MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1 chromosome

Total Repeats: 22884

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010531	CTG	2	6	62168	62173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171462886
1002	NC_010531	TAC	2	6	62209	62214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171462886
1003	NC_010531	TGA	2	6	62262	62267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171462886
1004	NC_010531	GCT	2	6	62299	62304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171462886
1005	NC_010531	GTT	2	6	62616	62621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171462888
1006	NC_010531	A	6	6	62635	62640	100 %	0 %	0 %	0 %	171462888
1007	NC_010531	GTTG	2	8	62651	62658	0 %	50 %	50 %	0 %	171462888
1008	NC_010531	GGC	2	6	63099	63104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171462889
1009	NC_010531	CGT	2	6	63111	63116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171462889
1010	NC_010531	TCA	2	6	63136	63141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171462889
1011	NC_010531	CTG	2	6	63157	63162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171462889
1012	NC_010531	A	7	7	63179	63185	100 %	0 %	0 %	0 %	171462889
1013	NC_010531	GTA	2	6	63204	63209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171462889
1014	NC_010531	TC	3	6	63369	63374	0 %	50 %	0 %	50 %	171462889
1015	NC_010531	GCAA	2	8	63457	63464	50 %	0 %	25 %	25 %	171462890
1016	NC_010531	GGC	2	6	63561	63566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171462890
1017	NC_010531	AGC	2	6	63667	63672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171462890
1018	NC_010531	AGT	2	6	63762	63767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171462891
1019	NC_010531	A	6	6	63940	63945	100 %	0 %	0 %	0 %	171462891
1020	NC_010531	TCGTT	2	10	64032	64041	0 %	60 %	20 %	20 %	171462891
1021	NC_010531	ACA	2	6	64112	64117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171462891
1022	NC_010531	ACG	2	6	64198	64203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171462891
1023	NC_010531	CGA	2	6	64215	64220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171462891
1024	NC_010531	GGC	2	6	64239	64244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171462891
1025	NC_010531	GC	3	6	64314	64319	0 %	0 %	50 %	50 %	171462892
1026	NC_010531	ATCA	2	8	64376	64383	50 %	25 %	0 %	25 %	171462892
1027	NC_010531	GTT	2	6	64466	64471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171462892
1028	NC_010531	AGC	2	6	64584	64589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171462892
1029	NC_010531	CGT	2	6	64691	64696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171462893
1030	NC_010531	AATG	2	8	64896	64903	50 %	25 %	25 %	0 %	171462893
1031	NC_010531	ATT	2	6	64918	64923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	171462893
1032	NC_010531	GCG	2	6	64976	64981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171462893
1033	NC_010531	AAG	2	6	65003	65008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171462893
1034	NC_010531	AAG	2	6	65148	65153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171462894
1035	NC_010531	TCAG	2	8	65203	65210	25 %	25 %	25 %	25 %	171462894
1036	NC_010531	AAC	2	6	65231	65236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171462894
1037	NC_010531	GTT	2	6	65240	65245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171462894
1038	NC_010531	ACT	2	6	65252	65257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171462894
1039	NC_010531	TAG	2	6	65280	65285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171462894
1040	NC_010531	TGC	3	9	65299	65307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171462894
1041	NC_010531	ATT	2	6	65351	65356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	171462894
1042	NC_010531	CAA	2	6	65422	65427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171462894
1043	NC_010531	GCA	2	6	65428	65433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171462894
1044	NC_010531	GAAA	2	8	65527	65534	75 %	0 %	25 %	0 %	171462894
1045	NC_010531	AAG	3	9	65537	65545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171462894
1046	NC_010531	AGC	2	6	65705	65710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171462895
1047	NC_010531	CAA	2	6	65716	65721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171462895
1048	NC_010531	GTT	2	6	65820	65825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171462895
1049	NC_010531	TGA	2	6	65970	65975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171462896
1050	NC_010531	AGA	2	6	65987	65992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171462896
1051	NC_010531	AGT	2	6	66060	66065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171462896
1052	NC_010531	TGGCGA	2	12	66066	66077	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	171462896
1053	NC_010531	AAG	2	6	66110	66115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171462896
1054	NC_010531	TCG	2	6	66150	66155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171462896
1055	NC_010531	GAT	2	6	66159	66164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171462896
1056	NC_010531	GCA	2	6	66192	66197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171462896
1057	NC_010531	ATT	2	6	66262	66267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	171462896
1058	NC_010531	TGG	2	6	66270	66275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171462896
1059	NC_010531	TGCG	2	8	66281	66288	0 %	25 %	50 %	25 %	171462896
1060	NC_010531	CAA	2	6	66338	66343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171462896
1061	NC_010531	CTG	2	6	66398	66403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171462896
1062	NC_010531	TGC	2	6	66408	66413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171462896
