MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida F1 chromosome

Total Repeats: 114169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21502	NC_009512	CAG	2	6	1142155	1142160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546258
21503	NC_009512	GTG	2	6	1142174	1142179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148546258
21504	NC_009512	TCG	2	6	1142261	1142266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546258
21505	NC_009512	CTT	2	6	1142373	1142378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148546258
21506	NC_009512	CGT	2	6	1142397	1142402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546258
21507	NC_009512	GGC	2	6	1142445	1142450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148546258
21508	NC_009512	GGC	2	6	1142457	1142462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148546258
21509	NC_009512	GCC	2	6	1142470	1142475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148546258
21510	NC_009512	GCG	2	6	1142635	1142640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148546258
21511	NC_009512	GTT	2	6	1142668	1142673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148546258
21512	NC_009512	CGG	3	9	1142710	1142718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148546258
21513	NC_009512	ATG	2	6	1142723	1142728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148546258
21514	NC_009512	TGCG	2	8	1142803	1142810	0 %	25 %	50 %	25 %	148546258
21515	NC_009512	ATC	2	6	1143128	1143133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148546259
21516	NC_009512	GCG	2	6	1143140	1143145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148546259
21517	NC_009512	GCA	2	6	1143165	1143170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546259
21518	NC_009512	GGC	2	6	1143180	1143185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148546259
21519	NC_009512	GTC	2	6	1143196	1143201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546259
21520	NC_009512	CGG	2	6	1143225	1143230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148546259
21521	NC_009512	GGC	2	6	1143247	1143252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148546259
21522	NC_009512	CAG	2	6	1143259	1143264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546259
21523	NC_009512	AGC	2	6	1143293	1143298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546259
21524	NC_009512	AGC	2	6	1143323	1143328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546259
21525	NC_009512	TCG	2	6	1143393	1143398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546259
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21527	NC_009512	CAA	2	6	1143494	1143499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148546260
21528	NC_009512	CAG	2	6	1143561	1143566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546260
21529	NC_009512	GTG	2	6	1143570	1143575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148546260
21530	NC_009512	TGG	2	6	1143827	1143832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148546260
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21532	NC_009512	CAG	2	6	1143911	1143916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546261
21533	NC_009512	GGC	2	6	1143925	1143930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148546261
21534	NC_009512	GCC	2	6	1143950	1143955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148546261
21535	NC_009512	GCT	2	6	1144093	1144098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546261
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21537	NC_009512	GC	3	6	1144143	1144148	0 %	0 %	50 %	50 %	148546261
21538	NC_009512	GTC	2	6	1144178	1144183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546261
21539	NC_009512	CGA	2	6	1144222	1144227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546261
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21542	NC_009512	GCC	2	6	1144391	1144396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148546261
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21548	NC_009512	GGC	2	6	1144638	1144643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148546261
21549	NC_009512	CAG	2	6	1144892	1144897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546261
21550	NC_009512	CGGCT	2	10	1144919	1144928	0 %	20 %	40 %	40 %	148546261
21551	NC_009512	CAG	2	6	1144967	1144972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546261
21552	NC_009512	CAG	2	6	1144982	1144987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546261
21553	NC_009512	CCA	2	6	1145092	1145097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148546261
21554	NC_009512	CTT	2	6	1145125	1145130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148546261
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21558	NC_009512	GCA	2	6	1145340	1145345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546261
21559	NC_009512	GCTGT	2	10	1145730	1145739	0 %	40 %	40 %	20 %	148546262
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21565	NC_009512	CTG	2	6	1145964	1145969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546262
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21569	NC_009512	ATC	2	6	1146063	1146068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148546262
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21572	NC_009512	CCA	2	6	1146269	1146274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148546262
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21583	NC_009512	CTG	2	6	1146705	1146710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546262
21584	NC_009512	TTGGCC	2	12	1146712	1146723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546262
21585	NC_009512	CGC	2	6	1146755	1146760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148546262
21586	NC_009512	CCG	2	6	1146761	1146766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148546262
21587	NC_009512	TCGA	2	8	1146791	1146798	25 %	25 %	25 %	25 %	148546263
21588	NC_009512	TGC	2	6	1146815	1146820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546263
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21596	NC_009512	TGA	2	6	1147085	1147090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148546263
21597	NC_009512	TGG	2	6	1147112	1147117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148546263
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21601	NC_009512	CTG	3	9	1147279	1147287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546263
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21604	NC_009512	GCT	2	6	1147374	1147379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546263
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21608	NC_009512	ACT	2	6	1147535	1147540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148546263
