MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Psychrobacter sp. PRwf-1 plasmid pRWF101

Total Repeats: 213

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009516	TTA	2	6	214	219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148641525
2	NC_009516	TTA	2	6	291	296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148641525
3	NC_009516	AGA	2	6	305	310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148641525
4	NC_009516	GGT	2	6	318	323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148641525
5	NC_009516	ATT	2	6	325	330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148641525
6	NC_009516	ATC	2	6	358	363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148641525
7	NC_009516	ATT	2	6	443	448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148641525
8	NC_009516	AG	3	6	512	517	50 %	0 %	50 %	0 %	148641525
9	NC_009516	TAA	2	6	518	523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148641525
10	NC_009516	AAC	2	6	691	696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148641526
11	NC_009516	GAAG	2	8	698	705	50 %	0 %	50 %	0 %	148641526
12	NC_009516	AAG	2	6	741	746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148641526
13	NC_009516	TAT	2	6	811	816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148641526
14	NC_009516	TGA	2	6	858	863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148641526
15	NC_009516	TCA	2	6	950	955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148641526
16	NC_009516	TAG	2	6	993	998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148641526
17	NC_009516	TAC	2	6	1062	1067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148641526
18	NC_009516	ATG	2	6	1070	1075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148641526
19	NC_009516	CTC	2	6	1201	1206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148641526
20	NC_009516	TTG	2	6	1373	1378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148641526
21	NC_009516	T	6	6	1394	1399	0 %	100 %	0 %	0 %	148641526
22	NC_009516	GGGT	2	8	1401	1408	0 %	25 %	75 %	0 %	148641526
23	NC_009516	TGA	2	6	1437	1442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148641526
24	NC_009516	CA	3	6	1687	1692	50 %	0 %	0 %	50 %	148641526
25	NC_009516	T	6	6	1732	1737	0 %	100 %	0 %	0 %	148641526
26	NC_009516	ACGA	2	8	1741	1748	50 %	0 %	25 %	25 %	148641526
27	NC_009516	GTC	2	6	1792	1797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148641526
28	NC_009516	ACA	2	6	2473	2478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148641527
29	NC_009516	ACA	2	6	2482	2487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148641527
30	NC_009516	GCCAAA	2	12	2529	2540	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	148641527
31	NC_009516	CAAACT	2	12	2582	2593	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	148641527
32	NC_009516	A	6	6	2676	2681	100 %	0 %	0 %	0 %	148641527
33	NC_009516	GTG	2	6	2685	2690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148641527
34	NC_009516	TAAA	2	8	2697	2704	75 %	25 %	0 %	0 %	148641527
35	NC_009516	CAT	2	6	2764	2769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148641527
36	NC_009516	CAA	2	6	2806	2811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148641527
37	NC_009516	CT	3	6	2843	2848	0 %	50 %	0 %	50 %	148641527
38	NC_009516	AAC	2	6	2858	2863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148641527
39	NC_009516	CAA	2	6	2897	2902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148641527
40	NC_009516	GAA	2	6	2918	2923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148641527
41	NC_009516	AGCT	2	8	2952	2959	25 %	25 %	25 %	25 %	148641527
42	NC_009516	TGA	2	6	2998	3003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148641527
43	NC_009516	TCT	2	6	3030	3035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148641527
44	NC_009516	GAC	2	6	3047	3052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148641527
45	NC_009516	A	6	6	3068	3073	100 %	0 %	0 %	0 %	148641527
46	NC_009516	A	6	6	3094	3099	100 %	0 %	0 %	0 %	148641527
47	NC_009516	GTA	2	6	3117	3122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148641527
48	NC_009516	CAG	2	6	3128	3133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148641527
49	NC_009516	GAA	2	6	3233	3238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148641527
50	NC_009516	TA	3	6	3270	3275	50 %	50 %	0 %	0 %	148641527
51	NC_009516	GAA	2	6	3421	3426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148641527
52	NC_009516	TCA	2	6	3438	3443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148641527
