MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida F1 chromosome

Total Repeats: 114169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_009512	TGC	2	6	114723	114728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545368
2002	NC_009512	GCA	2	6	114755	114760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545368
2003	NC_009512	TGAG	2	8	114761	114768	25 %	25 %	50 %	0 %	148545368
2004	NC_009512	TGA	2	6	114842	114847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545369
2005	NC_009512	ACG	3	9	114854	114862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545369
2006	NC_009512	ACCGC	2	10	114867	114876	20 %	0 %	20 %	60 %	148545369
2007	NC_009512	ACC	2	6	114956	114961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545369
2008	NC_009512	GCG	2	6	114973	114978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545369
2009	NC_009512	TTC	2	6	115003	115008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545369
2010	NC_009512	GGC	2	6	115237	115242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545370
2011	NC_009512	TGC	2	6	115254	115259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545370
2012	NC_009512	CAT	2	6	115285	115290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545370
2013	NC_009512	GCT	2	6	115357	115362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545370
2014	NC_009512	GCC	2	6	115376	115381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545370
2015	NC_009512	CAC	2	6	115383	115388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545370
2016	NC_009512	TCA	2	6	115419	115424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545370
2017	NC_009512	GC	3	6	115448	115453	0 %	0 %	50 %	50 %	148545370
2018	NC_009512	GCAA	2	8	115521	115528	50 %	0 %	25 %	25 %	148545370
2019	NC_009512	CGC	2	6	115576	115581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545370
2020	NC_009512	GCA	2	6	115665	115670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545370
2021	NC_009512	AGCA	2	8	115761	115768	50 %	0 %	25 %	25 %	148545370
2022	NC_009512	GGT	2	6	115779	115784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545370
2023	NC_009512	TGC	2	6	115828	115833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545370
2024	NC_009512	GCA	2	6	115921	115926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545370
2025	NC_009512	GAG	2	6	115943	115948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148545370
2026	NC_009512	CCT	2	6	115954	115959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148545370
2027	NC_009512	TGT	2	6	116215	116220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545370
2028	NC_009512	GCA	2	6	116230	116235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545370
2029	NC_009512	GTT	2	6	116248	116253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545370
2030	NC_009512	TGC	2	6	116262	116267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545370
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2032	NC_009512	GGT	3	9	116452	116460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545370
2033	NC_009512	CAC	2	6	116555	116560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545370
2034	NC_009512	CTG	2	6	116561	116566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545370
2035	NC_009512	GTAC	2	8	116567	116574	25 %	25 %	25 %	25 %	148545370
2036	NC_009512	GTT	2	6	116626	116631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545370
2037	NC_009512	TGG	2	6	116673	116678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545370
2038	NC_009512	GC	3	6	116687	116692	0 %	0 %	50 %	50 %	148545370
2039	NC_009512	ACG	2	6	116697	116702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545370
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2041	NC_009512	GCAA	2	8	116718	116725	50 %	0 %	25 %	25 %	148545370
2042	NC_009512	GCA	2	6	116752	116757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545370
2043	NC_009512	GGA	2	6	116764	116769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148545370
2044	NC_009512	CG	4	8	116864	116871	0 %	0 %	50 %	50 %	148545370
2045	NC_009512	ACC	2	6	116922	116927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545370
2046	NC_009512	TAC	2	6	116951	116956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545370
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2048	NC_009512	GGC	2	6	117111	117116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545370
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2050	NC_009512	CA	3	6	117277	117282	50 %	0 %	0 %	50 %	148545371
2051	NC_009512	GAT	2	6	117315	117320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545371
2052	NC_009512	GCCC	2	8	117474	117481	0 %	0 %	25 %	75 %	148545371
2053	NC_009512	CGC	2	6	117548	117553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545371
2054	NC_009512	GC	3	6	117595	117600	0 %	0 %	50 %	50 %	148545371
2055	NC_009512	TGC	2	6	117730	117735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545371
2056	NC_009512	CTG	2	6	117747	117752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545371
2057	NC_009512	TGA	2	6	117784	117789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545371
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2060	NC_009512	GAT	2	6	117920	117925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545371
2061	NC_009512	GAT	2	6	117929	117934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545371
2062	NC_009512	GGC	2	6	117965	117970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545371
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2064	NC_009512	GCG	2	6	117993	117998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545371
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2104	NC_009512	ATC	2	6	120660	120665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545373
