MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Prochlorococcus marinus str. MIT 9215 chromosome

Total Repeats: 40121

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009840	ATT	2	6	175	180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157412339
2	NC_009840	TAA	2	6	198	203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157412339
3	NC_009840	GTAA	2	8	217	224	50 %	25 %	25 %	0 %	157412339
4	NC_009840	TGA	2	6	279	284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157412339
5	NC_009840	CTT	2	6	338	343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157412339
6	NC_009840	AAAC	2	8	408	415	75 %	0 %	0 %	25 %	157412339
7	NC_009840	ATA	2	6	461	466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157412339
8	NC_009840	TAA	2	6	470	475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157412339
9	NC_009840	TGA	2	6	516	521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157412339
10	NC_009840	TTG	2	6	539	544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157412339
11	NC_009840	CTT	2	6	554	559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157412339
12	NC_009840	T	6	6	579	584	0 %	100 %	0 %	0 %	157412339
13	NC_009840	TAG	2	6	612	617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157412339
14	NC_009840	ATG	2	6	620	625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157412339
15	NC_009840	ACT	2	6	636	641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157412339
16	NC_009840	ATT	2	6	671	676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157412339
17	NC_009840	TAA	2	6	726	731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157412339
18	NC_009840	ATG	2	6	767	772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157412339
19	NC_009840	CAA	2	6	794	799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157412339
20	NC_009840	AGT	2	6	879	884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157412339
21	NC_009840	TCAAA	2	10	895	904	60 %	20 %	0 %	20 %	157412339
22	NC_009840	TAC	2	6	909	914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157412339
23	NC_009840	ATT	2	6	941	946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157412339
24	NC_009840	AATT	2	8	950	957	50 %	50 %	0 %	0 %	157412339
25	NC_009840	ACAA	2	8	991	998	75 %	0 %	0 %	25 %	157412339
26	NC_009840	AGAA	2	8	1014	1021	75 %	0 %	25 %	0 %	157412339
27	NC_009840	AGT	2	6	1045	1050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157412339
28	NC_009840	GAT	2	6	1069	1074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157412339
29	NC_009840	ACT	2	6	1246	1251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157412339
30	NC_009840	AGA	2	6	1269	1274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157412339
31	NC_009840	GTTC	2	8	1315	1322	0 %	50 %	25 %	25 %	157412339
32	NC_009840	TTA	2	6	1349	1354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157412340
33	NC_009840	ATA	2	6	1520	1525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157412340
34	NC_009840	TAAATG	2	12	1614	1625	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	157412340
35	NC_009840	T	6	6	1651	1656	0 %	100 %	0 %	0 %	157412340
36	NC_009840	TGAAA	2	10	1660	1669	60 %	20 %	20 %	0 %	157412340
37	NC_009840	TAG	2	6	1726	1731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157412340
38	NC_009840	ATA	2	6	1749	1754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157412340
39	NC_009840	CAA	2	6	1763	1768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157412340
40	NC_009840	GAT	2	6	1802	1807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157412340
41	NC_009840	TAA	2	6	1815	1820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157412340
42	NC_009840	A	7	7	1855	1861	100 %	0 %	0 %	0 %	157412340
43	NC_009840	TGA	2	6	1876	1881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157412340
44	NC_009840	GAA	2	6	1922	1927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157412340
45	NC_009840	A	6	6	1962	1967	100 %	0 %	0 %	0 %	157412340
46	NC_009840	ATCC	2	8	1990	1997	25 %	25 %	0 %	50 %	157412340
47	NC_009840	A	8	8	2007	2014	100 %	0 %	0 %	0 %	157412340
48	NC_009840	GAT	2	6	2018	2023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157412340
49	NC_009840	ATAA	2	8	2032	2039	75 %	25 %	0 %	0 %	157412340
50	NC_009840	AAT	2	6	2054	2059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157412341
51	NC_009840	GAA	2	6	2117	2122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157412341
52	NC_009840	TTG	2	6	2194	2199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157412341
53	NC_009840	TAT	2	6	2220	2225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157412341
54	NC_009840	AAT	2	6	2297	2302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157412341
55	NC_009840	ATC	2	6	2334	2339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157412341
56	NC_009840	GCA	2	6	2366	2371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157412341
57	NC_009840	AGG	2	6	2380	2385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157412341
58	NC_009840	AT	3	6	2397	2402	50 %	50 %	0 %	0 %	157412341
59	NC_009840	ATC	2	6	2464	2469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157412341
60	NC_009840	GAG	2	6	2487	2492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157412341
61	NC_009840	GAT	2	6	2561	2566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157412341
62	NC_009840	TGG	2	6	2701	2706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157412341
63	NC_009840	CTT	2	6	2739	2744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157412341
64	NC_009840	GAT	2	6	2747	2752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157412341
65	NC_009840	AGGT	2	8	2766	2773	25 %	25 %	50 %	0 %	157412341
66	NC_009840	TGC	2	6	2857	2862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157412341
67	NC_009840	AGA	2	6	2944	2949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157412341
