MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida GB-1 chromosome

Total Repeats: 119320

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
105501	NC_010322	TCG	2	6	5398880	5398885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035822
105502	NC_010322	TGTTC	2	10	5398914	5398923	0 %	60 %	20 %	20 %	167035822
105503	NC_010322	CAG	2	6	5398981	5398986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035822
105504	NC_010322	GCA	2	6	5399000	5399005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035822
105505	NC_010322	GC	3	6	5399057	5399062	0 %	0 %	50 %	50 %	167035822
105506	NC_010322	GTG	2	6	5399063	5399068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167035822
105507	NC_010322	GCG	2	6	5399069	5399074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167035822
105508	NC_010322	CTC	2	6	5399131	5399136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167035822
105509	NC_010322	GCC	2	6	5399213	5399218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167035822
105510	NC_010322	GGCG	2	8	5399389	5399396	0 %	0 %	75 %	25 %	167035823
105511	NC_010322	C	6	6	5399427	5399432	0 %	0 %	0 %	100 %	167035823
105512	NC_010322	CTCCCG	2	12	5399453	5399464	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	167035823
105513	NC_010322	GGC	2	6	5399469	5399474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167035823
105514	NC_010322	ACC	2	6	5399495	5399500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167035823
105515	NC_010322	GCC	2	6	5399624	5399629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167035823
105516	NC_010322	GCA	2	6	5399706	5399711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035823
105517	NC_010322	CCG	2	6	5399877	5399882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167035823
105518	NC_010322	GTC	2	6	5399914	5399919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035823
105519	NC_010322	GCC	2	6	5399963	5399968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167035823
105520	NC_010322	GCT	2	6	5400012	5400017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035823
105521	NC_010322	GTG	2	6	5400055	5400060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167035823
105522	NC_010322	GGC	2	6	5400061	5400066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167035823
105523	NC_010322	CCA	2	6	5400129	5400134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167035823
105524	NC_010322	GAT	2	6	5400139	5400144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167035823
105525	NC_010322	CGCCC	2	10	5400153	5400162	0 %	0 %	20 %	80 %	167035823
105526	NC_010322	TTC	2	6	5400163	5400168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167035823
105527	NC_010322	ATC	2	6	5400173	5400178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167035823
105528	NC_010322	TTC	2	6	5400239	5400244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167035823
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105530	NC_010322	CA	3	6	5400348	5400353	50 %	0 %	0 %	50 %	167035823
105531	NC_010322	GC	3	6	5400443	5400448	0 %	0 %	50 %	50 %	167035823
105532	NC_010322	AGCGC	2	10	5400585	5400594	20 %	0 %	40 %	40 %	167035823
105533	NC_010322	GCG	2	6	5400602	5400607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167035823
105534	NC_010322	AGGT	2	8	5400656	5400663	25 %	25 %	50 %	0 %	167035823
105535	NC_010322	AAG	2	6	5400714	5400719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167035823
105536	NC_010322	CGG	2	6	5400735	5400740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167035823
105537	NC_010322	CGATG	2	10	5400783	5400792	20 %	20 %	40 %	20 %	167035823
105538	NC_010322	GCT	2	6	5400808	5400813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035823
105539	NC_010322	GCC	2	6	5400862	5400867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167035823
105540	NC_010322	CGG	2	6	5400979	5400984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167035823
105541	NC_010322	TGGT	2	8	5400986	5400993	0 %	50 %	50 %	0 %	167035823
105542	NC_010322	AGCG	2	8	5401160	5401167	25 %	0 %	50 %	25 %	167035824
105543	NC_010322	CG	3	6	5401248	5401253	0 %	0 %	50 %	50 %	167035824
105544	NC_010322	GCC	2	6	5401324	5401329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167035824
105545	NC_010322	GAA	2	6	5401360	5401365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167035824
105546	NC_010322	TCA	2	6	5401394	5401399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167035824
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105548	NC_010322	ATC	2	6	5401475	5401480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167035824
105549	NC_010322	TGA	2	6	5401490	5401495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167035824
105550	NC_010322	CCA	2	6	5401515	5401520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167035824
105551	NC_010322	GC	3	6	5401637	5401642	0 %	0 %	50 %	50 %	167035824
105552	NC_010322	GC	3	6	5401658	5401663	0 %	0 %	50 %	50 %	167035824
105553	NC_010322	GCTG	2	8	5401676	5401683	0 %	25 %	50 %	25 %	167035824
105554	NC_010322	GGC	2	6	5401692	5401697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167035824
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105556	NC_010322	CAT	2	6	5401741	5401746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167035824
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105558	NC_010322	CTG	2	6	5401963	5401968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035824
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105561	NC_010322	GC	3	6	5402143	5402148	0 %	0 %	50 %	50 %	167035824
105562	NC_010322	GCCAC	2	10	5402158	5402167	20 %	0 %	20 %	60 %	167035824
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105564	NC_010322	GC	3	6	5402277	5402282	0 %	0 %	50 %	50 %	167035824
105565	NC_010322	GCA	2	6	5402301	5402306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035824
