MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida GB-1 chromosome

Total Repeats: 119320

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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112002	NC_010322	CAT	2	6	5713161	5713166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167036100
112003	NC_010322	AGC	2	6	5713217	5713222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167036100
112004	NC_010322	GCA	2	6	5713275	5713280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167036100
112005	NC_010322	TGA	2	6	5713290	5713295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167036100
112006	NC_010322	TCAGC	2	10	5713401	5713410	20 %	20 %	20 %	40 %	167036100
112007	NC_010322	CGG	2	6	5713455	5713460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167036100
112008	NC_010322	CGT	2	6	5713623	5713628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167036100
112009	NC_010322	CAGC	2	8	5713695	5713702	25 %	0 %	25 %	50 %	167036100
112010	NC_010322	CTG	2	6	5713714	5713719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167036100
112011	NC_010322	CG	3	6	5713768	5713773	0 %	0 %	50 %	50 %	167036100
112012	NC_010322	AC	3	6	5713986	5713991	50 %	0 %	0 %	50 %	167036101
112013	NC_010322	CACG	2	8	5714034	5714041	25 %	0 %	25 %	50 %	167036101
112014	NC_010322	CGT	2	6	5714085	5714090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167036101
112015	NC_010322	GCT	2	6	5714118	5714123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167036101
112016	NC_010322	CTCG	2	8	5714152	5714159	0 %	25 %	25 %	50 %	167036101
112017	NC_010322	GGCT	2	8	5714181	5714188	0 %	25 %	50 %	25 %	167036101
112018	NC_010322	CAT	2	6	5714215	5714220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167036101
112019	NC_010322	CAT	2	6	5714233	5714238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167036101
112020	NC_010322	CTT	2	6	5714301	5714306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167036101
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112025	NC_010322	CAG	2	6	5714557	5714562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167036101
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112032	NC_010322	CGA	2	6	5714706	5714711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167036101
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112045	NC_010322	GCA	2	6	5715401	5715406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167036101
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112047	NC_010322	GGCT	2	8	5715579	5715586	0 %	25 %	50 %	25 %	167036101
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112049	NC_010322	CAG	2	6	5715643	5715648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167036101
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112052	NC_010322	GAC	2	6	5715763	5715768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167036101
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112112	NC_010322	GC	3	6	5719399	5719404	0 %	0 %	50 %	50 %	167036104
112113	NC_010322	ACCT	2	8	5719415	5719422	25 %	25 %	0 %	50 %	167036104
112114	NC_010322	GCCCGC	2	12	5719451	5719462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167036104
112115	NC_010322	TCGCC	2	10	5719491	5719500	0 %	20 %	20 %	60 %	167036104
112116	NC_010322	GCT	2	6	5719504	5719509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167036104
112117	NC_010322	CG	3	6	5719530	5719535	0 %	0 %	50 %	50 %	167036104
112118	NC_010322	CTG	2	6	5719538	5719543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167036104
112119	NC_010322	ACC	2	6	5719602	5719607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167036104
112120	NC_010322	GCT	2	6	5719660	5719665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167036104
112121	NC_010322	TGG	2	6	5719667	5719672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167036104
112122	NC_010322	CCAG	2	8	5719675	5719682	25 %	0 %	25 %	50 %	167036104
112123	NC_010322	GGT	2	6	5719745	5719750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167036104
112124	NC_010322	CGA	2	6	5720077	5720082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167036104
112125	NC_010322	CGA	2	6	5720155	5720160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167036104
112126	NC_010322	GCATG	2	10	5720191	5720200	20 %	20 %	40 %	20 %	167036104
112127	NC_010322	ATC	2	6	5720240	5720245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167036104
112128	NC_010322	CCA	2	6	5720262	5720267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167036104
112129	NC_010322	GCA	2	6	5720325	5720330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167036104
112130	NC_010322	GTGAA	2	10	5720382	5720391	40 %	20 %	40 %	0 %	167036104
112131	NC_010322	TGG	2	6	5720714	5720719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167036105
112132	NC_010322	GTC	2	6	5720745	5720750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167036105
112133	NC_010322	TCA	2	6	5720774	5720779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167036105
112134	NC_010322	TGG	2	6	5720811	5720816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167036105
112135	NC_010322	CAT	2	6	5720820	5720825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167036105
112136	NC_010322	CAA	2	6	5720829	5720834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167036105
112137	NC_010322	TGG	2	6	5720852	5720857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167036105
112138	NC_010322	CGG	2	6	5720889	5720894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167036105
112139	NC_010322	TGA	2	6	5720963	5720968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167036105
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112141	NC_010322	GCC	2	6	5720995	5721000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167036105
112142	NC_010322	CTG	2	6	5721031	5721036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167036105
112143	NC_010322	CGC	2	6	5721063	5721068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167036105
