MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida F1 chromosome

Total Repeats: 114169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_009512	CGA	2	6	196370	196375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545441
3502	NC_009512	GTC	2	6	196440	196445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545441
3503	NC_009512	TGG	2	6	196468	196473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545441
3504	NC_009512	GCC	2	6	196539	196544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545441
3505	NC_009512	GGC	2	6	196545	196550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545441
3506	NC_009512	TGGC	2	8	196568	196575	0 %	25 %	50 %	25 %	148545441
3507	NC_009512	CG	4	8	196583	196590	0 %	0 %	50 %	50 %	148545441
3508	NC_009512	GTTG	2	8	196657	196664	0 %	50 %	50 %	0 %	148545441
3509	NC_009512	TGT	2	6	196666	196671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545441
3510	NC_009512	CGC	2	6	196764	196769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545441
3511	NC_009512	CACG	2	8	196795	196802	25 %	0 %	25 %	50 %	148545441
3512	NC_009512	CGC	2	6	196812	196817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545441
3513	NC_009512	TGCG	2	8	196894	196901	0 %	25 %	50 %	25 %	148545441
3514	NC_009512	CCG	2	6	196937	196942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545441
3515	NC_009512	CG	4	8	196988	196995	0 %	0 %	50 %	50 %	148545441
3516	NC_009512	CTG	2	6	197004	197009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545441
3517	NC_009512	TGC	2	6	197011	197016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545441
3518	NC_009512	CTGG	2	8	197028	197035	0 %	25 %	50 %	25 %	148545441
3519	NC_009512	CGCC	2	8	197042	197049	0 %	0 %	25 %	75 %	148545441
3520	NC_009512	GGC	2	6	197052	197057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545441
3521	NC_009512	TGC	2	6	197074	197079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545441
3522	NC_009512	CGT	2	6	197100	197105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545441
3523	NC_009512	CGG	2	6	197153	197158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545441
3524	NC_009512	GAG	2	6	197193	197198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148545441
3525	NC_009512	CAC	2	6	197314	197319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545441
3526	NC_009512	CGA	2	6	197339	197344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545441
3527	NC_009512	TGC	2	6	197405	197410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545441
3528	NC_009512	GTT	2	6	197480	197485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545441
3529	NC_009512	CCAG	2	8	197489	197496	25 %	0 %	25 %	50 %	148545441
3530	NC_009512	CAC	2	6	197529	197534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545441
3531	NC_009512	CGG	2	6	197578	197583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545441
3532	NC_009512	TGCTGG	2	12	197635	197646	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148545441
3533	NC_009512	CCG	2	6	197701	197706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545441
3534	NC_009512	GCT	2	6	197747	197752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545441
3535	NC_009512	GCG	2	6	197763	197768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545441
3536	NC_009512	GAG	2	6	197799	197804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148545441
3537	NC_009512	GCAG	2	8	197816	197823	25 %	0 %	50 %	25 %	148545441
3538	NC_009512	AGC	2	6	197977	197982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545441
3539	NC_009512	GCG	2	6	198015	198020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545441
3540	NC_009512	TGG	2	6	198118	198123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545441
3541	NC_009512	GC	3	6	198326	198331	0 %	0 %	50 %	50 %	148545442
3542	NC_009512	ATG	2	6	198360	198365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545442
3543	NC_009512	CCA	2	6	198397	198402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545442
3544	NC_009512	CAG	2	6	198416	198421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545442
3545	NC_009512	TCG	2	6	198429	198434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545442
3546	NC_009512	TCT	2	6	198484	198489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545442
3547	NC_009512	GTC	2	6	198650	198655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545442
3548	NC_009512	GAT	2	6	198671	198676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545442
3549	NC_009512	CTGG	2	8	198685	198692	0 %	25 %	50 %	25 %	148545442
3550	NC_009512	CAG	2	6	198716	198721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545442
3551	NC_009512	GTC	2	6	198773	198778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545442
3552	NC_009512	TGG	2	6	198790	198795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545442
3553	NC_009512	GTGC	2	8	198816	198823	0 %	25 %	50 %	25 %	148545442
3554	NC_009512	GCC	2	6	198900	198905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545442
3555	NC_009512	GC	3	6	198909	198914	0 %	0 %	50 %	50 %	148545442
3556	NC_009512	GGCGCA	2	12	198967	198978	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148545442
3557	NC_009512	CCA	2	6	199009	199014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545442
3558	NC_009512	GCA	2	6	199042	199047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545442
3559	NC_009512	CTG	2	6	199100	199105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545442
3560	NC_009512	CTG	2	6	199118	199123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545442
3561	NC_009512	GCC	2	6	199130	199135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545442
3562	NC_009512	CTC	2	6	199178	199183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148545442
3563	NC_009512	GCC	2	6	199188	199193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545442
3564	NC_009512	TCG	2	6	199221	199226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545442
3565	NC_009512	GCA	2	6	199342	199347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545442
3566	NC_009512	TGGC	2	8	199349	199356	0 %	25 %	50 %	25 %	148545442
3567	NC_009512	CGA	2	6	199363	199368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545442
