MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida GB-1 chromosome

Total Repeats: 119320

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
102501	NC_010322	GCT	2	6	5232997	5233002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035673
102502	NC_010322	GCC	2	6	5233178	5233183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167035673
102503	NC_010322	GCA	2	6	5233208	5233213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035673
102504	NC_010322	GGT	2	6	5233237	5233242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167035673
102505	NC_010322	ACCT	2	8	5233253	5233260	25 %	25 %	0 %	50 %	167035673
102506	NC_010322	GCCA	2	8	5233295	5233302	25 %	0 %	25 %	50 %	167035673
102507	NC_010322	GCTG	2	8	5233359	5233366	0 %	25 %	50 %	25 %	167035673
102508	NC_010322	AGC	2	6	5233368	5233373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035673
102509	NC_010322	GCA	2	6	5233500	5233505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035673
102510	NC_010322	GCCTG	2	10	5233540	5233549	0 %	20 %	40 %	40 %	167035673
102511	NC_010322	GCA	2	6	5233743	5233748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035674
102512	NC_010322	GAA	2	6	5233752	5233757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167035674
102513	NC_010322	GCC	2	6	5233789	5233794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167035674
102514	NC_010322	GCC	2	6	5233820	5233825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167035674
102515	NC_010322	GGTG	2	8	5233833	5233840	0 %	25 %	75 %	0 %	167035674
102516	NC_010322	TGT	2	6	5233886	5233891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167035674
102517	NC_010322	CTG	2	6	5233909	5233914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035674
102518	NC_010322	CAA	2	6	5233963	5233968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167035674
102519	NC_010322	A	7	7	5233991	5233997	100 %	0 %	0 %	0 %	167035674
102520	NC_010322	AAT	2	6	5234003	5234008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167035674
102521	NC_010322	CCG	2	6	5234192	5234197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167035675
102522	NC_010322	GC	3	6	5234203	5234208	0 %	0 %	50 %	50 %	167035675
102523	NC_010322	CA	3	6	5234241	5234246	50 %	0 %	0 %	50 %	167035675
102524	NC_010322	CAGC	2	8	5234284	5234291	25 %	0 %	25 %	50 %	167035675
102525	NC_010322	CAG	2	6	5234381	5234386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035675
102526	NC_010322	GCG	2	6	5234395	5234400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167035675
102527	NC_010322	CAG	2	6	5234405	5234410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035675
102528	NC_010322	CGG	2	6	5234424	5234429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167035675
102529	NC_010322	GCT	3	9	5234434	5234442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035675
102530	NC_010322	GCA	2	6	5234476	5234481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035675
102531	NC_010322	GC	3	6	5234496	5234501	0 %	0 %	50 %	50 %	167035675
102532	NC_010322	GGC	2	6	5234516	5234521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167035675
102533	NC_010322	CCG	2	6	5234527	5234532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167035675
102534	NC_010322	GCT	2	6	5234626	5234631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035675
102535	NC_010322	GCCAG	2	10	5234683	5234692	20 %	0 %	40 %	40 %	167035675
102536	NC_010322	TGC	2	6	5234748	5234753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035675
102537	NC_010322	GCA	2	6	5234761	5234766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035675
102538	NC_010322	GCA	2	6	5234812	5234817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035675
102539	NC_010322	GAT	2	6	5234939	5234944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167035675
102540	NC_010322	TGCG	2	8	5234961	5234968	0 %	25 %	50 %	25 %	167035675
102541	NC_010322	GGC	2	6	5234997	5235002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167035675
102542	NC_010322	CTGGC	2	10	5235006	5235015	0 %	20 %	40 %	40 %	167035675
102543	NC_010322	GCC	2	6	5235017	5235022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167035675
102544	NC_010322	ACA	2	6	5235028	5235033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167035675
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102548	NC_010322	CGC	2	6	5235248	5235253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167035676
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102550	NC_010322	CAC	2	6	5235289	5235294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167035676
102551	NC_010322	GCG	2	6	5235305	5235310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167035676
102552	NC_010322	TG	3	6	5235326	5235331	0 %	50 %	50 %	0 %	167035676
102553	NC_010322	TCG	2	6	5235363	5235368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035676
102554	NC_010322	AGC	2	6	5235369	5235374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035676
102555	NC_010322	TGC	2	6	5235379	5235384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035676
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102557	NC_010322	GC	3	6	5235467	5235472	0 %	0 %	50 %	50 %	167035676
102558	NC_010322	GCC	2	6	5235492	5235497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167035676
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102562	NC_010322	GCACA	2	10	5235710	5235719	40 %	0 %	20 %	40 %	167035676
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102564	NC_010322	GCT	2	6	5235728	5235733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035676
102565	NC_010322	ACT	2	6	5235765	5235770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167035676
