MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida F1 chromosome

Total Repeats: 114169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_009512	GTC	2	6	88493	88498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545339
1502	NC_009512	GGC	2	6	88528	88533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545339
1503	NC_009512	CCA	2	6	88595	88600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545339
1504	NC_009512	CCA	2	6	88705	88710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545339
1505	NC_009512	GCCAG	2	10	88716	88725	20 %	0 %	40 %	40 %	148545339
1506	NC_009512	CAG	2	6	88736	88741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545339
1507	NC_009512	GCC	2	6	88754	88759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545339
1508	NC_009512	GCA	2	6	88766	88771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545339
1509	NC_009512	CAG	2	6	88805	88810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545339
1510	NC_009512	CAG	2	6	88955	88960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545339
1511	NC_009512	ATC	2	6	89007	89012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545339
1512	NC_009512	GGTG	2	8	89013	89020	0 %	25 %	75 %	0 %	148545339
1513	NC_009512	TTG	2	6	89025	89030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545339
1514	NC_009512	GCG	2	6	89031	89036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545339
1515	NC_009512	CAGC	2	8	89084	89091	25 %	0 %	25 %	50 %	148545339
1516	NC_009512	CAC	2	6	89108	89113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545339
1517	NC_009512	AGC	2	6	89136	89141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545339
1518	NC_009512	CTT	2	6	89201	89206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545339
1519	NC_009512	GGC	2	6	89240	89245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545339
1520	NC_009512	CAG	3	9	89288	89296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545339
1521	NC_009512	CATCGG	2	12	89305	89316	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148545339
1522	NC_009512	GCA	2	6	89335	89340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545339
1523	NC_009512	CAG	2	6	89351	89356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545339
1524	NC_009512	CAG	2	6	89482	89487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545339
1525	NC_009512	GCG	3	9	89499	89507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545339
1526	NC_009512	CGG	2	6	89538	89543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545340
1527	NC_009512	CGG	2	6	89555	89560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545340
1528	NC_009512	GCC	2	6	89593	89598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545340
1529	NC_009512	CGCA	2	8	89637	89644	25 %	0 %	25 %	50 %	148545340
1530	NC_009512	GGC	2	6	89710	89715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545340
1531	NC_009512	CGGG	2	8	89803	89810	0 %	0 %	75 %	25 %	148545340
1532	NC_009512	GCGG	2	8	89927	89934	0 %	0 %	75 %	25 %	148545340
1533	NC_009512	GCC	2	6	89965	89970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545340
1534	NC_009512	GAC	2	6	89995	90000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545340
1535	NC_009512	AGC	2	6	90005	90010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545340
1536	NC_009512	GGCC	2	8	90027	90034	0 %	0 %	50 %	50 %	148545340
1537	NC_009512	CGC	2	6	90054	90059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545340
1538	NC_009512	GCA	2	6	90117	90122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545340
1539	NC_009512	CAC	2	6	90166	90171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545340
1540	NC_009512	CGGC	2	8	90335	90342	0 %	0 %	50 %	50 %	148545340
1541	NC_009512	CGG	2	6	90411	90416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545340
1542	NC_009512	TGC	2	6	90527	90532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545341
1543	NC_009512	CTT	3	9	90541	90549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545341
1544	NC_009512	CGA	2	6	90582	90587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545341
1545	NC_009512	CAG	2	6	90634	90639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545341
1546	NC_009512	CCT	2	6	90747	90752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148545341
1547	NC_009512	CGAC	2	8	90783	90790	25 %	0 %	25 %	50 %	148545341
1548	NC_009512	TGA	2	6	90795	90800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545341
1549	NC_009512	CG	3	6	90804	90809	0 %	0 %	50 %	50 %	148545341
1550	NC_009512	GTC	2	6	90916	90921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545341
1551	NC_009512	CGT	2	6	90939	90944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545341
1552	NC_009512	TCG	2	6	91239	91244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545342
1553	NC_009512	CTG	2	6	91255	91260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545342
1554	NC_009512	CCA	2	6	91402	91407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545342
1555	NC_009512	GC	3	6	91441	91446	0 %	0 %	50 %	50 %	148545342
1556	NC_009512	CGC	2	6	91448	91453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545342
1557	NC_009512	CGA	2	6	91532	91537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545342
1558	NC_009512	CCG	2	6	91542	91547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545342
1559	NC_009512	GCA	2	6	91606	91611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545342
1560	NC_009512	GGTG	2	8	91743	91750	0 %	25 %	75 %	0 %	148545342
1561	NC_009512	GAT	2	6	91820	91825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545342
1562	NC_009512	CAT	2	6	91904	91909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545342
1563	NC_009512	TGG	2	6	91933	91938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545342