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2118	NC_009512	GGCC	2	8	121105	121112	0 %	0 %	50 %	50 %	148545374
2119	NC_009512	ACC	2	6	121153	121158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545374
2120	NC_009512	GGC	3	9	121175	121183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545374
2121	NC_009512	GCT	2	6	121375	121380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545375
2122	NC_009512	TC	3	6	121386	121391	0 %	50 %	0 %	50 %	148545375
2123	NC_009512	TCG	2	6	121439	121444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545375
2124	NC_009512	GTG	2	6	121450	121455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545375
2125	NC_009512	CAC	2	6	121456	121461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545375
2126	NC_009512	TGG	2	6	121499	121504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545375
2127	NC_009512	GTG	2	6	121523	121528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545375
2128	NC_009512	GCT	2	6	121545	121550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545375
2129	NC_009512	CCA	2	6	121584	121589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545375
2130	NC_009512	CAG	2	6	121615	121620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545375
2131	NC_009512	GGC	2	6	121655	121660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545375
2132	NC_009512	GGC	2	6	121738	121743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545375
2133	NC_009512	CAG	2	6	121747	121752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545375
2134	NC_009512	GC	3	6	121786	121791	0 %	0 %	50 %	50 %	148545375
2135	NC_009512	GGCTT	2	10	121900	121909	0 %	40 %	40 %	20 %	148545375
2136	NC_009512	CAG	2	6	121923	121928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545375
2137	NC_009512	ATG	2	6	122308	122313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545376
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2139	NC_009512	CGC	2	6	122370	122375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545376
2140	NC_009512	TCT	2	6	122444	122449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545376
2141	NC_009512	GTG	2	6	122473	122478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545376
2142	NC_009512	CCG	2	6	122511	122516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545376
2143	NC_009512	CAG	2	6	122527	122532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545376
2144	NC_009512	TGG	2	6	122597	122602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545376
2145	NC_009512	CCA	2	6	122618	122623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545376
2146	NC_009512	GACATC	2	12	122659	122670	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148545376
2147	NC_009512	TTC	2	6	122728	122733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545376
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2149	NC_009512	CTG	2	6	122794	122799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545376
2150	NC_009512	TGC	2	6	122819	122824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545376
2151	NC_009512	CTG	2	6	122855	122860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545376
2152	NC_009512	TGG	2	6	122878	122883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545376
2153	NC_009512	GGT	3	9	123015	123023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545376
2154	NC_009512	CTGG	2	8	123054	123061	0 %	25 %	50 %	25 %	148545376
2155	NC_009512	GCC	2	6	123079	123084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545376
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2157	NC_009512	ACCAC	2	10	123152	123161	40 %	0 %	0 %	60 %	148545376
2158	NC_009512	GCC	2	6	123198	123203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545376
2159	NC_009512	GAAG	2	8	123246	123253	50 %	0 %	50 %	0 %	148545376
2160	NC_009512	ACC	2	6	123254	123259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545376
2161	NC_009512	AGC	2	6	123311	123316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545376
2162	NC_009512	GCT	2	6	123334	123339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545376
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2165	NC_009512	CGA	2	6	123493	123498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545377
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2167	NC_009512	ACC	2	6	123560	123565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545377
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2171	NC_009512	TCG	2	6	123756	123761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545377
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2193	NC_009512	GTT	2	6	124432	124437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545377
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2200	NC_009512	GTC	2	6	124885	124890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545377
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2209	NC_009512	CAG	2	6	125471	125476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545378
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2222	NC_009512	CTT	2	6	125966	125971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545379
2223	NC_009512	GCT	2	6	126077	126082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545379
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2226	NC_009512	CAC	2	6	126198	126203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545379
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2228	NC_009512	TTC	2	6	126357	126362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545379
2229	NC_009512	TCG	2	6	126499	126504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545379
2230	NC_009512	TGTGG	2	10	126506	126515	0 %	40 %	60 %	0 %	148545379
2231	NC_009512	GTT	2	6	126521	126526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545379
2232	NC_009512	TGT	2	6	126541	126546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545379