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21614	NC_009512	CGC	2	6	1147766	1147771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148546263
21615	NC_009512	GGT	2	6	1147779	1147784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148546263
21616	NC_009512	CGG	2	6	1147790	1147795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148546263
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21720	NC_009512	CGG	2	6	1153654	1153659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148546268
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21728	NC_009512	GAA	2	6	1154112	1154117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148546268
21729	NC_009512	TTC	2	6	1154134	1154139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148546268
21730	NC_009512	TCG	2	6	1154185	1154190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546268
21731	NC_009512	AGG	2	6	1154195	1154200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148546268
21732	NC_009512	CAG	2	6	1154250	1154255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546268
21733	NC_009512	GGC	2	6	1154264	1154269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148546268
21734	NC_009512	CAG	2	6	1154325	1154330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546268
21735	NC_009512	GTA	2	6	1154364	1154369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148546268
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21740	NC_009512	CG	3	6	1154567	1154572	0 %	0 %	50 %	50 %	148546268
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21746	NC_009512	CTG	2	6	1154882	1154887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546269
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21762	NC_009512	G	7	7	1156117	1156123	0 %	0 %	100 %	0 %	148546271
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21833	NC_009512	GTT	2	6	1159787	1159792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148546276
21834	NC_009512	CTT	2	6	1159820	1159825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148546276
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21838	NC_009512	CTT	2	6	1160136	1160141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148546276
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21840	NC_009512	GCC	2	6	1160274	1160279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148546276
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21842	NC_009512	CCA	2	6	1160745	1160750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148546277
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21958	NC_009512	ACC	2	6	1166317	1166322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148546282
21959	NC_009512	GAT	2	6	1166323	1166328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148546282
21960	NC_009512	CAG	2	6	1166383	1166388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546282
21961	NC_009512	ATC	2	6	1166426	1166431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148546282
21962	NC_009512	AGGT	2	8	1166456	1166463	25 %	25 %	50 %	0 %	148546282
21963	NC_009512	GCT	2	6	1166464	1166469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546282
21964	NC_009512	TGA	2	6	1166481	1166486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148546282
21965	NC_009512	GCG	2	6	1166554	1166559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148546282
21966	NC_009512	GCG	2	6	1166591	1166596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148546282
21967	NC_009512	ACA	2	6	1166613	1166618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148546282
21968	NC_009512	CAG	2	6	1166629	1166634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546282
21969	NC_009512	AGC	2	6	1166642	1166647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546282
21970	NC_009512	C	6	6	1166679	1166684	0 %	0 %	0 %	100 %	148546282
21971	NC_009512	ATG	2	6	1166756	1166761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148546282
21972	NC_009512	CAG	2	6	1166794	1166799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546282
21973	NC_009512	TTGCC	2	10	1166823	1166832	0 %	40 %	20 %	40 %	148546282
21974	NC_009512	CCGC	2	8	1166850	1166857	0 %	0 %	25 %	75 %	148546282
21975	NC_009512	CAT	2	6	1166911	1166916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148546282
21976	NC_009512	CGG	2	6	1166973	1166978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148546282
21977	NC_009512	CAC	2	6	1167034	1167039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148546282
21978	NC_009512	GTG	2	6	1167050	1167055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148546282
21979	NC_009512	TGA	2	6	1167063	1167068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148546282
21980	NC_009512	CCT	2	6	1167075	1167080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148546282
21981	NC_009512	ATG	2	6	1167134	1167139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148546282
21982	NC_009512	GAA	2	6	1167172	1167177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148546282
21983	NC_009512	CAG	2	6	1167196	1167201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546282
21984	NC_009512	CCAG	2	8	1167222	1167229	25 %	0 %	25 %	50 %	148546282
21985	NC_009512	AGCC	2	8	1167279	1167286	25 %	0 %	25 %	50 %	148546282
21986	NC_009512	GCATAC	2	12	1167290	1167301	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148546282
21987	NC_009512	CCA	2	6	1167305	1167310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148546282
21988	NC_009512	GGC	2	6	1167418	1167423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148546282
21989	NC_009512	CGC	2	6	1167450	1167455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148546282
21990	NC_009512	ATC	2	6	1167458	1167463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148546282
21991	NC_009512	CGA	2	6	1167468	1167473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546282
21992	NC_009512	GC	3	6	1167990	1167995	0 %	0 %	50 %	50 %	148546283
21993	NC_009512	TGG	2	6	1168005	1168010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148546283
21994	NC_009512	GAT	2	6	1168018	1168023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148546283
21995	NC_009512	GGC	2	6	1168025	1168030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148546283
21996	NC_009512	TCT	2	6	1168035	1168040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148546283
21997	NC_009512	CG	3	6	1168060	1168065	0 %	0 %	50 %	50 %	148546283
21998	NC_009512	CTGG	2	8	1168252	1168259	0 %	25 %	50 %	25 %	148546283
21999	NC_009512	CTG	2	6	1168280	1168285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546283
22000	NC_009512	CCATCG	2	12	1168335	1168346	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148546283

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