MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida GB-1 chromosome

Total Repeats: 119320

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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105002	NC_010322	AAG	2	6	5364629	5364634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167035786
105003	NC_010322	TGC	2	6	5364946	5364951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035787
105004	NC_010322	ATA	2	6	5364997	5365002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167035787
105005	NC_010322	CCG	2	6	5365051	5365056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167035787
105006	NC_010322	ATC	2	6	5365066	5365071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167035787
105007	NC_010322	TC	3	6	5365085	5365090	0 %	50 %	0 %	50 %	167035787
105008	NC_010322	CAC	2	6	5365290	5365295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167035787
105009	NC_010322	C	6	6	5365297	5365302	0 %	0 %	0 %	100 %	167035787
105010	NC_010322	TAG	2	6	5365513	5365518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167035787
105011	NC_010322	CAA	2	6	5365548	5365553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167035787
105012	NC_010322	TGA	2	6	5365568	5365573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167035787
105013	NC_010322	AGC	2	6	5365585	5365590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035787
105014	NC_010322	ATC	2	6	5365595	5365600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167035787
105015	NC_010322	CTC	2	6	5365621	5365626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167035787
105016	NC_010322	TCAT	2	8	5365631	5365638	25 %	50 %	0 %	25 %	167035787
105017	NC_010322	AGC	2	6	5365675	5365680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035787
105018	NC_010322	GCA	2	6	5365721	5365726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035787
105019	NC_010322	CCT	2	6	5365740	5365745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167035787
105020	NC_010322	GTC	2	6	5365756	5365761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035787
105021	NC_010322	ATG	2	6	5365763	5365768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167035787
105022	NC_010322	TAC	2	6	5365945	5365950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167035788
105023	NC_010322	TCA	2	6	5365972	5365977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167035788
105024	NC_010322	TCA	2	6	5365993	5365998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167035788
105025	NC_010322	CGC	2	6	5366004	5366009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167035788
105026	NC_010322	CCATT	2	10	5366069	5366078	20 %	40 %	0 %	40 %	167035788
105027	NC_010322	TCGC	2	8	5366107	5366114	0 %	25 %	25 %	50 %	167035788
105028	NC_010322	GCTG	2	8	5366159	5366166	0 %	25 %	50 %	25 %	167035788
105029	NC_010322	GAG	2	6	5366172	5366177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167035788
105030	NC_010322	CCG	2	6	5366186	5366191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167035788
105031	NC_010322	GCT	2	6	5366239	5366244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035788
105032	NC_010322	GTC	2	6	5366262	5366267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035788
105033	NC_010322	TCG	2	6	5366406	5366411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035788
105034	NC_010322	TCC	2	6	5366658	5366663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167035789
105035	NC_010322	T	6	6	5366736	5366741	0 %	100 %	0 %	0 %	167035790
105036	NC_010322	CTC	2	6	5366750	5366755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167035790
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105038	NC_010322	GCT	2	6	5366900	5366905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035790
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105041	NC_010322	GCA	2	6	5367004	5367009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035790
105042	NC_010322	GAA	2	6	5367179	5367184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167035790
105043	NC_010322	GTC	2	6	5367218	5367223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035790
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105051	NC_010322	TGA	2	6	5367429	5367434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167035790
105052	NC_010322	GAA	2	6	5367467	5367472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167035790
105053	NC_010322	TAG	2	6	5367474	5367479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167035790
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105056	NC_010322	TCA	2	6	5367670	5367675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167035790
105057	NC_010322	TAT	2	6	5367694	5367699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167035790
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105060	NC_010322	CGA	2	6	5367940	5367945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035790
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105064	NC_010322	TCA	2	6	5368134	5368139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167035790
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105082	NC_010322	CAT	2	6	5369700	5369705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167035792
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105106	NC_010322	CGA	2	6	5372115	5372120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035794
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105109	NC_010322	TG	3	6	5372185	5372190	0 %	50 %	50 %	0 %	167035794
105110	NC_010322	AGT	2	6	5372293	5372298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167035794
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105112	NC_010322	ATC	2	6	5372385	5372390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167035795
105113	NC_010322	GCCC	2	8	5372411	5372418	0 %	0 %	25 %	75 %	167035795
105114	NC_010322	CTG	2	6	5372461	5372466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035795
105115	NC_010322	CTT	2	6	5372492	5372497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167035795
105116	NC_010322	CGA	2	6	5372810	5372815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035796
105117	NC_010322	GTG	2	6	5372891	5372896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167035796
105118	NC_010322	CCA	2	6	5372929	5372934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167035796
105119	NC_010322	CGC	2	6	5372957	5372962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167035796
105120	NC_010322	TGG	2	6	5373012	5373017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167035796
105121	NC_010322	AGTC	2	8	5373151	5373158	25 %	25 %	25 %	25 %	167035796
105122	NC_010322	CGC	2	6	5373182	5373187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167035796
105123	NC_010322	GTCC	2	8	5373212	5373219	0 %	25 %	25 %	50 %	167035796
105124	NC_010322	GTA	2	6	5373338	5373343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167035796
105125	NC_010322	TTCG	2	8	5373386	5373393	0 %	50 %	25 %	25 %	167035796
105126	NC_010322	ACTT	2	8	5373595	5373602	25 %	50 %	0 %	25 %	167035797
105127	NC_010322	TGG	2	6	5373938	5373943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167035797
105128	NC_010322	CTT	3	9	5373963	5373971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167035797
