MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida F1 chromosome

Total Repeats: 114169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_009512	GTT	2	6	860169	860174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148546013
16002	NC_009512	GGC	2	6	860175	860180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148546013
16003	NC_009512	TCGC	2	8	860214	860221	0 %	25 %	25 %	50 %	148546013
16004	NC_009512	CAG	2	6	860238	860243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546013
16005	NC_009512	GCA	2	6	860303	860308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546013
16006	NC_009512	GGC	2	6	860319	860324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148546013
16007	NC_009512	GAT	2	6	860328	860333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148546013
16008	NC_009512	TGC	2	6	860510	860515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546013
16009	NC_009512	CGG	2	6	860582	860587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148546013
16010	NC_009512	GCTG	2	8	860603	860610	0 %	25 %	50 %	25 %	148546013
16011	NC_009512	TGGC	2	8	860621	860628	0 %	25 %	50 %	25 %	148546013
16012	NC_009512	GTC	2	6	860649	860654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546013
16013	NC_009512	TCG	2	6	860662	860667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546013
16014	NC_009512	GCCTCA	2	12	860692	860703	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148546013
16015	NC_009512	CTG	2	6	860705	860710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546013
16016	NC_009512	TGC	2	6	860758	860763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546013
16017	NC_009512	CCG	2	6	860808	860813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148546013
16018	NC_009512	TCT	2	6	860855	860860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148546013
16019	NC_009512	ACTG	2	8	860864	860871	25 %	25 %	25 %	25 %	148546013
16020	NC_009512	CGGA	2	8	860913	860920	25 %	0 %	50 %	25 %	148546013
16021	NC_009512	CAG	2	6	860967	860972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546013
16022	NC_009512	CAT	2	6	860984	860989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148546013
16023	NC_009512	GCT	2	6	860996	861001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546013
16024	NC_009512	CTC	2	6	861015	861020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148546013
16025	NC_009512	GACA	2	8	861053	861060	50 %	0 %	25 %	25 %	148546013
16026	NC_009512	CAG	2	6	861108	861113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546013
16027	NC_009512	GGC	2	6	861183	861188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148546013
16028	NC_009512	CAGGT	2	10	861304	861313	20 %	20 %	40 %	20 %	148546013
16029	NC_009512	GCC	2	6	861369	861374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148546014
16030	NC_009512	CAC	2	6	861448	861453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148546014
16031	NC_009512	GCA	2	6	861490	861495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546014
16032	NC_009512	GTC	2	6	861503	861508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546014
16033	NC_009512	GCT	2	6	861589	861594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546014
16034	NC_009512	AGC	2	6	861627	861632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546014
16035	NC_009512	CAG	2	6	861683	861688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546014
16036	NC_009512	CGG	2	6	861691	861696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148546014
16037	NC_009512	GCA	2	6	861703	861708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546014
16038	NC_009512	TGC	2	6	861742	861747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546014
16039	NC_009512	CAGC	2	8	861749	861756	25 %	0 %	25 %	50 %	148546014
16040	NC_009512	AGC	2	6	861822	861827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546014
16041	NC_009512	GCA	3	9	861829	861837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546014
16042	NC_009512	GTT	2	6	861838	861843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148546014
16043	NC_009512	GC	3	6	861900	861905	0 %	0 %	50 %	50 %	148546014
16044	NC_009512	CCGA	2	8	862008	862015	25 %	0 %	25 %	50 %	148546014
16045	NC_009512	AGCCA	2	10	862029	862038	40 %	0 %	20 %	40 %	148546014
16046	NC_009512	GC	3	6	862134	862139	0 %	0 %	50 %	50 %	148546014
16047	NC_009512	GCA	2	6	862186	862191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546014
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16049	NC_009512	TTG	2	6	862329	862334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148546015
16050	NC_009512	CTGC	2	8	862349	862356	0 %	25 %	25 %	50 %	148546015
16051	NC_009512	CTG	2	6	862371	862376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546015
16052	NC_009512	TGC	2	6	862408	862413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546015
16053	NC_009512	GCG	2	6	862446	862451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148546015
16054	NC_009512	GCTG	2	8	862466	862473	0 %	25 %	50 %	25 %	148546015
16055	NC_009512	TCA	2	6	862501	862506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148546015
16056	NC_009512	TGC	2	6	862517	862522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546015
16057	NC_009512	GGC	2	6	862529	862534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148546015