112144	NC_010322	GCT	2	6	5721081	5721086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167036105
112145	NC_010322	GGC	2	6	5721088	5721093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167036105
112146	NC_010322	GCA	2	6	5721140	5721145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167036105
112147	NC_010322	CTG	2	6	5721223	5721228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167036105
112148	NC_010322	TGC	2	6	5721236	5721241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167036105
112149	NC_010322	CGG	2	6	5721255	5721260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167036105
112150	NC_010322	GCG	2	6	5721275	5721280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167036105
112151	NC_010322	GCTG	2	8	5721281	5721288	0 %	25 %	50 %	25 %	167036105
112152	NC_010322	TGC	2	6	5721290	5721295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167036105
112153	NC_010322	CGG	2	6	5721321	5721326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167036105
112154	NC_010322	CGG	2	6	5721351	5721356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167036105
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112160	NC_010322	CTG	2	6	5721547	5721552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167036105
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112164	NC_010322	CTG	2	6	5721628	5721633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167036105
112165	NC_010322	GCGCG	2	10	5721687	5721696	0 %	0 %	60 %	40 %	167036105
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112169	NC_010322	CTG	2	6	5721790	5721795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167036105
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112179	NC_010322	ACC	2	6	5722530	5722535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167036106
112180	NC_010322	GCA	2	6	5722604	5722609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167036106
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112182	NC_010322	AGC	2	6	5722678	5722683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167036106
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112185	NC_010322	AAAGC	2	10	5722744	5722753	60 %	0 %	20 %	20 %	167036106
112186	NC_010322	CCTG	2	8	5722754	5722761	0 %	25 %	25 %	50 %	167036106
112187	NC_010322	AGCG	2	8	5722812	5722819	25 %	0 %	50 %	25 %	167036106
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112191	NC_010322	CAG	3	9	5722916	5722924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167036106
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112197	NC_010322	CTG	2	6	5723079	5723084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167036106
112198	NC_010322	CTG	2	6	5723112	5723117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167036106
112199	NC_010322	GC	3	6	5723123	5723128	0 %	0 %	50 %	50 %	167036106
112200	NC_010322	CG	3	6	5723129	5723134	0 %	0 %	50 %	50 %	167036106
112201	NC_010322	AGG	2	6	5723197	5723202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167036106
112202	NC_010322	CAG	2	6	5723211	5723216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167036106
112203	NC_010322	TCGA	2	8	5723217	5723224	25 %	25 %	25 %	25 %	167036106
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112205	NC_010322	CAG	2	6	5723243	5723248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167036106
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112207	NC_010322	CAG	2	6	5723331	5723336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167036106
112208	NC_010322	AGC	3	9	5723350	5723358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167036106
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112210	NC_010322	GCT	2	6	5723579	5723584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167036106
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112212	NC_010322	CTG	2	6	5723661	5723666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167036106
112213	NC_010322	AGC	2	6	5723731	5723736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167036106
112214	NC_010322	CAC	2	6	5723762	5723767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167036106
112215	NC_010322	CGA	2	6	5723771	5723776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167036106
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112217	NC_010322	GGACTG	2	12	5723810	5723821	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	167036106
112218	NC_010322	TGT	2	6	5723920	5723925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167036106
112219	NC_010322	CTG	3	9	5723934	5723942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167036106
112220	NC_010322	CTG	2	6	5723955	5723960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167036106
112221	NC_010322	GGC	2	6	5723962	5723967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167036106
112222	NC_010322	CCG	2	6	5724020	5724025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167036106
112223	NC_010322	TCA	2	6	5724058	5724063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167036106
112224	NC_010322	CTG	2	6	5724069	5724074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167036106
112225	NC_010322	CTGG	2	8	5724182	5724189	0 %	25 %	50 %	25 %	167036106
112226	NC_010322	GTGGC	2	10	5724223	5724232	0 %	20 %	60 %	20 %	167036106
112227	NC_010322	CGC	2	6	5724288	5724293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167036106
112228	NC_010322	GTG	2	6	5724303	5724308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167036106
112229	NC_010322	GTG	2	6	5724324	5724329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167036106
112230	NC_010322	CGA	2	6	5724362	5724367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167036106
112231	NC_010322	GTG	2	6	5724384	5724389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167036106
112232	NC_010322	GCT	2	6	5724416	5724421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167036106
112233	NC_010322	GCC	2	6	5724424	5724429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167036106
112234	NC_010322	TGC	2	6	5724430	5724435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167036106