105129	NC_010322	GAA	2	6	5373975	5373980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167035797
105130	NC_010322	GCA	3	9	5374034	5374042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035797
105131	NC_010322	GCA	2	6	5374049	5374054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035797
105132	NC_010322	GAAG	2	8	5374942	5374949	50 %	0 %	50 %	0 %	167035798
105133	NC_010322	CCT	2	6	5375077	5375082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167035798
105134	NC_010322	CTC	2	6	5375120	5375125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167035798
105135	NC_010322	CAT	2	6	5375183	5375188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167035798
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105140	NC_010322	AGA	2	6	5375730	5375735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167035799
105141	NC_010322	GCGTG	2	10	5375768	5375777	0 %	20 %	60 %	20 %	167035799
105142	NC_010322	CGG	2	6	5375819	5375824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167035799
105143	NC_010322	CTG	2	6	5375897	5375902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035799
105144	NC_010322	GCA	2	6	5375917	5375922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035799
105145	NC_010322	ATA	2	6	5375931	5375936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167035799
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105147	NC_010322	GCA	2	6	5376082	5376087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035799
105148	NC_010322	CG	3	6	5376178	5376183	0 %	0 %	50 %	50 %	167035799
105149	NC_010322	GC	3	6	5376208	5376213	0 %	0 %	50 %	50 %	167035799
105150	NC_010322	TCA	2	6	5376421	5376426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167035799
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105152	NC_010322	GTC	2	6	5376554	5376559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035799
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105197	NC_010322	GAC	2	6	5379399	5379404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035803
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105202	NC_010322	CCAG	2	8	5380209	5380216	25 %	0 %	25 %	50 %	167035804
105203	NC_010322	TGC	2	6	5380286	5380291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035804
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105208	NC_010322	CCGC	2	8	5380390	5380397	0 %	0 %	25 %	75 %	167035804
105209	NC_010322	TCA	2	6	5380503	5380508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167035804
105210	NC_010322	CAG	2	6	5380542	5380547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035804
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105212	NC_010322	GCCAA	2	10	5380718	5380727	40 %	0 %	20 %	40 %	167035804
105213	NC_010322	CTG	2	6	5380768	5380773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035804
105214	NC_010322	C	6	6	5380854	5380859	0 %	0 %	0 %	100 %	167035804
105215	NC_010322	CCA	2	6	5380899	5380904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167035804
105216	NC_010322	GTG	2	6	5381036	5381041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167035804
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105218	NC_010322	CTG	2	6	5381169	5381174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035804
105219	NC_010322	AAG	2	6	5381242	5381247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167035804
105220	NC_010322	ACC	2	6	5381303	5381308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167035804
105221	NC_010322	GCATC	2	10	5381310	5381319	20 %	20 %	20 %	40 %	167035804
105222	NC_010322	ACC	2	6	5381416	5381421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167035805
105223	NC_010322	ACG	2	6	5381474	5381479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035805
105224	NC_010322	AC	3	6	5381485	5381490	50 %	0 %	0 %	50 %	167035805
105225	NC_010322	GCG	2	6	5381520	5381525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167035805
105226	NC_010322	CATC	2	8	5381597	5381604	25 %	25 %	0 %	50 %	167035805
105227	NC_010322	GCT	2	6	5381633	5381638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035805
105228	NC_010322	GCTC	2	8	5381710	5381717	0 %	25 %	25 %	50 %	167035805
105229	NC_010322	CATC	2	8	5381768	5381775	25 %	25 %	0 %	50 %	167035805
105230	NC_010322	GCA	2	6	5381839	5381844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035805
105231	NC_010322	GCA	2	6	5381863	5381868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035805
105232	NC_010322	CCG	2	6	5381896	5381901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167035805
105233	NC_010322	GTT	2	6	5381914	5381919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167035805
105234	NC_010322	CAC	2	6	5382017	5382022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167035805
105235	NC_010322	TCA	2	6	5382076	5382081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167035805
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105239	NC_010322	GAG	2	6	5382179	5382184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167035805
105240	NC_010322	GGC	2	6	5382187	5382192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167035805
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105255	NC_010322	GCTG	2	8	5383188	5383195	0 %	25 %	50 %	25 %	167035806
105256	NC_010322	CAT	3	9	5383258	5383266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167035806
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105262	NC_010322	ATC	2	6	5383501	5383506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167035806
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105280	NC_010322	CTT	2	6	5384594	5384599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167035807
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105291	NC_010322	CTT	3	9	5385136	5385144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167035807
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105294	NC_010322	TG	3	6	5385408	5385413	0 %	50 %	50 %	0 %	167035807
105295	NC_010322	T	6	6	5385575	5385580	0 %	100 %	0 %	0 %	167035807
105296	NC_010322	CAGC	2	8	5386150	5386157	25 %	0 %	25 %	50 %	167035808
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105330	NC_010322	CAAA	2	8	5388313	5388320	75 %	0 %	0 %	25 %	167035811
105331	NC_010322	TTTG	2	8	5388340	5388347	0 %	75 %	25 %	0 %	167035811
105332	NC_010322	GCA	2	6	5388376	5388381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035811
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105334	NC_010322	CTTTG	2	10	5388716	5388725	0 %	60 %	20 %	20 %	167035811
105335	NC_010322	A	6	6	5388756	5388761	100 %	0 %	0 %	0 %	167035811
105336	NC_010322	TCG	2	6	5388783	5388788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035811
105337	NC_010322	GCTG	2	8	5388871	5388878	0 %	25 %	50 %	25 %	167035811
105338	NC_010322	CAT	2	6	5388880	5388885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167035811
105339	NC_010322	CT	3	6	5388906	5388911	0 %	50 %	0 %	50 %	167035811
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105341	NC_010322	TGC	2	6	5389014	5389019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035811
105342	NC_010322	GGT	2	6	5389036	5389041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167035811
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