MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida W619 chromosome

Total Repeats: 109437

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010501	GCA	2	6	403	408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170719188
2	NC_010501	CTGC	2	8	434	441	0 %	25 %	25 %	50 %	170719188
3	NC_010501	TCCG	2	8	462	469	0 %	25 %	25 %	50 %	170719188
4	NC_010501	CGA	2	6	490	495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170719188
5	NC_010501	TGAA	2	8	537	544	50 %	25 %	25 %	0 %	170719188
6	NC_010501	TTA	2	6	611	616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170719188
7	NC_010501	CAGC	2	8	707	714	25 %	0 %	25 %	50 %	170719188
8	NC_010501	CTG	2	6	759	764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719188
9	NC_010501	CGT	2	6	795	800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719188
10	NC_010501	GCA	2	6	971	976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170719188
11	NC_010501	ATGC	2	8	1061	1068	25 %	25 %	25 %	25 %	170719188
12	NC_010501	ACC	2	6	1077	1082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170719188
13	NC_010501	GAA	3	9	1087	1095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170719188
14	NC_010501	GGT	2	6	1108	1113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170719188
15	NC_010501	TCG	2	6	1134	1139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719188
16	NC_010501	CGA	2	6	1219	1224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170719188
17	NC_010501	TTC	2	6	1232	1237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170719188
18	NC_010501	AGG	2	6	1257	1262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170719188
19	NC_010501	CAG	2	6	1301	1306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170719188
20	NC_010501	TGA	2	6	1434	1439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170719188
21	NC_010501	TTC	2	6	1484	1489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170719188
22	NC_010501	ACGT	2	8	1512	1519	25 %	25 %	25 %	25 %	170719188
23	NC_010501	CTG	2	6	1613	1618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719188
24	NC_010501	TAC	2	6	1673	1678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170719188
25	NC_010501	AAGATC	2	12	1679	1690	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	170719188
26	NC_010501	TGT	2	6	1698	1703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170719188
27	NC_010501	GC	3	6	1727	1732	0 %	0 %	50 %	50 %	170719188
28	NC_010501	ACCA	2	8	1769	1776	50 %	0 %	0 %	50 %	170719188
29	NC_010501	GGC	2	6	1805	1810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170719188
30	NC_010501	ACCAC	2	10	1815	1824	40 %	0 %	0 %	60 %	170719188
31	NC_010501	TGC	2	6	1827	1832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719188
32	NC_010501	CTG	2	6	1898	1903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719188
33	NC_010501	CAC	2	6	1912	1917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170719188
34	NC_010501	GTC	2	6	2019	2024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719189
35	NC_010501	CTG	2	6	2061	2066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719189
36	NC_010501	CAG	2	6	2079	2084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170719189
37	NC_010501	GCCG	2	8	2144	2151	0 %	0 %	50 %	50 %	170719189
38	NC_010501	GC	3	6	2175	2180	0 %	0 %	50 %	50 %	170719189
39	NC_010501	ACG	2	6	2212	2217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170719189
40	NC_010501	CGA	2	6	2237	2242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170719189
41	NC_010501	GGCC	2	8	2261	2268	0 %	0 %	50 %	50 %	170719189
42	NC_010501	GCCA	2	8	2294	2301	25 %	0 %	25 %	50 %	170719189
43	NC_010501	GAA	2	6	2319	2324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170719189
44	NC_010501	GAGCA	2	10	2352	2361	40 %	0 %	40 %	20 %	170719189
45	NC_010501	CGT	2	6	2367	2372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719189
46	NC_010501	CAG	2	6	2403	2408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170719189
47	NC_010501	ACGT	2	8	2410	2417	25 %	25 %	25 %	25 %	170719189
48	NC_010501	TAC	2	6	2418	2423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170719189
49	NC_010501	TCA	2	6	2534	2539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170719189
50	NC_010501	GC	3	6	2574	2579	0 %	0 %	50 %	50 %	170719189
51	NC_010501	CAC	2	6	2625	2630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170719189
52	NC_010501	GTG	2	6	2716	2721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170719189
53	NC_010501	AAC	2	6	2847	2852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170719189
54	NC_010501	GAA	2	6	2871	2876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170719189
55	NC_010501	TGA	2	6	2953	2958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170719189
56	NC_010501	CTG	2	6	3006	3011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719189
57	NC_010501	GAC	2	6	3027	3032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170719189
58	NC_010501	C	6	6	3145	3150	0 %	0 %	0 %	100 %	170719190
59	NC_010501	GCAG	2	8	3272	3279	25 %	0 %	50 %	25 %	170719190
60	NC_010501	GT	3	6	3334	3339	0 %	50 %	50 %	0 %	170719190
61	NC_010501	GCGG	2	8	3347	3354	0 %	0 %	75 %	25 %	170719190
62	NC_010501	CGC	2	6	3395	3400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170719190