2233	NC_009512	TCA	2	6	126694	126699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545380
2234	NC_009512	TGG	2	6	126865	126870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545381
2235	NC_009512	CTG	2	6	126879	126884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545381
2236	NC_009512	TGC	2	6	126940	126945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545381
2237	NC_009512	CTC	2	6	126996	127001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148545381
2238	NC_009512	AGA	2	6	127007	127012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545381
2239	NC_009512	CCG	2	6	127022	127027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545381
2240	NC_009512	TGC	2	6	127066	127071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545381
2241	NC_009512	GCT	2	6	127109	127114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545381
2242	NC_009512	TGGC	2	8	127163	127170	0 %	25 %	50 %	25 %	148545381
2243	NC_009512	CCG	2	6	127184	127189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545381
2244	NC_009512	CGG	2	6	127289	127294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545381
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2251	NC_009512	GCCA	2	8	127867	127874	25 %	0 %	25 %	50 %	148545382
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2345	NC_009512	CAG	2	6	132219	132224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545387
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2357	NC_009512	CGA	2	6	132694	132699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545388
2358	NC_009512	CGG	2	6	132738	132743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545388
2359	NC_009512	CAG	2	6	132806	132811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545388
2360	NC_009512	TGG	2	6	132850	132855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545388
2361	NC_009512	TCG	2	6	132858	132863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545388
2362	NC_009512	TGG	2	6	132883	132888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545388
2363	NC_009512	GCT	2	6	132913	132918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545388
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2365	NC_009512	AGT	2	6	132981	132986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545388
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2380	NC_009512	ACCG	2	8	134163	134170	25 %	0 %	25 %	50 %	148545389
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2384	NC_009512	ATC	2	6	134551	134556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545389
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2392	NC_009512	CAA	2	6	134799	134804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545389
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2399	NC_009512	CAT	2	6	135042	135047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545389
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2401	NC_009512	GGC	3	9	135141	135149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545389
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2468	NC_009512	GTC	2	6	138027	138032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545392
2469	NC_009512	CGAC	2	8	138079	138086	25 %	0 %	25 %	50 %	148545392
2470	NC_009512	TGA	2	6	138246	138251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545393
2471	NC_009512	TGC	2	6	138264	138269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545393
2472	NC_009512	GCTCGA	2	12	138273	138284	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148545393
2473	NC_009512	GCGAT	3	15	138366	138380	20 %	20 %	40 %	20 %	148545393
2474	NC_009512	CAG	2	6	138397	138402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545393
2475	NC_009512	GCG	2	6	138429	138434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545393
2476	NC_009512	CGGCG	3	15	138430	138444	0 %	0 %	60 %	40 %	148545393
2477	NC_009512	CGG	2	6	138524	138529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545393
2478	NC_009512	CGTG	2	8	138768	138775	0 %	25 %	50 %	25 %	148545394
2479	NC_009512	GCA	2	6	138798	138803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545394
2480	NC_009512	AGG	2	6	138821	138826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148545394
2481	NC_009512	TGC	3	9	138845	138853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545394
2482	NC_009512	CAC	2	6	138871	138876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545394
2483	NC_009512	TGCGC	2	10	138879	138888	0 %	20 %	40 %	40 %	148545394
2484	NC_009512	GCG	2	6	138900	138905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545394
2485	NC_009512	TTCC	2	8	138955	138962	0 %	50 %	0 %	50 %	148545394
2486	NC_009512	GCA	2	6	138980	138985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545394
2487	NC_009512	GAA	2	6	139060	139065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545394
2488	NC_009512	TCG	2	6	139126	139131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545394
2489	NC_009512	GC	3	6	139264	139269	0 %	0 %	50 %	50 %	148545394
2490	NC_009512	GCA	2	6	139392	139397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545394
2491	NC_009512	GGC	2	6	139401	139406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545394
2492	NC_009512	GCC	2	6	139455	139460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545394
2493	NC_009512	CTG	2	6	139762	139767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545395
2494	NC_009512	CTCG	2	8	139792	139799	0 %	25 %	25 %	50 %	148545395
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2498	NC_009512	ACGC	2	8	139864	139871	25 %	0 %	25 %	50 %	148545395
2499	NC_009512	TCGGCT	2	12	139901	139912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545395
2500	NC_009512	CAG	2	6	139945	139950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545395

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