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102569	NC_010322	CAG	3	9	5235940	5235948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035677
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102573	NC_010322	CAG	2	6	5235991	5235996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035677
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102597	NC_010322	CCGC	2	8	5237018	5237025	0 %	0 %	25 %	75 %	167035678
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102599	NC_010322	GCC	2	6	5237122	5237127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167035678
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102614	NC_010322	GCC	2	6	5238005	5238010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167035679
102615	NC_010322	AGA	2	6	5238072	5238077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167035679
102616	NC_010322	GAC	2	6	5238088	5238093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035679
102617	NC_010322	CAT	2	6	5238118	5238123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167035679
102618	NC_010322	GC	3	6	5238125	5238130	0 %	0 %	50 %	50 %	167035679
102619	NC_010322	GCG	2	6	5238146	5238151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167035679
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102621	NC_010322	AGC	2	6	5238237	5238242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035679
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102625	NC_010322	GCCC	2	8	5238687	5238694	0 %	0 %	25 %	75 %	167035680
102626	NC_010322	CA	3	6	5238701	5238706	50 %	0 %	0 %	50 %	167035680
102627	NC_010322	GCC	2	6	5238712	5238717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167035680
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102630	NC_010322	CAG	2	6	5238902	5238907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035680
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102634	NC_010322	CGG	2	6	5239223	5239228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167035681
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102650	NC_010322	GCG	2	6	5239970	5239975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167035681
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102652	NC_010322	CGT	2	6	5240013	5240018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035681
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102662	NC_010322	A	6	6	5240744	5240749	100 %	0 %	0 %	0 %	167035682
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102664	NC_010322	CCCCCA	2	12	5240861	5240872	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	167035683
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102682	NC_010322	CAT	2	6	5241940	5241945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167035684
102683	NC_010322	TGG	2	6	5241950	5241955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167035684
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102685	NC_010322	GTC	2	6	5242010	5242015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035684
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102722	NC_010322	TCG	2	6	5243257	5243262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035685
102723	NC_010322	GTACT	2	10	5243295	5243304	20 %	40 %	20 %	20 %	167035685
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102725	NC_010322	GCT	2	6	5243339	5243344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035685
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102727	NC_010322	GCT	2	6	5243384	5243389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035685
102728	NC_010322	GAC	2	6	5243442	5243447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035685
102729	NC_010322	GGC	2	6	5243462	5243467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167035685
102730	NC_010322	GGC	2	6	5243480	5243485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167035685
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102734	NC_010322	CGC	2	6	5243603	5243608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167035685
102735	NC_010322	CGA	2	6	5243708	5243713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035685
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102746	NC_010322	GGC	2	6	5244191	5244196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167035685
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102748	NC_010322	TGC	2	6	5244235	5244240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035685
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102758	NC_010322	CCA	2	6	5244506	5244511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167035685
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102763	NC_010322	TCG	2	6	5244757	5244762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035685
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102787	NC_010322	GGGT	2	8	5245844	5245851	0 %	25 %	75 %	0 %	167035686
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102824	NC_010322	GTGCG	2	10	5247877	5247886	0 %	20 %	60 %	20 %	167035687
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102828	NC_010322	GC	3	6	5247975	5247980	0 %	0 %	50 %	50 %	167035687
102829	NC_010322	GTT	2	6	5248055	5248060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167035687
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102831	NC_010322	CTG	2	6	5248203	5248208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035687
102832	NC_010322	TGC	2	6	5248231	5248236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035687
102833	NC_010322	GCC	2	6	5248256	5248261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167035687
102834	NC_010322	GC	4	8	5248309	5248316	0 %	0 %	50 %	50 %	167035687