63	NC_010501	CTG	2	6	3414	3419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719190
64	NC_010501	TCA	2	6	3430	3435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170719190
65	NC_010501	GCC	2	6	3609	3614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170719190
66	NC_010501	CTA	2	6	3743	3748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170719190
67	NC_010501	CCT	2	6	3790	3795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170719190
68	NC_010501	CT	3	6	3794	3799	0 %	50 %	0 %	50 %	170719190
69	NC_010501	CAG	2	6	3810	3815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170719190
70	NC_010501	TGG	2	6	3913	3918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170719190
71	NC_010501	CGC	2	6	3963	3968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170719190
72	NC_010501	GAC	2	6	4011	4016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170719190
73	NC_010501	AGA	2	6	4046	4051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170719190
74	NC_010501	TCA	2	6	4069	4074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170719190
75	NC_010501	CAC	2	6	4303	4308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170719191
76	NC_010501	TCGA	2	8	4333	4340	25 %	25 %	25 %	25 %	170719191
77	NC_010501	AGA	2	6	4446	4451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170719191
78	NC_010501	TCA	2	6	4472	4477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170719191
79	NC_010501	TGA	2	6	4506	4511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170719191
80	NC_010501	CGG	2	6	4530	4535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170719191
81	NC_010501	GTA	2	6	4558	4563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170719191
82	NC_010501	GCGAAA	2	12	4667	4678	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	170719191
83	NC_010501	TCCT	2	8	4774	4781	0 %	50 %	0 %	50 %	170719191
84	NC_010501	CTG	2	6	4801	4806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719191
85	NC_010501	AGA	2	6	4827	4832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170719191
86	NC_010501	TTC	2	6	4834	4839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170719191
87	NC_010501	GGC	2	6	4849	4854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170719191
88	NC_010501	CAA	2	6	4884	4889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170719191
89	NC_010501	CTG	2	6	4990	4995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719191
90	NC_010501	CAA	2	6	5004	5009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170719191
91	NC_010501	TGGT	2	8	5039	5046	0 %	50 %	50 %	0 %	170719191
92	NC_010501	AAG	2	6	5104	5109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170719191
93	NC_010501	CCA	2	6	5120	5125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170719191
94	NC_010501	AGTTC	2	10	5186	5195	20 %	40 %	20 %	20 %	170719191
95	NC_010501	CCG	2	6	5234	5239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170719191
96	NC_010501	GAT	2	6	5316	5321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170719191
97	NC_010501	TGCCCG	2	12	5328	5339	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	170719191
98	NC_010501	GCG	2	6	5344	5349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170719191
99	NC_010501	GC	3	6	5381	5386	0 %	0 %	50 %	50 %	170719191
100	NC_010501	TGG	2	6	5459	5464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170719191
101	NC_010501	CAAG	2	8	5490	5497	50 %	0 %	25 %	25 %	170719191
102	NC_010501	CGT	2	6	5506	5511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719191
103	NC_010501	GAT	2	6	5574	5579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170719191
104	NC_010501	ACA	2	6	5642	5647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170719191
105	NC_010501	CAT	4	12	5670	5681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170719191
106	NC_010501	CTG	3	9	5719	5727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719191
107	NC_010501	CTT	3	9	5730	5738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170719191
108	NC_010501	CTACAT	2	12	5769	5780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170719191
109	NC_010501	GAA	2	6	5805	5810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170719191
110	NC_010501	GAC	2	6	5836	5841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170719191
111	NC_010501	GAA	2	6	5851	5856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170719191
112	NC_010501	TGA	2	6	5963	5968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170719191
113	NC_010501	TG	3	6	6168	6173	0 %	50 %	50 %	0 %	170719191
114	NC_010501	GCA	2	6	6242	6247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170719191
115	NC_010501	GGT	2	6	6261	6266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170719191
116	NC_010501	CTG	2	6	6292	6297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719191
117	NC_010501	GTG	2	6	6320	6325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170719191
118	NC_010501	TCG	2	6	6341	6346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719191
119	NC_010501	AAGG	2	8	6352	6359	50 %	0 %	50 %	0 %	170719191
120	NC_010501	TGA	2	6	6371	6376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170719191