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105572	NC_010322	GCT	2	6	5402803	5402808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035824
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105614	NC_010322	GC	3	6	5404789	5404794	0 %	0 %	50 %	50 %	167035826
105615	NC_010322	CGC	2	6	5404806	5404811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167035826
105616	NC_010322	GGC	2	6	5404948	5404953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167035827
105617	NC_010322	CGC	2	6	5404955	5404960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167035827
105618	NC_010322	TTC	2	6	5404963	5404968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167035827
105619	NC_010322	GAC	2	6	5405002	5405007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035827
105620	NC_010322	GAT	2	6	5405043	5405048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167035827
105621	NC_010322	GCAA	2	8	5405087	5405094	50 %	0 %	25 %	25 %	167035827
105622	NC_010322	ACCG	2	8	5405121	5405128	25 %	0 %	25 %	50 %	167035827
105623	NC_010322	CCA	2	6	5405213	5405218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167035827
105624	NC_010322	CAT	2	6	5405262	5405267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167035827
105625	NC_010322	GCT	2	6	5405279	5405284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035827
105626	NC_010322	CTG	2	6	5405305	5405310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035827
105627	NC_010322	CCGGCT	2	12	5405318	5405329	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	167035827
105628	NC_010322	CGG	2	6	5405366	5405371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167035827
105629	NC_010322	ACCCTG	2	12	5405386	5405397	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	167035827
105630	NC_010322	CGC	2	6	5405412	5405417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167035827
105631	NC_010322	CAT	2	6	5405460	5405465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167035827
105632	NC_010322	TGGC	2	8	5405477	5405484	0 %	25 %	50 %	25 %	167035827
105633	NC_010322	C	6	6	5405499	5405504	0 %	0 %	0 %	100 %	167035827
105634	NC_010322	GTG	2	6	5405554	5405559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167035827
105635	NC_010322	CGA	2	6	5405568	5405573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035827
105636	NC_010322	TGA	2	6	5405576	5405581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167035827
105637	NC_010322	CGG	2	6	5405601	5405606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167035827
105638	NC_010322	TCG	2	6	5405657	5405662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035827
105639	NC_010322	GCG	2	6	5405663	5405668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167035827
105640	NC_010322	GCT	2	6	5405681	5405686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035827
105641	NC_010322	CGG	2	6	5405688	5405693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167035827
105642	NC_010322	GCC	2	6	5405776	5405781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167035827
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105644	NC_010322	GCC	2	6	5405807	5405812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167035827
105645	NC_010322	GCA	2	6	5405865	5405870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035827
105646	NC_010322	GC	3	6	5405871	5405876	0 %	0 %	50 %	50 %	167035827
105647	NC_010322	CAC	2	6	5405901	5405906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167035827
105648	NC_010322	GCG	2	6	5405939	5405944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167035827
105649	NC_010322	GAC	2	6	5405947	5405952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035827
105650	NC_010322	CTT	2	6	5406003	5406008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167035827
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105653	NC_010322	CTG	2	6	5406486	5406491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035828
105654	NC_010322	TAC	3	9	5406642	5406650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167035828
105655	NC_010322	A	7	7	5406662	5406668	100 %	0 %	0 %	0 %	167035828
105656	NC_010322	TTC	2	6	5406747	5406752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167035828
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105660	NC_010322	CGA	2	6	5406872	5406877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035828
105661	NC_010322	CTG	2	6	5406924	5406929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035828
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105703	NC_010322	CTG	2	6	5409331	5409336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035832
105704	NC_010322	CTG	2	6	5409382	5409387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035832
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105718	NC_010322	GGC	2	6	5410074	5410079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167035833
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105720	NC_010322	CTG	3	9	5410101	5410109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035833
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105722	NC_010322	TGCCC	2	10	5410142	5410151	0 %	20 %	20 %	60 %	167035833
105723	NC_010322	GC	3	6	5410164	5410169	0 %	0 %	50 %	50 %	167035833
105724	NC_010322	CGC	2	6	5410214	5410219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167035833
105725	NC_010322	GCT	2	6	5410226	5410231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035833
105726	NC_010322	CAGC	2	8	5410289	5410296	25 %	0 %	25 %	50 %	167035833
105727	NC_010322	GGCC	2	8	5410310	5410317	0 %	0 %	50 %	50 %	167035833
105728	NC_010322	GCG	2	6	5410330	5410335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167035833
105729	NC_010322	CTG	2	6	5410374	5410379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035833
105730	NC_010322	GC	3	6	5410397	5410402	0 %	0 %	50 %	50 %	167035833
105731	NC_010322	GGC	2	6	5410514	5410519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167035833
