MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida F1 chromosome

Total Repeats: 114169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_009512	GGTG	2	8	140073	140080	0 %	25 %	75 %	0 %	148545395
2502	NC_009512	GCA	2	6	140184	140189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545395
2503	NC_009512	TCCAG	2	10	140244	140253	20 %	20 %	20 %	40 %	148545395
2504	NC_009512	CGGT	2	8	140258	140265	0 %	25 %	50 %	25 %	148545395
2505	NC_009512	GCG	2	6	140266	140271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545395
2506	NC_009512	GAT	2	6	140275	140280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545395
2507	NC_009512	TG	3	6	140304	140309	0 %	50 %	50 %	0 %	148545395
2508	NC_009512	GTT	2	6	140341	140346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545395
2509	NC_009512	GCA	2	6	140382	140387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545395
2510	NC_009512	AGC	2	6	140480	140485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545395
2511	NC_009512	GAA	2	6	140491	140496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545395
2512	NC_009512	GAA	2	6	140563	140568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545395
2513	NC_009512	CGG	2	6	140586	140591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545395
2514	NC_009512	ATG	2	6	140681	140686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545395
2515	NC_009512	CGT	2	6	140964	140969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545396
2516	NC_009512	CCG	2	6	140970	140975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545396
2517	NC_009512	GAC	2	6	140983	140988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545396
2518	NC_009512	TGG	2	6	141137	141142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545397
2519	NC_009512	TCC	2	6	141148	141153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148545397
2520	NC_009512	CGGTG	2	10	141213	141222	0 %	20 %	60 %	20 %	148545397
2521	NC_009512	GCAA	2	8	141254	141261	50 %	0 %	25 %	25 %	148545397
2522	NC_009512	GTG	2	6	141283	141288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545397
2523	NC_009512	GGC	2	6	141301	141306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545397
2524	NC_009512	GCT	2	6	141420	141425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545397
2525	NC_009512	GT	3	6	141426	141431	0 %	50 %	50 %	0 %	148545397
2526	NC_009512	GAC	2	6	141448	141453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545397
2527	NC_009512	GC	3	6	141469	141474	0 %	0 %	50 %	50 %	148545397
2528	NC_009512	GCC	2	6	141481	141486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545397
2529	NC_009512	ATC	2	6	141502	141507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545397
2530	NC_009512	TGG	2	6	141536	141541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545397
2531	NC_009512	TGGC	2	8	141590	141597	0 %	25 %	50 %	25 %	148545397
2532	NC_009512	CAT	2	6	141630	141635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545397
2533	NC_009512	ACA	2	6	141668	141673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545397
2534	NC_009512	A	6	6	141698	141703	100 %	0 %	0 %	0 %	148545397
2535	NC_009512	GCT	2	6	141714	141719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545397
2536	NC_009512	CGG	3	9	141729	141737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545397
2537	NC_009512	GGA	2	6	141816	141821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148545397
2538	NC_009512	CCA	2	6	141857	141862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545397
2539	NC_009512	GTCGAG	2	12	141886	141897	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148545397
2540	NC_009512	TGA	2	6	142005	142010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545397
2541	NC_009512	CTGG	2	8	142089	142096	0 %	25 %	50 %	25 %	148545397
2542	NC_009512	ACC	2	6	142138	142143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545397
2543	NC_009512	CAG	2	6	142156	142161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545397
2544	NC_009512	GC	3	6	142238	142243	0 %	0 %	50 %	50 %	148545397
2545	NC_009512	GGA	2	6	142293	142298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148545397
2546	NC_009512	GGCCAA	2	12	142302	142313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545397
2547	NC_009512	C	7	7	142361	142367	0 %	0 %	0 %	100 %	148545397
2548	NC_009512	ACCAC	2	10	142472	142481	40 %	0 %	0 %	60 %	148545397
2549	NC_009512	AGC	2	6	142517	142522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545397
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2551	NC_009512	CGC	2	6	142563	142568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545397
2552	NC_009512	GAGCTG	2	12	142765	142776	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148545397
2553	NC_009512	AGC	2	6	142823	142828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545397
2554	NC_009512	GCCA	2	8	142886	142893	25 %	0 %	25 %	50 %	148545397
2555	NC_009512	CCG	2	6	142898	142903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545397
2556	NC_009512	CGA	2	6	142914	142919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545397
2557	NC_009512	CAG	2	6	143053	143058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545397
2558	NC_009512	GGC	2	6	143064	143069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545397