1063	NC_010531	ACA	2	6	66478	66483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171462897
1064	NC_010531	TAA	2	6	66627	66632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	171462897
1065	NC_010531	TAA	2	6	66661	66666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	171462897
1066	NC_010531	TCG	2	6	66735	66740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171462898
1067	NC_010531	CTG	2	6	66779	66784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171462898
1068	NC_010531	TGG	2	6	66816	66821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171462898
1069	NC_010531	TCG	2	6	66864	66869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171462898
1070	NC_010531	CGT	2	6	66901	66906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171462898
1071	NC_010531	AGC	2	6	67086	67091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171462898
1072	NC_010531	AGC	2	6	67098	67103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171462898
1073	NC_010531	GGC	2	6	67105	67110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171462898
1074	NC_010531	GCA	2	6	67182	67187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171462899
1075	NC_010531	GGC	2	6	67191	67196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171462899
1076	NC_010531	GGC	2	6	67359	67364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171462899
1077	NC_010531	ATC	2	6	67422	67427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171462899
1078	NC_010531	CTT	2	6	67453	67458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171462899
1079	NC_010531	AAGG	2	8	67473	67480	50 %	0 %	50 %	0 %	171462899
1080	NC_010531	GTT	2	6	67590	67595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171462899
1081	NC_010531	CAT	2	6	67709	67714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171462899
1082	NC_010531	CGG	2	6	67721	67726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171462899
1083	NC_010531	TGGC	2	8	67957	67964	0 %	25 %	50 %	25 %	171462899
1084	NC_010531	TAT	2	6	67991	67996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	171462899
1085	NC_010531	GCTG	2	8	68016	68023	0 %	25 %	50 %	25 %	171462899
1086	NC_010531	CCAA	2	8	68040	68047	50 %	0 %	0 %	50 %	171462899
1087	NC_010531	ATT	2	6	68061	68066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	171462899
1088	NC_010531	ATT	2	6	68130	68135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	171462899
1089	NC_010531	TTC	2	6	68136	68141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171462899
1090	NC_010531	TCT	2	6	68146	68151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171462899
1091	NC_010531	CTG	2	6	68182	68187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171462899
1092	NC_010531	GAA	2	6	68195	68200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171462899
1093	NC_010531	TTA	2	6	68313	68318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	171462899
1094	NC_010531	TTG	2	6	68373	68378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171462899
1095	NC_010531	ATT	2	6	68379	68384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	171462899
1096	NC_010531	GTT	2	6	68385	68390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171462899
1097	NC_010531	GCA	3	9	68432	68440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171462899
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1099	NC_010531	A	6	6	68457	68462	100 %	0 %	0 %	0 %	171462899
1100	NC_010531	AG	3	6	68532	68537	50 %	0 %	50 %	0 %	171462900
1101	NC_010531	CG	3	6	68678	68683	0 %	0 %	50 %	50 %	171462900
1102	NC_010531	TTC	2	6	68824	68829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171462901
1103	NC_010531	AGC	2	6	68844	68849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171462901
1104	NC_010531	ATC	2	6	68916	68921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171462902
1105	NC_010531	ACA	2	6	68990	68995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171462902
1106	NC_010531	A	6	6	69011	69016	100 %	0 %	0 %	0 %	171462902
1107	NC_010531	TGA	2	6	69055	69060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171462902
1108	NC_010531	TCG	2	6	69091	69096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171462902
1109	NC_010531	CG	3	6	69199	69204	0 %	0 %	50 %	50 %	171462902
1110	NC_010531	AAT	2	6	69246	69251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	171462902
1111	NC_010531	CAA	2	6	69275	69280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171462903
1112	NC_010531	CTG	2	6	69285	69290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171462903
1113	NC_010531	GCT	2	6	69293	69298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171462903
1114	NC_010531	GC	3	6	69304	69309	0 %	0 %	50 %	50 %	171462903
1115	NC_010531	TAA	2	6	69367	69372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	171462903
1116	NC_010531	TAT	2	6	69376	69381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	171462903
1117	NC_010531	GGC	2	6	69428	69433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171462903
1118	NC_010531	TGC	2	6	69469	69474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171462903
1119	NC_010531	GCCCAG	2	12	69549	69560	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171462903
1120	NC_010531	CAG	2	6	69570	69575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171462903
1121	NC_010531	TCC	2	6	69652	69657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171462903
1122	NC_010531	CGT	3	9	69662	69670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171462903
1123	NC_010531	ATA	2	6	69898	69903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	171462904
1124	NC_010531	CAAT	2	8	69953	69960	50 %	25 %	0 %	25 %	171462904
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