1564	NC_009512	GC	3	6	91974	91979	0 %	0 %	50 %	50 %	148545342
1565	NC_009512	TCA	2	6	92027	92032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545342
1566	NC_009512	CCA	2	6	92051	92056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545342
1567	NC_009512	GCT	2	6	92075	92080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545342
1568	NC_009512	GCC	2	6	92132	92137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545342
1569	NC_009512	ACC	2	6	92158	92163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545342
1570	NC_009512	CTG	2	6	92175	92180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545342
1571	NC_009512	AGC	2	6	92224	92229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545342
1572	NC_009512	GAGCTG	2	12	92259	92270	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148545342
1573	NC_009512	CG	3	6	92310	92315	0 %	0 %	50 %	50 %	148545342
1574	NC_009512	CAA	2	6	92385	92390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545343
1575	NC_009512	CGGG	2	8	92406	92413	0 %	0 %	75 %	25 %	148545343
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1577	NC_009512	GCA	2	6	92605	92610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545343
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1579	NC_009512	GCA	2	6	92675	92680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545343
1580	NC_009512	GGT	2	6	92714	92719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545343
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1582	NC_009512	TGG	2	6	92737	92742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545343
1583	NC_009512	GGCG	2	8	92772	92779	0 %	0 %	75 %	25 %	148545343
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1585	NC_009512	GGGC	2	8	92855	92862	0 %	0 %	75 %	25 %	148545343
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1588	NC_009512	GAA	2	6	93493	93498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545344
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1596	NC_009512	GCAG	2	8	94035	94042	25 %	0 %	50 %	25 %	148545345
1597	NC_009512	CGT	2	6	94077	94082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545345
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1599	NC_009512	ACC	2	6	94267	94272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545345
1600	NC_009512	ATCAC	2	10	94292	94301	40 %	20 %	0 %	40 %	148545345
1601	NC_009512	CAG	2	6	94327	94332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545345
1602	NC_009512	GCC	2	6	94367	94372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545345
1603	NC_009512	GCC	2	6	94453	94458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545345
1604	NC_009512	CGG	2	6	94558	94563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545345
1605	NC_009512	ACGCAC	2	12	94621	94632	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	148545345
1606	NC_009512	CTG	2	6	94633	94638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545345
1607	NC_009512	CGGG	2	8	94644	94651	0 %	0 %	75 %	25 %	148545345
1608	NC_009512	GCA	2	6	94674	94679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545345
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1610	NC_009512	GCTG	2	8	94695	94702	0 %	25 %	50 %	25 %	148545345
1611	NC_009512	TCTGC	2	10	94912	94921	0 %	40 %	20 %	40 %	148545346
1612	NC_009512	AGA	2	6	94931	94936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545346
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1616	NC_009512	CTT	2	6	95189	95194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545346
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1619	NC_009512	CGG	3	9	95234	95242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545346
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1621	NC_009512	GC	3	6	95314	95319	0 %	0 %	50 %	50 %	148545346
1622	NC_009512	GTG	2	6	95386	95391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545346
1623	NC_009512	CGG	2	6	95405	95410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545346
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1625	NC_009512	CCG	2	6	95564	95569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545346
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1870	NC_009512	CAT	2	6	108430	108435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545361
1871	NC_009512	AC	3	6	108537	108542	50 %	0 %	0 %	50 %	148545361
1872	NC_009512	GGA	2	6	108571	108576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148545361
1873	NC_009512	GTT	2	6	108600	108605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545361
1874	NC_009512	ATG	2	6	108623	108628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545361
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1990	NC_009512	CCAG	2	8	114216	114223	25 %	0 %	25 %	50 %	148545368
1991	NC_009512	GCC	2	6	114290	114295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545368
1992	NC_009512	CTG	2	6	114308	114313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545368
1993	NC_009512	ATG	3	9	114350	114358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545368
1994	NC_009512	GCCA	2	8	114401	114408	25 %	0 %	25 %	50 %	148545368
1995	NC_009512	CCG	2	6	114473	114478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545368
1996	NC_009512	CGG	2	6	114531	114536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545368
1997	NC_009512	CTA	2	6	114538	114543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545368
1998	NC_009512	GAA	2	6	114596	114601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545368
1999	NC_009512	GTG	2	6	114654	114659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545368
2000	NC_009512	CG	3	6	114663	114668	0 %	0 %	50 %	50 %	148545368

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