2559	NC_009512	CCGG	2	8	143072	143079	0 %	0 %	50 %	50 %	148545397
2560	NC_009512	GTC	2	6	143082	143087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545397
2561	NC_009512	GCG	2	6	143133	143138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545397
2562	NC_009512	GGC	2	6	143181	143186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545397
2563	NC_009512	CAT	2	6	143211	143216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545397
2564	NC_009512	TGC	2	6	143243	143248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545397
2565	NC_009512	ACC	2	6	143323	143328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545397
2566	NC_009512	TGGCC	2	10	143388	143397	0 %	20 %	40 %	40 %	148545397
2567	NC_009512	GGC	2	6	143499	143504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545397
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2569	NC_009512	CCCTG	2	10	143571	143580	0 %	20 %	20 %	60 %	148545397
2570	NC_009512	CTG	2	6	143627	143632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545397
2571	NC_009512	CAT	2	6	143637	143642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545397
2572	NC_009512	ACG	2	6	143717	143722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545397
2573	NC_009512	TGG	2	6	143750	143755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545397
2574	NC_009512	GCT	2	6	143814	143819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545397
2575	NC_009512	TCCA	2	8	144290	144297	25 %	25 %	0 %	50 %	148545398
2576	NC_009512	C	6	6	144372	144377	0 %	0 %	0 %	100 %	148545398
2577	NC_009512	CAG	2	6	144406	144411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545398
2578	NC_009512	CAG	2	6	144454	144459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545398
2579	NC_009512	TGC	2	6	144474	144479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545398
2580	NC_009512	CAT	2	6	144499	144504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545398
2581	NC_009512	CAT	2	6	144538	144543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545398
2582	NC_009512	CACGC	2	10	144550	144559	20 %	0 %	20 %	60 %	148545398
2583	NC_009512	TGC	2	6	144605	144610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545398
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2586	NC_009512	GTC	2	6	144811	144816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545398
2587	NC_009512	GCT	2	6	145110	145115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545399
2588	NC_009512	GCA	2	6	145243	145248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545399
2589	NC_009512	GCC	2	6	145317	145322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545399
2590	NC_009512	TGA	2	6	145431	145436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545400
2591	NC_009512	CTG	2	6	145454	145459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545400
2592	NC_009512	CTG	2	6	145488	145493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545400
2593	NC_009512	GCC	2	6	145514	145519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545400
2594	NC_009512	GGCCA	2	10	145523	145532	20 %	0 %	40 %	40 %	148545400
2595	NC_009512	CCG	2	6	145536	145541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545400
2596	NC_009512	GGCC	2	8	145600	145607	0 %	0 %	50 %	50 %	148545400
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2599	NC_009512	CCAG	2	8	145734	145741	25 %	0 %	25 %	50 %	148545400
2600	NC_009512	GCC	2	6	145757	145762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545400
2601	NC_009512	TGG	2	6	145801	145806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545400
2602	NC_009512	GGGC	2	8	145891	145898	0 %	0 %	75 %	25 %	148545400
2603	NC_009512	AGC	2	6	145920	145925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545400
2604	NC_009512	GCGCT	2	10	146221	146230	0 %	20 %	40 %	40 %	148545401
2605	NC_009512	CGC	2	6	146234	146239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545401
2606	NC_009512	GCC	2	6	146268	146273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545401
2607	NC_009512	GTC	2	6	146346	146351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545401
2608	NC_009512	TGC	2	6	146534	146539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545401
2609	NC_009512	GGACAA	2	12	146621	146632	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	148545401
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2611	NC_009512	GTC	2	6	146730	146735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545401
2612	NC_009512	CGG	2	6	146768	146773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545401
2613	NC_009512	GC	3	6	146819	146824	0 %	0 %	50 %	50 %	148545401
2614	NC_009512	GGC	2	6	146834	146839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545401
2615	NC_009512	GCT	2	6	146948	146953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545402
2616	NC_009512	GCA	2	6	147017	147022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545402
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2618	NC_009512	AGA	2	6	147058	147063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545402
2619	NC_009512	TGG	2	6	147091	147096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545402
2620	NC_009512	GGC	2	6	147114	147119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545402
2621	NC_009512	CAG	2	6	147189	147194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545402