105732	NC_010322	CA	3	6	5410561	5410566	50 %	0 %	0 %	50 %	167035833
105733	NC_010322	CGC	2	6	5410700	5410705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167035833
105734	NC_010322	GAA	2	6	5410746	5410751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167035833
105735	NC_010322	CAC	2	6	5410755	5410760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167035833
105736	NC_010322	CTA	2	6	5410769	5410774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167035833
105737	NC_010322	ACCT	2	8	5410809	5410816	25 %	25 %	0 %	50 %	167035833
105738	NC_010322	CTG	2	6	5410863	5410868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035833
105739	NC_010322	TTC	2	6	5410884	5410889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167035833
105740	NC_010322	GGA	2	6	5410922	5410927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167035833
105741	NC_010322	GCT	2	6	5410934	5410939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035833
105742	NC_010322	GGT	2	6	5410982	5410987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167035833
105743	NC_010322	CGC	2	6	5411000	5411005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167035833
105744	NC_010322	CG	3	6	5411015	5411020	0 %	0 %	50 %	50 %	167035833
105745	NC_010322	CTG	3	9	5411028	5411036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035833
105746	NC_010322	ATCG	2	8	5411066	5411073	25 %	25 %	25 %	25 %	167035833
105747	NC_010322	GCA	2	6	5411081	5411086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035833
105748	NC_010322	TGCG	2	8	5411104	5411111	0 %	25 %	50 %	25 %	167035833
105749	NC_010322	GCCG	2	8	5411118	5411125	0 %	0 %	50 %	50 %	167035833
105750	NC_010322	GAT	2	6	5411129	5411134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167035833
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105753	NC_010322	GCA	2	6	5411243	5411248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035833
105754	NC_010322	GCT	3	9	5411300	5411308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035833
105755	NC_010322	CCA	2	6	5411498	5411503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167035834
105756	NC_010322	CAC	2	6	5411508	5411513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167035834
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105760	NC_010322	CAC	2	6	5411685	5411690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167035834
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105795	NC_010322	CAC	2	6	5413665	5413670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167035836
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105800	NC_010322	CTG	2	6	5413846	5413851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035836
105801	NC_010322	ACG	2	6	5413949	5413954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035836
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105811	NC_010322	GTC	2	6	5414421	5414426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035836
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105816	NC_010322	CTG	2	6	5414623	5414628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035836
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105821	NC_010322	GTCGAA	2	12	5414799	5414810	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	167035836
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105826	NC_010322	GGCTCA	2	12	5414967	5414978	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	167035836
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105830	NC_010322	TGA	2	6	5415134	5415139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167035836
105831	NC_010322	CTG	2	6	5415184	5415189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035836
105832	NC_010322	TGC	2	6	5415215	5415220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035836
105833	NC_010322	GCA	2	6	5415258	5415263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035836
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105836	NC_010322	TGG	2	6	5415344	5415349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167035836
105837	NC_010322	TGCC	2	8	5415386	5415393	0 %	25 %	25 %	50 %	167035836
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105839	NC_010322	TCG	2	6	5415509	5415514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035836
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105954	NC_010322	GAAC	2	8	5421256	5421263	50 %	0 %	25 %	25 %	167035843
105955	NC_010322	GAGG	2	8	5421286	5421293	25 %	0 %	75 %	0 %	167035843
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105960	NC_010322	CAC	2	6	5421502	5421507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167035843
105961	NC_010322	CAG	2	6	5421526	5421531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035843
105962	NC_010322	CCAG	2	8	5421582	5421589	25 %	0 %	25 %	50 %	167035843
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105981	NC_010322	CAG	3	9	5422561	5422569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035845
105982	NC_010322	GCT	2	6	5422581	5422586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035845
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105984	NC_010322	AGA	2	6	5422599	5422604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167035845
105985	NC_010322	TGA	2	6	5422647	5422652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167035845
105986	NC_010322	CG	3	6	5422654	5422659	0 %	0 %	50 %	50 %	167035845
105987	NC_010322	CGA	2	6	5422684	5422689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035845
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105992	NC_010322	TGA	2	6	5422893	5422898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167035845
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106000	NC_010322	TCTGC	2	10	5423127	5423136	0 %	40 %	20 %	40 %	167035845

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