15266	15275	20 %	40 %	40 %	0 %	194335196
291	NC_011060	TTG	2	6	15448	15453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194335196
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293	NC_011060	ATG	2	6	15535	15540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194335196
294	NC_011060	GGC	2	6	15573	15578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194335196
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302	NC_011060	TGC	2	6	16096	16101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194335197
303	NC_011060	ATC	3	9	16112	16120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194335197
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383	NC_011060	GCAA	2	8	20211	20218	50 %	0 %	25 %	25 %	194335200
384	NC_011060	GCC	2	6	20229	20234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194335200
385	NC_011060	CTT	2	6	20240	20245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194335200
386	NC_011060	CCG	3	9	20305	20313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194335200
387	NC_011060	GTT	2	6	20373	20378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194335200
388	NC_011060	ATC	2	6	20406	20411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194335200
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390	NC_011060	GGC	2	6	20665	20670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194335201
391	NC_011060	GAGAA	2	10	20711	20720	60 %	0 %	40 %	0 %	194335201
392	NC_011060	CGG	2	6	20792	20797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194335201
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394	NC_011060	TGA	2	6	20891	20896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194335201
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