53	NC_009516	TGA	2	6	3469	3474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148641527
54	NC_009516	AAC	2	6	3491	3496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148641527
55	NC_009516	AC	3	6	3495	3500	50 %	0 %	0 %	50 %	148641527
56	NC_009516	ACC	2	6	3756	3761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148641527
57	NC_009516	GACC	2	8	3801	3808	25 %	0 %	25 %	50 %	148641527
58	NC_009516	ATT	2	6	3833	3838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148641527
59	NC_009516	TCC	2	6	3910	3915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148641527
60	NC_009516	TAG	2	6	3966	3971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148641527
61	NC_009516	TA	3	6	4019	4024	50 %	50 %	0 %	0 %	148641527
62	NC_009516	TAA	2	6	4051	4056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148641527
63	NC_009516	TA	3	6	4067	4072	50 %	50 %	0 %	0 %	148641527
64	NC_009516	CAA	2	6	4089	4094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148641527
65	NC_009516	TGA	2	6	4144	4149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148641527
66	NC_009516	CAT	2	6	4175	4180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148641527
67	NC_009516	ATT	2	6	4229	4234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148641527
68	NC_009516	TAG	2	6	4248	4253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148641527
69	NC_009516	AAAG	2	8	4255	4262	75 %	0 %	25 %	0 %	148641527
70	NC_009516	A	6	6	4310	4315	100 %	0 %	0 %	0 %	148641527
71	NC_009516	TAG	2	6	4363	4368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148641527
72	NC_009516	AAG	2	6	4369	4374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148641527
73	NC_009516	AGT	2	6	4394	4399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148641527
74	NC_009516	CAA	2	6	4411	4416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148641527
75	NC_009516	TA	3	6	4457	4462	50 %	50 %	0 %	0 %	148641527
76	NC_009516	TAAT	2	8	4467	4474	50 %	50 %	0 %	0 %	148641527
77	NC_009516	ATG	2	6	4511	4516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148641527
78	NC_009516	A	6	6	4599	4604	100 %	0 %	0 %	0 %	148641527
79	NC_009516	TTA	2	6	4611	4616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148641527
80	NC_009516	TAA	2	6	4720	4725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148641527
81	NC_009516	CGT	2	6	4744	4749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148641527
82	NC_009516	ATC	2	6	4750	4755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148641527
83	NC_009516	AGA	2	6	4763	4768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148641527
84	NC_009516	AAC	2	6	4946	4951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148641527
85	NC_009516	TGA	2	6	4972	4977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148641527
86	NC_009516	GA	3	6	5002	5007	50 %	0 %	50 %	0 %	148641527
87	NC_009516	ACT	2	6	5125	5130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148641527
88	NC_009516	TGA	2	6	5194	5199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148641527
89	NC_009516	CGAGT	3	15	5202	5216	20 %	20 %	40 %	20 %	148641527
90	NC_009516	AAG	2	6	5225	5230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148641527
91	NC_009516	A	6	6	5242	5247	100 %	0 %	0 %	0 %	148641527
92	NC_009516	AGAT	2	8	5917	5924	50 %	25 %	25 %	0 %	148641528
93	NC_009516	TAC	2	6	5963	5968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148641528
94	NC_009516	CCA	2	6	5994	5999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148641528
95	NC_009516	AAAATA	2	12	6019	6030	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	148641528
96	NC_009516	TGGAGA	2	12	6094	6105	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	148641528
97	NC_009516	A	6	6	6110	6115	100 %	0 %	0 %	0 %	148641528
98	NC_009516	GCA	3	9	6125	6133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148641528
99	NC_009516	ATC	2	6	6139	6144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148641528
100	NC_009516	GTTG	2	8	6152	6159	0 %	50 %	50 %	0 %	148641528
101	NC_009516	TAAG	2	8	6187	6194	50 %	25 %	25 %	0 %	148641528
102	NC_009516	TC	3	6	6280	6285	0 %	50 %	0 %	50 %	148641528
103	NC_009516	AAC	2	6	6294	6299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148641528
104	NC_009516	ATTCAA	2	12	6340	6351	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148641528
105	NC_009516	CTA	2	6	6358	6363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148641528
106	NC_009516	AAG	2	6	6367	6372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148641528