121	NC_010501	ACC	2	6	6382	6387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170719191
122	NC_010501	ACC	2	6	6451	6456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170719191
123	NC_010501	ACG	2	6	6471	6476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170719191
124	NC_010501	GCC	2	6	6508	6513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170719191
125	NC_010501	GGT	2	6	7461	7466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170719192
126	NC_010501	CGG	2	6	7471	7476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170719192
127	NC_010501	CTT	2	6	7564	7569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170719192
128	NC_010501	GTG	2	6	7689	7694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170719192
129	NC_010501	TGAAG	2	10	7698	7707	40 %	20 %	40 %	0 %	170719192
130	NC_010501	CGAC	2	8	7713	7720	25 %	0 %	25 %	50 %	170719192
131	NC_010501	GGA	2	6	7893	7898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170719192
132	NC_010501	GCC	2	6	7923	7928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170719192
133	NC_010501	TGGT	2	8	7955	7962	0 %	50 %	50 %	0 %	170719192
134	NC_010501	GTG	2	6	7996	8001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170719192
135	NC_010501	G	6	6	8053	8058	0 %	0 %	100 %	0 %	170719192
136	NC_010501	GTC	2	6	8096	8101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719193
137	NC_010501	TCGT	2	8	8103	8110	0 %	50 %	25 %	25 %	170719193
138	NC_010501	GCT	2	6	8152	8157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170719193
139	NC_010501	CGAGAT	2	12	8227	8238	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	170719193
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141	NC_010501	GAC	2	6	8354	8359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170719193
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143	NC_010501	AAG	2	6	8408	8413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170719193
144	NC_010501	TGCG	2	8	8443	8450	0 %	25 %	50 %	25 %	170719193
145	NC_010501	GTA	2	6	8504	8509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170719193
146	NC_010501	TAA	2	6	8590	8595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170719193
147	NC_010501	ACCT	2	8	8597	8604	25 %	25 %	0 %	50 %	170719193
148	NC_010501	AG	3	6	8662	8667	50 %	0 %	50 %	0 %	170719193
149	NC_010501	GCA	2	6	8783	8788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170719193
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151	NC_010501	GCG	2	6	8807	8812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170719193
152	NC_010501	TTG	2	6	8864	8869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170719193
153	NC_010501	TC	3	6	8943	8948	0 %	50 %	0 %	50 %	170719193
154	NC_010501	TGG	2	6	9074	9079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170719193
155	NC_010501	TCA	2	6	9141	9146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170719193
156	NC_010501	AAAGG	2	10	9201	9210	60 %	0 %	40 %	0 %	170719193
157	NC_010501	CA	3	6	9232	9237	50 %	0 %	0 %	50 %	170719193
158	NC_010501	ACC	2	6	9269	9274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170719193
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161	NC_010501	GGT	2	6	9349	9354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170719193
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164	NC_010501	CTC	2	6	9387	9392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170719193
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166	NC_010501	TCA	2	6	9453	9458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170719193
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172	NC_010501	CAG	2	6	9972	9977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170719193
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252	NC_010501	CAT	2	6	14923	14928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170719199
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261	NC_010501	GCC	2	6	15383	15388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170719199
262	NC_010501	T	7	7	15405	15411	0 %	100 %	0 %	0 %	170719199
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265	NC_010501	GCCAG	2	10	15593	15602	20 %	0 %	40 %	40 %	170719200
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274	NC_010501	G	6	6	16079	16084	0 %	0 %	100 %	0 %	170719200
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283	NC_010501	GCTT	2	8	16692	16699	0 %	50 %	25 %	25 %	170719201
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341	NC_010501	CTTTCA	2	12	20226	20237	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	170719205
342	NC_010501	GCA	2	6	20238	20243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170719205
343	NC_010501	TGA	2	6	20246	20251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170719205
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378	NC_010501	GC	3	6	22632	22637	0 %	0 %	50 %	50 %	170719207
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387	NC_010501	CAG	2	6	23335	23340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170719208
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500	NC_010501	CGC	2	6	29807	29812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170719213

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