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112240	NC_010322	CTGG	2	8	5724599	5724606	0 %	25 %	50 %	25 %	167036106
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112249	NC_010322	CTG	2	6	5724930	5724935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167036106
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112259	NC_010322	ATCCGC	2	12	5725284	5725295	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	167036106
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112331	NC_010322	ATG	2	6	5728821	5728826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167036110
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112336	NC_010322	CCA	2	6	5729047	5729052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167036110
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112338	NC_010322	GCT	2	6	5729129	5729134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167036110
112339	NC_010322	CGA	2	6	5729219	5729224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167036110
112340	NC_010322	GCC	2	6	5729283	5729288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167036110
112341	NC_010322	CCTG	2	8	5729308	5729315	0 %	25 %	25 %	50 %	167036110
112342	NC_010322	GCC	2	6	5729332	5729337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167036110
112343	NC_010322	CGA	2	6	5729358	5729363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167036110
112344	NC_010322	CTG	2	6	5729414	5729419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167036110
112345	NC_010322	GCT	2	6	5729446	5729451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167036110
112346	NC_010322	GCG	2	6	5729454	5729459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167036110
112347	NC_010322	ATG	2	6	5729517	5729522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167036110
112348	NC_010322	CCCG	2	8	5729620	5729627	0 %	0 %	25 %	75 %	167036111
112349	NC_010322	CTG	2	6	5729634	5729639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167036111
112350	NC_010322	C	6	6	5729643	5729648	0 %	0 %	0 %	100 %	167036111
112351	NC_010322	GCG	2	6	5729739	5729744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167036111
112352	NC_010322	CTG	2	6	5729762	5729767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167036111
112353	NC_010322	GAT	2	6	5729782	5729787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167036111
112354	NC_010322	GCT	2	6	5729791	5729796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167036111
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112356	NC_010322	CTG	2	6	5729873	5729878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167036111
112357	NC_010322	GCC	2	6	5729942	5729947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167036111
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112359	NC_010322	CGG	2	6	5730109	5730114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167036111
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112364	NC_010322	GAT	2	6	5730271	5730276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167036111
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112404	NC_010322	CGGC	2	8	5732343	5732350	0 %	0 %	50 %	50 %	167036113
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112409	NC_010322	TGC	2	6	5732747	5732752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167036114
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112413	NC_010322	TTC	2	6	5732975	5732980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167036114
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112437	NC_010322	CG	3	6	5734240	5734245	0 %	0 %	50 %	50 %	167036115
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112440	NC_010322	CGA	2	6	5734321	5734326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167036115
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112443	NC_010322	ACA	2	6	5734458	5734463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167036115
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112445	NC_010322	GCC	2	6	5734526	5734531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167036115
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112447	NC_010322	CGA	2	6	5734558	5734563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167036115
112448	NC_010322	GGC	2	6	5734599	5734604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167036115
112449	NC_010322	TGCAGG	2	12	5734662	5734673	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	167036115
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112451	NC_010322	GGC	2	6	5734745	5734750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167036115
112452	NC_010322	CCA	2	6	5734879	5734884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167036115
112453	NC_010322	CGG	2	6	5734913	5734918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167036115
112454	NC_010322	CAG	2	6	5734973	5734978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167036115
112455	NC_010322	CTG	2	6	5734997	5735002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167036115
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112471	NC_010322	GCC	2	6	5735711	5735716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167036115
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112481	NC_010322	GCC	2	6	5736231	5736236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167036115
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112492	NC_010322	CCA	2	6	5736583	5736588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167036115
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112495	NC_010322	CG	3	6	5736719	5736724	0 %	0 %	50 %	50 %	167036115
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112497	NC_010322	GGCG	2	8	5736854	5736861	0 %	0 %	75 %	25 %	167036115
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112500	NC_010322	GAA	2	6	5737016	5737021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036115

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