16058	NC_009512	GC	3	6	862604	862609	0 %	0 %	50 %	50 %	148546015
16059	NC_009512	CAG	2	6	862629	862634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546015
16060	NC_009512	GGCGTA	2	12	862647	862658	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148546015
16061	NC_009512	GCA	2	6	862682	862687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546015
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16063	NC_009512	CTT	2	6	862706	862711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148546015
16064	NC_009512	CGC	2	6	862760	862765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148546015
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16068	NC_009512	GGTC	2	8	862907	862914	0 %	25 %	50 %	25 %	148546015
16069	NC_009512	CG	3	6	862985	862990	0 %	0 %	50 %	50 %	148546015
16070	NC_009512	AC	3	6	863019	863024	50 %	0 %	0 %	50 %	148546015
16071	NC_009512	GCC	2	6	863082	863087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148546015
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16073	NC_009512	GCGCC	2	10	863290	863299	0 %	0 %	40 %	60 %	148546016
16074	NC_009512	GGGC	2	8	863414	863421	0 %	0 %	75 %	25 %	148546016
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16089	NC_009512	GGC	2	6	864202	864207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148546016
16090	NC_009512	GAT	2	6	864232	864237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148546016
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16092	NC_009512	AT	3	6	864447	864452	50 %	50 %	0 %	0 %	148546017
16093	NC_009512	CTGG	2	8	864499	864506	0 %	25 %	50 %	25 %	148546017
16094	NC_009512	CG	3	6	864586	864591	0 %	0 %	50 %	50 %	148546017
16095	NC_009512	CGA	2	6	864610	864615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546017
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16098	NC_009512	TTGG	2	8	864733	864740	0 %	50 %	50 %	0 %	148546017
16099	NC_009512	AGC	2	6	864750	864755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546017
16100	NC_009512	GCGAAC	2	12	864807	864818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546017
16101	NC_009512	GCCA	2	8	864854	864861	25 %	0 %	25 %	50 %	148546017
16102	NC_009512	GGC	2	6	864956	864961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148546017
16103	NC_009512	GGGC	2	8	865000	865007	0 %	0 %	75 %	25 %	148546017
16104	NC_009512	GGC	2	6	865020	865025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148546017
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16106	NC_009512	TGAT	2	8	865065	865072	25 %	50 %	25 %	0 %	148546017
16107	NC_009512	GCA	2	6	865081	865086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546017
16108	NC_009512	GC	3	6	865116	865121	0 %	0 %	50 %	50 %	148546017
16109	NC_009512	CGGC	2	8	865175	865182	0 %	0 %	50 %	50 %	148546017
16110	NC_009512	TGC	2	6	865203	865208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546017
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16112	NC_009512	GC	3	6	865259	865264	0 %	0 %	50 %	50 %	148546017
16113	NC_009512	CTG	3	9	865377	865385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546018
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16116	NC_009512	TGG	2	6	865557	865562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148546018
16117	NC_009512	GAG	2	6	865563	865568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148546018
16118	NC_009512	GCAG	2	8	865601	865608	25 %	0 %	50 %	25 %	148546018
16119	NC_009512	GCCA	2	8	865660	865667	25 %	0 %	25 %	50 %	148546018
16120	NC_009512	GCC	2	6	865695	865700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148546018
16121	NC_009512	GGT	2	6	865766	865771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148546018
16122	NC_009512	AGCG	2	8	865794	865801	25 %	0 %	50 %	25 %	148546018
16123	NC_009512	TGC	2	6	865825	865830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546018
16124	NC_009512	ACC	2	6	865906	865911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148546018
16125	NC_009512	TGC	2	6	865912	865917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546018
16126	NC_009512	TGC	2	6	865988	865993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546018
16127	NC_009512	TGC	2	6	865998	866003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546018
16128	NC_009512	CCG	2	6	866014	866019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148546018
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16130	NC_009512	GCT	2	6	866201	866206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546018
16131	NC_009512	GCTGGT	2	12	866303	866314	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148546018
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16133	NC_009512	CTT	2	6	866426	866431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148546019
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16139	NC_009512	GC	3	6	866713	866718	0 %	0 %	50 %	50 %	148546019
16140	NC_009512	GGT	2	6	866825	866830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148546019
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16147	NC_009512	CAG	2	6	867185	867190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546019
16148	NC_009512	GGC	2	6	867269	867274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148546019
16149	NC_009512	GAT	2	6	867302	867307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148546019