2622	NC_009512	CAGCA	2	10	147222	147231	40 %	0 %	20 %	40 %	148545402
2623	NC_009512	GCC	2	6	147244	147249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545402
2624	NC_009512	CCGG	2	8	147288	147295	0 %	0 %	50 %	50 %	148545402
2625	NC_009512	GGCGAA	2	12	147321	147332	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	148545402
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2724	NC_009512	CCCAG	2	10	152444	152453	20 %	0 %	20 %	60 %	148545406
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2732	NC_009512	CAG	2	6	152755	152760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545406
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2740	NC_009512	GCA	2	6	153039	153044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545406
2741	NC_009512	GTC	2	6	153139	153144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545406
2742	NC_009512	GTT	2	6	153186	153191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545406
2743	NC_009512	GCT	2	6	153226	153231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545406
2744	NC_009512	CCAGC	2	10	153250	153259	20 %	0 %	20 %	60 %	148545406
2745	NC_009512	GGC	2	6	153291	153296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545406
2746	NC_009512	GAT	2	6	153307	153312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545406
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2777	NC_009512	CGGG	2	8	154432	154439	0 %	0 %	75 %	25 %	148545407
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2844	NC_009512	TCG	2	6	158668	158673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545412
2845	NC_009512	TCCA	2	8	158698	158705	25 %	25 %	0 %	50 %	148545412
2846	NC_009512	GCA	2	6	158777	158782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545412
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2850	NC_009512	GCAG	2	8	158909	158916	25 %	0 %	50 %	25 %	148545412
2851	NC_009512	TCAC	2	8	158974	158981	25 %	25 %	0 %	50 %	148545412
2852	NC_009512	GCT	2	6	159056	159061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545412
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2854	NC_009512	CTT	2	6	159104	159109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545412
2855	NC_009512	CAT	2	6	159173	159178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545412
2856	NC_009512	TGC	2	6	159226	159231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545412
2857	NC_009512	TCGT	2	8	159282	159289	0 %	50 %	25 %	25 %	148545412
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2859	NC_009512	CAG	2	6	159393	159398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545412
2860	NC_009512	CTG	3	9	159399	159407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545412
2861	NC_009512	TCGT	2	8	159459	159466	0 %	50 %	25 %	25 %	148545412
2862	NC_009512	CTG	2	6	159471	159476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545412
2863	NC_009512	GGCCT	2	10	159510	159519	0 %	20 %	40 %	40 %	148545412
2864	NC_009512	CAT	2	6	159539	159544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545412
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2943	NC_009512	CGGT	2	8	162794	162801	0 %	25 %	50 %	25 %	148545416
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2974	NC_009512	GGCGC	2	10	164118	164127	0 %	0 %	60 %	40 %	148545417
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2978	NC_009512	AGC	2	6	164293	164298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545417
2979	NC_009512	CTGG	2	8	164301	164308	0 %	25 %	50 %	25 %	148545417
2980	NC_009512	CAG	2	6	164364	164369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545417
2981	NC_009512	CGG	2	6	164378	164383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545417
2982	NC_009512	GGC	2	6	164390	164395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545417
2983	NC_009512	GCTG	2	8	164399	164406	0 %	25 %	50 %	25 %	148545417
2984	NC_009512	TGCG	2	8	164434	164441	0 %	25 %	50 %	25 %	148545417
2985	NC_009512	GCTC	2	8	164447	164454	0 %	25 %	25 %	50 %	148545417
2986	NC_009512	GCAG	2	8	164504	164511	25 %	0 %	50 %	25 %	148545417
2987	NC_009512	GGT	2	6	164547	164552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545417
2988	NC_009512	CAT	2	6	164783	164788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545418
2989	NC_009512	ACC	2	6	164791	164796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545418
2990	NC_009512	GCA	2	6	164804	164809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545418
2991	NC_009512	TGGG	2	8	164867	164874	0 %	25 %	75 %	0 %	148545418
2992	NC_009512	CCTT	2	8	164905	164912	0 %	50 %	0 %	50 %	148545418
2993	NC_009512	CCG	2	6	164917	164922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545418
2994	NC_009512	CTG	2	6	165034	165039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545418
2995	NC_009512	GGC	2	6	165051	165056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545418
2996	NC_009512	CGG	2	6	165135	165140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545418
2997	NC_009512	GCA	2	6	165152	165157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545418
2998	NC_009512	GCCA	2	8	165158	165165	25 %	0 %	25 %	50 %	148545418
2999	NC_009512	ACCG	2	8	165171	165178	25 %	0 %	25 %	50 %	148545418
3000	NC_009512	CGGCG	2	10	165203	165212	0 %	0 %	60 %	40 %	148545418

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