102835	NC_010322	CGC	2	6	5248383	5248388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167035687
102836	NC_010322	GC	3	6	5248397	5248402	0 %	0 %	50 %	50 %	167035687
102837	NC_010322	TGC	2	6	5248408	5248413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035687
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102841	NC_010322	GTG	2	6	5248496	5248501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167035687
102842	NC_010322	AGCG	2	8	5248527	5248534	25 %	0 %	50 %	25 %	167035687
102843	NC_010322	ACGCAA	2	12	5248589	5248600	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	167035687
102844	NC_010322	GCA	2	6	5248609	5248614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035687
102845	NC_010322	CGA	2	6	5248631	5248636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035687
102846	NC_010322	GCA	2	6	5248674	5248679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035688
102847	NC_010322	GCT	2	6	5248783	5248788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035688
102848	NC_010322	CTGGAC	2	12	5248925	5248936	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	167035688
102849	NC_010322	CTG	2	6	5248940	5248945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035688
102850	NC_010322	CGA	2	6	5248963	5248968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035688
102851	NC_010322	CATG	2	8	5248996	5249003	25 %	25 %	25 %	25 %	167035688
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102853	NC_010322	TCG	2	6	5249103	5249108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035688
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102856	NC_010322	ACG	2	6	5249461	5249466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035689
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102860	NC_010322	CTG	2	6	5249760	5249765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035689
102861	NC_010322	GCGTG	2	10	5249771	5249780	0 %	20 %	60 %	20 %	167035689
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102866	NC_010322	TGC	3	9	5249917	5249925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035689
102867	NC_010322	GGC	2	6	5249948	5249953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167035689
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102871	NC_010322	CAAG	2	8	5250143	5250150	50 %	0 %	25 %	25 %	167035689
102872	NC_010322	GC	3	6	5250214	5250219	0 %	0 %	50 %	50 %	167035690
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102874	NC_010322	GC	3	6	5250322	5250327	0 %	0 %	50 %	50 %	167035690
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102877	NC_010322	CTG	2	6	5250449	5250454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035690
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102930	NC_010322	CTG	2	6	5253302	5253307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035692
102931	NC_010322	GAC	2	6	5253317	5253322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035692
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102933	NC_010322	CAATG	2	10	5253382	5253391	40 %	20 %	20 %	20 %	167035692
102934	NC_010322	GC	3	6	5253395	5253400	0 %	0 %	50 %	50 %	167035692
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102939	NC_010322	GCGT	2	8	5253585	5253592	0 %	25 %	50 %	25 %	167035692
102940	NC_010322	GGC	2	6	5253593	5253598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167035692
102941	NC_010322	CAG	2	6	5253655	5253660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035692
102942	NC_010322	TGG	2	6	5253666	5253671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167035692
102943	NC_010322	CGG	2	6	5253682	5253687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167035692
102944	NC_010322	CGA	2	6	5253748	5253753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035692
102945	NC_010322	C	7	7	5253757	5253763	0 %	0 %	0 %	100 %	167035692
102946	NC_010322	GGC	2	6	5253772	5253777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167035692
102947	NC_010322	GCA	2	6	5253810	5253815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167035692
102948	NC_010322	TGC	2	6	5253834	5253839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035692
102949	NC_010322	ACC	2	6	5253842	5253847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167035692
102950	NC_010322	GGC	2	6	5253848	5253853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167035692
102951	NC_010322	CTG	2	6	5253857	5253862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035692
102952	NC_010322	GGT	2	6	5254045	5254050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167035692
102953	NC_010322	GC	3	6	5254096	5254101	0 %	0 %	50 %	50 %	167035692
102954	NC_010322	CGC	2	6	5254122	5254127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167035692
102955	NC_010322	TTG	2	6	5254157	5254162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167035692
102956	NC_010322	TGG	2	6	5254250	5254255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167035692
102957	NC_010322	CGG	2	6	5254267	5254272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167035692
102958	NC_010322	CAT	2	6	5254273	5254278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167035692
102959	NC_010322	CA	3	6	5254324	5254329	50 %	0 %	0 %	50 %	167035692
102960	NC_010322	TCA	2	6	5254407	5254412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167035692
102961	NC_010322	CTA	2	6	5254495	5254500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167035692
102962	NC_010322	CGC	2	6	5254520	5254525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167035692
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102966	NC_010322	TGC	2	6	5254623	5254628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167035692
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