16150	NC_009512	CAC	2	6	867320	867325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148546019
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16156	NC_009512	CGG	2	6	867544	867549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148546019
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16158	NC_009512	GC	3	6	867628	867633	0 %	0 %	50 %	50 %	148546019
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16166	NC_009512	AGGT	2	8	867980	867987	25 %	25 %	50 %	0 %	148546020
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16173	NC_009512	GC	3	6	868209	868214	0 %	0 %	50 %	50 %	148546020
16174	NC_009512	CCG	2	6	868487	868492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148546021
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16199	NC_009512	CG	3	6	869455	869460	0 %	0 %	50 %	50 %	148546022
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16222	NC_009512	TCG	2	6	870327	870332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546024
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16226	NC_009512	CGT	2	6	870613	870618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546025
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16230	NC_009512	GCA	2	6	870844	870849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546025
16231	NC_009512	CGC	2	6	870850	870855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148546025
16232	NC_009512	T	6	6	870857	870862	0 %	100 %	0 %	0 %	148546025
16233	NC_009512	TCTT	2	8	870867	870874	0 %	75 %	0 %	25 %	148546025
16234	NC_009512	GAT	2	6	870875	870880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148546025
16235	NC_009512	ACG	2	6	870941	870946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546025
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16237	NC_009512	TGT	2	6	871012	871017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148546025
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16342	NC_009512	AGCTCA	2	12	877451	877462	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148546033
16343	NC_009512	GTG	2	6	877483	877488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148546033
16344	NC_009512	TCGGCC	2	12	877586	877597	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148546033
16345	NC_009512	AGC	2	6	877600	877605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546033
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16347	NC_009512	GGT	2	6	877623	877628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148546033
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16349	NC_009512	GCA	2	6	877864	877869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148546033
16350	NC_009512	ATCCA	2	10	877927	877936	40 %	20 %	0 %	40 %	148546034
16351	NC_009512	GAA	2	6	877982	877987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148546034
16352	NC_009512	GCC	2	6	877995	878000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148546034
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16354	NC_009512	ACC	2	6	878055	878060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148546034
16355	NC_009512	CAGC	2	8	878128	878135	25 %	0 %	25 %	50 %	148546034
16356	NC_009512	GAA	2	6	878177	878182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148546034
16357	NC_009512	GTC	2	6	878193	878198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546034
16358	NC_009512	TCG	2	6	878229	878234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546034
16359	NC_009512	CATC	2	8	878236	878243	25 %	25 %	0 %	50 %	148546034
16360	NC_009512	CAGTG	2	10	878298	878307	20 %	20 %	40 %	20 %	148546034
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16368	NC_009512	GT	3	6	878962	878967	0 %	50 %	50 %	0 %	148546035
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16373	NC_009512	GGC	2	6	879080	879085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148546035
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16425	NC_009512	TGC	2	6	881709	881714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546037
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16457	NC_009512	GTC	2	6	883517	883522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546038
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16463	NC_009512	GTC	2	6	883800	883805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148546038
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16465	NC_009512	CAT	2	6	883838	883843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148546038
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16468	NC_009512	CCTCG	2	10	883916	883925	0 %	20 %	20 %	60 %	148546038
16469	NC_009512	GTG	2	6	883966	883971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148546038
16470	NC_009512	CCG	2	6	884106	884111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148546038
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16472	NC_009512	GC	3	6	884150	884155	0 %	0 %	50 %	50 %	148546038
16473	NC_009512	CCA	2	6	884239	884244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148546038
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16475	NC_009512	GTCC	2	8	884337	884344	0 %	25 %	25 %	50 %	148546038
16476	NC_009512	GGC	2	6	884349	884354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148546038
16477	NC_009512	ACC	2	6	884439	884444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148546038
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