3568	NC_009512	CCT	2	6	199375	199380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148545442
3569	NC_009512	CGA	2	6	199396	199401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545442
3570	NC_009512	GCC	2	6	199403	199408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545442
3571	NC_009512	TCT	2	6	199423	199428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545442
3572	NC_009512	GCCTT	2	10	199449	199458	0 %	40 %	20 %	40 %	148545442
3573	NC_009512	TCG	2	6	199473	199478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545442
3574	NC_009512	GAA	2	6	199514	199519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545442
3575	NC_009512	CAC	2	6	199547	199552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545442
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3577	NC_009512	CTT	2	6	199689	199694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545443
3578	NC_009512	CGAT	2	8	199744	199751	25 %	25 %	25 %	25 %	148545443
3579	NC_009512	CAG	2	6	199800	199805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545443
3580	NC_009512	CCA	2	6	199820	199825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545443
3581	NC_009512	GCT	2	6	199838	199843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545443
3582	NC_009512	TTC	2	6	199851	199856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545443
3583	NC_009512	CAG	3	9	199890	199898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545443
3584	NC_009512	AGC	2	6	199915	199920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545443
3585	NC_009512	GCC	2	6	199950	199955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545443
3586	NC_009512	CGCC	2	8	200027	200034	0 %	0 %	25 %	75 %	148545443
3587	NC_009512	CAG	2	6	200112	200117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545443
3588	NC_009512	TGT	2	6	200144	200149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545443
3589	NC_009512	CAG	2	6	200196	200201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545443
3590	NC_009512	CCA	2	6	200206	200211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545443
3591	NC_009512	GAT	2	6	200274	200279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545443
3592	NC_009512	TTC	2	6	200317	200322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545443
3593	NC_009512	CTG	2	6	200334	200339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545443
3594	NC_009512	GCA	2	6	200384	200389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545443
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3596	NC_009512	CCA	2	6	200549	200554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545443
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3598	NC_009512	GAT	2	6	200580	200585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545443
3599	NC_009512	CAG	2	6	200634	200639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545443
3600	NC_009512	GTT	2	6	200742	200747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545443
3601	NC_009512	GAT	2	6	200886	200891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545443
3602	NC_009512	ATG	2	6	200917	200922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545443
3603	NC_009512	GGTCAG	2	12	200970	200981	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148545443
3604	NC_009512	CGAGG	2	10	200982	200991	20 %	0 %	60 %	20 %	148545443
3605	NC_009512	GCCG	2	8	201046	201053	0 %	0 %	50 %	50 %	148545443
3606	NC_009512	CGA	2	6	201071	201076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545443
3607	NC_009512	GAT	2	6	201099	201104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545443
3608	NC_009512	GGTC	2	8	201107	201114	0 %	25 %	50 %	25 %	148545443
3609	NC_009512	TGCC	2	8	201119	201126	0 %	25 %	25 %	50 %	148545443
3610	NC_009512	CAC	2	6	201231	201236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545443
3611	NC_009512	TCA	2	6	201251	201256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545443
3612	NC_009512	GCG	2	6	201263	201268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545443
3613	NC_009512	GGC	2	6	201300	201305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545443
3614	NC_009512	TGC	2	6	201329	201334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545443
3615	NC_009512	GCA	2	6	201335	201340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545443
3616	NC_009512	CG	3	6	201363	201368	0 %	0 %	50 %	50 %	148545443
3617	NC_009512	TGC	2	6	201403	201408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545443
3618	NC_009512	GAA	2	6	201417	201422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545443
3619	NC_009512	GC	3	6	201501	201506	0 %	0 %	50 %	50 %	148545443
3620	NC_009512	AGC	3	9	201556	201564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545443
3621	NC_009512	GCA	2	6	201650	201655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545443
3622	NC_009512	TGT	2	6	201693	201698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545443
3623	NC_009512	AC	3	6	201733	201738	50 %	0 %	0 %	50 %	148545443
3624	NC_009512	CAG	2	6	201744	201749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545443
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3634	NC_009512	CAG	2	6	203036	203041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545445
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3644	NC_009512	GGGCT	2	10	203256	203265	0 %	20 %	60 %	20 %	148545445
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3650	NC_009512	GTA	2	6	203581	203586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545445
3651	NC_009512	GGT	3	9	203589	203597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545445
3652	NC_009512	ACC	2	6	203658	203663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545445
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3979	NC_009512	ATCG	2	8	220502	220509	25 %	25 %	25 %	25 %	148545445
3980	NC_009512	CGA	2	6	220586	220591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545445
3981	NC_009512	CAA	2	6	220733	220738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545445
3982	NC_009512	GC	3	6	220771	220776	0 %	0 %	50 %	50 %	148545445
3983	NC_009512	ACG	2	6	220813	220818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545445
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