68	NC_009840	TCT	2	6	2957	2962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157412341
69	NC_009840	TAT	2	6	2973	2978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157412341
70	NC_009840	AAGA	2	8	2988	2995	75 %	0 %	25 %	0 %	157412341
71	NC_009840	TCG	2	6	3003	3008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157412341
72	NC_009840	AGA	2	6	3013	3018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157412341
73	NC_009840	A	6	6	3018	3023	100 %	0 %	0 %	0 %	157412341
74	NC_009840	GTT	2	6	3071	3076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157412341
75	NC_009840	ATT	2	6	3104	3109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157412341
76	NC_009840	TGA	2	6	3157	3162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157412341
77	NC_009840	TAA	2	6	3190	3195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157412341
78	NC_009840	GAT	2	6	3203	3208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157412341
79	NC_009840	GAAA	2	8	3229	3236	75 %	0 %	25 %	0 %	157412341
80	NC_009840	AT	3	6	3264	3269	50 %	50 %	0 %	0 %	157412341
81	NC_009840	TTTTTC	2	12	3292	3303	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	157412341
82	NC_009840	ATT	2	6	3308	3313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157412341
83	NC_009840	ACT	2	6	3319	3324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157412341
84	NC_009840	CT	3	6	3323	3328	0 %	50 %	0 %	50 %	157412341
85	NC_009840	TAA	2	6	3426	3431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157412341
86	NC_009840	A	8	8	3449	3456	100 %	0 %	0 %	0 %	157412341
87	NC_009840	AAAGT	2	10	3459	3468	60 %	20 %	20 %	0 %	157412341
88	NC_009840	GCT	2	6	3482	3487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157412341
89	NC_009840	TAG	2	6	3502	3507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157412341
90	NC_009840	AAT	2	6	3605	3610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157412341
91	NC_009840	TTC	2	6	3619	3624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157412341
92	NC_009840	CTC	2	6	3655	3660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157412341
93	NC_009840	AGG	2	6	3712	3717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157412341
94	NC_009840	TA	3	6	3729	3734	50 %	50 %	0 %	0 %	157412341
95	NC_009840	AGT	2	6	3830	3835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157412341
96	NC_009840	GCA	2	6	3899	3904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157412341
97	NC_009840	TTG	2	6	3962	3967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157412341
98	NC_009840	T	6	6	3988	3993	0 %	100 %	0 %	0 %	157412341
99	NC_009840	TCT	2	6	4025	4030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157412341
100	NC_009840	TAT	2	6	4140	4145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157412341
101	NC_009840	G	7	7	4153	4159	0 %	0 %	100 %	0 %	157412341
102	NC_009840	ATT	2	6	4166	4171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157412341
103	NC_009840	AATG	2	8	4196	4203	50 %	25 %	25 %	0 %	157412341
104	NC_009840	ATT	2	6	4209	4214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157412341
105	NC_009840	A	8	8	4255	4262	100 %	0 %	0 %	0 %	157412341
106	NC_009840	A	7	7	4305	4311	100 %	0 %	0 %	0 %	157412341
107	NC_009840	TAA	2	6	4351	4356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157412341
108	NC_009840	ATG	2	6	4457	4462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157412342
109	NC_009840	CAA	2	6	4468	4473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157412342
110	NC_009840	CTTTTG	2	12	4486	4497	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	157412342
111	NC_009840	CAA	2	6	4649	4654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157412342
112	NC_009840	CAG	2	6	4661	4666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157412342
113	NC_009840	AGA	2	6	4674	4679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157412342
114	NC_009840	TTC	2	6	4797	4802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157412342
115	NC_009840	TGT	2	6	4817	4822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157412342
116	NC_009840	ATT	2	6	4882	4887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157412342
117	NC_009840	TTA	2	6	4963	4968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157412342
118	NC_009840	A	7	7	5031	5037	100 %	0 %	0 %	0 %	157412342
119	NC_009840	GAA	2	6	5038	5043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157412342
120	NC_009840	AAT	2	6	5077	5082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157412342
121	NC_009840	AGT	2	6	5091	5096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157412342
122	NC_009840	GA	3	6	5097	5102	50 %	0 %	50 %	0 %	157412342
123	NC_009840	ATT	2	6	5273	5278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157412342
124	NC_009840	CAAT	2	8	5300	5307	50 %	25 %	0 %	25 %	157412342
125	NC_009840	TTC	2	6	5343	5348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157412342
126	NC_009840	T	6	6	5404	5409	0 %	100 %	0 %	0 %	157412342
127	NC_009840	CAG	2	6	5449	5454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157412342
128	NC_009840	TAAAAA	2	12	5505	5516	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	157412342
129	NC_009840	TTG	2	6	5525	5530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157412342
130	NC_009840	TAC	2	6	5550	5555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157412342
131	NC_009840	T	8	8	5603	5610	0 %	100 %	0 %	0 %	157412342
132	NC_009840	CAG	2	6	5615	5620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157412342
133	NC_009840	CTC	2	6	5621	5626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157412342
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135	NC_009840	TAA	2	6	5771	5776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157412342
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