107	NC_009516	TGG	2	6	6399	6404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148641528
108	NC_009516	TCA	2	6	6558	6563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148641529
109	NC_009516	CAG	2	6	6644	6649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148641529
110	NC_009516	TAA	2	6	6811	6816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148641529
111	NC_009516	CAG	2	6	6854	6859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148641529
112	NC_009516	AGC	2	6	6970	6975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148641530
113	NC_009516	GAG	2	6	7008	7013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148641530
114	NC_009516	TC	3	6	7021	7026	0 %	50 %	0 %	50 %	148641530
115	NC_009516	AGC	2	6	7057	7062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148641530
116	NC_009516	A	6	6	7116	7121	100 %	0 %	0 %	0 %	148641530
117	NC_009516	GGT	2	6	7137	7142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148641530
118	NC_009516	TA	3	6	7215	7220	50 %	50 %	0 %	0 %	148641531
119	NC_009516	CAAT	2	8	7258	7265	50 %	25 %	0 %	25 %	148641531
120	NC_009516	AGA	2	6	7320	7325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148641531
121	NC_009516	AAT	2	6	7331	7336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148641531
122	NC_009516	CAG	2	6	7463	7468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148641531
123	NC_009516	GTA	2	6	7486	7491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148641531
124	NC_009516	TTG	2	6	7520	7525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148641531
125	NC_009516	AT	3	6	7533	7538	50 %	50 %	0 %	0 %	148641531
126	NC_009516	CAT	2	6	7672	7677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148641531
127	NC_009516	TGC	2	6	7739	7744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148641531
128	NC_009516	CT	3	6	7760	7765	0 %	50 %	0 %	50 %	148641531
129	NC_009516	TAA	2	6	7837	7842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148641531
130	NC_009516	TAT	2	6	8814	8819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148641532
131	NC_009516	CAAGC	2	10	8948	8957	40 %	0 %	20 %	40 %	148641532
132	NC_009516	TA	3	6	8970	8975	50 %	50 %	0 %	0 %	148641532
133	NC_009516	CTA	2	6	8976	8981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148641532
134	NC_009516	ATT	2	6	9002	9007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148641532
135	NC_009516	ACA	2	6	9027	9032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148641532
136	NC_009516	AGC	2	6	9033	9038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148641532
137	NC_009516	TAAAGG	2	12	9195	9206	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148641532
138	NC_009516	CAG	2	6	9319	9324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148641532
139	NC_009516	GCA	2	6	9362	9367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148641532
140	NC_009516	ATT	2	6	9517	9522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148641533
141	NC_009516	ATC	2	6	9523	9528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148641533
142	NC_009516	ACC	2	6	9604	9609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148641533
143	NC_009516	TGC	2	6	9643	9648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148641533
144	NC_009516	CTG	2	6	9662	9667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148641533
145	NC_009516	TCT	2	6	9689	9694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148641533
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147	NC_009516	TGGTA	2	10	9796	9805	20 %	40 %	40 %	0 %	148641533
148	NC_009516	ATT	2	6	9821	9826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148641533
149	NC_009516	TTG	2	6	9842	9847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148641533
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152	NC_009516	AATC	2	8	9918	9925	50 %	25 %	0 %	25 %	148641533
153	NC_009516	TAT	2	6	10146	10151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148641534
154	NC_009516	GTA	2	6	10166	10171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148641534
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157	NC_009516	AAC	2	6	10249	10254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148641534
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182	NC_009516	A	6	6	12099	12104	100 %	0 %	0 %	0 %	148641536
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212	NC_009516	CT	3	6	13854	13859	0 %	50 %	0 %	50 %	148641538
213	NC_009516	ATA	2	6	13889	13894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148641538

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.